• 한국축산식품학회지
• /
• 제32권2호
• /
• pp.241-246
• /
• 2012

This report outlines the development of a rapid, simple, and sensitive detection system for pathogenic bacteria using a capillary electrophoresis-based, single strand conformation polymorphism (CE-SSCP) combined with PCR. We demonstrate that this method, used with primers targeting the V4 region of the16S rRNA gene, is capable of the simultaneous detection of 10 microbes that could be associated with foodborne illness, caused by animal-derived foods: Salmonella enterica, Listeria monocytogenes, Escherichia coli O157:H7, Campylobacter jejuni, Staphylococcus aureus, Bacillus cereus, Clostridium perfringens, Yersinia enterocolitica, Vibrio parahaemolyticus, and Enterobacter sakazakii. The traditional detection techniques are time-consuming and labor-intensive, due to the necessary task of separate cultivation of each target species. As such, the CE-SSCP-PCR method, that we have developed, has the potential to diagnose pathogens rapidly, unlike the traditional technique, in order to prevent foodborne illness in a much more efficient manner.

• 한국미생물학회:학술대회논문집
• /
• 한국미생물학회 2006년도 International Meeting of the Microbiological Society of Korea
• /
• pp.29-31
• /
• 2006

In a previous report, we showed that enzyme $IIA^{Glc}(EIIA^{Glc}$ of Escherichia coli phosphotransferase system (PTS) interacts with and regulates activity of FrsA (fermentation/respiration switch protein). A BLAST search revealed that orthologs of FrsA exist only in some Gram-negative bacteria such as E. coli, Salmonella typhimurium, Shigella flexneri, Yersinia pestis, Vibrio cholerae, Vibrio vulnificus, Vibrio parahemeolyticus, and Photorhabdus luminescens and all of these species are facultative anaerobes belonging to the ${\gamma}-proteobacterial$ group, and most of them are highly pathogenic. Ligand-fishing experiments using $EIIA^{Glc}$ of Vibrio vulnificus ($vEIIA^{Glc}$) as bait revealed that $vEIIA^{Glc}$ also interacts with vFrsA in a phosphorylation state-dependent manner. The frsA mutant of Vibrio vulnificus showed remarkably reduced cytotoxicity to HeLa cells and reduced lethality to mice compared to wild type. Comparison of extracellular proteomes between the mutant and wild type indicated that hemolysin was not produced in the frsA mutant. Characterization of another protein interacting with $vEIIA^{Glc}$ will be discussed.

• Fisheries and Aquatic Sciences
• /
• 제22권2호
• /
• pp.5.1-5.9
• /
• 2019

Background: Live fish import may lead to the unintended introduction of pathogens. We examined the monthly distribution of microbial pathogens in ornamental finfish imported into South Korea over a 6-month period. Results: Vibrio alginolyticus was detected in one lemon damsel in June and July; V. vulnificus was detected in one lemon damsel, one caerulean damsel, and one pearl-spot chromis and one ocellaris clownfish in July, April, and May, respectively; Photobacterium damselae was detected in one ocellaris clownfish and one caerulean damsel in June and July, respectively; V. anguillarum was detected in one pearl-spot chromis in February; V. harveyi was detected in one ocellaris clownfish and two mandarin fish in February and April, respectively; Yersinia ruckeri was detected in a pearlscale goldfish group in June and July and in two colored carp groups in July; and Lactococcus garvieae was detected in a lemon damsel group and a sutchi catfish group in July and May, respectively. European catfish virus, the only viral pathogen detected, was found in two sutchi catfish groups in May. Conclusion: This study is the first to identify pathogenic species and the presence or absence of pathogens (non-quarantine diseases) in imported ornamental finfish. These results demonstrate that various pathogens with the potential to harm indigenous fish populations can accompany ornamental finfish imported into South Korea.

