• 제목/요약/키워드: Spanning Tree

검색결과 236건 처리시간 0.023초

유전자발현데이터의 군집분석을 위한 나무 의존 성분 분석 (Tree-Dependent Components of Gene Expression Data for Clustering)

  • 김종경;최승진
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국정보과학회 2006년도 한국컴퓨터종합학술대회 논문집 Vol.33 No.1 (A)
    • /
    • pp.4-6
    • /
    • 2006
  • Tree-dependent component analysis (TCA) is a generalization of independent component analysis (ICA), the goal of which is to model the multivariate data by a linear transformation of latent variables, while latent variables fit by a tree-structured graphical model. In contrast to ICA, TCA allows dependent structure of latent variables and also consider non-spanning trees (forests). In this paper, we present a TCA-based method of clustering gene expression data. Empirical study with yeast cell cycle-related data, yeast metaboiic shift data, and yeast sporulation data, shows that TCA is more suitable for gene clustering, compared to principal component analysis (PCA) as well as ICA.

  • PDF

On Minimum Cost Multicast Routing Based on Cost Prediction

  • Kim, Moon-Seong;Mutka, Matt W.;Hwang, Dae-Jun;Choo, Hyun-Seung
    • Journal of Communications and Networks
    • /
    • 제11권5호
    • /
    • pp.500-508
    • /
    • 2009
  • We have designed an algorithm for a problem in multicast communication. The problem is to construct a multicast tree while minimizing its cost, which is known to be NP-complete. Our algorithm, which employs new concepts defined as potential cost and spanning cost, generates a multicast tree more efficiently than the well-known heuristic called Takahashi and Matsuyama (TM) [1] in terms of tree cost. The time complexity of our algorithm is O($kn^2$) for an n-node network with k members in the multicast group and is comparable to the TM. Our empirical performance evaluation comparing the proposed algorithm with TM shows that the enhancement is up to 1.25%~4.23% for each best case.

선택-삭제 최소신장트리 알고리즘 (Minimum Spanning Tree with Select-and-Delete Algorithm)

  • 최명복;이상운
    • 한국인터넷방송통신학회논문지
    • /
    • 제13권4호
    • /
    • pp.107-116
    • /
    • 2013
  • 본 논문은 알고리즘 수행 횟수를 줄여 최소신장트리를 빨리 얻는 방법을 제안하였다. 제안된 알고리즘은 선택과 삭제 과정을 수행한다. 선택 과정은 먼저, 그래프의 모든 정점들에 대해 Borůvka의 첫 번째 단계를 수행하고, 특정 정점들에 대해 Borůvka의 첫 번째 단계를 재 수행하여 간선들의 모집단을 축소시키는 결과를 얻었다. 삭제 과정은 축소된 모집단 간선들에 대해 3개 정점들 간에 사이클이 발생할 경우 최대 가중치 간선을 삭제한다. 나머지 간선들 중 최대 가중치 간선에 대해 결합가 개념을 적용하여 삭제한다. 마지막으로 결합가가 큰 정점들 간의 사이클이 발생하는 경우 최대 가중치 간선을 삭제하는 기법을 적용하였다. 선택-삭제 알고리즘을 9개의 다양한 그래프에 적용하여 알고리즘 적용성을 평가하였다. 제안된 선택 과정은 MST 알고리즘을 최적으로 수행해야 하는 간선의 수와 비교시 6개는 적은 개수를, 3개 그래프만이 1개 큰 간선을 선택하는 결과를 나타내어 최적으로 간선을 선택하는 방법임을 알 수 있다. 삭제 단계를 Kruskal 알고리즘을 적용할 경우 Kruskal 알고리즘을 최적으로 수행하는 횟수와 비교한 결과 6개의 그래프는 수행 횟수가 적은 반면, 3개 그래프는 1회 많게 수행하는 결과를 얻었다. 또한, 제안된 삭제 단계를 수행할 경우 1개 그래프는 1단계만, 5개 그래프는 2단계까지, 나머지 3개 그래프만이 3단계를 수행하는 결과를 나타내었다. 결국, 선택-삭제 알고리즘이 MST 알고리즘들 중에서 가장 적은 수행 횟수를 나타내었다.

후위순회 피보나치 원형군-짧은 지름을 갖는 새로운 상호연결망 (The Postorder Fibonacci Circulants-a new interconnection networks with lower diameter)

  • 김용석;권승탁
    • 대한전자공학회:학술대회논문집
    • /
    • 대한전자공학회 2004년도 하계종합학술대회 논문집(1)
    • /
    • pp.91-94
    • /
    • 2004
  • In this paper, we propose a new parallel computer topology, called the postorder Fibonacci circulants and analyze its properties. It is compared with Fibonacci cubes, when its number of nodes and its degree is kept the same of comparable one. Its diameter is improved from n-2 to [$\frac{n}{3}$] and a its topology is changed from asymmetric to symmetric. It includes Fibonacci cube as a spanning tree.

