• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제5권2호
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• pp.80-86
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• 1995

The bacterial strain WC-17 able to produce chitinase was isolated from soil using an enrichment technique. The isolated strain was identified as Acinetobacter sp. judging by their morphological and physiological characterisitics. The optimal culture conditions for the production of chitinase of Acinetobacter sp. WC -17 are 1.5% colloidal chitin and 1 % tryptone at $30^{\circ}C$ with pH 6.5. Since the enzyme was rapidly produced in a culture supplied with chitin, glucose, or N-acetylglucosamine but not with other polymers and monosaccharide, the enzyme was considered to be an inducible enzyme. Notably N- acetylglucosamine and glucose were found to be effective inducers at low concentrations but repressors at excessive concentrations. The cultural supernatant of Acinetobacter sp. WC-17 inhibited the growth of phytopathogenic fungi such as P.oryzae, R.solani, and F.solani. Among the phytopathogenic fungi tested, P.oryzae was the most sensitive. The conventional agar plate (PDA containing 1 % colloidal chitin) method also produced the same result.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제11권6호
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• pp.940-945
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• 2001

Symbiobacterium toebii has been previously reported as a novel commensal thermophile exhibiting a commensal interaction with thermophilic Geobacillus sp. SK-1. We investigated the distribution of this commensal thermophile in various soils using molecular methods, such as quantitative PCR and terminal restriction fragment polymorphism analysis. Based on a nested competitive quantitative PCR the 16S rDNA of the commensal thermophile was only detected in compost soils at about $1.0{\times}10^4$ cpoies per gram of soil, corresponding to $0.25{\times}10^4$ cells per gram of soil. However, in an enrichment experiment at $60^{\circ}C$, about $1.0{\times}10^8$ copies of 16S rDNA molecules were detected per ml of enriched culture broth for all the soils, and more than 0.1 mM indole accumulated as the product of commensal bacterial growth. When incubated at $30^{\circ}C$, neither the 16S rDNA of the commensal bacterium nor any indole accumulation was detected. Accordingly, even though the 16S rDNA of the bacterium was only detected in the compost soils by a nested PCR, the presence of the 16S rDNA molecules of commensal thermophile and accumulation of indole in all the enriched cultures appeared to indicate that the commensal thermophile is widely distributed in various soils.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제32권1호
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• pp.96-100
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• 2004

토양 시료를 대상으로 chlorothalonil을 함유한 최소배지에서의 집식배양과 배양 추 HPLC에 의한 잔류분석을 통해 chlorothalonil의 제거 능력이 우수한 균주 Ochrobactrum sp. SH35B를 분리하였다. 분리균 SH35B는 1/10 LB 배지에 함유된 10 ppm의 chlorothalonil을 30시간만에 완전히 제거하였으며, 20 ppm의 chlorothalonil의 경우 30시간 동안 88%를 제거하였다. 분리균의 Glu-SH함량과 glutathione S-transferase활성은 각각 1.33및 62.1 nmol/mg이었으며, 대조균인 E. coli나 B. subtilis 보다 높은 것으로 나타났다. 이상의 결과로부터 chlorothalonil의 전환에 있어서 세포내의 Glu-SH 함량과 glutathione S-transferase 활성 이 중요한 인자로 작용하는 것으로 생각된다.

• 환경생물
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• 제25권3호
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• pp.267-272
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• 2007

우리나라 20개 지역의 경작토, 쓰레기 매립토, 부엽토 및 활성오니토에서 채취한 40개 토양 시료로부터 Poly(butylene succinate-co-butylene adipate) (PBSA)를 분해하는 미생물을 $37^{\circ}C$에서 강화배양과 투명환시험법을 이용하여 PBSA를 분해하는 균주를 선발하였다. 선발한 세균은 16S rDNA 염기서열분석으로 동정한 결과 Streptomyces sp. PBSA-1로 밝혀졌으며 진균은 형태적, 배양적 특징을 통하여 Aspergillus fumigatus PBSA-2와 Aspergillus fumigatus PBSA-3으로 동정되었다. 변형 Sturm test를 이용하여 선발균의 PBSA분해활성을 측정한 결과 $37^{\circ}C$에서 40일 동안 Streptomyces sp. PBSA-1은 PBSA를 83% 분해하였으며, A. fumigatus PBSA-2와 A. fumigatus PBSA-3은 PBSA를 각각 65% 및 75%분해하는 것으로 나타나 이 균주들은 PBSA의 분해에 대하여 매우 높은 활성을 가지는 것으로 평가되었다.

