• 제목/요약/키워드: Stem rot disease

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Multiplex TaqMan qPCR Assay for Detection, Identification, and Quantification of Three Sclerotinia Species

  • Dong Jae Lee;Jin A Lee;Dae-Han Chae;Hwi-Seo Jang;Young-Joon Choi;Dalsoo Kim
    • Mycobiology
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    • 제50권5호
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    • pp.382-388
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    • 2022
  • White mold (or Sclerotinia stem rot), caused by Sclerotinia species, is a major air, soil, or seed-transmitted disease affecting numerous crops and wild plants. Microscopic or culture-based methods currently available for their detection and identification are time-consuming, laborious, and often erroneous. Therefore, we developed a multiplex quantitative PCR (qPCR) assay for the discrimination, detection, and quantification of DNA collected from each of the three economically relevant Sclerotinia species, namely, S. sclerotiorum, S. minor, and S. nivalis. TaqMan primer/probe combinations specific for each Sclerotinia species were designed based on the gene sequences encoding aspartyl protease. High specificity and sensitivity of each probe were confirmed for sclerotium and soil samples, as well as pure cultures, using simplex and multiplex qPCRs. This multiplex assay could be helpful in detecting and quantifying specific species of Sclerotinia, and therefore, may be valuable for disease diagnosis, forecasting, and management.

작약 비가림재배에 따른 병 발생 억제효과 및 생육 특성 (Effect of the Rain Shelter Cultivation on Disease Occurrence Inhibition and Growth in Peony(Paeonia lactiflora Pallas L.))

  • 김세종;박준홍;김정혜;박소득;최부술
    • 한국약용작물학회지
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    • 제9권2호
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    • pp.150-155
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    • 2001
  • 작약 비가림 재배시 생육 특성과 수량에 미치는 영향을 구명하기 위해 시험을 수행한 결과는 아래와 같다. 비가림 재배시 노지 재배에 비해 맹아기와 개화기가 각각 9일, 15일빨랐으며 경장, 경수 등도 더 크거나 많았다. 병발생은 녹병, 탄저병, 횐가루병, 뿌리썩음병은 비가림 재배가 노지 재배에 비해 현저히 감소 되었으나 점무늬병은 비슷하였다. 근장, 근수, 근경은 비가림 재배가 노지 재배에 비해 생육이 양호하였으며 뿌리 수량도 비가림 재배가 10a당 2,395kg으로서 노지 재배의 2,201kg, 1,892kg에 비해 27%, 9% 증수 되었다. 품질면에서 뿌리 색도는 비가림 재배가 노지 재배에 비해 더 양호하였으며 상품 수량도 향상되었다.

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Sclerotium rolfsii에 의한 할미꽃 흰비단병 (Sclerotium Rot of Pulsatilla koreana Nakai Caused by Sclerotium rolfsii)

  • 권진혁;황갑춘;이슬비;최용조;이상대;응웬레민
    • 식물병연구
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    • 제21권4호
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    • pp.334-336
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    • 2015
  • 2013년 7월 경상남도 진주시농업기술센터 양묘장 전시포에 재배중인 할미꽃에서 흰비단병 증상이 발생하였다. 병징은 할미꽃의 꽃줄기와 꽃자루 부분이 수침상으로 물러지면서 부패되어지고 서서히 시들면서 포기 전체가 말라 죽었다. 병반부와 토양 표면에 흰색의 곰팡이가 발생하며 갈색의 작은 둥근 균핵이 많이 형성되었다. 감자한천배지에서 균총은 흰색이고 배양 기간이 경과됨에 따라 갈색의 작은 둥근 균핵을 많이 형성하였다. 균핵의 크기는 1-3 mm이며 균사의 폭은 $4-9{\mu}m$였다. 균사생육과 균핵 형성 적온은 $30^{\circ}C$이었다. 균사특유의 clamp connection이 관찰되었다. 할미꽃에서 발생한 병징과 병원균의 균학적 특징, 그리고 ITS rDNA 염기서열 비교분석 결과, 이 병을 S. rolfsii Saccardo에 의한 할미꽃 흰비단병으로 명명하고자 제안한다.

