• 한국식품영양학회지
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• 제22권1호
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• pp.103-109
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• 2009

현재까지 미생물에 의해 생산되는 10,000여 종의 항생물질 가운데 약 2/3 에 해당하는 64% 정도가 방선균으로부터 발견되었다. 따라서 토양 중에 널리 분포하고 있는 방선균을 분리하여 광범위 항생물질 생산능이 가강 우수한 Y-88을 최종 선정하였다. 이 균을 형태학적, 생리상 및 배양학적으로 동정한 결과 Streptomyces 속으로 밝혀져 Streptomyces sp. Y-88 이라 명명하였다. Y-88로부터 항생물질 생산 최적 배양조건을 검토한 결과 soluble starch 1.6%, glucose 1.6%, beef extract 0.6%, $K_2HPO_4$, $MgSO_4$ $7H_2O$ 및 $ZnSO_4$ $7H_2O$가 각각 0.01%였으며, 최적 pH4.0, 배양온도 25$^{\circ}C$ 그리고 배양시간으로 위의 조건에 30시간에서 항생물질 생산이 빠른 것으로 나타났다.

• 한국해양학회지:바다
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• 제3권2호
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• pp.90-93
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• 1998

국내 남해안의 적조발생지역에서 채집한 Prorocentrum minimum, P. micans, P. triestinum, P. balticum, Gymnodinium sanguineum, Alexandrium catenella, Scrippsiella trochoidea, Heterosigma akashiwo를 순수배양하고 이로부터 PCR을 이용해 약 700 bp에 해당되는 24S rRNA 유전자의 D1과 D2 변이부위를 증폭하고 클로닝한 후 염기서열을 분석하였다. 분석된 염기서열들을 이미 밝혀진 적조원인종들의 것과 ClustalW 프로그램을 사용하여 배열하고 계통수를 구성한 결과 Prorocentrum과 Alexandrium 속의 것들은 형태적인 분류결과와 종수준까지 거의 일치함을 보여주었다. 이러한 연구결과는 그 24S rRNA 유전자의 염기서열분석이 국내에서 발생하는 적조원인종들에 대한 종 수준에서의 신속한 확인에 이용될 수 있음을 제시한다.

• 보존과학회지
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• 제33권1호
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• pp.17-24
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• 2017

국립중앙박물관 소장품인 조선왕조실록상자(고적 25247)에 사용된 목재의 수종식별과 칠층의 특징을 관찰하고, 보존처리 과정 및 결과를 소개 위하여 본 연구를 실시하였다. 조사결과 실록상자의 제작에는 피나무과의 피나무속(Tilia spp.)의 목재가 사용되었다. 표면의 칠기법은 목재 위에 골회를 칠하고 닥나무속(Broussonetia spp.) 인피섬유로 제작한 한지를 덧바른 뒤 다시 토회칠, 흑칠, 정제옻칠, 흑칠 순서로 제작하였다. 보존처리 전 실록상자의 상태는 짜임이 벌어지고, 칠이 벗겨져 있었으며 장석이나 족대 등 일부 부재가 사라진 상태이었다. 이러한 손상부위는 아교 및 토회로 강화처리하여 안정적인 상태가 되도록 수리하였고, 결실부는 수종분석 결과와 남아있는 부재의 형태를 바탕으로 최대한 원형에 가깝게 복원하였다. 이를 통해 실록상자의 기초적인 제작방법을 파악할 수 있었다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제31권4호
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• pp.371-378
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• 2015

Surveys of yellowing viruses in plastic tunnels and in open field crops of melon (Cucumis melo cultivar catalupo), oriental melon (C. melo cultivar oriental melon), and cucumber (C. sativus) were carried out in two melon-growing areas in 2014, Korea. Severe yellowing symptoms on older leaves of melon and chlorotic spots on younger leaves of melon were observed in the plastic tunnels. The symptoms were widespread and included initial chlorotic lesions followed by yellowing of whole leaves and thickening of older leaves. RT-PCR analysis using total RNA extracted from diseased leaves did not show any synthesized products for four cucurbit-infecting viruses; Beet pseudo-yellows virus, Cucumber mosaic virus, Cucurbit yellows stunting disorder virus, and Melon necrotic spot virus. Virus identification using RT-PCR showed Cucurbit aphid-borne yellows Virus (CABYV) was largely distributed in melon, oriental melon and cucumber. This result was verified by aphid (Aphis gossypii) transmission of CABYV. The complete coat protein (CP) gene amplified from melon was cloned and sequenced. The CP gene nucleotide and the deduced amino acid sequence comparisons as well as phylogenetic tree analysis of CABYV CPs showed that the CABYV isolates were undivided into subgroups. Although the low incidence of CABYV in infections to cucurbit crops in this survey, CABYV may become an important treat for cucurbit crops in many different regions in Korea, suggesting that CABYV should be taken into account in disease control of cucurbit crops in Korea.