• 한국축산식품학회지
• /
• 제23권3호
• /
• pp.269-277
• /
• 2003

한국인 모유중 미생물을 분리 및 동정하여 미생물의 분포를 파악함으로써 영 유아의 건강에 대한 안정성을 확보하고자 하였다. 건강한 한국인 149명의 산모로부터 비유기간을 고려하여 유즙기에 의한 수집과 손에 의한 수집방법에 따라 모유를 나누어 미생물의 동정을 실시하였다. 유즙기로 수집한 경우 일반세균수는 평균 2.33${\times}$$10^4$ cfu/mL이구 손으로 착유시는 평균 7.83${\times}$$10^3$ c려/mL로서 유즙기를 이용하여 착유한 경우 평균 9.80${\times}$$10^2$∼3.06${\times}$$10^4$ cfu/mL 많이 존재하였으며, 대장균군 또한 유즙기를 이용하여 착유할 경우 평균9.36${\times}$$10^3$∼8.57${\times}$$10^4$ cfu/mL 많이 존재하는 것으로 나타났다. 반면에 유산균수는 평균 8.63${\times}$$10^2$∼7.64${\times}$$10^4$ cfu/mL로서 기계착유와 손착유 방법에 따른 차이점이 없었다. 일반세균의 동정은 산모로부터 수집된 모유를 Standard plate count agar를 이용하여 콜로니의 형태학적 특성에 따라 5가지 형태로 나누어 100개군으로 분리하였으며, Microbial Identification System(MIDI)을 이용하여 일반세균군을 동정한 결과, 휴 13개 균종으로 분포하고 있었으며, 그 중 Staphylococcus속이 7가지의 아종으로 전체 일반세균의 81% (1.07${\times}$$10^4$ cfu/mL)로서 가장 많이 존재하고 있는 것으로 나타났다. 그 밖에 Mcrococcus속, Bacillus속, Providencia속, Pseudomonas속, Yersinia속 및 Acinetobacter속이 각각 1종씩 검출되었다. 유산균의 동정은 BCP agar를 이용하여 콜로니의 형태학적 특성에 따라 6가지 형태로 나누어 36개군의 유산균군을 분리하였다. 그리고 Bergey's Manual 및 API 50CH system을 이용하여 생리적 및 생화학적 동정을 실시한 결과, 총 7개 균종으로 분포하고 있었으며, Lactobacillus brevis 균주간 전체 유산균중 50.9% (4.72${\times}$$10^4$ cfu/mL)로서 가장 많이 존재하고 있는 것으로 나타났다. 그 밖에 Lactobacillus curvatus, Lactobacillus delbrueckii subsp. lactis, Lactobacillus acidophiiu 등 85.1%(7.89x$10^4$ cfu/mL)가 간균으로 분포하고 있었으며 구균으로는 Leuconostoc lactis와 Streptococcus salivarius subsp. thermophilus가 총 14.9% (1.39${\times}$$10^4$ cfu/mL)분포하고 있는 것으로 동정되었다.

• Pediatric Infection and Vaccine
• /
• 제13권2호
• /
• pp.147-155
• /
• 2006

목 적 : 소아에서 흔한 감염성 질환인 급성 위장관염은 바이러스, 원충, 세균 등 다양한 원인에 의해 발생한다. 소아 위장관염의 다양한 원인에 대한 연구가 드물어 이에 급성 위장관염으로 방문했던 환아들을 대상으로 병원체의 원인과 임상양상에 대해 연구하고자 하였다. 방 법 : 2004년 12월부터 2005년 12월까지 설사, 구토 등의 위장관염 증상으로 단국대학교병원 외래를 내원하였거나 입원한 환아들을 대상으로 하였다. 대변검사는 총 17종의 원인 병원체에 대한 검사를 하였다. RT-PCR에 의한 norovirus, ELISA에 의한 rotavirus, astrovirus, adenovirus와 선택적 배지를 사용하여 Salmonella spp., Shigella spp., C. perfrigens, Campylobacter spp., E. coli, Vibrio spp., S. aureus, B. cereus, Yersinia spp., L. monocytogenes에 대한 배양검사, EIA에 의한 C. parvum, E. histolytica, G. lamblia에 대한 검사를 하였다. 원인별 임상양상에 대해 후향적으로 의무기록지를 검토하였다. 결 과 : 총 215례 환아에서 대변검사를 시행하였으며 이중 89례(41.4%)가 양성을 보였다. 89례의 남녀비는 1.3:1, 평균나이는 25개월(3일~14세), 평균 입원기간은 3.4일(1~10일)이었다. 연령별로 1개월 미만이 4례(4.5%), 1~2개월이 4례(4.5%), 3~12개월 24례(26.7%)였고 13~48개월이 47례(52.8%)로 가장 많았으며 4세 이상이 10례(11.2%)의 분포를 보였다. 원인별로 바이러스가 68례(77.5%), 세균이 26례(28.9%), 원충이 21례(23.6%)에서 검출되었고 바이러스류에서는 rotavirus(50례), 세균류에서는 salmonella(10례), 원충류에서는 C. parvum(11례)이 가장 많이 검출되었다. 양성 환아의 22례(24.4%)에서 2종 이상의 혼합감염을 보였고 바이러스와 원충의 혼합감염이 가장 많았다. 결 론 : 본 연구에서 소아 급성 위장관염을 일으키는 것으로 알려진 다양한 병원체들이 검출되었다. 이는 소아 급성 위장관염의 치료에 많은 정보를 줄 것으로 생각되며 향후 소아 급성 위장관염의 다양한 원인에 대한 광범위하고 지속적인 연구가 필요할 것으로 사료된다.