Sclerotium rolfsii에 의한 동부 흰비단병 (Sclerotium Rot of Cowpea (Vigna sinensis King) Caused by Sclerotium rolfsii)

  • 권진혁;강동완;한인영;최용조;이상대;손대영
    • 한국균학회지
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    • 제44권1호
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    • pp.61-63
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    • 2016
  • 2015년 9월 경상남도농업기술원 시험연구 포장에서 재배 중인 동부에 흰비단병 증상이 발생하였다. 병징은 동부의 줄기 지제부위가 수침상으로 물러지고 부패되어 서서히 시들면서 포기 전체가 말라 죽었다. 줄기의 병반부와 토양표면에 흰색의 곰팡이가 발생하며 갈색의 둥글고 작은 균핵이 많이 형성되었다. 감자한천배지에서 균총은 흰색으로 잘 자라며 배양기간이 경과함에 따라 갈색의 둥글고 작은 균핵을 많이 형성하였다. 균핵의 크기는 1~3 mm이며 균사의 폭은 $4{\sim}9{\mu}m$였다. 균사생육과 균핵형성 적온은 $30^{\circ}C$이었다. 담자균 균사특유의 clamp connection이 관찰되었다. 동부에서 발생한 병징과 병원균의 균학적 특징, internal transcribed spacer rDNA 염기서열을 비교 분석한 결과를 토대로, 이 병을 Sclerotium rolfsii에 의한 동부 흰비단병으로 명명하고자 제안한다.

Sclerotium rolfsii에 의한 양파 흰비단병 (Sclerotium Rot of Onion Caused by Sclerotium rolfsii)

  • 권진혁;김희대;최옥희;곽연식;이용환;심홍식
    • 식물병연구
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    • 제17권2호
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    • pp.222-224
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    • 2011
  • 경남 창녕군 대합면 양파 재배농가 포장에서 Sclerotium rolfsii에 의한 양파 흰비단병 증상이 발생되었다. 병징은 인경과 줄기 및 잎이 수침상으로 물러지고 썩으면서 시들어 말라 죽고, 병반부와 지제부의 토양 표면에 흰색의 곰팡이가 발생하며 갈색의 작고 둥근 균핵을 형성하였다. 감자한천배지에서 균총은 흰색이며 배양기간이 경과됨에 따라 갈색의 작고 둥근 균핵을 많이 형성하였다. 균핵의 크기는 1-3 mm이며 균사의 폭은 4-9 ${\mu}m$였다. 균사생육과 균핵 형성 적온은 $30^{\circ}C$었다. 균사특유의 clamp connection이 관찰되었다. 양파에서 발생한 병징과 병원균의 균학적 특징, 그리고 ITS rDNA 염기서열 비교분석 결과, 이 병을 S. rolfsii에 의한 양파 흰비단병으로 명명하고자 제안한다.

Sclerotinia sclerotiorum에 의한 잠두 균핵병 (Sclerotinia Rot of Broad Bean (Vicia faba) Caused by Sclerotinia sclerotiorum)

  • 권진혁;배영석
    • 식물병연구
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    • 제13권2호
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    • pp.115-118
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    • 2007
  • 2004년부터 2006년까지 3년 동안 경남농업기술원 잠두재배포장에서 지제부위의 줄기와 꼬투리가 수침상으로 물러지고 썩으면서 그 부위에 흰색 곰팡이와 균핵이 생기고 시들어 죽는 증상이 발생하였다. 감자한천배지 상에서 균총은 흰색에서 연한 회색을 띄었다. 균핵은 구형, 타원형 또는 불규칙하며 검은색이었다. 자낭반은 컵모양이며 크기는 $5{\sim}10\;mm$이었으며 자낭은 원통형이고 크기는 $90{\sim}180{\times}12\;{\mu}m$이었다. 자낭포자는 타원형이며 무색으로 크기는 $8{\sim}12{\times}4{\sim}6\;{\mu}m$이었다. 균사생육 최적온도는 $25^{\circ}C$, 균핵형성 적온은 $20^{\circ}C$이었다. 이상과 같이 잠두에 발생한 병징, 병원균의 균학적 특징 및 병원성 검정 결과를 토대로 병원균을 Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) do Bary으로 동정하였으며, 이 병을 잠두 균핵병으로 명명할 것을 제안한다.

