• 제목/요약/키워드: Single strand DNA

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홍삼 추출물에 의한 유전독성 감소효과 (I) - 배양 NIH3T3 세포에서 자외선에 의한 유전독성의 감소에 미치는 홍삼추출물 처리효과 (Decrease of Genotoxicity by Red Ginseng Root Extract (I) - Decrease of UV -induced Genotoxicity by Red Ginseng Root Extract in Cultured NIH3T3 Cells)

  • 김완주;유병수
    • 대한화장품학회지
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    • 제24권1호
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    • pp.74-86
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    • 1998
  • 자외선에 의한 유전독성의 감소에 미치는 홍삼추출물의 영향을 배양 NIH3T3 세포계에서 분석하였다. 자외선을 조사한 후 정상 배지에서 배양한 시간간격에 따라 세포의 생존률은 증가하였는데 홍삼추출물이 함유된 배지에서 배양한 경우는 약 15%정도 증가한 생존률을 보였다. 자외선을 조사한 후 감소된 DNA복제가 정상배지 배양시간에 따라 증가하는 정도도 홍삼추출물을 후처리할 경우 현저한 증가를 보였다. 자외선 상해를 회복하기 위한 절제회복능은 홍삼추출물을 처리할 경우 유의미한 증가를 보였다. 이러한 절제회복과정 중 효소에 의한 절제단계가 홍삼추출물 처리에 의해 활성화됨을 단사절단 분석을 통하여 규명하였다. 이상의 결과는 홍삼추출물이 자외선 상해의 절제회복에 유의미한 증가를 보이며 따라서 유전독성을 감소시키는 항노화제로써 사용할 수 있음을 시사한다.

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현미부수체 불안정성을 동반한 위암에서 Chk1 유전자의 돌연변이 (Mutation of the Chk1 Gene in Gastric Cancers with Microsatellite Instability)

  • 이종흔;조용구;송재휘;박조현;김수영;남석우;이석형;유남진;이정용;박원상
    • Journal of Gastric Cancer
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    • 제5권4호
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    • pp.260-265
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    • 2005
  • 목적: Chk1 kinase는 세포 내 DNA 손상에 따른 세포주기의 저지에 관여하며 G2/M checkpoint에서 중요한 역할을 한다. 연구자들은 위암에서 현미부수체 불안정성과 Chk1 유전자의 격자이동 돌연변이와의 연관성을 알아보고자 하였다. 대상 및 방법: 95예의 위암조직에서 레이저를 이용하여 정상과 암세포를 미세절제한 다음 6개의 현미부수체 표식자를 이용하여 현미부수체 불안정성을 조사하였다. 현미부수체 불안정이 있는 예에서 single strand conformational polymorphism과 염기서열 분석으로 Chk1 유전자의 격자이동 돌연변이를 조사하였다. 결과: 현미부수체 불안정성은 95예의 위암 중 19예 (20%)에서 발견되었는데 고빈도와 저빈도의 현미부수체 불안정성은 각각 13예와 6예였다. 고빈도의 현미부수체 불안정성이 있는 13예 중 2예에서 Chk1 유전자의 격자이동 돌연변이가 발견되었는데 이는 아미노산의 격자이동으로 truncated 단백을 형성하였다. 결론 : 이러한 결과는 현미부수체 불안정성은 Chk1 유전자의 격자이동 돌연변이를 유도하여 세포주기 조절 기능을 상실하게 함으로써 위암의 발생에 관여한다는 것을 의미한다.

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이온화 방사선 및 염화수은(II)에 의한 자궁경부암 세포의 DNA 손상 평가 (Evaluation of DNA Damage by Mercury Chloride (II) and Ionizing Radiation in HeLa Cells)

  • 우현정;김지향;안토니나 체불스카바실레프스카;김진규
    • 환경생물
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    • 제24권1호
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    • pp.46-52
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    • 2006
  • 세포에 미치는 염화수은(II)과 이온화 방사선의 영향과 수은 처리 전 후 방사선 조사 시 그 상호 작용에 관해 알아보고자 본 연구를 수행하였다. 염화수은(II)의 독성정도를 알아보기 위하여 사람의 자궁암 세포에 농도별로 염화수은(II)을 처리하였다. 세포의 생존율은 3가지 농도(1,0. 1,0. $0.01\;{\mu}M$)모두에서 유의하게 감소하였으며 이미 $0.1\;{\mu}M$에서 약 73%의 생존율이 감소하는 것으로 나타났다. 염화수은(II)과 방사선의 단독처리 시 DNA의 손상 정도에 비해 복합처리 시의 DNA손상 정도가 $2\sim4$배 정도 확연히 높아짐을 볼 수 있었다. 특히 방사선 후 수은 처리군은 DNA손상의 정도가 다른 처리군에 비하여 높게 나타났는데 이는 이미 기존의 보문에서 밝혀진 바와 같이 수은의 DNA수복에 관련되어 있는 Fpg protein에 미치는 영향 때문으로 사료된다. 이미 방사선에 의해 산화적 손상을 입은 DNA의 수복 기작을 수은이 방해하여 좀 더 높은 손상을 가져오는 것을 확인할 수 있었다.

