• BMB Reports
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• 제56권2호
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• pp.78-83
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• 2023

Chronic myeloid leukemia (CML) has a markedly improved prognosis with the use of breakpoint cluster region-abelson 1 (BCR-ABL1) tyrosine kinase inhibitors (BCR-ABL1 TKIs). However, approximately 40% of patients are resistant or intolerant to BCR-ABL1 TKIs. Hypoxia-inducible factor 1α (HIF-1α) is a hypoxia response factor that has been reported to be highly expressed in CML patients, making it a therapeutic target for BCR-ABL1 TKI-sensitive CML and BCR-ABL1 TKI-resistant CML. In this study, we examined whether HIF-1α inhibitors induce cell death in CML cells and BCR-ABL1 TKI-resistant CML cells. We found that echinomycin and PX-478 induced cell death in BCR-ABL1 TKIs sensitive and resistant CML cells at similar concentrations while the cell sensitivity was not affected with imatinib or dasatinib in BCR-ABL1 TKIs resistant CML cells. In addition, echinomycin and PX-478 inhibited the c-Jun N-terminal kinase (JNK), Akt, and extracellular-regulated protein kinase 1/2 (ERK1/2) activation via suppression of BCR-ABL1 and Met expression in BCR-ABL1 sensitive and resistant CML cells. Moreover, treatment with HIF-1α siRNA induced cell death by inhibiting BCR-ABL1 and Met expression and activation of JNK, Akt, and ERK1/2 in BCR-ABL1 TKIs sensitive and resistant CML cells. These results indicated that HIF-1α regulates BCR-ABL and Met expression and is involved in cell survival in CML cells, suggesting that HIF-1α inhibitors induce cell death in BCR-ABL1 TKIs sensitive and resistant CML cells and therefore HIF-1α inhibitors are potential candidates for CML treatment.

• 한국축산식품학회지
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• 제42권2호
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• pp.240-251
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• 2022

Fat deposition in animal muscles differs according to the genetics and muscle anatomical locations. Moreover, different fat to lean muscle ratios (quality grade, QG) might contribute to aroma development in highly marbled beef. Scientific evidence is required to determine whether the abundance of aroma volatiles is positively correlated with the amount of fat in highly marbled beef. Therefore, this study aims to investigate the effect of QG on beef aroma profile using electronic nose data and a chemometric approach. An electronic nose with metal oxide semiconductors was used, and discrimination was performed using multivariate analysis, including principal component analysis and hierarchical clustering. The M. longissimus lumborum (striploin) of QG 1++, 1+, 1, and 2 of Hanwoo steers (n=6), finished under identical feeding systems on similar farms, were used. In contrast to the proportion of monounsaturated fatty acids (MUFAs), the abundance of volatile compounds and the proportion of polyunsaturated fatty acids (PUFAs) decreased as the QG increased. The aroma profile of striploin from carcasses of different QGs was well-discriminated. QG1++ was close to QG1+, while QG1 and QG2 were within a cluster. In conclusion, aroma development in beef is strongly influenced by fat deposition, particularly the fat-to-lean muscle ratio with regard to the proportion of PUFA. As MUFA slows down the oxidation and release of volatile compounds, leaner beef containing a higher proportion of PUFA produces more volatile compounds than beef with a higher amount of intramuscular fat.

• 한국빅데이터학회지
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• 제7권1호
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• pp.89-97
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• 2022

선박 충돌 사고는 경제적 손실, 인명피해 등 다양한 부정적 상황을 초래할 수 있기 때문에 사고를 예방하기 위한 다각적인 노력이 필요하다. 따라서 사고 예방을 위한 연구가 활발히 이루어고 있으며, 본 연구에서는 선박 충돌 사고 예방을 위한 새로운 선행 지표를 제안한다. 기존 연구에서는 특정 해역에서 선박들간의 거리를 고려하여 충돌위험을 표현하였지만 이를 다른 해역에 적용하기 위해서는 모델을 새로 개발해야하는 단점이 존재한다. 본 연구에서는 선박 운항 정보인 AIS(Automatic Identification System) 데이터를 활용하여 해역의 환경과 운항의 특징을 포함한 밀도기반 선박 도메인 DESD(Density based Empirical Ship Domain)을 정의하였다. 각 해역별로 만들어진 2차원의 DESD를 대상으로 Deep Clustering을 적용하여 유사한 운항 환경을 가진 해역들을 군집화 한다. 군집화된 해역과 선박 충돌 사고의 연관성 분석을 통해 해역의 특징별로 사고의 발생여부가 달라짐을 통계적으로 검정하여 DESD가 사고의 선행 지표로서 활용될 수 있음을 증명하였다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제40권1호
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• pp.59-72
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• 2024