둥굴레에 흰비단병을 일으키는 Sclerotium rolfsii에 관하여 (Sclerotium rolfsii Causing Collar Rot on Doonggulle (Polygonatum odoratum var. pluriflorum))

  • 권진혁;강수웅;박창석
    • 한국균학회지
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    • 제28권2호
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    • pp.121-122
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    • 2000
  • 경상남도농업기술원 함양약초시험장 포장에 발생한 병든 둥굴레로부터 병원균을 분리하여 병원균의 특성과 병징을 토대로 Sclerotium rolfsii에 의한 둥굴레 흰비단병을 동정하였다. 이 병의 병징은 지제부가 암갈색으로 변하고 그 위에 흰색의 곰팡이가 솜털처럼 밀생하고, 병반부위에 갈색의 둥근 균핵을 많이 형성하며 지제부 부근의 토양 표면에도 형성되었다. 병원균은 PDA 배지 상에서 왕성하게 생장하였으며 균사생장 중에 특유의 Clamp connection이 관찰되었고 균사가 가장 잘 자랄수 있는 온도는 $30^{\circ}C$이였다. PDA 배지에서 시간이 경과되면 갈색을 띤 구형 또는 부정형의 많은 균핵을 형성하였는데 균핵의 크기는 $0.9{\sim}6.8{\times}0.6{\sim}5.2\;mm$ (평균 $2.7{\sim}2.3\;mm$) 이었다.

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Evaluation of Durum Wheat Genotypes for Resistance against Root Rot Disease Caused by Moroccan Fusarium culmorum Isolates

  • Bouarda, Jamila;Bassi, Filippo M.;Wallwork, Hugh;Benchacho, Mohammed;Labhilili, Mustapha;Maafa, Ilyass;El Aissami, Aicha;Bentata, Fatiha
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제38권1호
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    • pp.1-11
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    • 2022
  • Fusarium culmorum is one of the most important causal agents of root rot of wheat. In this study, 10 F. culmorum isolates were collected from farms located in five agro-ecological regions of Morocco. These were used to challenge 20 durum wheat genotypes via artificial inoculation of plant roots under controlled conditions. The isolate virulence was determined by three traits (roots browning index, stem browning index, and severity of root rot). An alpha-lattice design with three replicates was used, and the resulting ANOVA revealed a significant (P < 0.01) effect of isolate (I), genotype (G), and G × I interaction. A total of four response types were observed (R, MR, MS, and S) revealing that different genes in both the pathogen and the host were activated in 53% of interactions. Most genotypes were susceptible to eight or more isolates, while the Moroccan cultivar Marouan was reported resistant to three isolates and moderately resistant to three others. Similarly, the Australian breeding line SSD1479-117 was reported resistant to two isolates and moderately resistant to four others. The ICARDA elites Icaverve, Berghisyr, Berghisyr2, Amina, and Icaverve2 were identified as moderately resistant. Principal component analysis based on the genotypes responses defined two major clusters and two sub-clusters for the 10 F. culmorum isolates. Isolate Fc9 collected in Khemis Zemamra was the most virulent while isolate Fc3 collected in Haj-Kaddour was the least virulent. This work provides initial results for the discovery of differential reactions between the durum lines and isolates and the identification of novel sources of resistance.

Pathogenicity Determinants of Sclerotinia sclerotiorum and Their Association to Its Aggressiveness on Brassica juncea

  • Gill, Rupeet;Sandhu, Prabhjodh S.;Sharma, Sanjula;Sharma, Pankaj
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제37권4호
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    • pp.365-374
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    • 2021
  • White rot or stem rot caused by Sclerotinia sclerotiorum is one of the most destructive fungal diseases that have become a serious threat to the successful cultivation of oilseed Brassicas. The study was designed with an aim to investigate the association between the pathogenic aggressiveness and pathogenicity determinants of this pathogen specifically in Brassica for the first time. For this, a total of 58 isolates of S. sclerotiorum from different geographical regions were collected and purified. These isolates were inoculated on a Brassica juncea cv. RL-1359 and they exhibited high level of variation in their disease progression. The isolates were grouped and then 24 isolates were selected for the biochemical analysis of pathogenicity determinants. The isolates varied significantly with respect to their total organic acids, oxalic acid production and pectin methyl esterase and polygalacturonase activity. The oxalic acid production corresponded to the disease progression of the isolates; the isolates with higher oxalic acid production were the more aggressive ones and vice-versa. This is, in our knowledge, the first study to establish a correlation between oxalic acid production and pathogenic aggressiveness of S. sclerotiorum on B. juncea. However, the pectinases' enzyme activity did not follow the trend as of disease progression. These suggest an indispensable role of oxalic acid in pathogenicity of the fungus and the potential to be used as biochemical marker for preliminary assessment of pathogenic aggressiveness of various isolates before incorporating them in a breeding program.