• 식물병연구
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• 제11권2호
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• pp.146-151
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• 2005

2000년 수원, 홍천, 연천 지역의 참깨 포장에서 새로운 병해가 발견되었다. 처음에는 잎에 수침상의 작은 점무늬를 형성하다가 점점 커져 괴사가 일어나고 주위로 황화되었다. 심하게 감염된 경우는 병든 잎은 떨어졌다. YDC 배지에서 병원세균을 순수 분리 하였을 때 Xanthomonas 속 세균의 전형적인 특징인 노란색 색소를 띤 세균이 형성되었다. 분리된 세균을 $10^{8}cfu/ml$로 현탁한 후 3주 동안 자란 참깨 잎에 분무 접종하였을 때 처음과 같은 증상이 재현되었다. 분리된 세균은 대조균주 X. campestris pv. sesami LMG865와 지방산 조성 및 다양한 탄소원 이용정도를 이용하여 비교하였을 때 $100\%$의 가능성으로 X. campestris pv. sesami로 동정되었다. 분리된 병원균은 $18\~36^{\circ}C$에서 생장이 양호하였으며, $27^{\circ}C$에서 가장 우수하였다. 이 보고는 국내에서 참깨의 세균성잎마름병 최초 보고이며, P. syringae pv. sesami에 의한 세균성점무늬병과 외부적인 병징으로 구별하기가 매우 어렵다.

• 미생물학회지
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• 제39권4호
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• pp.248-252
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• 2003

2000년~2002년 사이 부산지역의 병의원으로부터 의뢰된 바이러스성 뇌수막염 환자로 의심되는 환자의 가검물을 대상으로 바이러스 분리를 시도한 결과 2000년에는 검체 292건 중 2건, 2001년에는 371건 중 4건, 2002년에는 703건 중 83건의 장내바이러스를 분리하였다. 2000년에 분리된 원인 바이러스의 경우 echovirus 11 혈청형과 coxsackievirus B2 혈청형이, 2001년에는 coxsackievirus B5 혈청형만이 분리되었으며, 2002년에는 echovirus 2, 3, 6, 7, 9, 13, 25, 30 혈청형이 70건으로 가장 많았고, coxsackievirus B3과 B4 혈청형이 10건으로 예전에 비해 보다 다양한 경향을 나타내었다. 월별발생 양상은 2000년에는 동절기인 12월과 1월에, 2001년에는 5월에 집중적으로 발생하였으며, 2002년에는 4월부터 11월까지 넓은 발생 분포를 나타내었지만 특히 6월과 7월에 가장 발생율이 높았다. Echovirus와 coxsackievirus는 Vero와 HEp-2 세포주에서 강한 병변 효과를 나타내었다. 전자현미경으로 촬영한 echovirus 및 coxsackievirus의 형태학적 양상은 모두 envelope가 없고 크기가 30~35 nm로 아주 작은 구형의 특징을 나타내었다. 세포병변 효과가 나타난 세포배양액에 대하여 nested PCR을 수행한 결과 echovirus 및 coxsackievirus 모두 436 bp 위치에 단일띠를 나타내었으며, serotype은 국립보건원 소화기계바이러스과에 의뢰하여 확인 동정하였다.

• 한국가축번식학회지
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• 제25권4호
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• pp.359-369
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• 2001

황해와 남해산이 각각 50마리씩 총100마리의 조피볼락 (Sebastes schlegeli)의 DNA를 혈액으로부터 추출하여 30개의 무작위 primer를 사용한 RAPD(random amplified polymorphic DNAs)-PCR (polymerase chain reaction) 방법으로 분석하였다 genomic DNA의 독특한 특징들이 그 어종군의 특징을 알아내기 위해서 사용되었다. 30개의 primer 중에서 7개의 primer로 부터 증폭된 전체 산물 (307) 중에서 약 67.4%인 207개의 다형성의 산물 (polymorphic products)이 나타났고, 1개의 primer당 약 2.7개의 다양성의 산물 (polymorphic bands)이 확인되었다. 황해산의 경우 bandsharing analysis를 통해서 볼 때 0.22로부터 0.63까지의 bandsharing value가 확인되었고, 이러한 수치는 0.39$\pm$0.02의 평균값을 나타내었다. 황해산과 남해산 2개체군의 RAPD-PCR산물의 전기영동적 분석을 통해서 볼 때 황해산 조피볼락의 개체들 사이에서 변이가 약간 높게 나타났지만 매우 유사한 특징을 나타내었다. 그러나 일부 개체에서 적은 수이지만 polymorphic bands가 확인되었다. 더 많은 개체군과 다른 연구방법을 통한 연구가 있어야 되겠지만, 이러한 결과는 RAPD 방법을 통하여 2 지역산 조피볼락의 유전적 차이를 어느 정도 확인할 수 있는 가능성을 제시해 주고 있다.

