This research presents the whole-genome sequence of Priestia megaterium S1, which was isolated from the soil of soybean (Glycine max). The genome of the strain is composed of a single chromosome with 5,297,673 bp, and the GC content is 38.12%.
제주도 토양의 분포특성을 객관적으로 파악하기 위하여 인접정도 및 해발고도별 토양통의 분포를 GIS기법을 이용하여 정량화하고 이를 바탕으로 통계분석을 실시하였다. 토양통 간의 인접정도는 각 통별 경계의 인접비율로 나타내었고 이를 토양통의 고유특성으로 파악하여 군집분석을 실시한 결과 5개의 군집으로 분류할 수 있었고, 이러한 결과는 정밀토양도에서 토색별로 4개의 토양군으로 구분한 분류체계와 유사한 결과였다. 정밀토양도에서는 토색, 해발고도, 토양의 화학적 특성 등 다양한 근거로 분류하였으나 이번 연구에서는 인접성 한 개의 기준으로 분류한 것으로 인접정도의 관점에서 볼 때 관행의 분류체계가 합리적일 수 있음을 의미하고 있다. 해발고도별 토양통 분포면적으로부터 토양통의 대표해발고도를 수치화할 수 있었고, 이를 바탕으로 토양통간 해발고도별 분포순서를 정할 수 있었다. 분포순서는 한라산의 정상에서 4면의 해안방향으로 갈색산림토 - 흑색토 - 농암갈색토 - 암갈색토의 순서로 토양이 연쇄되고 있어, 제주도 토양의 생성과정과 밀접하게 연관되는 것으로 추정되었다.
Kim, Ju-Yong;Yang, Dong-Yoon;Nahm, Wook-Hyun;Lee, Yung-Jo;Park, Ji-Hoon
한국제4기학회지
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제18권2호통권23호
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pp.33-42
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2004
In South Korea a Pedo-sedimentary Sequence(PS) indicating the Last Glacial Maximun(LGM) is typified y a brown to dark brown, relatively stiff paleosol layers formed by repetitive freezing and thawing processes which in turn left characteristi glossic textures in soil-solum, polygolnal structures with a flagipans, vertical soil wedges or freezing cracks, and horizontal foliations, As a pre-LGM sedimentary sequences (older than 25Ka), the Old Fluvial Sequence(OFS) overlain by the Slope Sedimentary Sequence(SS) are distributed commonly at the base level higher than 14-15m above present river-bed along the major river basin. After the LGM (ca. 18Ka), the Young Fluvial Sequence(YFS) appears at an altitude ascending order of sedimentary profiles. In this fluvial organic muds of Jangheungri site(Jinju), Sorori site(Cheonwon), and Youngsan estruarine rivermouth(Mokpo) were exemplified in order to interpret their formation ages and environments. As result of $^{14}C$ datings, the formation ages of te organic muds are Boelling to Alleroed (MIS-1). These organic muds were fomed in fluvial backswamp or local pond/bog in response to shifting fluvial system. On the basis of palynological production dominant with Abies/Picea-Betula and Ranunculaceae, Compositae, Cyperaceae, and Graminae, it was interpreted that more boreal to subboreal condition was prevailed rather than temperate like today during the formation of organic muds and soil moisture condition was a repetition of wet and dry condition.
In this study, we reported the morphogenetic analysis and genome sequence by genomic analysis of the newly isolated staphylococcal phage SMSAP5 from soil of slaughterhouses for cattle. Based on transmission electron microscopy evident morphology, phage SMSAP5 belonged to the Siphoviridae family. Phage SMSAP5 had a double-stranded DNA genome with a length of 45,552 bp and 33 % G+C content. Bioinformatics analysis of the phage genome revealed 43 open reading frames. A blastn search revealed that its nucleotide sequence shared a high degree of similarity with that of the Staphylococcus phage tp310-2. In conclusion, this study is the first report to show the morphological features and the complete genome sequence of the phage SMSAP5 from soil of slaughterhouses for cattle.
탄성지반에서 지반스프링을 이용하여 굴착단계별로 토류벽의 거동을 검토하였다. 토막선형함수를 이용하여 지반계수에 따른 p-y 특성곡선을 산정한 수 있는 수학적 모델을 사용하였고, 토류벽의 굴착단계는 beam-column 방법에 의해 분석하였다. 개발된 프로그램의 신뢰도는 예측치와 실제변위의 비교를 통해 검증하였다. 건설단계를 잘 반영하므로, 앵커로 지지된 토류벽의 변위예측이 향상되었다. 분석결과에 따르면 제안된 방법은 민감도해석에 적용되는 계수들의 상대적 중요성의 평가에 효과적으로 이용될 수 있다.
점액세균의 16S rDNA에 특이적으로 부착하는 프라이머를 사용한 중합효소연쇄반응(PCR)을 통해 아산시와 우포늪에서 채취한 다섯 토양시료 내 점액세균의 다양성을 조사하였다. 점액세균의 16S rDNA을 갖는 76개 PCR 조각의 서열분석 결과, 표준균주와 95% 미만의 상동성을 보이는 5개의 신속 추정 점액세균이 관찰되어 국내 토양에 아직까지 분리되지 않은 많은 새로운 점액세균들이 존재함을 보여주었다.
전라북도 완주군 봉동읍에 위치한 만경강 하안단구 역층 상부에 퇴적되어 있는 뢰스-고토양 연속층을 대상으로 토양분석과 대자율 측정, 입도 및 원소분석을 행하여 퇴적물의 풍화 특성과 기원지를 검토하였다. 봉동단면은 상부에서 하부로 Layer 1(고토양), Layer 2(뢰스), Layer 3(고토양) 그리고 하안단구 역층으로 이루어진다. 대자율은 뢰스층과 고토양층 사이에 뚜렷한 차이를 보이며, 입도분석 결과는 봉동단면이 하천이나 사면이동이 아니라 바람에 의해 운반되었으며, 중국 뢰스고원이나 대천뢰스보다 상당히 세립질임을 보여준다. 토양분석 중 유기물 함량만이 대자율과 유사한 변화를 보이며, 건조 토색보다는 습윤 토색이 뢰스-고토양 연속층의 특성을 보다 잘 반영한다. 주원소 및 희토류 원소 분석 결과, 봉동단면의 뢰스물질은 중국 뢰스고원과 동일한 기원지 또는 재이동된 물질에 의해 형성되었으며, 퇴적 이후에는 고온다습한 우리나라 기후 환경에서 중국 뢰스고원보다 심하게 풍화작용을 받았다.
Fibrin clots of blood vessels are one of the serious factor caused cardiovascular disease. The development of a antithrombotic and thrombolysis solvent is necessary to prevent and treat these diseases. It has been reported that a strong fibrin-specific fibrinolytic enzyme was produced from a Korean fermented soybean paste similar to Japanese miso. We have been screened the known or novel fibrinolytic enzymes by activity-based and sequence-based screening from soil DNA metagenome library containing all kinds of environmental genomic DNA. The activity-based screening was determined the protease activity on 0.5% skim milk. For sequence-based screening, we designed a set of primer expanding gene sequence of fibrinolytic enzyme, performed PCR and selected clones showing the expected size of amplicons from metagenome library. Transformation of the gene encoding fibrinolytic enzyme was carried out with commercial vectors and their transformants were selected. Finally, we found 15 positive clones from metagenome library. Then each of sequences were analyzed and identified as similar or known the clones of nattokinase. We are going to perform full sequence of each clones, ligate with expression vector, transform into competent cells and then determine activity of expressed enzymes.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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