Targeted Editing of Myostatin Gene in Sheep by Transcription Activator-like Effector Nucleases

  • Zhao, Xinxia;Ni, Wei;Chen, Chuangfu;Sai, Wujiafu;Qiao, Jun;Sheng, Jingliang;Zhang, Hui;Li, Guozhong;Wang, Dawei;Hu, Shengwei
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제29권3호
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    • pp.413-418
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    • 2016
  • Myostatin (MSTN) is a secreted growth factor expressed in skeletal muscle and adipose tissue that negatively regulates skeletal muscle mass. Gene knockout of MSTN can result in increasing muscle mass in sheep. The objectives were to investigate whether myostatin gene can be edited in sheep by transcription activator-like effector nucleases (TALENs) in tandem with single-stranded DNA oligonucleotides (ssODNs). We designed a pair of TALENs to target a highly conserved sequence in the coding region of the sheep MSTN gene. The activity of the TALENs was verified by using luciferase single-strand annealing reporter assay in HEK 293T cell line. Co-transfection of TALENs and ssODNs oligonucleotides induced precise gene editing of myostatin gene in sheep primary fibroblasts. MSTN gene-edited cells were successfully used as nuclear donors for generating cloned embryos. TALENs combined with ssDNA oligonucleotides provide a useful approach for precise gene modification in livestock animals.

방사선 장해에 대한 백작약의 방호효과 (Protective Effects of Paeonia japonica against Radiation-induced Damage)

  • 오헌;박혜란;정일윤;김성호;조성기
    • Journal of Radiation Protection and Research
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    • 제27권3호
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    • pp.181-188
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    • 2002
  • 방사선 생체 손상에 대한 방호 효과를 나타내는 천연물을 검색하기 위한 일환으로 한의학에서 보혈양혈 탕제에 널리 사용되는 백작약 (Paeonia japonica)을 열수총추출물, 에탄올분획, 조다당분획으로 나누어 방사선에 의한 산화적 손상 경감 효과를 검정하였다. 사람 림프구에서 단세포전기영동 (single cell gel electrophoresis; comet assay)을 수행하여 DNA 손상 경감정도를 관찰하였으며, 마우스에 백작약 추출물을 투여한 다음 8 Gy의 감마선을 조사한 후 간에서 지질과산화 정도를 살펴보았다. 에탄올분획 처리군에서 높은 DNA 손상 경감효과를 확인할 수 있었으며, 지질과산화 억제작용 및 라디칼 소거효과 또한 에탄올분획이 높은 효과를 나타내어 에탄올분획이 방사선 방호에 주된 역할을 하는 것으로 사료된다. 이상의 결과로 보아 백작약은 방사선의 산화절 손상에 대하여 효과적으로 세포 DNA를 방호하고, 생체막의 주성분인 지질의 과산화를 억제하는 것으로 관찰되어 특히, 독성이 거의 없는 천연물이라는 관점에서 방사선 방호제로 적용이 가능할 것으로 사료된다.

TFF1 유전자의 C/T 다형성과 위암 민감성과의 연관성 (An Association of C/T Polymorphism in the TFF1 Gene and the Susceptibility to Gastric Cancer)