• 한국임상수의학회지
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• 제23권1호
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• pp.41-49
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• 2006

In this study, antimicrobial activity of oriental herbal medicine extract (OHME) was tested for some organisms and the preventive effects of OHME for the colonization of Campylobacter jejuni on epithelium of small intestine were examined in Korean native broiler chickens fed a forage added 1.0% OHME. The isolated Campylobacter spp were biotyped, serotyped and the susceptiblility of isolates to antimicrobial agent were examined. The growth of Staphylococcus aureus was inhibited in 0.25% OHME. C. jejuni and C. coli were inhibited in 0.1% OHME, and Salmonella spp, Lactobacillus acidophilus and Escheichia coli 0157 were inhibited in 2.0% OHME. For the application of forage added 1.0% OHME in broiler chicken farm, the frequency of Campylobacter spp from feces, liver and spleen sample of chickens were examined during 2 weeks interval. The frequence of Campylobacter spp in feces from chickens fed assorted forage (control group) was increased from 25% in first week to 75% in seventh week. But the frequence of Campylobacter spp in feces sample from chickens 134 forage added OHME was slightly reduced from 25% in first week to 15% in seventh week. The frequence of Campylobacter spp in liver, and spleen was 13.7% and 10% respectively after seventh week in control group, but the Campylobacter spp was not isolated after fifth week in live and spleen from chickens fed forage added OHME. Isolated 56 strains of thermophilic Campyiobacter from Korean native chickens was classified as C. jejuni (76.7%), C. coli (214%) and C. laridis (1.6%). The majority of 43 isolates of C. jejuni was classified on biotype I (60.4%), II (30.2%). Most of 12 isolates of C.coli were biotype I (83.3%). Isolated 31 strains C. jejuni of showed 11 different serotype, and serotype 36 (18.6%), 17 (13.9%)were most frequent. Isolated 10 strains of C. coli showed 5 different serotypes and serotype 31 (33.3%) and 21 (25%) were relatively common. Isolated Campylobacter spp were highly susceptible to nalidixic acid, amikacin, gentamicin, colistin and chloramphenucol.

• 한국약용작물학회지
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• 제3권1호
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• pp.25-29
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• 1995

작약주산지(芍藥主産地)의 일반농가재배(一般農家栽培) 포장(圃場)에서 수집(蒐集)된 지방종(地方種)의 지상부생육(地上部生育) 및 화기특성(花器特性)과 교배친화성(交配親和性)을 조사(調査)하여 교배육종(交配育種)의 기초자료(基礎資料)를 얻고자 시험(試驗)한 결과(結果)는 다음과 같다. 1. 작약(芍藥) 수집종(蒐集種)의 출현기(出現期)는 조기출현계통(早期出現系統)이 6종(種), 만기출현계통(晩期出現系統)이 13종(種)으로 구분(區分)되었다. 2. 작약(芍藥)의 화기특성중(花器特性中)화형(花形)은 홑꽃과 겹꽃으로 구분(區分)되었고, 화색(花色)은 홑꽃은 분홍색, 겹꽃은 분홍색+분홍색이 주종(主種)을 이루었고, 암술수는 꽃당 $3{\sim}4$개(倜)인 계통이 많았고, 수술수는 꽃당 $0{\sim}200$개(倜) 이상(以上)으로 차이가 많았으며, 화폭(花幅)은 10cm 미만(未滿)의 소형화(小形花)가 3종(種), 14cm 이상(以上)의 대형화(大型花)가 5종(種) 이었다. 3. 작약(芍藥) 수집종간(蒐集種間)의 인공교배(人工交配)에서 교잡(交雜) 친화성(親和性)은 대부분이 높은 것으로 검정(檢定)되었고 꽃당 골돌과(follicle)의 수(數)는 $3.0{\sim}5.0$개(倜), 종실(種實)의 수(數)는 평균(平均) 15.6개(倜)였으며, 인공교배(人工交配)에서 얻어진 종실(種實) 100입중(粒重)은 10g 이하(以下)인 것이 3조합(組合), 15g 이상(以上)인 것이 3조합(組合)이었으며 이들은 금후(今後) 육종 재료로 활용키 위해 계속 검토중에 있다.