A comprehensive survey of mungbean-growing areas was conducted to observe leaf spot disease caused by Alternaria alternata. Alternaria leaf spot symptoms were observed on the leaves. Diversity of 50 genotypes of mungbean was assessed against A. alternata and data on pathological traits was subjected to cluster analysis. The results showed that genotypes of mungbean were grouped into four clusters based on resistance parameters under the influence of disease. The principal component biplot demonstrated that all the disease-related parameters (% disease incidence, % disease intensity, lesion area, and % of infection) were strongly correlated with each other. Alt a 1 gene that is precisely found in Alternaria species and is responsible for virulence and pathogenicity. Alt a 1 gene was amplified using gene specific primers. The isolated pathogen produced similar symptoms when inoculated on mungbean and tobacco. The sequence analysis of the internal transcribed spacer (ITS) region, a 600 bp fragment amplified using specific primers, ITS1 and ITS2 showed 100% identity with A. alternata. Potato virus X (PVX) -based silencing vector expressing Alt a 1 gene was constructed to control this pathogen through RNA interference in tobacco. Out of 50 inoculated plants, 9 showed delayed onset of disease. Furthermore, to confirm our findings at molecular level semi-quantitative reverse transcriptase polymerase chain reaction was used. Both phenotypic and molecular investigation indicated that RNAi induced through the VIGS vector was efficacious in resisting the pathogen in the model host, Tobacco (Nicotiana tabacum). To the best of our knowledge, this study has been reported for the first time.

• International Journal of Internet, Broadcasting and Communication
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• 제16권2호
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• pp.179-184
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• 2024

Franchise are now a red ocean in Food industry and they need to find other options to appeal for their product, the uprising content, food tech. The franchises are working on R&D to help franchisees with the operations. Through this paper, we analyze the franchise interest on food tech and to help find the necessity of development for franchisees who are in needs with hand, not of human, but of technology. Using Textom, a big data analysis tool, "franchise" and "food tech" were selected as keywords, and search frequency information of Naver and Daum was collected for a year from 01 January, 2023 to 31 December, 2023, and data preprocessing was conducted based on this. For the suitability of the study and more accurate data, data not related to "food tech" was removed through the refining process, and similar keywords were grouped into the same keyword to perform analysis. As a result of the word refining process, a total of 10,049 words were derived, and among them, the top 50 keywords with the highest relevance and search frequency were selected and applied to this study. The top 50 keywords derived through word purification were subjected to TF-IDF analysis, visualization analysis using Ucinet6 and NetDraw programs, network analysis between keywords, and cluster analysis between each keyword through Concor analysis. By using big data analysis, it was found out that franchise do have interest on food tech. "technology", "franchise", "robots" showed many interests and keyword "R&D" showed that franchise are keen on developing food tech to seize competitiveness in Franchise Industry.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제19권3호
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• pp.238-249
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• 2009

The genus Listeria consists of six closely related species and forms three phylogenetic groups: L. monocytogenes-L. innocua, L. ivanovii-L. seeligeri-L. welshimeri, and L. grayi. In this report, we attempted to examine the evolutionary relationship in the L. monocytogenes-L. innocua group by probing the nucleotide sequences of 23S rRNA and 16S rRNA, and the gene clusters lmo0029-lmo0042, ascB-dapE, rplS-infC, and prs-ldh in L. monocytogenes serovars 1/2a, 4a, and 4b, and L. innocua. Additionally, we assessed the status of L. monocytogenes-specific inlA and inlB genes and 10 L. innocua-specific genes in these species/serovars, together with phenotypic characterization by using in vivo and in vitro procedures. The results indicate that L. monocytogenes serovar 4a strains are genetically similar to L. innocua in the lmo0035-lmo0042, ascB-dapE, and rplS-infC regions and also possess L. innocua-specific genes lin0372 and lin1073. Furthermore, both L. monocytogenes serovar 4a and L. innocua exhibit impaired intercellular spread ability and negligible pathogenicity in mouse model. On the other hand, despite resembling L. monocytogenes serovars 1/2a and 4b in having a nearly identical virulence gene cluster, and inlA and inlB genes, these serovar 4a strains differ from serovars 1/2a and 4b by harboring notably altered actA and plcB genes, displaying strong phospholipase activity and subdued in vivo and in vitro virulence. Thus, by possessing many genes common to L. monocytogenes serovars 1/2a and 4b, and sharing many similar gene deletions with L. innocua, L. monocytogenes serovar 4a represents a possible evolutionary intermediate between L. monocytogenes serovars 1/2a and 4b and L. innocua.

