We present here an in silico search of fungal sterol-esterase/lipase and bacterial depolymerase sequences from environmental metagenomes. Both enzyme types contain the α/β-hydrolase protein fold. Analysis of DNA conserved motifs, protein homology search, phylogenetic analysis, and protein 3D modeling have been used, and the efficiency of these screening strategies is discussed. The presence of bacterial genes in the metagenomes was higher than those from fungi, and the sequencing depth of the metagenomes seemed to be crucial to allow finding enough diversity of enzyme sequences. As a result, a novel putative PHA-depolymerase is described.
In pattern recognition field, there are many optimization problems having exponential search spaces. To solve of sequential search algorithms seeking sub-optimal solutions have been used. The algorithms have limitations of stopping at local optimums. Recently lots of researches attempt to solve the problems using genetic algorithms. This paper explains the huge search spaces of typical problems such as feature selection, classifier ensemble selection, neural network pruning, and clustering, and it reviews the genetic algorithms for solving them. Additionally we present several subjects worthy of noting as future researches.
Transactions of the Korean Society of Mechanical Engineers
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v.19
no.2
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pp.433-442
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1995
For the line search of a multi-variable optimization, an efficient algorithm is presented. The algorithm sequentially employs several polynomial approximations such as 2-point quadratic interpolation, 3-point cubic interpolation/extrapolation and 4-point cubic interpolation/extrapolation. The order of polynomial function is automatically increased for improving the accuracy of approximation. The method of approximation (interpolation or extrapolation) is automatically switched by checking the slope information of the sample points. Also, for selecting the initial step length along the descent vector, a new approach is presented. The performance of the proposed method is examined by solving typical test problems such as mathematical problems, mechanical design problems and dynamic response problems.
This paper presents a new method for Huffman decoding specially designed for the MPEG-2 AAC audio. The method significantly enhances the processing efficiency of the conventional Huffman decoding realized with the ordinary binary tree search method. A data structure is newly designed based on the numerical interpretation of the incoming bit stream and its utilization for the offset oriented nodes allocation. The experimental results show the average performance enhancement of 54% and 665%, compared to those of the conventional binary tree search method and the sequential search method, respectively.
Location management is very important in location-based services to provide services to the mobile users like banking, city guides and many more. Ubiquitous and mobile devices are the source of data in location management and its significant operations are update and search method. Some studies to improve these were presented by using optimal sequential paging, location area scheme and hierarchical database scheme. In addition, not all location services have the same access methods on data and it lead to difficulties of providing services. A proposed location management of multi-agent architecture is presented in this study. It shows the coordination of the agents on the distributed database of location-based services. The proposal focuses on the location management of the mobile object presented in a hierarchical search and update. Also, it uses a nearest neighbor technique for efficient search method of mobile objects.
International Journal of Fuzzy Logic and Intelligent Systems
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v.8
no.3
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pp.192-195
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2008
People have tendency of forgetting music title, though they easily remember particular part of music. If a music search system can find the title through a part of melody, this will provide very convenient interface to users. In this paper, we propose an algorithm that enables this type of search using feature transformation function. The original music is transformed to new feature information with sequential melodies. When a melody that is a part of search music is given to the system, the music retrieval system searches the music similar to the feature information of the melody. Moreover, this transformation function can be easily extended to various music recognition systems.
Journal of the Korea Society of Computer and Information
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v.6
no.2
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pp.48-57
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2001
In a fuzzy connectionist expert system(FCES), the knowledge base can be constructed of neural logic networks to represent fuzzy rules and their relationship, We call it fuzzy rule inference network. To find out the belief value of a conclusion, the traditional inference strategy in a FCES will back-propagate from a rule term of the conclusion and follow through the entire network sequentially This sequential search strategy is very inefficient. In this paper, to improve the above search strategy, we proposed fuzzy rule inference rule used in a FCES was modified. The proposed adaptive search strategy in fuzzy rule inference network searches the network according to the search priorities.
Journal of Wellbeing Management and Applied Psychology
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v.6
no.1
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pp.23-31
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2023
Purpose: The purpose of this study is a preliminary study to develop a comprehensive information avoidance scale that includes various search contexts. Research design, data and methodology: This study is a part of exploratory sequential design of mixed method for the development of information avoidance scale. Based on the themes derived from the analysis of the in-depth interview data collected in the qualitative research of the first stage of the study, 45 preliminary items on information search and avoidance were constructed. The factors related to information searching included information recognition, information seeking purpose, and information search expectations. Individual, information, time, and system factors were related to information avoidance. Pearson's correlation analysis was performed for the correlation between factor items, and Cronbach's alpha analysis was performed for the reliability analysis of the items. Exploratory factor analysis was applied to examine the construct validity of 35 items of information avoidance. Results: Among the information avoidance items, one of the less relevant among information purpose items, two information factor items, and one time factor item were excluded. Conclusions: A secondary survey should be conducted to confirm the validity and reliability of the scale composed of adjusted items (35) based on the results of exploratory factor analysis. The strength of this preliminary scale is that it was developed based on vivid qualitative data of ordinary people who had experiences of search and avoidance in various search contexts.
In this paper, we will show that a control search methodology is a alternative method of a sequential search which is difficult in finding books for arrangement at library or a bookstore when books are out of place. To solve the problem of the sequential search, we apply a edge operator and the Hough Transform to boundary of a taken photograph image book. We generate histogram by a projected image from boundary range of selected books and select title areas from this and possible areas which are a character number of title, authors, a publishing company and an array sequence. Finally, we can select the final possible area of a book location by a curve fitting and a regression line extraction, and show utility through experiment.
Journal of the Korea Society of Computer and Information
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v.20
no.1
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pp.185-195
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2015
During hospital peak times of outpatients, an effective mechanism that informs the newly receipted patient information to corresponding medical departments is lacking in current hospital reception systems. Since every department repeatedly searches entire patient reception database in sequential manner to acquire its reception information, this is a significant performance degradation factor in hospital information system. To improve hospital reception system efficiency, we developed two web socket based systems, a primary key transmitting batch system and a reception information transmitting real time system. The former reduced database access time compared to sequential search system as well as kept search time low regardless of receipted patient number. The latter effectively reduced waiting list updating time in request/response patient reception system by eliminating database access.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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