• 제목/요약/키워드: Venturia nashicola

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Whole Genome Enabled Phylogenetic and Secretome Analyses of Two Venturia nashicola Isolates

  • Prokchorchik, Maxim;Won, Kyungho;Lee, Yoonyoung;Segonzac, Cecile;Sohn, Kee Hoon
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제36권1호
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    • pp.98-105
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    • 2020
  • Venturia nashicola is a fungal pathogen causing scab disease in Asian pears. It is particularly important in the Northeast Asia region where Asian pears are intensively grown. Venturia nashicola causes disease in Asian pear but not in European pear. Due to the highly restricted host range of Venturia nashicola, it is hypothesized that the small secreted proteins deployed by the pathogen are responsible for the host determination. Here we report the whole genome based phylogenetic analysis and predicted secretomes for V. nashicola isolates. We believe that our data will provide a valuable information for further validation and functional characterization of host determinants in V. nashicola.

Specific and Sensitive Detection of the Pear Scab Fungus Venturia nashicola by SYBR Green Real-Time PCR

  • Yun, Yeo Hong;Yoon, Seong Kwon;Jung, Jae Sung;Kim, Seong Hwan
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제25권11호
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    • pp.1782-1786
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    • 2015
  • A new improved PCR method has been developed for the rapid, reliable, and sensitive detection of Venturia nashicola, a destructive pathogen of scab disease in Japanese pear. The translation elongation factor-1 alpha gene-derived PCR primers specifically amplified a 257-bp-sized DNA band of the target gene from the genomic DNA of V. nashicola. No amplicon was produced from the genomic DNA of other Venturia spp. and reference fungal species tested. With the high detection limit of 10 fg DNA content, our real-time method could be used for the quarantine inspection and field monitoring of V. nashicola.

배 검은별무늬병균(Venturia nashicola) 감염특성과 방제기술 (Characteristics and Control of Pear Scab (Venturia nashicola): A Review)

  • 최으뜸;송장훈;서호진
    • 식물병연구
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    • 제29권2호
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    • pp.101-107
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    • 2023
  • 배 검은별무늬병을 일으키는 원인 병원균은 Venturia nashicola는 국내를 포함한 일본, 중국, 대만에서 가장 문제가 되는 대표적인 병이다. 이 병을 관리하기 위해서는 주로 화학적 방제에 의존하는 방식으로 관리가 되고 있었다. 하지만 지속인 화학적방제는 환경오염뿐만 아니라 병원균의 저항성 출현을 야기하여 보다 지속 가능한 관리방안이 필요한 시점이다. 이에 V. nashicola의 생환 및 감염 특성을 이해하고 과거부터 이어져온 달력형 방제나 특정 계통의 살균제 연용에서보다 기상환경조건에 따라 능동적인 방제시기 설정이 필요한 상황이다. 이 논문에서는 배 검은별무늬병인 V. nashicola의 병환, 감염특성 그리고 방제체계에 대한 내용을 정리하고 보다 효과적인 방제관리체계에 대한 방안을 논의하고자 다양한 연구결과들을 리뷰하였다.

신고배 개화기 NaDCC 처리에 의한 검은별무늬병의 방제 (Control Effect of Sodium Dichloroisocyanurate for Pear Scab (Venturia nashicola) on Niitaka Pear during Flowering Period)

  • 남기웅;한미경;윤덕훈
    • 한국유기농업학회지
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    • 제22권2호
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    • pp.347-357
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    • 2014
  • 본 연구는 배 개화기에 염소계 살균제인 NaDCC(sodium dichloroisocyanurate)의 사용에 따른 배검은별무늬병의 방제 가능성을 검토하기 위하여 수행하였다. 건전한 배나무에 배검은 별무늬병원균인 Venturia nashicola의 분생포자를 접종하고 NaDCC를 농도별로 살포한 결과, 무처리에서 51.6% 발생한 반면에 NaDCC 처리시 750mg/L에서는 23.8%, 1,000mg/L에서는 26.2%로 발병억제 효과가 있었다. 원황 등 6개 품종을 대상으로 만개기에 NaDCC를 살포하여도 배꽃의 화분발아에는 피해가 없었다. 신고 배 포장에서 개화초기와 만개기로 구분하여 NaDCC를 살포한 결과 개화초기에 NaDCC를 단독 살포 처리시 98% 이상의 높은 수정율을 나타내어 가장 효과적인 살포시기로 판단되었다. 또한 신고 배 재배포장에서 NaDCC를 배검은별무늬병 방제 적기에 4회를 살포한 결과 NaDCC 750mg/L 이상의 농도로 처리시 발병과율은 0%이었다.

