• Title/Summary/Keyword: Southern hybridization

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팽나무버섯 Leu 2 gene(${\beta}-isopropylmalate$ dehydrogenase)의 사철 느타리버섯 형질전환 (Transformation of the ${\beta}-Isopropylmalate$ Dehydrogenase Gene of Flammulina velutipes into Pleurotus florida)

  • 변명옥;유영복;고승주;유창현;차동열;박용환
    • 한국균학회지
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    • 제17권1호
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    • pp.27-30
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    • 1989
  • 팽나무버섯 ${\beta}-isopropylmalate$ dehydrogenase의 유전자가 PBR322에 크로닝된 백터를 이용하여 사철느타리버섯 Leucine 영양요구성 균주를 형질전환 시켰다. 형질전환율은 저조하였으나 형질전환된 균총은 버섯 최소배지에서 다소 느리지만 생육할 수 있었다. 형질전환은 Southern hybridization과 형질 전환된 사철 느타리버섯 염색체 DNA를 다시 대장균에 형질전환시켜 확인하였다.

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Agrobacterium tumefaciens Mediated Genetic Transformation of Pigeonpea [Cajanus cajan (L.) Millsp.]

  • Kumar, S.Manoj;Syamala, D.;Sharma, Kiran K.;Devi, Prathibha
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제6권2호
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    • pp.69-75
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    • 2004
  • Optimal protocol for efficient genetic transformation has been defined to aid future strategies of genetic engineering in pigeon pea with agronomically important genes. Transgenic pigeonpea plants were successfully produced through Agrobacterium tumefaciens-mediated genetic transformation method using cotyledonary node explants by employing defined culture media. The explants were co-cultivated with A. tumefaciens strain C-58 harboring the binary plasmid, pCAMBIA-1301 [con-ferring $\beta$-glucuronidase(GUS) activity and resistance to hygromycin] and cultured on selection medium (regeneration medium supplemented with hygromycin) to select putatively transformed shoots. The shoots were then rooted on root induction medium and transferred to pots containing sand and soil mixture in the ratio of 1:1. About 22 putative TO transgenic plants have been produced. Stable expression and integration of the transgenes in the putative transgenics were confirmed by GUS assay, PCR and Southern blot hybridization with a transformation efficiency of over 45%. Stable integration and expression of the marker gene has been confirmed in the TO and T1 transgenics through PCR, and Southern hybridization.

Agrobacterium tumefaciens에 의한 RAG25유전자의 더덕 (Codonopsis lanceolata)으로의 도입 (Introduction of RAG25gene into Codonopsis lanceolata by Agrobacterium tumefaciens)

  • 신준혜;박민철
    • 식물조직배양학회지
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    • 제27권6호
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    • pp.491-496
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    • 2000
  • 더덕의 효과적인 재분화조건 (약 90%의 재분화율)을 바탕으로 개화시기 조절유전자인 RAG25 Codonopsis lanceolata유전자의 도입을 시도하였다. 더덕의 잎 절편을Agrobacterium과 3일 동안 공조배양 하였으며 NAA 2 mg/L, BA 2 mg/L (N2B2)와 NAA 2 mg/L, BA 4 mg/L (N2B4)가 첨가된 shoot inducing media (Km 20mg/L와 Cf 250 mg/L가 첨가됨)에서 배양하였을 때 형질전환 신초가 형성되었다. 획득된 신초에서 genomic DNA를 추출하고 npt II와 RAG25 primer를 이용한 PCR을 수행하여 각각 0.7 kb와 0.6 kb의 band를 확인하였다. RAG25 유전자에 대한 PCR산물을 이용하여 Southern hybridization을 수행한 결과 PCR과 동일한 위치에서 band 가 검출되어져 이 유전자의 도입을 재확인하였다.

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Kluyveromyces fragilis의 LEU gene의 Cloning (Molecular Cloning of the Gene Coding for 3-Isopropylmalate Dehydrogenase of Kluyveromyces fragilis)

  • 박성희;이동선;우주형;김종국;홍순덕
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제18권3호
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    • pp.305-308
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    • 1990
  • Shuttle plasmid vector인 pHN114를 이용하여 Kluyveromyces fragilis의 3-isopropylmalate dehydrogenase 유전자를 cloning 하였다. 그 결과 Saccharomyces cerevisiae의 leu2변이와 E.coli의 leuB변이를 상보하는 두가지 clone 체 pJK104와 pJK106을 얻었다. Restriction mapping 결과 이들은 서로 반대방향으로 삽입되어 있었으며 expression activity는 pJK104가 높았다. pJK104에 삽입된 유전자를 BglII와 SalI으로 끊은 1.6kb fragment를 probe 로 하여 Southern Hybridization 한 결과 유전자의 유래가 Kluyveromyces fragilis 임을 확인하였다.

