• 제목/요약/키워드: Wild strain

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RpoS 대장균 돌연변이 균주에서 아미노산의 생산 증가 (Increased Production of Amino Acids in an Escherichia coli rpoS Mutant)

  • 정일래;김인규
    • 미생물학회지
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    • 제45권3호
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    • pp.263-267
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    • 2009
  • 세포정지기 및 스트레스에서 유도되는 RpoS 인자는 다양한 세포반응에 관여하는 유전자의 전사발현에 관여하는 전자조절인자이다. 대장균에서 proline의 생합성에 관여하는 유전자인 proBA와 proC 발현을 세포생장 주기별로 조사해 본 결과, 세포지수기에서는 proBA와 proC 유전자의 발현이 유도되는데 비해, 세포정지기에서는 이 세유전자의 전사발현이 극적으로 저해되었다. 그러나 rpoS 돌연변이를 야생형 대장균에 도입한 결과 proline 생합성에 관여하는 유전자인 proBA와 proC 유전자의 발현이 세포정지기에서 저해되지 않았다. 이러한 결과는 RpoS가 proline 생합성에 관여하는 proBA와 proC 유전자의 전사발현에 음성효과를 미치고 있음을 의미한다. 한편 rpoS 돌연변이 균주에서는 proline 외에도 threonine, methionine, lysine, arginine 등의 아미노산이 야생형 대비 2배 이상 생합성이 증가되었는데, 이는 rpoS 대장균 돌연변이 균주가 아미노산의 대량생산에 이용될 수 있음을 의미한다.

Overexpression, Purification and Truncation Analysis of RmlC Protein of Mycobacterium tuberculosis

  • Lee, Jong-Seok;Lee, Tae-Yoon;Park, Jae-Ho;Kim, Jong-Sun;Lee, Tae-Jin;Lee, Jai-Youl;Kim, Sung-Kwang
    • 대한미생물학회지
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    • 제35권4호
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    • pp.273-282
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    • 2000
  • dTDP-rhamnose provides L-rhamnose to the bridge-like structure between mycolyl arabinogalactan and peptidoglycan of the mycobacterial cell wall. dTDP-rhamnose is composed of glucose-l-phosphate and dTTP by four enzymes encoded by rmlA-D. To determine the region(s) of RmlC protein essential for its dTDP-4-keto-6-deoxyglucose epimerase activity, we overexpressed both whole (202 amino acids) and three different truncated (N-terminal 106 or 150 or C-terminal 97 amino acids) RmlC proteins of Mycobacterium tuberculosis. The RmlC enzyme activity in the soluble lysates of ${\Delta}rmlC$ E. coli strain $S{\Phi}874$ (DE3 PlysS) expressing the wild type or truncated rmlC genes was initially analyzed by three sequential reactions from dTDP-glucose to dTDP-rhamnose in the presence of purified RmlB and RmlD. All three soluble lysates containing the truncated RmlC proteins showed no enzyme activity, while that containing the wild type RmlC was active. This wild type RmlC was then overexpressed and purified. The incubation of the purified RmlC enzyme so obtained with dTDP-4-keto-6-deoxyglucose resulted in the conversion of dTDP-4-keto-rhamnose. The results show that the truncated regions of the RmlC protein are important for the RmlC enzyme activity in M. tuberculosis.

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Assessment of environmental impact of vitamin A-enhanced soybeans and hybrid soybeans

  • Sung-Dug Oh;Ji Eun Choi;Ye-Jin Jang;Seong-Kon Lee;Gang-Seob Lee;Ancheol Chang;Doh-Won Yun
    • 농업과학연구
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    • 제50권4호
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    • pp.749-758
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    • 2023
  • An understanding of safety problems pursuant to environmental release of GM (Genetically Modified) crops is considered important. Among the recognized safety problems, the possibilities of weediness and ecosystem invasion are constantly being validated. We herein compared the growth characteristics and germination rate of soybeans formed by hybridization with vitamin A-enhanced soybeans carrying an introduced gene that increases β-carotene content. We also examined overwintering, survival, and weed competitiveness to evaluate hybrid ecological impact on long-term unmanaged cultivatable land. These studies revealed that the hybrid soybeans exhibited intermediate growth characteristics and germination rate compared with the vitamin A-enhanced soybeans and wild soybeans, or exhibited traits similar to those of the maternal strain. Overwintering experiments were conducted by planting seeds at depths of 0, 5, 10, and 20 cm and recovering them after three or five months. After five months, all seeds at depths more than 5 cm lost viability. Among seeds recovered after three months, only wild soybeans retained viability at depths of more than 5 cm. Survival and weed competitiveness were assessed by sowing each type of seed and performing no irrigation, or pest or weed control. Quantitative assessment of numbers of individual soybean plants that appeared in the experimental plot revealed that all plants germinated after sowing, but only wild type plants survived overwintering. These studies suggest that both GM soybeans and hybrid soybeans cannot survive in uncultivated land even if they are released into the environment, which indicates less possibility of ecosystem invasion and weediness.