• 한국균학회지
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• 제49권4호
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• pp.531-537
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• 2021

때죽나무는 때죽나무과에 속하는 낙엽 소교목으로 우리나라와 중국, 일본, 대만이 원산이나 캐나다, 미국, 영국 등에도 도입되어 분포하고 있다. 1990년 이후 전국에 분포하는 때죽나무에서 녹병균이 지속적으로 발견되었다. 한국의 때죽나무 녹병균의 형태적 특성은 일본의 쪽동백나무에서 보고된 Pucciniastrum styracinum의 형태적 특성과 가장 유사하였으며 internal transcribed spacer (ITS) 및 28S large subunit (LSU) rDNA의 염기서열의 분자계통학적 분석을 통해 동정을 확인하였다. 본 연구에서는 한국의 때죽나무에서 발견한 녹병균 P. styracinum의 존재를 재확인하였고, 균학적 특성과 형태적 측정치 및 분자적 특성에 대한 정보를 제공하였다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제49권4호
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• pp.271-291
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• 2022

Pectin methylesterase (PME) plays an important role in vegetative and reproductive development and biotic/abiotic stress responses by regulating the degree of methyl-esterification of pectic polysaccharides in the plant cell wall. PMEs are encoded by a large multigene family in higher land plant genomes. In general, the expression of plant PME genes shows tissue- or cell-specific patterns and is induced by endogenous and exogenous stimuli. In this study, we identified PME multigene family members (CsPMEs) from the sweet orange genome and report detailed molecular characterization and expression profiling in different citrus tissues and two fruit developmental stages. We also discussed the possible functional roles of some CsPME genes by comparing them with the known functions of PMEs from other plant species. We identified 48 CsPME genes from the citrus genome. A phylogenetic tree analysis revealed that the identified CsPMEs were divided into two groups/types. Some CsPMEs showed very close phylogenetic relationships with the PMEs whose functions were formerly addressed in Arabidopsis, tomato, and maize. Expression profiling showed that some CsPME genes are highly or specifically expressed in the leaf, root, flower, or fruit. Based on the phylogenetic relationships and gene expression profiling results, we suggest that some CsPMEs could play functional roles in pollen development, pollen tube growth, cross incompatibility, root development, embryo/seed development, stomata movement, and biotic/abiotic stress responses. Our results shed light on the biological roles of individual CsPME isoforms and contribute to the search for genetic variations in citrus genetic resources.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제45권2호
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• pp.168-177
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• 2017

Strain A28-5는대한민국 제주도 연안의 해수샘플로부터 고체배지내 xylan과 agar를 분해하는 균주로 분리되었다. Strain A28-5는그람 음성균으로 한 개의 polar flagella로 운동성을 갖는 $Na^+$ 이온 요구성 균주로 분석되었다. 또한 ampilcillin과 thiostreptone 등의 항생제에 내성을 보였다. Genome 내 G+C content는 43.96%이고, Menaquinone-7 (MK-7)을 predominant quinone으로 함유하고 있었다. Strain A28-5의 세포벽을 구성하는 주요 지방산은 $C_{16:1}$ ${\omega}7c/iso-C_{15:0}$ 2-OH (23.32%), $C_{16:0}$ (21.83%), $C_{18:1}$ ${\omega}7c$ (17.98%)였다. strain A28-5의 16S rRNA gene sequence는 Catenovulum agarivorans YM01와 가장 높은 상동성(98.94%)을 보였으며, Neighbor-Joining phylogenetic tree 제작을 통해서 Catenovulum agarivorans YM01와 가장 높은 근연관계를 보이는 것을 증명하였다. Catenovulum agarivorans YM01과의 DNA-DNA hybridization 분석을 통하여 A28-5을 Catenovulum 속의 신종으로 분류하여Catenovulum jejuensis A28-5로 명명하였다. 이 균주의 액체배양으로부터 준비된 두 종류의 조효소를 이용한 xylan 또는 agarose와의 효소반응액을 Thin layer chromatography로 분석하여 각각 tetramer와 hexamer의 xylooligosaccharides와 (neo)agarooligosacchardes가 생산되는 것을 확인하였다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제45권1호
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• pp.43-50
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• 2017

