XML 의 중요성이 부각 되면서 XML 데이터의 효율적 관리 기법에 관한 연구가 활발히 수행되고 있다. XML 질의의 표준화 작업도 활발히 이루어져 현재 XQuery가 유력한 표준으로 부각되었다. 그러나 XQuery 등이 완전한 XML 질의어가 되기 위해서는 변경 연산을 제공해야 하는데 XML 변경어의 표준화 작업이나 XML 변경 처리 기법에 대한 연구는 아직 미미한 실정이다. 본 논문에서는 e-Business 등 XML 데이터베이스 기반 웹 응용의 효율적 지원을 위한 XML 문서 갱신에 대한 기법을 다룬다. XML 문서의 효율적 갱신을 위한 RN(RmdEid, NextChildEid) 번호 체계, R(RmdEid) 번호 체계 을 제시한다. 어떤 XML 번호 체계를 사용하여 XML 문서를 저장하는 가는 XML 문서의 갱신 연산에 중용한 영향을 미친다. 이들 번호 체계들은 데이터베이스내의 테이블 스키마의 차이점으로 구분한 것이다. 이들 번호체계 각각에 대하여 XML 데이터베이스 시스템을 구현하여 이들 기능의 성능 및 공간 부담을 평가한 결과를 기술한다.
기존의 Numbering 스킴을 이용한 XML 데이터의 인덱스 정의 방법은 개체가 삽입, 삭제, 갱신될 경우 인덱스가 재정의되어야 하는 문제점이 있다. 이러한 문제를 해결하기 위해서 본 논문은 블록단위의 인덱스기법을 제안한다. 블록과 블록사이는 많아야 하나의 관계가 유지 되도록 XML 데이터를 블록단위로 나누고, 각 블록에 대해 Numbering 스킴을 적용하여 인덱스를 정의한다. 이렇게 정의된 인덱스는 XML 데이터의 삽입, 삭제, 갱신의 경우 인덱스 재정의에 따른 오버헤드를 상당히 줄일 수 있다. 또한 XML 질의를 지원하기 위해 정의된 인덱스를 이용하여 두 개체사이의 관계를 검색하는 Parent-Child Block Merge Algorithm과 Ancestor-Descendent Block Merge Algorithm을 제안한다. 그리고 Ancestor-Descendent관계를 빠르게 검색하기 위하여 블록식별자가 부모의 정보를 유지하는 방법을 소개하고 이를 이용한 Parent-Child Block Merge Algorithm과 Ancestor-Descendent Block Merge Algorithm을 제안한다.
XML은 자기 서술적인 표현 언어라는 중요한 장점을 가지고 있기 때문에 인터넷 관련 응용들에서 정보의 표현 및 문서 교환의 표준으로 빠른 속도로 자리잡아 가고 있다. 본 논문에서는 SQL에 XPath 표현 중 일부를 추가하여 SQL을 확장함으로써 XML 문서에 대한 질의를 가능하게 하였고, 또한 SQL의 CRUD(Create, Read. Update, Delete) 기능을 그대로 사용함으로써 XML 문서의 변경이 가능한 XML 질의를 위한 새롭게 확장된 SQL을 제안하였다. 그리고 폭 넓게 사용되고 있는 ORDBMS 환경에서 XML 색인 정보를 자동 생성 관리하는 XML 저장 관리기 및 확장된 SQL 처리기를 설계하고 구현하였다. 본 논문에서 제안하는 확장된 SQL 처리기는 XML 원문 자체의 보관을 원칙으로 하여 완벽한 문서 복구 등에 따르는 부담을 제거하였고, XML 저장 문서에 대한 원본성 및 무결성을 쉽게 유지할 수 있도록 하였으며, 색인 정보를 자동 생성 관리함으로써 파일 처리 시간과 XML 트리 운행 시간 및 XPath 파싱 처리 시간을 줄였다. 또한, “path”라는 키워드를 추가로 관리함으로써 ORDBMS 환경에서 XML 질의를 위한 SQL 변환 과정에서 PATH의 깊이 만큼 조인이 중첩되는 문제를 배제하여 조인이 발생할 가능성을 줄이는 방법을 제시하였다.
