• 유기물자원화
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• 제19권4호
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• pp.84-89
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• 2011

퇴비 제조시 유용한 수분조절제로 각광받고 있는 코코피트를 대상으로 섬유소 분해능을 지닌 세균을 분리 동정하였다. 각기 다른 코코피트를 시료로 하여 섬유소 분해세균을 분리한 결과 각 시료로부터 다양한 세균들이 검출되었으며 이들을 동정한 결과 Burkholderia sp., Bacillu subtilis, Sphingomonas sp., Rhodotorula sp.를 비롯하여 여러 Pseudomonas sp. 등이 동정되었다. 이들 중 4종류의 균주, 즉 B. subtilis, P. aeruginosa, P. stutzeri, P. luteola 를 선별하여 이들의 생화학적 특성을 분석하였으며 배양액을 대상으로 섬유소 분해효소의 일종인 CMCase의 활성을 비교 분석하였다. CMCase의 활성비교를 위한 표준균주로 Cellulomonas sp.를 사용하였으며 비교결과 P. aeruginosa, P. stutzeri, B. subtilis, P. luteola 균주에서 각각 표준균주 효소활성의 83%, 40%, 8%, 6% 정도인 것으로 분석되었다.

• 한국융합학회논문지
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• 제10권10호
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• pp.27-31
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• 2019

본 연구의 목적은 교내 실습실의 유니트체어 수관의 바이오필름을 채취하여 미생물을 분석하고, 기존적인 물빼기방법과 소독제를 사용하는 방법을 적용하여 미생물 수의 변화를 비교하고자 실시하였다. 교내의 수관으로부터 샘플을 채취한 후 R2A배지를 이용하여 배양하였다. 미생물 동정을 거쳐 분리된 미생물의 균종을 분석하였다. 물빼기에 대한 미생물 감소를 확인하기 위해 30초, 60초, 120초 간격으로 샘플을 채취하였고, 소독제의 효과를 확인하기 위해 소독 후 샘플을 채취하였다. 이렇게 수거된 샘플을 통해 얻은 미생물의 정량적 비교는 SPSS 프로그램을 이용하였다. 결과에서 동정된 균주는 총 8개로 나타났으며 대부분 그람음성인 Sphingomonas 계열로 확인되었다. 60초의 물빼기를 통해 미생물의 수가 급감하는 것을 확인하였고, 소독 즉시 미생물은 검출되지 않았다. 본 연구에서 제시된 방법과 결과를 바탕으로 소홀하게 관리될 수 있는 유니트체어의 수관을 관리함으로써 교차 감염을 예방하고 체계적인 관리가 가능할 것이다.

• 한국물환경학회지
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• 제27권3호
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• pp.334-341
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• 2011

The free residual chlorine of tap water samples, collected from 266 faucets on the water pipe network in Daegu City, was between 0.1 and 0.79 mg/L. On microorganic tests, general bacteria and the coliform goup were not detected and thus the tap water was turned out to be fit to drink. In particular, samples of which free residual chlorine was 0.1 mg/L and over were cultured in R2A agar media at $25^{\circ}C$ for 7 days, and as a result heterotrophic bacteria were detected in 65.9% of samples; (1). The closer tap water got to the faucet from the stilling basin, the lower residual chlorine concentration became but the more the bacterial count became. And, more bacteria were detected in the R2A agar medium than in the PCA medium. (2). In the case of separated strains, most colonies were reddish or yellowish. 16S rRNA sequence was identified as Methylobacterium sp. and Williamsia sp., and yellow strain was identified as Sphingomonas sp., Sphingobium sp., Novosphingobium sp., Blastomonas sp., Rhodococcus sp. and Microbacterium sp. White strain was identified as Staphylococcus sp. (3). Sterilized tap water in polyethylene bottles was inoculated with separated strain and was left as it was for 2 months. As a result, bio-film was observed in tap water inoculated with Methylobacterium sp. and Sphingomonas sp. It was found that heterotrophic bacteria increased when free residual chlorine was removed from tap water in the water pipe network. Thus, there is a need to determine a base value for heterotrophic bacteria in order to check the cleanliness of tap water in the water pipe network.