  • 맹은재;송재휘;성수윤;;박원상
    • Journal of Gastric Cancer
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    • 제8권3호
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    • pp.113-119
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    • 2008
  • 목적: TFF1 유전자의 -2bp에 위치하고 있는 단일염기다형성의 유전자형 및 대립형질 빈도와 H. pylori 감염 및 위암발생 민감성과의 연관성을 조사하고자 하였다. 대상 및 방법: 2000년 1월부터 2003년 12월까지 위 샘암종으로 근치적 수술을 시행 받은 167명과 정상 건강인 299명의 DNA를 이용하였다. TFF1 유전자의 단일염기다형성의 유전자형은 중합효소연쇄반응 후 제한효소를 이용한 제한 분절길이다형성과 single strand conformation polymorphism의 방법으로 분석하였다. 또한, H. pylori 감염은 Giemsa 염색으로 조사하였다. 결과: 정상 건강인의 TFF1 단일염기다형성에 대한 유전자형 및 대립형질의 빈도를 위암 환자군과 비교한 결과 통계적으로 의의가 없었다(P=0.715 & P=0.595). 위암 환자군을 성별로 나누어 정상 건강인과 비교한 경우에도 통계적 의의를 발견할 수 없었다. 또한, 위암 조직의 조직학적 소견 및 환자 연령과 TFF1 단일염기다형성의 유전자형 및 대립형질 빈도를 조사한 결과, 위암 조직의 조직학적 소견 및 연령은 TFF1 유전자 단일염기다형성과 무관하였다(P=0.088 & P=0.551). 한편, H. pylori 감염은 모두 39예에서 관찰되었는데 TFF1 유전자형과는 통계적으로 연관성이 없었다(P=0.7200). 결론: TFF1 유전자의 -2bp에 존재하는 단일염기다형성은 TFF1 단백의 합성에 큰 영향이 없으며 H. pylori 감염과 위암의 발생과는 무관하다는 것을 의미한다.

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Identification of a New 5'-Noncoding Exon Region and Promoter Activity in Human N-Acetylglucosaminyltransferase III Gene

  • Kang, Bong-Seok;Kim, Yeon-Jeong;Shim, Jae-Kyoung;Song, Eun-Young;Park, Young-Guk;Lee, Young-Choon;Nam, Kyung-Soo;Kim, June-Ki;Lee, Tae-Kyun;Chung, Tae-Wha;Kim, Cheorl-Ho
    • BMB Reports
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    • 제31권6호
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    • pp.578-584
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    • 1998
  • In a previous paper (Kim et al., 1996a), the immediate 5' -flanking region and coding region of the human UDP-N -acetylglucosamine:-D-mannoside-1,4-Nacetylglucosaminyltransferase III (N-acetylglucosaminyitransferase- III; GnT-III) gene was reported, isolated and analyzed. Herein, we report on amplification of a new 5' -noncoding region of the GnT-III mRNA by single-strand ligation to single-stranded cDNA-PCR (5' -RACE PCR) using poly(A)+ RNA isolated from human fetal liver cells. A cDNA clone was obtained with 5' sequences (96 bp) that diverged seven nucleotides upstream from the ATG (+1) start codon. A concensus splice junction sequence, TCTCCCGCAG, was found immediately 5' to the position where the sequences of the cDNA diverged. The result suggested the presence of an intron in the 5' -noncoding region and that the cDNA was an incompletely reversetranscribed cDNA product derived from an mRNA containing a new noncoding exon. When mRNA expression of GnT-III in various human tissues and cancer cell lines was examined, Northern blot analysis indicated high expression levels of GnT-III in human fetal kidney and brain tissues, as well as for a number of leukemia and lymphoma cancer cell lines. Promoter activities of the 5' -flanking regions of exon 1 and the new noncoding region were measured in a human hepatoma cell line, HepG2, by luciferase assays. The 5'-flanking region of exon 1 was the most active, whilst that of exon 2 was inactive.

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Genotoxicity Study of sophoricoside derivatives in mammalian cells system

  • Yun, Hye-Jung;Kim, Youn-Jung;Kim, Eun-Young;Jung, Sang-Hun;Kim, Youngsoo;Kim, Mi-Kyung;Lee, Seung-Ho;Ryu, Jae-Chun
    • 한국환경독성학회:학술대회논문집
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    • 한국환경독성학회 2003년도 춘계학술대회
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    • pp.185-185
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    • 2003
  • To develope the novel anti-allergic drug, many sophoricoside derivatives were synthesized. Among these derivatives, JSH-II-3, JSH-Ⅵ-3, JSH-Ⅶ-3, and JSH-Ⅷ-3 were selected and subjected to high throughput toxicity screening (HTTS) because they revealed strong IL-5 inhibitory activity and limitation of quantity. Mouse lymphoma thymidine kinase (tk$\^$+/-/) gene assay (MOLY) and single cell gel electrophoresis (Comet) assay in mammalian cells were used as HTTS tool in our laboratory. In MOLY assay, JSH-Ⅶ-3 at 50 ∼ 6 $\mu\textrm{g}$/ml concentrations was not shown significant mutagenic effect in the absence and presence of S-9 metabolic activation system. However, the concentration of ISH-II-3, 38 $\mu\textrm{g}$/ml, induced increased mutation frequency (MF) in the presence of S-9 metabolic activation system. Also in comet assay, DNA damage was not observed in JSH-Ⅵ-3 and JSH-Ⅶ-3, wherase concentration of 32.8 $\mu\textrm{g}$/ml in JSH-II-3 and 13.9 $\mu\textrm{g}$/ml in JSH-Ⅶ-3 were induced DNA damage in the absence of S-9 metabolic activation system. Therefore, we suggest that JSH-Ⅵ-3 and JSH-Ⅶ-3 have no genotoxic effects but JSH-II-3 and JSH-Ⅷ-3 induce some mutagenicity and DNA strand breaks in mouse lymphoma cell line used this study.