지도 DB 업데이트 방법은 카 네비게이션을 사용하는 운전자 입장에서는 매우 중요한 요소이다. 본 연구는 클라우드 컴퓨팅 환경을 이용해 이기종 네비게이션 시스템을 사용하는 운전자들이 새로운 도로(Unknown Roads) 주행시 추출된 도로 속성 정보를 클라우드에서 분석해 이기종 네비게이션간 서비스가 가능한 XML 포맷의 Metadata를 생성한 다음, 이것을 모든 지도 정보 제공자(Provider)에게 제공하면 해당 Map DB 제공자는 클라우드로 부터 제공 받은 도로의 속성 정보 metadata를 자신의 네비게이션 시스템을 사용하는 모든 운전자의 Map DB를 실시간으로 업데이트하는 방법을 제안한다. 이 방법은 Map DB Provider들이 수행하는 실차 주행 테스트 비용을 줄이고 서버 자원 통합 구축을 통한 Map DB 데이터센터의 유지 비용을 줄일 수 있다. 결국 제안된 방법은 새로운 도로 정보를 모든 운전자들의 Map DB에 더욱 효율적으로 업데이트할 수 있다.
XML 트리를 공유하면서 여러 사용자가 동시에 수정할 수 있게 하기 위해서는 부분 트리의 삽입/삭제가 공유될 수 있어야 한다. 이를 위해서는 트리 데이터의 구소 변경 행위에 대한 통시성 제어가 가능해야 한다. 본 논문에서는 DTD 문서 타입 정보를 이용하여 XML 트리의 반복부에 대해서만 부분 트리의 삽입/삭제가 가능한 리스트 데이터 공유 모델을 제안한다. 제안된 리스트 데이터 공유 모델은 구조 변경 행위의 적용 결과가 항상 유효하며, 여러 사용자가 동시에 접근하는 경우에도 문서의 유효성을 보장할 수 있다. 리스트 데이터 공유 모델에서 반복부 자식 노드 리스트를 잠금의 대상으로 하는 리스트 잠금 프로토콜을 제안하였다. 이 잠금 프로토콜은 기존의 방법들과 비교하여 훨씬 간단하면서 적은 수의 잠금 객체만을 다루며, 높은 접근성을 가능하게 한다. 일반적으로 공유되는 XML 트리의 삽입 및 삭제는 흔히 반복부 데이터에 대해서 적용되는 경우가 많으므로 제안된 모델은 터미널 노드 데이터 값에 대한 기존의 접근제어 방법과 함께 사용하였을 때 효과적인 데이터 공유 방법을 제공할 수 있을 것으로 기대된다.
The difficulties in dealing with the Bioinformatics data come more from its idiosyncrasies than from its quantity Currently researchers need to an easy method for data exchange, manage, update. In order to integrate and manage all kinds of biological data, it is reasonable to adopt XML as standard tool since XML is independent of operating system, programming language and hardware platform. Although XML in Bioinformatics has been used widely as a standard notation abroad, however it is the beginning step in the domestic research. This article reviews a basic concept of XML and how to apply XML modeling in Bioinformatics. In addition we present XML applications for genomic sequences, structures and genetic network modeling.
XML 문서는 관계형 테이블과는 달리 문서의 구조가 매우 복잡하고 불규칙하여 부분적인 정보를 최대한 활용하는 전문 검색이 일반적인 구조적 검색보다 더 중요한 역할을 한다. XML 문서는 계층이 있으므로 계층을 사용하는 전문 검색 연산은 계층을 제공함으로써 검색 공간을 줄여서 검색의 정확성과 효율성을 훨씬 더 높일 수 있다. 전문 검색 연산을 효과적으로 지원하기 위한 방법으로는 역인덱스를 (inverted index) 사용하는 것이 가장 일반적인 방법이다. 지금까지의 전문 검색을 위한 XML 문서의 구조 정보를 표현, 저장하는 방법들은 문서의 내용이 변경되지 않는 정적 문서(static documents)만을 고려하여 왔다. 이 방법들은 문서가 동적으로 변화할 경우 저장된 문서의 구조 정보 중에서 많은 부분을 다시 표현해야 하는 비효율적인 면이 있다. 본 논문은 XML 문서의 동적인 변화를 지원하면서 동시에 복잡한 XML 전문 검색을 지원하기 위한 방법으로 경로 스트링을 사용하는 효율적인 역 인덱스 구축 기법을 제안하고 제안하는 방법이 복잡한 문서의 검색과 문서의 동적인 변화를 효율적으로 검색할 수 있음을 보인다.