Specific and Sensitive Detection of Venturia nashicola, the Scab Fungus of Asian Pears, by Nested PCR

  • Koh, Hyun Seok;Sohn, San Ho;Lee, Young Sun;Koh, Young Jin;Song, Jang Hoon;Jung, Jae Sung
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제29권4호
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    • pp.357-363
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    • 2013
  • The fungus Venturia nashicola is the causal agent of scab on Asian pears. For the rapid and reliable identification as well as sensitive detection of V. nashicola, a PCR-based technique was developed. DNA fingerprints of three closely related species, V. nashicola, V. pirina, and V. inaequalis, were obtained by random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis. Two RAPD markers specific to V. nashicola were identified by PCR, after which two pairs of sequence characterized amplified region (SCAR) primers were designed from the nucleotide sequences of the markers. The SCAR primer pairs, designated as D12F/D12R and E11F/E11R, amplified 535-bp and 525-bp DNA fragments, respectively, only from genomic DNA of V. nashicola. The specificity of the primer sets was tested on strains representing three species of Venturia and 20 fungal plant pathogens. The nested PCR primer pair specific to V. nashicola was developed based on the sequence of the species-specific 525-bp DNA fragment amplified by primer set E11F/E11R. The internal primer pair Na11F/Na11R amplified a 235-bp fragment from V. nashicola, but not from any other fungal species tested. The nested PCR assay was sensitive enough to detect the specific fragment in 50 fg of V. nashicola DNA.

Development of Carrot Medium Suitable for Conidia Production of Venturia nashicola

  • Choi, Eu Ddeum;Kim, Gyoung Hee;Lee, Young Sun;Jung, Jae Sung;Song, Jang Hoon;Koh, Young Jin
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제33권1호
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    • pp.75-79
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    • 2017
  • The causal fungus of pear scab, Venturia nashicola, grows slowly and rarely produces conidia on artificial media in the laboratory, but it produced conidia on the Cheongah medium containing Cheongah powder. V. nashicola grew too slow to produce conidia until 15 days after cultivation but produced conidia with $4{\time}10^4$ conidia/plate 30 days after cultivation on the Cheongah medium containing 1% Cheongah powder. V. nashicola showed a peak production of conidia with $4.5{\times}10^5$ conidia/plate 60 days after cultivation on the carrot medium containing 2% carrot powder, one of the constituents of Cheongah powder. The carrot medium is considered to be the best medium to obtain conidia of V. nashicola in the laboratory until now. This is the first report on the development of a suitable medium for conidia production of V. nashicola, as far as we know.

An Alternative Method to Evaluate Resistance to Pear Scab (Venturia nashicola)

  • Kyungho Won;Eu Ddeum Choi;Keumsun Kim;Hae Won Jung;Il Sheob Shin;Seongsig Hong;Cecile Segonzac;Young Jin Kim
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제39권2호
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    • pp.228-233
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    • 2023
  • Two pear cultivars with different degrees of resistance to Venturia nashicola were evaluated on the basis of a disease severity rating for pear scab resistance under controlled environmental condition. Two inoculation techniques were tested: the procedure for inoculation by dropping conidia suspension of V. nashicola; the procedure by deposition of agar plug on the abaxial surface of pear leaves. All tested cultivars resulted in blight symptoms on the inoculated leaves and became spread to uninoculated region or other leaves. Although both methods provide satisfactory infection of V. nashicola on pear leaves, the mycelial plug method of inoculation was more reliable than the spray inoculation method for the evaluation of pear scab disease resistance. The incubation period of V. nashicola in the resistant pear cultivar, Greensis was longer than that in the susceptible cultivar, Hwasan.

배검은별무늬병균의 Scytalone Dehydratase 멜라닌유전자의 상동성 (Homology of Scytalone Dehydratase Melanin Gene in Venturia nashicola)