• 한국식품과학회지
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• 제33권5호
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• pp.567-573
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• 2001

본 연구에서는 한국인 분변으로 부터 분리, 동정된 Lactobacillus 속 균주의 종별 출현빈도, 산 생성능, 인공 위액 및 인공 담즙에 대한 내성, cholesterol 저하능력 등이 검토되었다. 생후3일부터 37세까지의 총 13명의 남·여의 분변으로부터 총 52균주의 Lactobacilli가 분리되었고 이 중 L. acidophilus가 19주로 가장 많았으며 다음으로 L. plantarum 순이었다. 분리주 중 L. acidophilus로 동정된 17주와 L. casei로 동정된 3주에 대해서 생리적 특성을 검토한 바 각각 다음과 같은 결과가 얻어졌다. 인공위액에 대한 내성 실험결과 L. acidophilus a-4는 pH 2.5에서 3시간 경과 후에도 전혀 사멸하지 않고 100% 생존하는 것으로 나타났으며, L. acidophilus a-2와 L. casei b-3도 75%이상의 높은 생존율을 나타내었다. 나머지 13주는 40%이하의 생존율을 나타내어, 균주 별로 인공위액에 대한 내성은 큰 차이를 나타났다. 내 담즙성을 측정한 결과 L. acidophilus a-3를 포함한 4주는 성장에 지장을 받지 않았으나 대부분의 분리 균주는 생균수가 처리전 보다 $54{\sim}99%$ 정도로 감소되는 것으로 나타나 인공위액 내성과 마찬가지로 균주에 따라 편차가 큰 것으로 나타났다. 환원 탈지유를 이용한 산생성능에 있어서는 두 L. acidophilus 균주 (a-2 및 a-16)가 60시간 경과 후 $2.1{\sim}2.3%$의 적정 산도까지 도달하였고 이때 pH는 $3.5{\sim}3.6%$이었다 60시간 배양 후 적정 산도가 0.8%에 도달하지 못한 것은 총 20주중 10주였다. 한편 cholesterol 저하능을 측정한 결과 공시한 20개 분리주 중에서 L. acidophilus a-2 주와 a-6 주가 70% 이상의 우수한 저하능력을 나타냈고, 12균주가 60% 이상의 저하능을 나타냈다. cholesterol 저하능은 동일 균종이라 하더라도 분리원(사람)은 물론 동일 분리원에서 유래된 균주 간에도 큰 차이가 나타났다. 담즙산에 대한 내성과 cholesterol 저하능력과의 관련성은 상호간의 유의적인 관계가 없는 것으로 나타났다. 결론적으로 본 실험에서 얻은 몇 균주는 인체에 섭취될 경우 사멸하지 않고 소화관 하부까지 도달할 수 있는 잠재성이 있었으며, 따라서 이들 분리주는 정장제로 이용될 수 있다고 생각되었다.

• 식물병연구
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• 제18권4호
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• pp.268-276
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• 2012

Broad bean wilt virus 2 (BBWV2), genus Fabavirus, subfamily Comovirinae, family Secoviridae, causes damage in many economically important horticultural and ornamental crops. Sequence alignments showed several conserved sequences in 5' non-coding regions (5' NCRs) of RNA 1 and RNA 2 in all BBWV2 strains characterized so far. Based on this observation, we generated a hpRNA construct (pIR-BBWV2) harboring an inverted repeat containing a 210 bp cDNA fragment homologous to 5' NCR portion of BBWV2 RNA 1 to investigate the silencing potential for its ability to interfere with a rapidly replicating BBWV2. Agrobacterium-mediated transient expression of the IR-BBWV2 had a detrimental effect on BBWV2 infection, showing no distinct symptoms in non-inoculated leaves of the agroinfiltrated Nicotiana benthamiana plants. BBWV2 genomic RNAs were not detected by RT-PCR from tissues of both the inoculated leaves and upper leaves of the agroinfiltrated plants. Accumulation of virus-derived small interfering RNAs was detected in the inoculated leaf tissues of N. benthamiana plants elicited by transient expression of IR-BBWV2 indicating that RNA silencing is responsible for the resistance to BBWV2.