• 미생물학회지
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• 제51권4호
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• pp.355-363
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• 2015

본 연구에서는 염소 소독제를 함유한 수돗물을 수리학적 체류시간 2시간 수준으로 공급한 모델 상수관망에서 형성된 초기 생물막의 생장에 대해 연구하였다. PVC slide 표면에 형성된 세균 생물막의 비생장률(specific growth rate, ${\mu}$)은 총세균수와 종속영양세균수 기준으로 각각 $0.14{\pm}0.09day^{-1}$와 $0.16{\pm}0.08day^{-1}$로 측정되었으며, 생물막 형성 정도는 실험 개시 10일 후에 각각 $3.1{\times}10^4cells/cm^2$와 $6.6{\times}10^3CFU/cm^2$에 이르렀다. Bulk-phase 세균에 비해 훨씬 높은 생물막 형성 세균의 비생장률(${\mu}$)은 관망내에서 생물막 세균의 증식이 세균 재생장의 주된 요인으로 작용함을 의미하였다. 분리 배양된 생물막 균주들은 acetate 농도를 달리한 생장배지에서 얻어진 Monod 모델에서 특징적인 ${\mu}_{max}$와 $K_S$값을 보여주었다. 가장 낮은 ${\mu}_{max}$값을 보여준 Methylobacterium 균주는 느린 생장을 통해 염소 소독제 처리(0.5 mg/L, 10분간)에 대해 높은 내성을 나타내었다. 반포화상수(half-saturation constant) $K_S$값은 Sphingomonas 균주에서 다른 분리 균주들에 비해 100배 정도 낮게 측정되어 기질친화도가 매우 높게 나타났다. 이는 수돗물과 같이 영양물질의 농도가 매우 낮은 조건에서 생존할 수 있도록 적응된 절대 빈영양성 세균의 특징으로 판단된다. 비록 특징적인 ${\mu}_{max}$와 $K_S$값을 보이는 균주 만을 대상으로 수행되었지만, 이상의 결과는 상수관망에서 초기에 형성되는 복합 세균종으로 구성된 생물막에 대한 이해와 조절에 도움을 줄 수 있을 것으로 기대된다.

• Journal of Microbiology
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• 제35권4호
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• pp.241-252
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• 1997

Polychlorodibenzofurans and polychlorodibenzo-pdioxins are among the most toxic xenobiotics released into the biosphere and the cause of significant public concern because of their apparent ubiquityalbeit at low levels- in food and environment. Several bacteria able to degrade nonchlorinated dioxin and dibenzofuran and in some cases to attack chlorinated analogues have recently been isolated. This opens up the possibility that bioremediation processes may ultimately be developed to eliminate these toxic compounds from contaminated sites. In this review we summarize current knowledge on the genetics and biochemistry of dioxin and dibenzofruan degradation by Sphingomonas sp. RW1, a gram-negative bacterium, and highlight the unusual nature of the genetic organization of these pathways.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제12권1호
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• pp.172-175
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• 2002

The complete nucleotide sequence of the nahC gene from Pseudomonas fluorescens, the structural gene for 1,2-dihydroxynaphthalene (1,2-DHN) dioxygenase, was determined. The 1,2-DHN dioxygenase is an extradiol ring-cleavage enzyme that cleaves the first ring of 1,2-dihydroxynaphthalene. The amino acid sequence of the dioxygenase deduced from the nucleotide sequence suggested that the holoenzyme consists of eight identical subunits with a molecular weight of approximately 34,200. The amino acid sequence of 1,2-DHN dioxygenase showed more than $90\%$ homology with those of the dioxygenases of other Pseudomonas strains. However, sequence similarity with those of the Sphingomonas species was less than $60\%$. The nahC gene of P. fluorescens was moderately expressed in E. coli NM522, as determined by enzymatic activity.

• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제42권2호
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• pp.57-61
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• 1999

Seven numerically dominant 2-methyl-4-chlorophenoxyacetic acid (MCPA)-degrading bacteria were isolated from agricultural soils. The isolates utilized the herbicide MCPA as a sole carbon source, producing significant biomass in MCPA mineral medium. They exhibited diverse herbicide degradation capabilities, but most of them grew very slowly in mineral medium containing herbicide. The chromosomal DNA patterns of the isolates obtained by polymerase chain reaction amplification of repetitive extragenic palindromic sequences were distinct from each other. One isolate, SH3, which was identified as Sphingomonas species by fatty acid methyl ester analysis, was able to degrade 5 different phenoxyacetic acid herbicides within 4 days. This strain contains two plasmids, and the smaller one has a crucial role in herbicide degradation. MCPA treated into agricultural soils without indigenous MCPA-degraders persisted for a long time, but the application of the isolate SH3 resulted in rapid decline of MCPA concentration in the soil.

• 한국어업기술학회:학술대회논문집
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• 한국어업기술학회 2001년도 추계 수산관련학회 공동학술대회발표요지집
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• pp.233-234
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• 2001

Marine microorganisms have a diverse range of enzymatic activity and are capable of catalyzing various biochemical reactions with diverse enzymes. There have been several studies reporting that various sulfatases isolated from such bacteria as Klebsiella pneumoniae (Miech et al., 1998), Salmonella typhimurium (Henderson and Milazzo, 1979; Murooka and Harada, 1981), Serratia marcescens (Murooka et al., 1980), Pseudomonas aeruginosa(Delisle and Milazzo, 1970), and Comamonas terigena(Fitzgerald and Cline, 1977). (omitted)

• 한국정보과학회:학술대회논문집
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• 한국정보과학회 2003년도 가을 학술발표논문집 Vol.30 No.2 (2)
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• pp.850-852
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• 2003

이 논문에서는 여러 가지 도구를 논리적인 순서로 사용함으로써 이루어지는 작업을 워크플로우로 보고, 이러한 관점에서 바이오인포매틱스 도구를 통합하는 새로운 멀티에이전트 시스템을 제안한다. 제안한 시스템은 기존의 도구를 랩퍼 에이전트로 구현하고, 에이전트간의 통신은 XML 형식의 메시지로 이루어진다. 수신 에이전트는 송신 에이전트가 전송하는 정보를 명시적으로 알리지 않고도 메시지로부터 필요한 정보를 추출할 수 있다. 제안한 시스템의 이러한 특징은 바이오인포매틱스 도구와 데이터베이스의 통합을 용이하게 한다. 또한, 제안한 시스템에서는 워크플로우를 여러 가지 제어 구조를 이용하여 정의할 수 있으며. 워크플로우 진행을 모니터링할 수 있는 기능을 제공한다. 제안한 시스템의 가용성을 보이기 위해 박테리아 Sphingomonas Chungbukensis DJ77 의 유전자 주해(gene annotation) 작업에 제안한 시스템을 적용하여 구현하고 있다.

• Journal of Microbiology
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• 제43권5호
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• pp.456-462
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• 2005

More than seventy strains of aerobic bacteria showing ${\beta}$-glucosidase activity were isolated from a ginseng field, using a newly designed Esculin-R2A agar, and identified by their 16S rRNA gene sequences. Of these microorganisms, twelve strains could convert the major ginsenoside, $Rb_1$, to the pharmaceutically active minor ginsenoside Rd. Three strains, Burkholderia pyrrocinia GP16, Bacillus megaterium GP27 and Sphingomonas echinoides GP50, were phylogenetically studied, and observed to be most potent at converting ginsenoside $Rb_1$ almost completely within 48 h, as shown by TLC and HPLC analyses.