• 미생물학회지
• /
• 제30권4호
• /
• pp.286-290
• /
• 1992

광주근교 지역의 근권 토양으로부터 cetrimide agar medium을 이용하여 형광성 pseudomonads를 분리하였고, CAS medium에서 siderophore의 생성능력이 우수한 pseudomonads만을 분리하여 생리화학적인 실험을 수행하였다. Kanamycin-sensitive pseudomonads를 Tn5를 이용한 mutagenesis를 실시하여 Kanamycin에 내성을 갖는 transconjugants를 선별하였고, siderophore 생합성을 하지 못하는 돌연변이주를 선별하기 위하여 CAS medium에서 yellow hallow를 형성하지 못하거나 King's B medium에서 형광성을 나타내지 못하는 colony를 선별하였다. 선별된 mutants들의 genomic DNA에 Tn5가 삽입되었는지를 확인하기 위하여 Southern blot hybridization을 실시한 결과 intact Tn5에 homology를 나타내는 하나의 single band를 확인하였다.

• 미생물학회지
• /
• 제30권1호
• /
• pp.47-52
• /
• 1992

본 연구에서는 토양 내에서 비선택적으로 작용하는 제초제인 phosphinothricin(PPT) 을 분해할 수 있는 세균을 분리. 동정하고 돌연변이 유도 및 세포융합의 기법을 통해 그 능력을 개량하였으며, 아울러 다른 제초제인 glyphosate 저항성 균주 (Pseudomonas cepacia) 와의 종간 세포 융함을 이용하여 두가지 제초제에 동시에 작용 할 수 있는 균주의 개발 가능성을 알아보았다. 이때, 분리된 PPT 분해균주는 Pseudomonas paucimobilis 로 동정되었고, ethylmethansulfate 를 처리하여 영양 요구성 돌연변이를 얻은뒤, 이를 종내 세포융합을 위한 균주로 사용하였다. Lysozyme 과 EDTA 를 이용하여 원형질체를 형성시켰을때, 원형질체 재생율은 P. paucimoblis 의 경우 6.5%, P. cepacia 의 경우 8.8% 로 나타났다. 세포융합의 fusogen 으로 polyethylenglycol 6,000 을 사용하여, 종내 융합을 통한 융합체 F1, F2, 종간 융합을 통한 융합체 F3, F4 를 얻었다. 종내 융합의 결과, 융합체 F1 위 경우 야생형에 비해 PPT 분해능이 약 11% 정도 향상되었으며, 종간융합을 통하여 얻은 융합체의 경우, PPT 분해능 및 glyphosate 저항성 등의 모균주 특성을 모두 지니고 있다.

• 미생물학회지
• /
• 제38권4호
• /
• pp.276-280
• /
• 2002

본 연구는 수환경이나 먹는샘물 생산 공장 등에서 녹농균이 검출되었을 경우 오염원추적의 1차 조사수단으로 세포막 지방산의 유사도 분석 활용 가능성을 평가함을 목적으로 하였다. 이를 위하여 54개 수환경 분리 균주, 3개 표준 균주, 토양과 분변 분리 균주 4종 등 총 61 개 녹농균의 세포 지방산을 분석하였고, 유사도를 산정하여 가계도식 도표(dendrogram)로 나타내었다. 그 결과 61개 균주 모두가 ED (Euclidian Distance) 8.4에서 단일한 cluster로 grouping되었고 ED 6.9에서 4개의 subgroups들로 분류되었다. 그 subgroups들은 현장 분리, 외국의 표준 균주 등 기원에 따라 각각의 subgroup으로 분류되어 미생물 동정에 사용되는 세포 지방산 분석의 유사도 산출이 먹는샘물 공장 등 수환경에서 경제적이고 간단한 오염원 조사의 1차 수단으로서 활용 될 가능성을 보여주었다.

• 미생물학회지
• /
• 제38권4호
• /
• pp.318-321
• /
• 2002

토양 등의 인 제한환경에서 특이적으로 발현하는 벡터를 구축하기 위해서 Enterobacter areogenes의 phoA 유전자의 promoter가 든 pEAAP를 구축하였다. pEAAP는 pET-22b(+)을 BglII와 XbaI으로 절단하여 T7 promoter와 lac operator를 제거하고pho box가 포함된 phoA promoter를 삽입하여 구축하였다. pEAAP가 인 제한 환경에서 특이적으로 발현되는지 조사하고자 Bacillus subtillis var. amyloliquefaciens (KCTC 8913P)의 Phytase유전자인 Bsa-phy1을 도입한 pEAPHY1을 구축하였다. CK-PHY1 (pEAPHY1을 도입한Escherichia coli JM109)는 인 제한 환경에서 41 kD)의 Bsa-Phy1을 발현하였다. 또한, CK-PHY1은 phytate를 유일한 인산원으로 첨가된 고체배지에서 phytate를 분해하여 투명대를 형성하였다.