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Crystal vilet 색소분해능이 소실된 Citrobacter sp. 의 분리 및 특성 (Isolation and Characterization of Citrobacter sp. Mutants Defective in Decolorization of Crystal Violet)

  • Kim, Ji-Yoon;Kim, Kyung-Woon;Park, Yong-Lark;Cho, Young-Su;Lee, Young-Choon
    • 생명과학회지
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    • 제10권4호
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    • pp.333-339
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    • 2000
  • To identify genes involved in the decolorization of crystal violet, we isolated random mutants generated by transponson insertion in crystal violet-declorizing bacterium, Citrobacter sp. The resulting mutant bank yielded mutants with six distinct phenotypes, and Southern hybridization with a Tn5 fragment as a probe showed a single hybridized with six distinct phenotypes, and Southern hybridization with a Tn5 fragment as a probe showed a single hybridized band in the mutants Ctg 2, 5 an 6, whereas two and three bands were detected in Ctg1, 4 and 3, respectively. Tn5-inserted genes were isolated and the DNA sequence flanking Tn5 was determined. From comparison with a sequence database, putative protein product encoded by ctg 5 was identified as E. coli maltose transproter(Mal G) homolog, whereas the deduced amino acid sequence of the other ctg genes did not show any significant similarity with any DNA or protein sequency. Therefore, these results indicate that the other ctg genes except ctg 5 encode new proteins responsible for decolorization of crystal violet.

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NaOH처리에 의한 Agrobacterium이용 팽이균사체 형질전환 (Agrobacterium-Mediated Transformation of Flammulina velutipes with NaOH Treatment)

  • 신동일;박희성
    • 한국균학회지
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    • 제39권3호
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    • pp.235-238
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    • 2011
  • 팽이균사체의 형질전환을 위하여 Agrobacterium 세포를 사용하였다. 특히, Agrobacterium 세포의 감염단계 전에 약한 NaOH용액을 처리하였으며 이로써 균사체 세포들의 표면 상해 발생을 기대하였다. 그 결과, hygromycin 저항성 ($hyg^r$) 균사체는 NaOH 처리를 거친 경우에서만 출현하였다. 형질전환 균사체의 $hyg^r$ 유전자 도입은 PCR로 확인되었으며 또한 Southern blot hybridization과 western blotting 분석에 의하여 단일 유전자 copy의 삽입과 외래유전자의 발현을 확인할 수 있었다. 본 연구는 팽이균사체에 대한 효율적인 Agrobacterium 이용 형질전환수단을 보여주고 있다.

Glucoamylase 유전자 STA의 염색체내 삽입에 의한 Saccharomyces diastaticus의 glucoamylase 생성능 향상 (Improvement of Glucoamylase Productivity of Saccharomyces diastaticus by Intergration of Glucoamylase Gene, STA, into Chromosomal DHA)

  • 안종석;맹준호;강대욱;황인규;민태익
    • 미생물학회지
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    • 제31권1호
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    • pp.48-53
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    • 1993
  • Saccharomyces distaticus 의 glucoamylase 생성능을 증진시킬 목적으로 STA1 유전자를 YIp vector 를 이용하여 염색체에 도입해 주고자 하였다. STA1 유전자 5.8-Kb 를 YIp vector 에 재조합하여 YIp-STA 를 재작하고, S. diastaticus GMT-11 (a, ura 3, STA1) 을 숙주균주로 하여 염색체의 STA1 유전자 부위에 homologous recombination 되어 삽입하도록 형질전환을 실시하였다. 이렇게 하여 glucoamylase 생성능이 모균주에 비해 최대 6배까지 증대된 다양한 형질전환체들을 얻을 수 있었다. 그리고 glycoamylase 생성능이 증대된 형질전환체들의 염색체 DNA 를 분리하여 Southern hybridization 을 실시한 결과 YIp-STA 가 multi-copy integration 되었음을 확인하였고, 또한 도입해 준 YIp-STA 는 세포분열인 30세대기간 동안 계속되었어도 안정하게 유지되었음을 알았다.