• 미생물학회지
• /
• 제43권1호
• /
• pp.47-53
• /
• 2007

항생제 내성 세균의 출현으로 새로운 항생물질의 개발에 대한 필요성이 대두되고 있다. 본 연구에서는 새로운 항균활성물질을 개발하고자 강원도 대암산 용늪 토양으로부터 새로운 항균물질을 생산하는 균을 분리하였고, 이를 동정하였다. 생화학적인 시험과 16S ribosomal DNA 염기서열 분석결과 Paenibacillus polymyxa균과 가장 높은 상동성을 보여주었다. 지방산 조성의 분석에서도 이 균주는 Paenibacillus polymyxa와 가장 가까웠다. 이 균주가 생산하는 항균물질은 1군 법정 전염병을 일으키는 Samonella enterica serovar Typhi와 Shigella dysentery, enterohaemorrhagic Eschelichia coli, 그리고 Vibrio cholera등의 병원성 세균에 성장억제 효과를 나타냈으며, 다른 일반 식중독 장내세균에서도 성장억제 효과를 나타냈다. 이 균주가 생산하는 항균활성 물질은 과거에 보고된 것과 다른 새로운 것으로 보이며, 광범위한 항균활성으로 인하여 새로운 항생물질 개발 후보로 많은 잠재력을 가진 것으로 평가된다.

• 한국식품과학회지
• /
• 제48권5호
• /
• pp.437-444
• /
• 2016

최근 건강과 위생에 대한 소비자의 의식 향상으로 인해 농수축산 분야를 비롯한 식품의 가공 유통 분야에서도 식품의 안전성 확보를 위한 시험 검사가 실시되고 있고, HACCP과 같은 식품안전관리 프로그램의 조기 도입을 유도하고 있어 식품중독균에 대한 검사량이 증가하고 있다. 이에 따른 신속, 정확하고 대량의 시료를 처리할 수 있는 식품중독균 검사의 필요성이 증가되고 있다. 국내 식품 미생물의 확인시험방법은 전통적인 미생물 동정법인 그램 염색 등과 같은 형태학적 특성과 생화학적 분석에 의해서 주로 확인되는데, 확인 과정이 복잡하고 장시간이 소요된다. 이를 극복하기 위한 새로운 미생물 동정법인 MALDI-TOF 질량분석기반 미생물 동정법을 식품의 식품중독균 검사에 적용하기 위해 식품공전에서 주로 검사하는 식품중독균 10종에 대한 질량 패턴 데이터를 국내 질량분석 데이터베이스인 MicroID에 적용하였다. 표준 균주와 식품중독균이 검출된 시료에서 분리한 균으로 비교했을 때 질량분석기반 미생물 동정은 현재 사용되고 있는 생화학적 분석결과와 일치한 결과를 보여주었다. 또한, 식품중독균을 포함한 국내 미생물 균주를 이용해서 구축한 데이터베이스, MicroID는 기존의 상용화된 해외 MALDI-TOF 질량분석 데이터베이스 Biotyper와 동등 이상의 정확도를 나타내었다. 국내 식품관련 미생물에 대한 질량스펙트럼을 추가하여 데이터베이스를 지속적으로 확장시키면 신속 정확한 미생물 동정법으로 자리매김할 수 있을 것이다.