• 한국콘텐츠학회:학술대회논문집
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• 한국콘텐츠학회 2007년도 추계 종합학술대회 논문집
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• pp.522-526
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• 2007

중중급성호흡기증후군(SARS, Severe Acute Respiratory Syndrome)은 전 세계적으로 알려진 바가 없었던 신종 급성 전염성 질환으로써, 2003년 아시아로부터 북미와 유럽지역까지 빠른 속도로 전파되어 나간 이후로부터 많은 과학자들의 연구의 대상이 되어오고 있다. 계통발생학적인 관점에서 SARS 바이러스는 Coronavirus 속에 속하는 것으로 알려져 있으나, 전체적인 유전정보 면에서는 다른 코로나바이러스들에 비하여 진화상으로 보존된 부분들이 현저하게 적은 경향을 나타낸다. 자연계에서의 SARS 코로나바이러스(SARS-CoV)의 숙주생물종에 대해서는 아직까지도 명확히 알려지지 않고 있다. 본 연구에서는 SARS-CoV의 유전서열들을 대상으로 다중서열정렬법, 계통발생학적 분석기법 및 다변량 통계분석법 등과 같은 바이오인포매틱스 분석기법들을 활용하여 이 바이러스의 유전정보 패턴을 분석하였다. Relative synonymous codon usage(RSCU)값을 포함하는 여러 유전정보 파라미터들은 Coronavirus와 Lentivirus 속과 Orthomyxoviridae과로부터 수집된 총 30,305개의 암호화 서열들로부터 계산이 되었으며 이 모든 계산은 KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 SMP 클러스터 상에서 수행되었다. 분석 결과, SARS-CoV는 feline 코로나바이러스와 매우 유사한 RSCU 패턴을 나타내었는데, 이것은 기존에 보고되었던 혈청학적인 연구결과와 일치하는 결과였다. 또한 SARS-CoV와 human immunodeficiency virus 및 influenza A virus는 공통적으로 각각이 속한 속이나 과내에서 상대적으로 낮은 RSCU bias를 나타내어서 이와 같은 현상이 이들 바이러스들이 종 간 장벽을 뛰어넘어 전파되는 과정에 영향을 미쳤을 가능성을 시사하였다. 결론적으로 이와 같은 바이오인포매틱스 분석기법들을 활용한 대용량의 유전정보 분석은 유전체 역학 연구에 효과적으로 사용될 수 있을 것으로 기대된다.

• 서비스연구
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• 제3권2호
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• pp.53-60
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• 2013

데이터로부터 의미있는 형태의 정보를 얻기 위한 여러 가지 기법들이 개발되어 왔지만, 최근 들어 가장 각광받는 분야 중 하나는 패턴인식과 기계학습 방법이다. 기존의 학습 알고리즘은 대부분 범주 형 속성에 기반 한 규칙 또는 의사 결정 모델을 생성한다. 그런데, 실세계의 데이터는 보통 범주 형 속성 외에도 수치 값을 갖는 속성을 포함하고, 또 많은 경우에 있어 수치 형 속성으로만 구성되기도 한다. 따라서 이러한 경우, 데이터를 학습에 사용하기 위해서는 수치형 속성에 대한 적절한 처리 과정이 필요하다. 본 논문에서는, 수치형 속성의 도메인을 여러 개의 분절된 부분으로 나누어 학습 알고리즘에 사용하는 방법인 이산화 기법을 설명하고 또한 데이터마이닝의 기법으로 사용되는 클러스터링(Clustering)을 사용한다. 클러스터란 대량의 데이터베이스로부터 유사한 레코드 특성을 지닌 작은 그룹으로 여러 개를 분할하는 것으로 패턴 공간에 주어진 유한 개의 패턴들이 서로 가깝게 모여서 무리를 이루고 있는 패턴 집합이다. 그 집합들 중에서 특정한 카테고리를 지정하지 않고 주어진 데이터들에서 어떤 패턴을 추출하여, 비슷한 데이터들을 묶어서 데이터를 분류하는 기법인 클러스터링에 대해 실험한다.