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Characterization of Plasmids from Bifidobacterium sp.

  • Lee, Ju-Hoon;Park, Myeong-Soo;Lee, Ke-Ho;Ji, Geun-Eog
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제11권1호
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    • pp.1-6
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    • 2001
  • Ten strains of plasmid-harboring Bifidobacterium sp. were isolated from the feces of adults and children, and named as Bifidobacterium sp. GE1-GE8, ST, and SH5. These plasmids were categorized into three homologous groups (pKJ50-homologous, pKJ36-homologous, and non-homologous groups) according to Southern hybridization patterns using the formerly characterized bifidobacterial plasmids, pKJ50 and pKJ36, as probes. nine strains harboring the plasmids were shown to accumulate single-stranded DNA as a replication intermediate, based on the S1 nuclease treatment and Southern hybridization. These results suggest that the strains replicate by a rolling circle mechanism. Minimal inhibitory concentrations (MIC) of the isolated bifidobacteria against several antibiotics were determined. Two strains, GE2 and GE3, showed relatively high MiC values against tetracycline ($793.6{\mu}g/ml$) and erythromycin ($153.6{\mu}g/ml$), respectively. The tetracycline resistance of GE2 disappeared when the resident plasmid of GE2 was cured by ethidium bromide. These results show that pKJ36-homologous and pKJ50-homologous plasmids are prevalent among various Bifidobacterium strains and some Bifidobacterium plasmids appear to code for antibiotic resistance.

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Prevotella intermedia G8-9K-3을 동정할 수 있는 DNA 프로브의 개발에 관한 연구 (Study on development of DNA probe for identification of Prevotella intermedia G8-9-3)

  • 백종성;김세훈;김동기;성진효;김병옥;국중기
    • Journal of Periodontal and Implant Science
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    • 제32권2호
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    • pp.281-290
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    • 2002
  • The purpose of this study is to develop species-specific DNA probe for detection and identification of Prevotella intermedia (P. intermedia) G8-9K-3. This study procedure includes (1) whole-genomic DNA extraction of P. intermedia G8-9K-3 (2) construction of the genomic DNA library, (3) screening of strain-specific DNA probe by reverse dot hybridization, (4) confirmation of strain-specific DNA probe by Southern blot hybridization, (5) determination of nucleotide sequences of strain-specific DNA probe. Twenty-eight recombinant plasmids containing Hind III-digested DNA fragments of P. intermedia G8-9K-3 were obtained. Reverse Dot Hybridization and Southern blot analysis data showed that one of them, Pig3, could be P. intermedia G8-9K-3-specific DNA probe. This datum indicates that this Pig3 DNA probe could be useful in detection and identification of the P. intermedia G8-9K-3 strain.

T7 RNA polymerase 유전자의 담배식물에서의 발현 (T7 RNA Polymerase Is Expressed in Plants in a Nicked but Active Form)

  • ;;박상규
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제40권4호
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    • pp.271-276
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    • 1997
  • 박테리오파아지 T7 RNA polymerase 유전자를 식물체내에서 이용할 수 있을지 알아보기 위하여 상처유발인 감자 단백질 분해효소 억제제 유전자의 프로모터에 박테리오파지 T7 RNA polymerase 유전자를 연결시킨 후 담배에 도입시켰다. 형질전환 식물체의 DNA에 대한 Southern hybridization에 의하면 T7 RNA polymerase 유전자가 식물체내에 1-2 copy가 존재하며, Northern hybridization에 의하면 T7 RNA polymerase의 RNA가 상처에 따라 생성되는 것을 확인하였다. 또한 Western hybridization에 의하면 식물체내 T7 RNA polymerase 단백질이 생성되는데 그 크기는 대장균에서 생성되는 단백질 크기와 유사한 80 kDa 이었으며 시험관내에서 전사체에 뉴클레오타이드를 결합시키는 능력이 있음도 확인하였다. 따라서 T7 RNA polymerase 유전자를 이용하여 식물체내에서 원하는 유전자의 발현을 증대시킬 수 있을 것으로 사료된다.

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