최근에 인터넷의 급속한 발전과 더불어 대량의 정보를 효과적으로 표현 및 교환할 수 있는 새로운 데이터 표준으로 XML (extensible Markup Language)이 제안되었으며, XML 문서에 대한 저장과 인덱싱에 대한 연구가 활발하게 진행되고 있다. 본 논문에서는 실시간 XML 문서 처리에 효율적인 주기억장치 기반의 XML 전용 저장 시스템을 설계하고, 사용자 질의에 포함된 엘리먼트 타입 정보를 이용하여 XML 문서트리에 대한 순회를 최소화시킬 수 있는 구조적 검색 기법을 설계한다 또한, 엘리먼트의 삭제 및 삽입 등 동적인 변경에 빠르고 유연하게 대처할 수 있는 인덱스 구조와, 링크 정보를 가지고 있는 XML 문서의 질의 처리를 위해 XLink 표준을 준수하여 테이블 형식의 링크 정보 인덱스 구조를 설계한다.
뷰는 이질적인 데이타의 통합 및 여과(filtering) 기능을 통해서 데이타베이스의 필요한 부분을 제공한다. 많은 정보가 쏟아지고 있는 웹 환경의 데이타 교환 표준인 XML에 대해서도 뷰의 개념은 유용하다. 본 논문은 XML 뷰 인덱싱이라고 명명한 XML 뷰를 구현하는 기법을 제안한다. XML 뷰는 XML 뷰에 대한 정보와 더불어 뷰를 구성하는 하부 XML 엘리먼트에 대한 식별자를 저장하는 구조인 XML 뷰 인덱스로 표현된다. XML 뷰 인덱스가 XML 엘리먼트 자체가 아닌 식별자만을 저장하므로, 사용자가 XML 뷰를 요청하면 하부 XML 문서를 기반으로 XML 뷰를 실체화해야 한다. 또한, 하부 XML 문서에 대한 변경에 대하여 XML 뷰 인덱스의 일관성을 유지하기 위한 효율적인 점진적 갱신 기법이 필요하다. 본 논문에서는 XML 뷰 인덱싱을 위한 자료구조와 알고리즘을 제안하고 구현하였다. 성능 평가 결과 XML 뷰 인덱싱을 사용하는 것이 매번 뷰를 재생성하는 경우보다 질의 재수행 시간이 적게 걸렸다. XML 뷰 인덱싱 기법이 실체화 시간으로 인해 XML 실체뷰 기법보다 질의 재수행 시간은 많이 걸리지만, 저장 공간 면에서는 약 30배 정도 효율적인 것으로 나타났다.
정보 표현의 기본 단위인 엘리먼트로 구성되는 XML 문서 내에서 동적으로 구조 변경이 이루어진다. 이때 XML 문서의 구조변경은 빠른 검색을 위해 기존의 색인 구조 정보의 변경 없이 효율적으로 처리되어야 한다. 이를 위해 본 논문에서는 XML 문서의 구조 변경 시 기존의 색인 구조에 효율적으로 수용될 수 있는 동적 색인 모델을 제안한다. 제안하는 동적 색인 모델은 다양한 구조 검색을 지원하기 위한 구조 정보 표현 방법과 효율적인 구조 검색을 지원하기 위한 동적 색인 구조로 구성된다. 제안하는 색인 기법이 기존의 동적 색인을 지원하는 기법보다 내용 색인, 구조 색인, 애트리뷰트 색인 측면에서 우수함을 성능 평가를 통해 보인다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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