• Journal of Yeungnam Medical Science
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• 제16권2호
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• pp.244-254
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• 1999

1998년 1월 1일부터 12월 31일까지 영남대학교와 동국대학교 의과대학 부속병원을 내원한 기능성 소화불량증 환자 90명의 심리적 특성을 알아보기 위하여, 정신과 외래 환자 64명을 대조군으로 하여 다면적 인성검사와 질병행동 설문지 조사를 실시하였으며, 그 결과는 다음과 같다. 다면적 인성검사를 통한 비교에서, 기능성 소화불량증 환자군과 정신과 외래환자군 사이에 유의한 차이가 없이 유사한 성적분포를 보였다. 양군에서 건강염려증, 우울증, 히스테리 척도에서 상대적으로 높은 점수를 보였다. 질병행동 설문지를 통한 비교에서 기능성 소화불량증 환자군이 정신과 외래환자군보다 질병집착심과 정서적 혼란 소척도에서 성적이 낮게 나왔으며, 다른 소척도들은 비슷한 성적분포를 보였다. 다면적 인성검사 성적을 이용하여 기능성 소화불량증 환자를 중다변인 군집분석한 결과, 정신과 외래의 신경증환자와 같은 집단<집단 1>, 정상인과 같은 집단<집단 2>, 신경증적 경향이 심한 집단<집단 3>으로 나눌 수 있었다. 분류된 집단들 간의 다면적 인성검사 성적 비교에서, 신경증적 경향이 심한 집단<집단 3>은, 건강염려증, 우울증, 히스테리, 강박증, 정신분열증 등의 소척도 점수가 높게 나왔다(P<.05). 신경증적인 경향이 심한 집단<집단 3>의 질병행동 설문지 결과를 보면 다른 집단들과 정서적 억압척도를 제외한 모든 척도 즉, 건강염려증, 질병집착심, 심리적 대 신체적 관심, 정서적 혼란, 부정, 자극과민성 등의 척도에서 유의하게 차이가 있는 것으로 나타났다(P<.05). <집단 3>처럼 심한 신경증적인 질병행동을 보이는 군은 정신의학적 접근이 도움을 줄 수 있는 집단이다.

• 한국축산식품학회지
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• 제30권4호
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• pp.609-616
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• 2010

This study was conducted to determine the effects of dietary low grade soybean, fermented with Aspergillus oryzae (FSB 1) or Bacillus subtilis var. natto (FSB 2), on egg production and quality, fat and cholesterol content, and the fatty acid (FA) profile of eggs by lipid layer. A total of 18 Hi-Line strain layers, 22 wk of age, were randomly assigned to three dietary treatments: no fermented soybean (control), control with 15% FSB 1 (C + FSB 1), and control with 15% FSB 2 (C + FSB 2). The rate of egg production and egg weight were evaluated between two periods: one was from the 1st to 4th wk and the other was from the 5th to 8th wk. At the 8th wk, a total of 30 eggs were randomly selected from each treatment group and analyzed for physical quality, fat content, fatty acid composition and cholesterol content. The results showed that egg production was increased in hens fed with diets containing fermented soybeans from the 5th to 8th wk period (p<0.01). A similar tendency was observed through eight weeks' cumulative egg production (p<0.05). There were no significant differences in egg production between the C + FSB 1 and C + FSB 2 treatment groups (p>0.05). Egg weight and other physical properties did not vary between treatment groups (p>0.05). Egg yolks among different treatment groups were similar in fat content, but egg yolks in the C + FSB 1 and C + FSB 2 groups had lower oleic acid (p<0.05), higher linoleic, ${\alpha}$-linolenic, and arachidonic acids (p<0.01), and lower cholesterol content (p<0.05) than those in the control group. In conclusion, supplementation of fermented low grade soybeans might be useful as a functional feedstuff to improve egg production and quality for a healthy human diet.