• 대한미생물학회지
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• 제34권5호
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• pp.423-433
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• 1999

A novel bacteriophage, designated as VPP97, that infects the strains of Vibiro parahaemolyticus (hallophilic, Gram-negative bacterium) isolated most commonly from marine environments, has been discovered, and several of its properties have been determined. The plaques were clear and sized $0.6{\sim}1.0\;mm$ in diameter. The virion forms a single band on 70% sucrose gradient and ${\rho}1.50$ CsCl gradient by sucrose gradient centrifugation and CsCl gradient centrifugation respectively. It has a hexagonal head and a relatively long tail, as shown by electron microscopy. Vibrio alginolyticus, Vibrio fluvialis and Vibrio furnissii were also sensitive to this phage. It was almost totally inactivated at $70^{\circ}C$ and at pH below 5 or over 10. The nucleic acid of VPP97 is composed of DNA. The VPP97 had 9 specific structural proteins sized between 21.5 kDa and 97.4 kDa on SDS-PAGE. When V. parahaemolyticus cultures were treated with either phage VPP97 or one of the several antibiotics for 2 hours, the viable number of V. parahaemolyticus treated with the phage VPP97 is lower than that treated with chloramphenicol, erythromycin or penicillin, but not lower than that treated with tetracycline. Mice that have responded to the phage treatment revealed the lower numbers of V. parahaemolyticus in small intestine and less damage on small intestine compared to the untreated mice. Therefore, we suggest that the phage treatment appears effective to the infection by V. parahaemolyticus.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제24권12호
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• pp.1679-1684
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• 2014

Acetobacter sp. strains were isolated from traditional vinegar collected in Daegu city and Gyeongbuk province. The strain KJY8 showing a high acetic acid productivity was isolated and characterized by phenotypic, chemotaxonomic, and phylogenetic inference based on 16S rRNA sequence analysis. The chemotaxonomic and phylogenetic analyses revealed the isolate to be a strain of Acetobacter pomorum. The isolate showed a G+C content of 60.8 mol%. It contained $\small{LL}$-diaminopimelic acid ($\small{LL}$-$A_2pm$) as the cell wall amino acid and ubiquinone $Q_9$ (H6) as the major quinone. The predominant cellular fatty acids were $C_{18:1}w9c$, w12t, and w7c. Strain KJY8 grew rapidly on glucose-yeast extract (GYC) agar and formed pale white colonies with smooth to rough surfaces. The optimum cultivation conditions for acetic acid production by the KJY8 strain were $20^{\circ}C$ and pH 3.0, with an initial ethanol concentration of 9% (w/v) to produce an acetic acid concentration of 8% (w/v).

• The Plant Pathology Journal
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• 제29권2호
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• pp.144-153
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• 2013

Diverse bacteria are known to colonize plants. However, only a small fraction of that diversity has been evaluated for their biopesticide potential. To date, the criteria for sampling and selection in such bioprospecting endeavors have not been systematically evaluated in terms of the relative amount of diversity they provide for analysis. The present study aimed to enhance the success of bioprospecting efforts by increasing the diversity while removing the genotypic redundancy often present in large collections of bacteria. We developed a multivariate sampling and marker-based selection strategy that significantly increase the diversity of bacteria recovered from plants. In doing so, we quantified the effects of varying sampling intensity, media composition, incubation conditions, plant species, and soil source on the diversity of recovered isolates. Subsequent sequencing and high-throughput phenotypic analyses of a small fraction of the collected isolates revealed that this approach led to the recovery of over a dozen rare and, to date, poorly characterized genera of plant-associated bacteria with significant biopesticide activities. Overall, the sampling and selection approach described led to an approximately 5-fold improvement in efficiency and the recovery of several novel strains of bacteria with significant biopesticide potential.