  • 윤여홍;윤성권;손승렬;김성환
    • 한국균학회지
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    • 제41권3호
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    • pp.200-204
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    • 2013
  • 일부 자낭균류는 Dihydroxynaphthalene(DHN) 멜라닌을 가지고 있다. 본 연구는 배에 검은별무늬병을 일으키는 V. nashicola 균이 어떠한 형태의 멜라닌을 가지고 있는지 확인하고자 DHN 멜라닌 합성유전자중의 하나인 scytalone dehydratase(SD) 유전자의 부분 염기서열을 국내 여러 지역과 일본에서 분리된 11개 균주로부터 분석하였다. PCR 방법을 사용하여 429 bp 크기의 반응산물을 11개 균주 모두로부터 증폭하였고 염기서열을 분석하였다. 증폭된 PCR 산물은 GenBank database에 비교 탐색한 결과 SD 유전자로 판정되었다. 분석된 11개 균주의 SD 유전자에는 모두 1개의 인트론과 122개 아미노산을 코딩하는 2개의 엑손이 존재하였다. 이들 11개 SD 유전자 간에 염기서열은 100% 상동성을 보였다. 결정된 V. nashicola SD 유전자의 아미노산 서열의 유사도는 다른 곰팡이와 비교할 때 69~73%로 수준이었다. 본 연구 결과는 V. nashicola 균이 DHN 멜라닌 생합성 단계를 운영하고 있음을 입증하였다.

Genetic Diversity of the Pear Scab Fungus Venturia nashicola in Korea

  • Choi, Eu Ddeum;Kim, Gyoung Hee;Park, Sook-Young;Song, Jang Hoon;Lee, Young Sun;Jung, Jae Sung;Koh, Young Jin
    • Mycobiology
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    • 제47권1호
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    • pp.76-86
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    • 2019
  • Scab disease caused by Venturia nashicola is of agroeconomic importance in cultivation of Asian pear. However, little is known about the degree of genetic diversity in the populations of this pathogen. In this study, we collected 55 isolates from pear scab lesions in 13 major cultivation areas in Korea and examined the diversity using sequences of internal transcribed spacer (ITS) region, ${\beta}$-tubulin (TUB2), and translation elongation factor-$1{\alpha}$ ($TEF-1{\alpha}$) genes as molecular markers. Despite a low level of overall sequence variation, we found three distinctive subgroups from phylogenetic analysis of combined ITS, TUB2, and $TEF-1{\alpha}$ sequences. Among the three subgroups, subgroup 1 (60% of isolates collected) was predominant compared to subgroup 2 (23.6%) or subgroup 3 (16.4%) and was distributed throughout Korea. To understand the genetic diversity among the subgroups, RAPD analysis was performed. The isolates yielded highly diverse amplicon patterns and none of the defined subgroups within the dendrogram were supported by bootstrap values greater than 30%. Moreover, there is no significant correlation between the geographical distribution and the subgroups defined by molecular phylogeny. Our data suggest a low level of genetic diversification among the populations of V. nashicola in Korea.

Benzimidazole계 살균제에 대한 배 검은별무늬병균 Venturia nashicola 의 저항성과 β-Tubulin 유전자 돌연변이와의 관계 (Relationship of Resistance to Benzimidazole Fungicides with Mutation of β-Tubulin Gene in Venturia nashicola)

  • 곽연수;민지영;송장훈;김명수;이한찬;김흥태
    • 식물병연구
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    • 제23권2호
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    • pp.150-158
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    • 2017
  • Benzimidazole계 살균제 저항성을 모니터링하면서, 저항성과 ${\beta}$-tubulin 유전자의 198번째 코돈의 돌연변이와의 관계를 조사하였다. Venturia nashicola의 benzimidazole계 살균제에 대한 반응은 $0.16{\mu}g/ml$ carbendazim 배지에서 전혀 생장하지 못하는 감수성과 $4.0{\mu}g/ml$ 배지에서 생장이 안 되는 저저항성, $100{\mu}g/ml$에서조차 생장이 가능한 고저항성으로 구분할 수 있었다. 국내 3개 지역의 과원에서 채집한 30균주의 V. nashicola는 carbendazim에 대해서 모두 고저항성이었다. V. nashicola의 ${\beta}$-tubulin 유전자의 염기서열을 분석한 결과 저저항성 균주에서는 감수성 균주와 염기서열에 차이가 없었지만, 고저항성 균주는 GAG인 glutamic acid가 GCG인 alanine으로 치환되어 있었다. 옥천의 과원에서 분리한 10균주 중에서 5균주는 GGG인 glycine으로 치환되어 있었다. 특히 glycine으로 치환될 경우 carbendazim에 대해서 저항성이 되면서 carbendazim과 diethofencarb 혼합제에 대해서는 감수성이 더 커졌다. 결국 ${\beta}$-tubulin의 198번째 코돈의 돌연변이 E198A와 E198G는 V. nashicola가 benzimidazole계 살균제에 대해서 저항성이 되는 중요한 기작임을 알 수 있었다.