• Applied Biological Chemistry
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• 제44권4호
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• pp.246-250
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• 2001

토양시료로부터 높은 활성의 pretense를 생산하는 세균을 수십종 분리하였다. 분리된 세균중에서 protease활성과 성장속도면에서 가장 우수한 균주를 선별하여 WRD-2로 명명하였으며, 형태학적, 생화학적 및 생리학적 특성을 조사한 후 Bacillus sp로 동정되었다. WRD-2조효소액의 protease 최적 활성은 pH 6.0, 온도는 $40^{\circ}C$로 중성 protease임을 알 수 있었고, 온도 $20{\sim}40^{\circ}C$에서 높은 protease활성을 나타내었다. 또한, 초기 pH에 따른 protease 활성에서는 pH 6에서 가장 높은 활성을 나타내었고, 배양배지의 영향은 탄소원으로 maltose 3%, 질소원으로 yeast extract 4%에서 가장 높은 pretense활성을 나타내었다.

• 미생물학회지
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• 제44권2호
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• pp.156-163
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• 2008

본 연구에서는 유류로 오염된 토양에서 증식배양을 통해 등유 분해 균주 32개체를 순수 분리하였다. 분리한 개체에 대하여 스크린테스트를 통해 고효율 제거 균주를 선별하였으며, 그 결과 Kl4가 kerosene 1,000 mg/L에서 6일간 가장 높은 제거율을 보였다. Kl4는 형태학적, 생리생화학적 테스트, 16S rDNA 및 지방산 분석을 통하여 Pseudomonas aeruginosa로 동정되었다. 위 균주를 사용하여 다양한 생장조건에서의 등유제거를 측정한 결과, 최적분해조건으로 초기 접종 균농도 1.0 g/L (w/v), 등유 1,000 mg/L, 온도 $30^{\circ}C$, pH 7의 조건이 선정되었다. 이 조건으로 K14에 대한 회분식 실험을 실시하였으며, 위 균주는72시간 동안 등유 1,000 mg/L를 78.3% 이상 제거하였다. 또한, 기질농도에 변화를 주어 실험한 결과 저농도의 등유 200 mg/L에 대하여 48시간 동안 95.8%, 고농도의 등유 5,000 mg/L에서 48시간 동안 42% 이상의 제거능을 보여주었다. 위 결과로 보아, K14에 의한 등유의 생물학적 처리는 유류에 오염된 지하수 및 토양에 적용하였을 시, 뛰어난 제거 효능을 보일 것으로 사료된다.

• 한국환경농학회지
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• 제17권3호
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• pp.279-285
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• 1998

논, 밭, 임야, 오염지 토양과 폐수 등 124 지점의 미생물 급원에서 fenitrothion 분해미생물을 탐색하였다. 그 결과 총 1,071 균주를 1차 분리하였다. 배지별로는 nutrient agar, potato dextrose agar, Actinomyces isolation agar 및 basal salt medium 고체배지에서 각각 601, 201, 168, 101종의 활성균주를 1차 분리하였다. 이 중에서 fenitrothion 분해력이 상대적으로 우수한 미생물을 선발하기 위하여 액체배양을 통한 GLC분석 결과 분해율이 80% 이상인 균주 28종을 2차 선발하였다. 이들을 선발배지별, 미생물 급원별로 살펴보면 NA 배지에서는 논토양에서 3종, 밭 토양에서 3종, 임야 토양에서 2종, 오염지 토양에서 4종이 각각 분리되어 총 12종이 분리되었다. PDA 배지에서는 논 토양에서 1종, 밭 토양에서 2종, 임야 토양에서 2종, 오염지 토양에서 3종이 각각 분리되어 총 8종이 분리되었다. BSM 배지에서는 논 토양에서 1종, 임야 토양에서 1종, 오염지 토양엣 6종이 각각 분리되어 총 8종이 분리되었다. 그러나 AIA 배지에서는 모든 균주가 fenitrothion 분해율이 50% 이하이었다. 한편 100mg/ l의 고농도 fenitrothion 첨가 배지에서 2차 선발 균주를 강화배양하면 세균 중에는 Npa1과 NFo1 균주가, 사상균 중에서는 PFo1과 BPo1 균주가 분해율이 가장 높은 것으로 나타났다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제30권7호
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• pp.1005-1012
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• 2020