In vitro Stimulation of NK Cells and Lymphocytes Using an Extract Prepared from Mycelial Culture of Ophiocordyceps sinensis

  • Sun-Hee Jang;Jisang Park;Seung-Hwan Jang;Soo-Wan Chae;Su-Jin Jung;Byung-Ok So;Ki-Chan Ha;Hong-Sig Sin;Yong-Suk Jang
    • IMMUNE NETWORK
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    • 제16권2호
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    • pp.140-145
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    • 2016
  • Ophiocordyceps sinensis is a natural fungus that has been valued as a health food and used in traditional Chinese medicine for centuries. The fungus is parasitic and colonizes insect larva. Naturally occurring O. sinensis thrives at high altitude in cold and grassy alpine meadows on the Himalayan mountain ranges. Wild Ophiocordyceps is becoming increasingly rare in its natural habitat, and its price limits its use in clinical practice. Therefore, the development of a standardized alternative is a great focus of research to allow the use of Ophiocordyceps as a medicine. To develop an alternative for wild Ophiocordyceps, a refined standardized extract, CBG-CS-2, was produced by artificial fermentation and extraction of the mycelial strain Paecilomyces hepiali CBG-CS-1, which originated from wild O. sinensis. In this study, we analyzed the in vitro immune-modulating effect of CBG-CS-2 on natural killer cells and B and T lymphocytes. CBG-CS-2 stimulated splenocyte proliferation and enhanced Th1-type cytokine expression in the mouse splenocytes. Importantly, in vitro CBG-CS-2 treatment enhanced the killing activity of the NK-92MI natural killer cell line. These results indicate that the mycelial culture extract prepared from Ophiocordyceps exhibits immune-modulating activity, as was observed in vivo and this suggests its possible use in the treatment of diseases caused by abnormal immune function.

Safety and Immunogenicity of Salmonella enterica Serovar Typhimurium llaB in Mice

  • CHO SUN-A;LEE IN-SOO;PARK JONG-HWAN;SEOK SEUNG-HYEOK;LEE HUI-YOUNG;KIM DONG-JAE;BACK MIN-WON;LEE SEOK-HO;HUR SOOK-JIN;BAN SANG-JA;LEE YOO-KYOUNG;PARK JAE-HAK
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제15권3호
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    • pp.609-615
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    • 2005
  • The safety and immunogenicity of an attenuated recombinant Salmonella vaccine strain, Salmonella enterica serovar Typhimurium llaB, was assessed. This vaccine strain could survive in low pH condition, and its ability of intracellular survival did not differ from that of S. enterica serovar Typhimurium UK1, which is the wild-type of the vaccine strain. The mortality of the mice orally administered with the vaccine strain was $50\%$ at the dose of $10^7$ CFU. All mice administered with $10^5\;or\;10^3$ CFU of the vaccine strain survived for 3 days postinoculation (pi). However, all mice administered with more than $10^3$ CFU of the vaccine strain died within 3 days pi. To examine the protective effect of the vaccine strain, mice were orally immunized with $10^4\;and\;10^6$ CFU of the bacteria. Control mice were given with 0.5 ml of phosphate buffered saline (PBS). After 8 days, the mice were challenged with $10^9$ CFU of S. enterica serovar Typhimurium UK1, and mortality was examined for 5 days. The survival rates of the mice immunized with $10^4\;and\;10^6$ CFU of the vaccine strain were $60\%\;and\;80\%$, respectively, whereas all control mice died within 2 days after challenging. To investigate the immunogenicity of S. enterica serovar Typhimurium llaB, mice were orally immunized with $10^5\;or\;10^6$ CFU ml of the vaccine strain. Five mice of each group were sacrificed at 5 and 12 days after immunization, and results showed that immunization of the vaccine strain led to increases of IgG1, IgG2, and IgM titers against S. enterica serovar Typhimurium UK1 in mouse sera, cytokine expressions such as IL-2, IL-4, IL-6, and IL-10 in spleen, and the lymphocyte proliferation response to mitogens (concanavalin A or LPS) stimulation.