• 미생물학회지
• /
• 제16권4호
• /
• pp.170-179
• /
• 1978

By the successive enrichment culture, more than 250 methanol-utilizing bacteria were isolated from various samples such as soil, waste water and sewage. Two strains of which were selected and tentatively identified as Acinetobacter sp. and Pseudomonas sp. experiments were carried out to determine the growth conditions for the higher biomass yield and to demonstrate the difference to protein composition dependent upon carbon sources of these two species. the results were as follows ; 1. the optimum pH was determined as 8 in the both species. The optimum temperature in Acinetobacter sp. was $25^{\circ}C{\sim}30^{\circ}C$ and pseudomonas sp. was $30^{\circ}C-35^{\circ}C$. The optimum initial concentration of mthanol was determined as 1-2% in Acinetobacter sp. and 2-3% in pseudomonas sp. 2. The optimum concnetrations of nitrogen source, micro-elements, and vitamins such as biotin and thiamine-HCl in Acnetobactar sp. were 1g $(NH_4)_3SO4,\;1{\sim}3mg\;Mn^{++},\;4mg\;Fe^{++},\;10{\mu}g\;biotin,\;and\;100{\mu}g$ thiamine-HCl per liter medium. In the Pseudomonas sp., 2g $(NH_4)_3SO4,\;1mg\;Mn^{++},\;trace\;amounts\;of\;Fe^{++},\;5{\mu}g\;biotin,\;and\;100{\mu}g$ thiamine HCl per liter were effective. Maximum biomass yield was 2.5g/l in Acinetobacter sp. and 4.8g/l in Pseudomonas sp. 3. Protein composition of the two strains exhibited that alkai-labile protein was higher than alkali-stable protein. In Pseudomonas sp., the contents of acid soluble fraction and alkali-stable protein of the cells grown in the methanol medium were higher than in sucrose medium. On the other hand, in Acinetobacter sp., alkalilabile protein of the cells grown in sucrose medium was higher than in methanol medium.

• 미생물학회지
• /
• 제44권1호
• /
• pp.63-68
• /
• 2008

참외 경작지 토양으로부터 순수 분리된 선충포식성 곰팡이 Kan-23 균주는 배양 30일 이후에 분생포자가 형성되는 증식이 매우 더딘 특성을 나타내었다. 주사전자현미경(SEM)을 이용하여 Kan-23 균주의 미세형태 구조를 관찰한 결과 분생포자병의 각 가지마다 $5{\sim}10$개의 분생포자를 형성하였으며, 분생포자는 3개의 격막을 형성하고 타원형을 나타내었고, 수축성 고리형태(constricting ring)의 포식 구조체를 형성하는 특징을 나타내었다. 다양한 배지를 이용하여 포식 구조체의 형태학적 특성을 비교 검토한 결과 GPA 배지에서 2배 이상 크기의 대형 수축성 고리 형태의 포식 구조체를 형성하는 특징을 나타내었다. Kan-23 균주의 rDNA의 ITS 영역의 염기서열을 분석한 결과, Drechslerella 속의 계통군에 속하였으며, 특히 Drechslerella brochopaga (U51950)와 99%의 높은 염기서열 유사도를 나타내어 Drechslerella brochopaga로 동정되어 국내 미기록종임이 확인되었다.

• 식물병연구
• /
• 제15권2호
• /
• pp.77-82
• /
• 2009

최근 혹병이 심하게 발생한 충북지방의 포도나무의 뿌리로부터 선택배지를 이용하여 Agrobacterium속 세균을 분리하고 동정하였다. 분리균의 지방산 분석을 통한 MIDI에 의한 동정, 16S rDNA 염기서열, 생화학적 특성, 종 특이적 primer을 이용한 PCR 결과로 13개 분리균은 모두 A. tumefaciens로 동정 되었으며, 포도나무 혹병균인 A. vitis는 분리되지 않았다. 모든 분리균은 토마토와 포도나무의 줄기와 뿌리에 병원성을 나타내지 않았다. Rep-PCR 결과 분리균은 A. tumefaciens와 일부 유사성이 있지만 전체적으로 병원균인 A. tumefaciens와 A. vitis와는 유사성이 낮았다. 이상의 결과는 충북 일부 지방의 MBA와 거봉에서 발생한 혹병을 일으키는 병원균은 토양이나 뿌리로부터 전반되지 않고 묘목을 통해서 전반되었을 가능성을 시사하고 있다.