본 연구로부터 WJ-1 균주는 제주도에서 수집된 토양샘플로부터 동정되었는데, 형태분화관찰 및 16S rRNA 유전자 염기서열분석과 DNA-DNA hybridization 분석을 통하여 S. glaucescens의 신아종으로 분류되었다. 균주 WJ-1의 주요 cellular fatty acid와 게놈내 G+C 농도는 각각 $C_{15:0}$ anteiso (42.99%)와 74.73 mol%였다. 이 균은 배양액으로부터 준비된 조효소액의 xylanase 활성은 중성 pH 조건 및 $55^{\circ}C$에서 활성이 가장 높았다. S. glaucescens의 조효소액을 이용하여 xylan으로부터 xylotriose 및 xylotetraose를 포함하는 xylooligosaccharide를 제조할 수 있다. 본 연구는 S. glaucescens의 아종에 관한 최초의 보고이며, 관련 종에서 xylanase 활성에 관한 최초의 보고이다. 본 연구 결과로부터, WJ-1 균주는 lignocellulosic biomass의 이용 및 기능성 xylooligosacchade 생산에 유용하게 활용될 수 있을 것으로 기대된다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제56권4호
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• pp.379-383
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• 2018

The present study was performed with morphological and molecular analysis (cox1 and nad1 mitochondrial genes) to identify the proglottids of spirometrid tapeworm found in the stool of an African lion, Panthera leo, in the Serengeti plain of Tanzania. A strand of tapeworm strobila, about 75 cm in length, was obtained in the stool of a male African lion in the Serengeti National Park ($34^{\circ}$ 50' E, $02^{\circ}$ 30' S), Tanzania, in February 2012. The morphological features of the adult worm examined exhibited 3 uterine coils with a bow tie appearance and adopted a diagonal direction in the second turn. The posterior uterine coils are larger than terminal uterine ball and the feature of uteri are swirling rather than spirally coiling. The sequence difference between the Spirometra species (Tanzania origin) and S. erinaceieuropaei (GenBank no. KJ599680) was 9.4% while those of S. decipiens (GenBank no. KJ599679) differed by 2.1% in the cox1 and nad1 genes. Phylogenetic tree topologies generated using the 2 analytic methods were identical and presented high level of confidence values for the 3 major branches of the 3 Spirometra species in the cox1 gene. The morphological and molecular findings obtained in this study were nearly coincided with those of S. ranarum. Therefore, we can know for the first time that the African lion, Panthera leo, is to the definitive host of this tapeworm.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제30권7호
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• pp.912-919
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• 2017

Objective: Identification of the candidate genes that play key roles in phenotypic variations can provide new information about evolution and positive selection. Interleukin (IL)-32 is involved in many biological processes, however, its role for the immune response against various diseases in mammals is poorly understood. Therefore, the current investigation was performed for the better understanding of the molecular evolution and the positive selection of single nucleotide polymorphisms in IL-32 gene. Methods: By using fixation index ($F_{ST}$) based method, IL-32 (9375) gene was found to be outlier and under significant positive selection with the provisional combined allocation of mean heterozygosity and $F_{ST}$. Using nucleotide sequences of 11 mammalian species from National Center for Biotechnology Information database, the evolutionary selection of IL-32 gene was determined using Maximum likelihood model method, through four models (M1a, M2a, M7, and M8) in Codeml program of phylogenetic analysis by maximum liklihood. Results: IL-32 is detected under positive selection using the $F_{ST}$ simulations method. The phylogenetic tree revealed that goat IL-32 was in close resemblance with sheep IL-32. The coding nucleotide sequences were compared among 11 species and it was found that the goat IL-32 gene shared identity with sheep (96.54%), bison (91.97%), camel (58.39%), cat (56.59%), buffalo (56.50%), human (56.13%), dog (50.97%), horse (54.04%), and rabbit (53.41%) respectively. Conclusion: This study provides evidence for IL-32 gene as under significant positive selection in goat.