Continuous Passaging of a Recombinant C-Strain Virus in PK-15 Cells Selects Culture-Adapted Variants that Showed Enhanced Replication but Failed to Induce Fever in Rabbits

  • Tong, Chao;Chen, Ning;Liao, Xun;Yuan, Xuemei;Sun, Mengjiao;Li, Xiaoliang;Fang, Weihuan
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제27권9호
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    • pp.1701-1710
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    • 2017
  • Classical swine fever virus (CSFV) is the etiologic agent of classical swine fever, a highly contagious disease that causes significant economic losses to the swine industry. The lapinized C-strain, a widely used vaccine strain against CSFV, has low growth efficiency in cell culture, which limits the productivity in the vaccine industry. In this study, a recombinant virus derived from C-strain was constructed and subjected to continuous passaging in PK-15 cells with the goal of acquiring a high progeny virus yield. A cell-adapted virus variant, RecCpp80, had nearly 1,000-fold higher titer than its parent C-strain but lost the ability to induce fever in rabbits. Sequence analysis of cell-adapted RecC variants indicated that at least six nucleotide changes were fixed in RecCpp80. Further adaption of RecCpp80 variant in swine testicle cells led to a higher virus yield without additional mutations. Introduction of each of these residues into the wild-type RecC backbone showed that one mutation, M979R (T3310G), located in the C-terminal region of E2 might be closely related to the cell-adapted phenotype. Rabbit inoculation revealed that $RecCpp40_{+10}$ failed to induce fever in rabbits, whereas $RecCpp80_{+10}$ caused a fever response similar to the commercial C-strain vaccine. In conclusion, the C-strain can be adapted to cell culture by introducing specific mutations in its E2 protein. The mutations in RecCpp80 that led to the loss of fever response in rabbits require further investigation. Continuous passaging of the C-strain-based recombinant viruses in PK-15 cells could enhance its in vitro adaption. The non-synonymous mutations at 3310 and 3531 might play major roles in the enhanced capacity of general virus reproduction. Such findings may help design a modified C-strain for improved productivity of commercial vaccines at reduced production cost.

남.서해안과 동중국해 자연산 어류에서 Red Sea Bream Iridovirus (RSIV)의 검출 (Detection of Red Sea Bream Iridovirus (RSIV) from marine fish in the Southern Coastal Area and East China Sea)

  • 이월라;김석렬;윤현미;키타무라신이치;정성주;오명주
    • 한국어병학회지
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    • 제20권3호
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    • pp.211-220
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    • 2007
  • Red sea bream iridovius (RSIV)는 우리나라와 일본의 참돔 (Pagrus major), 돌돔(Oplegnathus fasciatus) 등 주로 돔류에 질병을 유발하는 어류 병원바이러스로 알려져 왔으나, 돔류 이외에도 감수성을 나타내는 어종이 매우 다양하며 아시아를 중심으로 고수온기에 대량 폐사를 유발하는 중요한 원인체로 보고되고 있다. 본 연구는 RSIV에 대한 자연산어류에서 검출동향의 모니터링을 통해 금후 red sea bream iridoviral disease (RSIVD)에 대한 예방학적 접근의 일환으로서 자연산 어류로부터의 RSIV 검출 및 지리적 분포, 보균 어종에 대한 유전학적인 조사를 실시하였다. 조사는 2003년과, 2005년도에 동중국해역 3지점, 서해안 5지점 그리고 남해안 5지점에서 어류를 채집하여 PCR을 이용한 검출결과, 자연산 해산어류 160마리 중 39마리에서 RSIV가 검출되어 24.3%의 높은 검출율을 보였으며 특히 조사된 어류 중 상어목에서 가장 높은 검출율을 보였다. 자연산 어류에서 분리한 RSIV 분리주는 양식산어류에서 분리된 RSIV-K strain과 염기서열 분석에서 97.2%~100%, 아미노산 분석에서 94.7~100% 유사성을 나타내었으며 megalocytivirus Subgroup Ⅲ에 속함을 확인하였다.

표고 야생형 계통의 배양 및 형태적 특성 비교 (Cultural Characteristics and Morphological Comparison of the Wild Mushroom Lentinula edodes Cultivated on Sawdust Substrate)

  • 박영애;서수영;가강현
    • 한국균학회지
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    • 제46권2호
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    • pp.177-185
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    • 2018
  • 야생 표고 26개 균주를 육종의 소재로 활용할 목적으로 배양 특성 및 버섯 생산성과 자실체의 특성 등을 조사하였다. potato dextrose agar 배지에서 균사의 배양 온도($10^{\circ}C$, $20^{\circ}C$, $30^{\circ}C$)에 따른 균사 생장력을 측정한 결과, 3가지 온도 조건에서 공통적으로 평균 이상의 생장력을 갖는 균주는 NIFoS 68, NIFoS 136, NIFoS 1521, NIFoS 1651, NIFoS 2064였다. NIFoS 411 균주는 $20^{\circ}C$에서 가장 저조한 생장을 보인 반면 $30^{\circ}C$에서 가장 높은 생장을 보였다. 배양 배지의 중량 감소율은 13.5~47.5%로 NIFoS 50 (47.5%), NIFoS 128 (34.5%), NIFoS 54 (34.4%) 순으로 조사되었다. 또한 26개 균주 중 24개 균주에서 버섯이 발생되었고, 생산성은 3~446 g/2 kg이었다. 버섯 생산량과 온도별 균사 생장력은 크게 상관관계를 보이지 않았으나 중량 감소율이 클수록 자실체 수확량이 높은 상관관계를 보였다. 생산량 측면을 고려할 때, 3개 균주 NIFoS 50 (446 g), NIFoS 53 (421 g), NIFoS 952 (435 g)은 육종 소재로 활용 가능하였고, 형태적인 면을 고려할 때 NIFoS 667 균주가 우수하였으며, NIFoS 670 균주는 자실체의 갓이 황갈색인 특징을 보였다.

