Second-order rate constants for nucleophilic substitution reactions of 2,4-dinitrophenyl benzenesulfonate 1a with a series of alicyclic secondary amines in MeCN have been measured spectrophotometrically and compared with those reported previously for the corresponding reactions performed in aqueous medium to investigate the effect of medium on reactivity and reaction mechanism. The amines employed in this study are found to be more reactive in the aprotic solvent than in $H_2O$. The reactions of 1a in MeCN result in a linear Br${\o}$nsted-type plot with ${\beta}_{nuc}$ = 0.58, which contrasts to the curved Br${\o}$nsted-type plot reported previously for the corresponding reactions performed in the aqueous medium (i.e., ${\beta}_2$ = 0.86 and ${\beta}_1$ = 0.38). Accordingly, it has been concluded that the reaction mechanism changes from a stepwise mechanism to a concerted pathway upon changing the medium from $H_2O$ to MeCN. Reactions of Y-substituted phenyl benzenesulfonates 1a-c with piperidine in MeCN result in a linear Br${\o}$nsted-type plot with ${\beta}_{lg}$ = -1.31, indicating that expulsion of the leaving group is significantly more advanced than bond formation in the transition state. The trigonal bipyramidal intermediate ($TBPy^{\pm}$) proposed previously for the reactions in $H_2O$ would be highly unstable in MeCN due to strong repulsion between the negative charge in $TBPy^{\pm}$ and the negative dipole end of MeCN. Thus, destabilization of $TBPy^{\pm}$ in MeCN has been concluded to change the reaction mechanism from a stepwise mechanism to a concerted pathway.
The human genome contains approximately 13 orphan cytochrome P450 (P450, CYP) genes, of which the apparent function or substrate has not been identified. However, they seem to possess their own biological relevance in some tissues or developmental stages. Here, we characterized the heterologously expressed CYP2W1, an orphan P450 enzyme. The recombinant CYP2W1 protein containing a $6{\times}$(His)-tag at Nterminus has been expressed in Escherichia coli and purified. Expression level of CYP2W1 holoenzyme was around 500 nmol P450 holoenzyme per liter culture medium. The reduced CO difference spectrum of CYP2W1 showed a maximum absorption at 449 nm. CYP2W1 indicated the significant induction to bioactivate Trp-P-1, MeIQ, and IQ in E. coli DJ701 tester strain. However, the bioactivation of B[$\alpha$]P, and NNK by CYP2W1 was relatively low. The model structure of CYP2W1 suggested the characteristic P450 folds with the lengths and orientations of the individual secondary elements. The F-G loop is situated on the distal side of heme to accommodate the flexibility of active site of CYP2W1. These studies can provide useful information for the finding of its biological roles and structure-function relationships of an orphan CYP2W1 enzyme.
Second-order rate constants ($k_N$) have been measured spectrophotometrically for reactions of 3,4-dinitrophenyl benzoates (5b) with a series of alicyclic secondary amines in 80 mol % $H_2O$/20 mol % DMSO at 25.0 ${\pm}$ 0.1 ${^{\circ}C}$. The kinetic data have been compared with the data reported previously for the corresponding reactions of 2,4- dinitrophenyl benzoates (5a) to investigate the effect of changing the nucleofuge from 2,4-dinitrophenoxide to 3,4-dinitrophenoxide on reactivity and mechanism. The kinetic results show that aminolyses of 5a and 5b proceed through the same mechanism, i.e., a zwitterionic tetrahedral intermediate ($T^{\pm}$) with a change in the rate-determining step (RDS). Substrate 5a is more reactive than 5b when breakdown of $T^{\pm}$ is the RDS but less reactive when formation of $T^{\pm}$ is the RDS. Dissection of kN values into the microscopic rate constants (e.g., $k_1$ and $k_2/k_{-1 }$ ratio) has revealed that 5a results in larger $k_2/k_{-1}$ ratios but smaller k1 values than 5b for all the amines studied. Since 2,4-dinitrophenoxide is less basic and a better nucleofuge than 3,4-dinitrophenoxide, the larger $k_2/k_{-1}$ ratios determined for the reactions of 5a than for those of 5b are as expected. The steric hindrance exerted by the ortho-nitro group on 5a contributes to the smaller k1 values found for the reactions of 5a than for those of 5b.
