The promoter of the HSV-1 VP16 gene contains binding sites for the cellular transcription factors such as USF, CTF, and Sp1, each of which affects basal level expression of the VP16 gene. Transcription of the VP16 gene was induced by viral immediate-early proteins, ICP0 and ICP4, in a synergistic manner but repressed by ICP22. To gain further insight into the role of ICP0 in the expression of the VP16 gene during virus infection, several mutants with deletions in each of their transcriptional regulatory elements were generated. According to transient gene expression assays of these mutants using the CAT gene as a reporter, the USF and CTF binding sites were necessary for efficient induction of the promoter in the presence of transfected ICP0 or during virus infection, whereas the Sp1 binding site had little effect on ICP0-mediated VP16 expression. These results indicate that the immediate early proteins of HSV-1 regulate expression of the VP16 gene during virus infection by modulating the activities of cellular transcription factors such as USF and CTF.
To elucidate of role(s) of tTA as a repressor in the tTA-mediated gene repression system, we introduced mutations into the acidic domain of VP16 and examined the effects of such various mutations. In the transient repression experiment, a region containing 34 amino acids of the activation domain of VP16 (412-456) which interacts with TFIIB was found to be necessary and sufficient for the tTA-mediated repression of gene expression. However, in the experiment to investigate the fact that tTA-regulated repression is related to the activation function of VP16, we found that the repression abilities of tTA derivatives did not correlate exactly with their activation abilities. Therefore, we conclude that increased mass of VP16 in tTA might be also important for efficient repression in addition to functional domain of VP16.
Kim, Do-Hyoung;Lee, Si-Hyung;Nam, Ki-Hoon;Chi, Seung-Wook;Chang, Ik-Soo;Han, Kyou-Hoon
BMB Reports
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제42권7호
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pp.411-417
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2009
Transcriptional activation domain (TAD) in virion protein 16 (VP16) of herpes simplex virus does not have any globular structure, yet exhibits a potent transcriptional activity. In order to probe the structural basis for the transcriptional activity of VP16 TAD, we have used NMR spectroscopy to investigate its detailed structural features. Results show that an unbound VP16 TAD is not merely "unstructured" but contains four short motifs (residues 424-433, 442-446, 465-467 and 472-479) with transient structural order. Pre-structured motifs in other intrinsically unfolded proteins (IUPs) were shown to be critically involved in target protein binding. The 472-479 motif was previously shown to bind to $hTAF_{II}31$, whereas the $hTAF_{II}31$-binding ability of other motifs found in this study has not been addressed. The VP16 TAD represents another IUP whose pre-structured motifs mediate promiscuous binding to various target proteins.
Ryu, Chun-Jeih;Whitehurst, Charles E.;Chen, Jianzhu
BMB Reports
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제41권8호
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pp.575-580
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2008
Thymocyte-specific transcriptional regulatory systems can be used to better understand the relationship between transcription and V(D)J recombination during early T cell development. In this study, we generated transgenic mice expressing the transactivator Gal4-VP16 or the Gal4 DNA binding domain (Gal4-DBD) under the control of the lck proximal promoter, which is only active in immature thymocytes. From these studies Gal4-VP16 and Gal4-DBD expression was shown to significantly alter thymic cellularity and differentiation without significantly changing the $CD3^+$ thymocyte distribution. Furthermore, the presence of Gal4-VP16 or Gal4-DBD in the transgenic thymocytes retarded the mobility of the Gal4 DNA binding motif as determined by a gel mobility shift assay, suggesting that the developmental alteration did not affect the functional property of the transgenic proteins. These results indicated that lck promoter-driven Gal4-VP16 or Gal4-DBD expression did not affect $CD3^+$ mature thymocytes, thus this system can be applied to study transcriptional regulation of transresponder genes in bigenic mouse model thymocytes.