• 미생물학회지
• /
• 제31권4호
• /
• pp.261-266
• /
• 1993

유일한 탄소 및 에어지원으로 메탄올만을 이용하여 성장하는 새로운 절대 메탄올 자화세균을 토양으로 부터 분리하였다. 분리균주는 그람음성의 운동성이 없고 포자를 형성하지 않는 간균으로 정대호기성 세균이었다. 이 균주는 catalase 활성과 oxidase 활성을 가지고 있으며, nitrate를 nitrite로 환원시킬 수 있고 성장시 vitamin이나 특이한 생육인자를 요구하지 않았다. 세대시간은 1.6시간으로 메탄올 동화경로로는 ribulose monophosphate pathway(Entner-Doudoroff 변형경로)를 이용하나 α-ketoglutarate dehydrogenase 활성은 없었다. Ammonium ion은 glutamate dehydrogenase를 이용하여 동화하였다. DNA의 guanine plus cytosine 함량은 61.0 mol%이고 세포내 지방산으로는 누고 straight-chain saturated C$^{16:0}$ acids(palmitie acids)와 unsaturated C$^{16:1}$ acids(palmitoleic acids)를 가지고 있으나 이외에도 두 종류의 unidentified C$_{17}$ branched fatty acid도 포함하고 있었다. Major ubiquinone은 Q-8이나 Q-6와 Q-7을 특이하게 소량 가지고 있었다. Phospatidylethanolamine과 Phosphatidylglycerol이 주요한 phospholip의 구성물질이나 diphosphatidylgycerol도 소량 포함하고 있었다. 위와같은 생리적, 생화학적 자료로 부터 분리균주를 새로은 종 즉, Methylohacillus methanolovorus sp. nov.로 명명하였다.

• 미생물학회지
• /
• 제38권1호
• /
• pp.45-49
• /
• 2002

Bradyrhizobium japonicum 은 콩과 식물의 뿌리에 감염하여 뿌리흑을 형성 질소를 고정하는 독특한 능력을 갖는 토양 세균이며 미생물 비료제로 사용되고 있다. 본 연구에서는 저온에서 전처리한 B . japonicum 균주를 여러 가지 환경스트레스 조건에 노출하였을 때 생균수의 변화를 확인하였다. 저온 전처리는 16시간 동안 $4^{\circ}C$의 조건을 유지했다. 다양한 스트레스(알콜, 과산화수소, 고온, 건조)에 노출하였을 때, 저온 전처리한 것이 그렇지 않는 것보다 10~1,000배 정도 높은 생균수를 유지하였다. 이러한 내성중진 현상에 전처리 동안 새로운 단백질 합성이 수반되는 것을 단백질 합성 저해제 인 chloramphenicol을 전처리 과정에 포함하여 확인하였다. 저온 스트레스 내성에 관여하는 유전자를 B. japonicum genome 으로부터 중폭하였고 염기서열 분석을 실시하였다. 실험에서 확인된 B . japonicum의 CSP (Cold shock protein) 단백질의 부분적 아미노산 서열은 이미 확인된 다른 균주의 Csp 단백질과 유사함을 확인하였다.

• 미생물학회지
• /
• 제36권1호
• /
• pp.40-45
• /
• 2000

Rhizoctonia solani 분류를 위해 균사의 anastomosis group과 phylogenetic group간의 유전적 차이의 분석을 위해 AFLP를 실시하였다. 그 결과, 각 집단의 유사도는 크게 5집단으로 나뉘어졌다. 균주 9와 균주 20은 0.777을 나타내며 AG-5 group에 속하였고 균주 6은 균주 24와 0.670으로 AG-3 group에 속하였다. 균주 3은 균주 13과 0.844, 균주 10과 0.833의 높은 상동성을 보이며 AG-2-2 group에 속하였다. 균주 2는 균주 11과 0.744, 균주 3은 균주 13과 0.844, 균주 4는 균주 5와 0.870, 균주 5는 균주 16과 0.833을 나타내며 AG-1 group에 속하였다. 균주 7은 균주 8과 0.837의 높은 상동성을 나타내고, 균주 8은 AG-1( I B)와 0.751를 나타냈고, 균주 1과 균주 7,8은 AG-1( I B)에 속하였다.