Acid mine drainage (AMD) has been a serious environmental issue that threatens soil and aquatic ecosystems. In this study, an acid-tolerant sulfate-reducing bacterium, strain S4, was isolated from the mud of an AMD storage pond in Vietnam via enrichment in anoxic mineral medium at pH 5. Comparative analyses of sequences of the 16S rRNA gene and dsrB gene involved in sulfate reduction revealed that the isolate belonged to the genus Desulfovibrio, and is most closely related to Desulfovibrio oxamicus (with 99% homology in 16S rDNA sequence and 98% homology in dsrB gene sequence). Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analyses of dsrB gene showed that strain S4 represented one of the two most abundant groups developed in the enrichment culture. Notably, strain S4 was capable of reducing sulfate in low pH environments (from 2 and above), and resistance to extremely high concentration of heavy metals (Fe 3,000 mg/l, Zn 100 mg/l, Cu 100 mg/l). In a batch incubation experiment in synthetic AMD with pH 3.5, strain S4 showed strong effects in facilitating growth of a neutrophilic, metal sensitive Desulfovibrio sp. strain SR4H, which was not capable of growing alone in such an environment. Thus, it is postulated that under extreme conditions such as an AMD environment, acid- and metal-tolerant sulfate-reducing bacteria (SRB)-like strain S4 would facilitate the growth of other widely distributed SRB by starting to reduce sulfate at low pH, thus increasing pH and lowering the metal concentration in the environment. Owing to such unique physiological characteristics, strain S4 shows great potential for application in sustainable remediation of AMD.

• 미생물학회지
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• 제23권1호
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• pp.1-8
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• 1985

일산화 탄소를 이용한 enrichment 배양 방법을 통하여 흙으로부터 일산화탄소를 이용하여 성장 할 수 있는 세가지 종류 (JC1, JC2, HY1)의 호기성 Acinetobacter 들을 분리했다. 이세균들은 모두Gramdma성 세균들로 운동성이 없었으며, 지수성장기에는 간균의 형태를 나타내었으나 성장이 정지되었을 때에는 구균으로 변하였다. 이들은 페니실린에 대해 내성이 있었고 $42^{\circ}C$에서도 성장을 할 수 있었다. DNA의 G+C함량은 43%-44.5%이였고 모든 세균에서 oxidase의 활성이 나타나지 않았다. 이 세균들의 coloy들은 모두 둥글고 매끄러웠으며 연한 노란색을 띄었다. 이들은 또 여러가지 종류의 당이나 유기산, 아미노산. 알코올 등을 이용하여 생장할 수 있였다. JC1과 J JC2 벚 HY1이 30%의 일산화탄소를 이용하여 $30^{\circ}C$에서 성장할 때의 doubling time은 각각 19시간. 25시간, 그리 고 35시간 이었다. JC1의 자가영양적 성장을 위한 최적조건은 pH가 6.8이였L 온도는 $42^{\circ}C$ 그리고 일산화탄소의 농도는 30%이였다. JC1 의 자가영양적 성장에는 몰리브데늄이 필요치 않았고, 또 이 세균은 100ppm의 CO만으로도 성장할 수 있는 것으로 밝혀졌다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제21권1호
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• pp.71-80
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• 2011

Four diazinon-degrading bacteria were isolated from agricultural soil by using an enrichment technique. The biochemical analysis and molecular method including RFLP indicated that these isolates were identical, and one strain designated DI101 was selected for further study. Phylogenetic analysis based on 16S rDNA sequencing indicated that the strain DI101 clearly belongs to the Serratia marcescens group. The ability of the strain to utilize diazinon as a source of carbon and phosphorus was investigated under different culture conditions. The DI101 strain was able to completely degrade 50 mg/l diazinon in MSM within 11 days with a degradation rate of 0.226 $day^{-1}$. The inoculation of sterilized soil treated with 100 mg/kg of diazinon with $10^6$ CFU/g DI101 resulted in a faster degradation rate than was recorded in non-sterilized soil. The diazinon degradation rate by DI101 was efficient at temperatures from 25 to $30^{\circ}C$ and at pHs from 7.0 to 8.0. The degradation rate of diazinon was not affected by the absence of a phosphorus supplement, and addition of other carbon sources (glucose or succinate) resulted in the slowing down of the degradation rate. The maximum degradation rate ($V_{max}$) of diazinon was 0.292 $day^{-1}$ and its saturation constant ($K_s$) was 11 mg/l, as determined by a Michaelis-Menten curve. The strain was able to degrade diethylthiophosphate-containing organophosphates such as chlorpyrifos, coumaphos, parathion, and isazofos when provided as a source of carbon and phosphorus, but not ethoprophos, cadusafos, and fenamiphos. These results propose useful information for the potential application of the DI101 strain in bioremediation of pesticide-contaminated environments.