본 논문에서는 HEVC와 VP9 겸용의 통합 역변환기를 설계하였다. 제안하는 아키텍처는 $4{\times}4$부터 $32{\times}32$ 크기의 HEVC IDCT, $4{\times}4$ 크기의 HEVC IDST, $4{\times}4$부터 $32{\times}32$ 크기의 VP9 IDCT, $4{\times}4$부터 $16{\times}16$ 크기의 VP9 IADST, $4{\times}4$ 크기의 IWHT까지 모든 모드의 계수 변환을 통합 역변환기에서 처리가 가능하다. HEVC와 VP9의 IDCT는 계수의 스케일만 다를 뿐 동일한 연산을 사용하며, HEVC의 $4{\times}4$ IDST와 VP9 $4{\times}4$ IADST 또한 계수의 스케일만 다를 뿐 동일한 연산을 사용한다. 더욱이 HEVC IDCT, VP9 IDCT, VP9 IADST 또한 상위 수준 IDCT의 서브셋이다. 제안하는 아키텍처는 연산이 같은 경우 곱셈기를 재사용하고 계수가 다를 경우에도 덧셈기 및 버터플라이 구조등을 최대한 공유함으로써 하드웨어의 크기를 크게 줄였다. 0.18 um 공정에서 합성했을 때 게이트 수가 456,442 게이트로 기존 아키텍처 대비 22.6% 감소하였다.
The estrogen receptor (ER) is activated and degraded by estrogen. We have examined ER downregulation and activation under hypoxia mimetic conditions. Cobalt chloride induced ER downregulation at 24 h of treatment. This degradation involved hypoxia-inducible factor-1$\alpha$ (HIF-1$\alpha$) as examined by using a constitutively active form of HIF-1$\alpha$, HIF-1$\alpha$/VP16, constructed by replacing the transactivation domain of HIF-1$\alpha$ with that of VP16. Western blot analysis revealed that E2-induced ER downregulation was observed within ${\~}6h$, whereas HIF-1$\alpha$/VP16-induced ER degradation was observed within 12${\~}$20h. HIF-1$\alpha$/VP16 activated the transcription of estrogen-responsive reporter gene in the absence of estrogen. These results suggest that ER downregulation and activation under hypoxia maybe mediated in part by a HIP-1$\alpha$ expression.
저 선량 흉부 전산화단층촬영(low dose computed tomography; LDCT)검사 시 기존의 검사방법인 필터보정역투영법인 FBP(filted back projection)와 적응식 통계적 반복 재구성법인 ASIR(adaptive statistical iterative reconstruction)의 적용 및 관전압 변화에 따른 영상의 화질과 피폭선량을 비교 평가해 보고자 하였다. 흉부 phantom을 이용하여 재구성방법에 따라 FBP와 ASIR적용(10%, 20%)을 하였고, 관전압(100kVp, 120kVp)에 변화를 주어 실험을 하였다. 화질평가를 위해 back-ground noise와 signal-noise ratio(SNR), contrast-noise ratio(CNR)를 구하였으며, 선량평가를 위해 CTDIvol과 DLP를 구하였다. 화질평가에 있어 kVp에 따른 ascending aorta(AA) SNR과 inpraspinatus muscle(IM) SNR은 AA SNR과 IM SNR은 유의한 차이가 있었다(p < 0.05). 선량평가에 있어 CTDIvol과 DLP는 유의한 차이가 있었으며(p < 0.05), CTDIvol은 120 kVp, FBP가 2.6 mGy, 120 kVp, 10%-ASIR가 2.38 mGy, 120kVp, 20%-ASIR가 2.17 mGy로 0.43 mGy 감소하였고, 100 kVp, FBP가 1.61 mGy, 100 kVp, 10%-ASIR가 1.48 mGy, 100 kVp, 20%-ASIR가 1.34 mGy로 0.27 mGy 감소하였다. 또한 DLP에서는 120 kVp, FBP가 $103.21mGy{\cdot}cm$, 120 kVp, 10%-ASIR가 $94.57mGy{\cdot}cm$, 120 kVp, 20%-ASIR가 $85.94mGy{\cdot}cm$로 $17.27mGy{\cdot}cm$(16.7%) 감소하였고, 100 kVp, FBP가 $63.87mGy{\cdot}cm$, 100 kVp, 10%-ASIR가 $58.54mGy{\cdot}cm$, 100 kVp, 20%-ASIR가 $53.25mGy{\cdot}cm$로 $10.62mGy{\cdot}cm$(16.7%)로 감소하였다. 재구성방법에 따른 FBP와 ASIR 10%, 20%에서는 화질의 변화 없이 선량을 줄일 수 있어 흉부 low dose CT검사 시 ASIR 20%적용하여 검사하는 것이 좋으며, 관전압 변화에 따른 120 kVp와 100 kVp에서는 선량은 크게 줄어들었지만, noise가 증가하여 화질이 떨어지는 것으로 나타났다.