  • PDF

One-to-All Broadcasting of Odd Networks for One-Port and All-Port Models

  • Kim, Jong-Seok;Lee, Hyeong-Ok
    • ETRI Journal
    • /
    • 제30권6호
    • /
    • pp.856-858
    • /
    • 2008
  • Odd networks were introduced in the context of graph theory. However, their potential as fault-tolerant multiprocessor networks has been shown. Broadcasting is one of the most important communication primitives used in multiprocessor networks. In this letter, we introduce efficient one-to-all broadcasting schemes of odd networks for one-port and all-port models. We show the broadcasting time of the former is 2d-2 and that of the latter is d-1. The total time steps taken by the proposed algorithms are optimal.

  • PDF

상대이음좌표방법을 이용한 다물체 시스템의 동역학적 해석에 관한 연구 (A Study on the Dynamic Analysis of Multibody System by the Relative Joint Coordinate Method)

  • 이동찬;배대성;한창수
    • 대한기계학회논문집
    • /
    • 제18권8호
    • /
    • pp.1974-1984
    • /
    • 1994
  • This paper presents a relative coordinate formulation for constrained mechanical systems. Relative coordinates are defined along degrees of freedom of a joint. Graph theoretic analyses are performed to identify topological paths in mechanical systems. Cut constraints are generated to handle closed loop systems. Equations of motion are derived in the Cartesian space and transformed to the joint space. Relative generalized coordinates are corrected to satisfy the cut constraints by a parametrizatiom method.

다차원 개체를 위한 차이등급 clustering (The Difference Order Clustering for Multi-dimensional Entities)

  • 이철;강석호
    • 한국경영과학회지
    • /
    • 제14권1호
    • /
    • pp.108-118
    • /
    • 1989
  • The clustering problem for multi-dimensional entities is investigated. A heuristic method, which is named as Difference Order Clustering (DOC) is developed for the grouping of multi-dimensional entities DOC method has an advantage of identifying the bottle-neck entities. Comparisons among the proposed DOC method, modified rank order clustering (MODROC) method, and lexicographical rank order clustering using minimum spanning tree (lexico-MMSTROC) are illustrated by a part type selection problems.

  • PDF

Industrial application of gross error estimation and data reconciliation to byproduction gases in iron and steel making plants

  • Yi, Heui-Seok;Hakchul Shin;Kim, Jeong-Hwan;Chonghun Han
    • 제어로봇시스템학회:학술대회논문집
    • /
    • 제어로봇시스템학회 2002년도 ICCAS
    • /
    • pp.69.2-69
    • /
    • 2002
  • Process measurements contain random and gross errors and the size estimation of gross errors is required for production accounting. Mixed integer programming technique had been applied to identify and estimate the gross errors simultaneously. However, the compensate model based on mixed integer programming used all measured variables or spanning tree as gross error candidates. This makes gross error estimation problem combinatorial or computationally expensive. Mixed integer programming with test statistics is proposed for computationally inexpensive gross error identification /estimation. The gross error candidates are identified by measurement test and the set of gross error candidates are...

  • PDF

FPTAS and pseudo-polynomial separability of integral hull of generalized knapsack problem

  • 홍성필
    • 한국경영과학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국경영과학회 2004년도 추계학술대회 및 정기총회
    • /
    • pp.225-228
    • /
    • 2004
  • The generalized knapsack problem, or gknap is the combinatorial optimization problem of optimizing a nonnegative linear functional over the integral hull of the intersection of a polynomially separable 0 - 1 polytope and a knapsack constraint. Among many potential applications, the knapsack, the restricted shortest path, and the restricted spanning tree problem are such examples. We prove via the ellipsoid method the equivalence between the fully polynomial approximability and a certain pseudo-polynomial separability of the gknap polytope.

  • PDF

이종 시스템 통합을 위한 데이터 관리 기법 모델링 (Data management Scheme modeling for Heterogeneous system integration)

  • 강인성;이홍철
    • 한국산학기술학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국산학기술학회 2010년도 춘계학술발표논문집 1부
    • /
    • pp.436-439
    • /
    • 2010
  • 본 논문에서는 Ubiquitous Computing 환경 하에서 이종 시스템 간의 통합을 위한 데이터 관리 기법 모델을 제안하였다. 이종 시스템 간의 통합이 이루어지면 방대한 양의 데이터를 모든 시스템이 공유해야 하기 때문에 무분별한 데이터의 중복과 저장으로 인해 프로세스의 데이터 처리 성능 및 데이터 무결성을 보장받지 못 하는 등의 문제점이 발생한다. 이를 보완하기 위해 Minimal cost Spanning tree의 원리를 적용하여 시스템 통합에 따른 데이터 처리 및 무결성 문제 해결을 위한 메커니즘을 제시하고자 한다.

  • PDF