Adipic acid 저항성 변이주 Leuconostoc paramesenteroides의 내산성 특성 (Properties of Acid Tolerance of the Adipic acid-resistant Mutant of Leuconostoc paramesenteroides)

  • 이중근;이홍석;김영찬;주현규;이시경;강상모
    • 한국식품과학회지
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    • 제32권2호
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    • pp.431-438
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    • 2000
  • Adipic acid에 대해 저항성을 갖도록 변이된 Leuconostoc paramesenteroides (ANaP100) 균주의 내산성 특성을 조사하기 위하여 수소이온 투과도, $H^+-ATPase$ 활성, $Mg^{++}$ 해리도, 원형질막의 지방산 조성을 지표로 삼아 야생균주(LPw)와 비교하였다. 수소이온 투과도의 경우 pH 5에서 $t_{1/2}$ 값이 LPw는 4.3분, ANaP100은 4.8분으로서 변이균주가 다소 내산성이 높았으며 $H^+-ATPase$ 활성은 maximal activity가 Leu. paramesenteroides는 모두 pH 6.0에서 가장 높았고 LPw는 0.59 unit/mg protein, 변이균주는 0.63 unit/mg protein으로서 ANaP100이 LPw보다 활성이 높았다. 세포막의 산 손상(acid damage)에 의한 $Mg^{++}$ 해리도에서도 pH 4.0에서 2시간 경과 후 LPw는 52.2%, ANaP100은 27.3%로서 LPw에 비해 약 1/2가량 $Mg^{++}$이 적게 유출되어 산에 의한 세포막의 손상이 적었다. 원형질막의 지방산 조성은 ANaP100가 $C_{18:1}$은 감소하고, $C_{19:0,\;cyclo}$는 증가하여 내산성이 증대되었으며 또한 adipic acid 첨가시에도 LPw에 비해 우수한 증식을 보였다. 따라서 ANaP100이 LPw에 비해 내산성이 증가되었으며 adipic acid 저항성도 함유하는 것이 확인되었다.

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누룩으로부터 분리한 Wild Type 효모의 청주(淸酒)제조 가능성에 관한 연구 (Feasibility of Cheonghju Brewing with Wild Type Yeast Strains from Nuruks)

  • 김혜련;백승희;서민재;안병학
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제34권3호
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    • pp.244-249
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    • 2006
  • 누룩으로부터 분리한 야생효모 10균주의 청주제조 가능성을 위해 발효에 관여하는 몇 가지 특성을 조사한 후 신속간이 동정하였다. 전국에서 수집한 300여 점의 누룩으로부터 알코올 발효성이 뛰어난 야생효모 10균주를 선별하였으며 알코올 내성, 내당성 및 침강성을 조사한 후 발효물을 제조하여 알코올 함량, 당도, pH, 유기산 및 휘발성 향기성분을 조사하였고 선별된 10균주를 Biolog를 이용하여 신속간이 동정하였다. 알코올 내성은 ethanol 함량 18%까지는 모두 활성을 보였으나 20%이상에서는 효모 54-3, 90-2 그리고 91-5만이 활성을 나타냈으며 내당성은 모두 우수하였고 침강성은 효모 90-2가 83.03%로 매우 좋게 나타났다. 야생효모를 이용하여 발효물을 제조한 후의 알코올 함량은 대조군 7.42%보다 높게 나타난 것이 3 균주였으며 유기산은 효모 272-7이 대조군과 거의 같은 함량을 보였고 acetic acid 함량이 적은 균주는 total acid 함량 또한 적게 나타났다. 발효물에서의 휘발성 향기성분은 alcohol류가 4종, ester류가 11종 그리고 acid류가 1종 확인되었다. Higher alcohol과 휘발성분의 대부분을 차지한 ester류는 대조군이 월등히 높았고 효모 54-3과 91-2에서 대조군 면적비율의 중간 이상으로 나타났다. BIOLOG로 신속 간이 동정한 결과 효모 54-3 외 6 균주가 S. cerevisiae, 효모 192-2와 271-4는 Z. cidri 그리고 효모 91-5는 P. sydowiorum으로 동정되었다.