능동형 전자식 개인피폭선량는 개인의 피폭 선량을 실시간으로 확인할 수 있는 장점을 가진 보조선량계이다. 하지만 국내에 사용되고 있는 다수의 능동형 개인피폭 선량계는 의료기관에서 사용하는 진단방사선 영역에서 큰 오차와 낮은 응답성을 가진다. 이에 본 연구에서는 Si 포토다이오드 검출기를 사용하는 능동형 전자식 개인선량계에서 저에너지 영역의 응답특성을 향상시키기 위한 에너지 보상 두께를 평가하였다. 40 kVp에서 80 kVp 영역에서는 Al 0.2 mm + Sn 1.0 mm 필터에서 우수한 응답특성을 보였고 80 kVp에서 120 kVp 영역에서는 Al 0.2 mm + Sn 1.6 mm 필터에서 우수한 응답특성을 보였다.
본 연구는 척추경 나사못(Pedicle screw)을 돼지 흉추에 삽입하여 일반적인 CT검사(Non MAR)와 인공물을 줄이기 위한 금속성 인공물 감소기법(Metallic Artifact Reduction for Orthopedic Implants, O-MAR)으로 얻어진 흉추 Axial영상을 4개의 알고리즘(Standard, Soft, Bone, Detail)에 재구성하였다. 이에 얻은 영상을 image J 프로그램을 이용하여 신호대잡음비(Signal Noise Ratio, SNR)와 대조도대잡음비(Contrast to Noise Ratio, CNR)를 주어진 식에 의거하여 측정값을 구하고 흉추 척추경 나사못 삽입술 CT검사에 맞는 관전압과 알고리즘을 알아보고자 하였다. 결과적으로 Non MAR 사용한 경우에는 80, 100, 120, 140 kVp에서 soft 알고리즘이 SNR, CNR이 가장 높게 나타났다. 반면에 MAR를 사용한 경우 80 kVp에서는 Standard 알고리즘이 가장 높게 나타났고 100 kVp에서는 Standard, Soft 알고리즘이 비슷한 값으로 높게 나타났다. 120 kVp에서는 Soft, Standard 알고리즘이 비슷한 값으로 나타났고 140 kVp에서는 Soft 알고리즘에서 SNR, CNR이 가장 높게 나타났다. 따라서 Non MAR와 MAR를 비교했을 경우 MAR를 사용한다고 하더라도 관전압 변화에 따라 모든 알고리즘에서 SNR과 CNR이 증가하는 것은 아니었다. 본 연구는 이후 척추경 나사못 CT검사 영상 평가에 도움이 되는 기초자료로써 선택적인 관전압과 알고리즘 사용으로 영상의 질을 더 높일 수 있는 계기가 될 것으로 사료된다.
본 연구는 흉부 방사선검사 시 AEC의 잘못된 사용으로 환자에게 가해지는 피폭선량 및 영상판독의 문제점을 개선하고자 연구를 진행하였다. 검사조건으로 AEC를 이용한 경우와 AEC를 사용하지 않은 경우로 구분하여 영상을 획득 하였으며 0.6 mAs를 고정시키고 110, 100, 90, 80 kVp의 조건으로 촬영하였다. 연구 결과 without AEC 110 kVp가 with AEC보다 선량은 1.17% 감소하였고 100 kVp에서는 17.2% 감소, 90 kVp에서는 30.19% 감소, 80 kVp에서는 46.45% 감소하였다. 폐와 기관, 심장에서 SNR의 평균값의 차이는 with AEC와 without AEC 110 kVp에서 관전압 변화에 따른 통계적인 수치에서는 유의한 차이가 있었으나 실제영상에서 화질의 차이는 미비하였다. 동일한 관전압에서 AEC를 적용하지 않은 경우 특히 without AEC 100kVp에서는 with AEC와 유사한 화질을 유지하면서 선량을 17.2% 감소시킬 수 있었다. 그러므로 흉부 방사선 검사 시 AEC 조건에 의존하기보다 적절한 관전압 선택으로 선량을 낮추면서 검사하는데 조건을 고려해 보아야 할 것으로 사료된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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