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Urban Particulate Matter-Induced Oxidative Damage Upon DNA, Protein, and Human Lung Epithelial Cell (A549): PM2.5 is More Damaging to the Biomolecules than PM10 Because of More Mobilized Transition Metals

  • Song, H-S;Chang, W-C;Bang, W-G;Kim, Y-S;Chung, N
    • 한국환경독성학회:학술대회논문집
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    • 한국환경독성학회 2002년도 추계국제학술대회
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    • pp.169-169
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    • 2002
  • The mobilizable amount of transition metals is a fraction of the total amount of the metal from urban particulate matter. Although the fraction is small, some metals (Fe, Cu) are the major participants in a reaction that generates reactive oxygen species (ROS), which can damage various biomolecules. Damaging effects of the metals can be measured by the single strand breakage (SSB) of X174 RFI DNA or the carbonyl formation of protein. In another study, we have shown that more metals are mobilized by PM2.5 than by PM10 in general. DNA SSB of >20% for PM2.5 and >15% for PM10 was observed in the presence of chelator (EDTA or citrate)/reductant (ascorbate), compared to the control (<3%) only with the chelator. The carbonyl formation by both PMs was very similar in the presence of the chelator, regardless of the kind of proteins. Compared to the control in the absence of chelator/reductant, 3.3 times and 4.9 times more carbonyl formation for PM2.5 and PM10, respectively, was obtained with BSA in the presence of chelator/reductant, showing that PM10 induced 33% more damage than PM2.5. However, 4.8 times and 1.9 times more carbonyl formation for PM2.5 and PM10, respectively, was observed with lysozyme in the presence of chelator/reductant, showing that PM2.5 induced 250% more damage than PM10. Although different proteins showed different sensitivities toward ROS, all these results indicate that the degrees of the oxidation of or damage to the biomolecules by the mobilized metals were higher with PM2.5 than with PM10. Therefore, it is expected that more metals mobilized from PM2.5 than from PM10, more damage to the biomolecules by PM2.5 than by PM10. We suggest that when the toxicity of the dust particle is considered, the particle size as well as the mobilizable fraction of the metal should be considered in place of the total amounts.

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Selective Effects of Curcumin on CdSe/ZnS Quantum-dot-induced Phototoxicity Using UVA Irradiation in Normal Human Lymphocytes and Leukemia Cells

  • Goo, Soomin;Choi, Young Joo;Lee, Younghyun;Lee, Sunyeong;Chung, Hai Won
    • Toxicological Research
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    • 제29권1호
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    • pp.35-42
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    • 2013
  • Quantum dots (QDs) have received considerable attention due to their potential role in photosensitization during photodynamic therapy. Although QDS are attractive nanomaterials due to their novel and unique physicochemical properties, concerns about their toxicity remain. We suggest a combination strategy, CdSe/ZnS QDs together with curcumin, a natural yellow pigment from turmeric, to reduce QD-induced cytotoxicity. The aim of this study was to explore a potentially effective cancer treatment: co-exposure of HL-60 cells and human normal lymphocytes to CdSe/ZnS QDs and curcumin. Cell viability, apoptosis, reactive oxygen species (ROS) generation, and DNA damage induced by QDs and/or curcumin with or without ultraviolet A (UVA) irradiation were evaluated in both HL-60 cells and normal lymphocytes. In HL-60 cells, cell death, apoptosis, ROS generation, and single/double DNA strand breaks induced by QDs were enhanced by treatment with curcumin and UVA irradiation. The protective effects of curcumin on cell viability, apoptosis, and ROS generation were observed in normal lymphocytes, but not leukemia cells. These results demonstrated that treatment with QD combined with curcumin increased cell death in HL-60 cells, which was mediated by ROS generation. However, curcumin acted as an antioxidant in cultured human normal lymphocytes.