A kinetic study on aminolysis of 4-chloro-2-nitrophenyl X-substituted-benzoates (6a-i) in MeCN is reported. The Hammett plot for the reactions of 6a-i with piperidine consists of two intersecting straight lines, while the Yukawa-Tsuno plot exhibits an excellent linear correlation with ${\rho}_X$ = 1.03 and r = 0.78. The nonlinear Hammett plot is not due to a change in rate-determining step (RDS) but is caused by the resonance stabilization of substrates possessing an electron-donating group in the benzoyl moiety. The Br${\phi}$nsted-type plot for the reactions of 4-chloro-2-nitrophenyl benzoate (6e) with a series of cyclic secondary amines is linear with ${\beta}_{nuc}$ = 0.69, an upper limit for reactions reported to proceed through a concerted mechanism. The aminolysis of 6e in aqueous medium has previously been reported to proceed through a stepwise mechanism with a change in RDS on the basis of a curved Br${\phi}$nsted-type plot. It has been concluded that instability of the zwitterionic tetrahedral intermediate ($T^{\pm}$) in MeCN forces the reaction to proceed through a concerted mechanism. This is further supported by the kinetic result that the amines used in this study are less reactive in MeCN than in $H_2O$, although they are more basic in MeCN over 7 $pK_a$ units.
Methamphetamine is an amine-containing illegal drug and is distributed unlawfully in South Korea. Finding a rapid, convenient and semi-quantitative determination method for methamphetamine is a very important issue in the area of forensic drug testing. As an effort to develop new screening method, the reactions between three organic compounds which are structurally similar to methamphetamine and N-(9-fluorenylmethoxycarbonyloxy) succinimide (FMOC-NHS) were performed on silica gel ($SiO_2$) TLC plates. Three reference compounds were synthesized and used for the identification, comparison and study of the limit of detection (LOD) of the products obtained from a direct reaction on a TLC plate. As a result, FMOC-NHS as a derivatization reagent generated compounds containing highly UV-active functional groups on the TLC plate after reacting with primary- and secondary amines. In the experiment 2D the LOD of amines was in the range of 0.045 and 0.01 mg/mL ($2{\mu}L/spot$), and in 1D the LOD was in the range of 0.002 and 0.007 mg/mL ($2{\mu}L/spot$). The LODs of the compounds tested were dependent on the concentration of the derivatizing reagent.
Park, Sunyoung;Jung, Sungjin;Kim, Yunjeong;Kim, Hekap
Analytical Science and Technology
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v.31
no.2
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pp.96-105
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2018
This study aimed to improve the method for detecting eight secondary aliphatic amines (SAAs), so as to measure their concentrations in fresh water and tap water samples. NaOH (8 mL, 10 M) and benzenesulfonyl chloride (2 mL) were added to a water sample (200 mL), and the mixture was stirred at $80^{\circ}C$ for 30 min. An additional NaOH solution (10 mL) was added and the stirring was continued for another 30 min. The pH of the cooled mixture was adjusted to 5.5-6.0 by adding HCl (35 %), and the SAAs were extracted using dichloromethane (50 mL). This extraction was repeated once. The extract was then washed with $NaHCO_3$ (15 mL, 0.05 M) and dried over $Na_2SO_4$ (4 g). The extract was finally concentrated to 0.1 mL, of which $1{\mu}L$ was analyzed for SAAs by GC-MS. The linearity of the spike calibration curves was high ($r^2=0.9969-0.9996$). The detection limits of the method ranged from 0.01 to $0.20{\mu}g/L$, and its repeatability and reproducibility (expressed as relative standard deviation) were both less than 10 % (6.6-9.4 %). Its accuracy (measured in percentage error) ranged between 2.4 % and 6.1 %. The established method was applied to the analysis of five surface water and 82 tap water samples. Dimethylamine was the only SAA detected in all the water samples, and its average concentration was $0.79{\mu}g/L$ (range: $0.20-2.54{\mu}g/L$). Therefore, this study improved the analytical method for SAAs in surface water and tap water, and the regional and seasonal concentration distributions were obtained.
Kim, Soo-Hyun;Lee, Eung-Ho;Kawabata, Toshiharu;Ishibashi, Tohru;Endo, Tsugao;Matsui, Masami
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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v.13
no.3
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pp.291-306
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1984
The possibility of formation of carcinogenic N-nitrosamines such as nitrosodimethylamine(NDMA), nitrosodiethylamine (NDEA) and nitrosopyrolidine (NPYR) during the fermentation of Kimchi was investigated. Three different types of Kimchi, formulated with chinese cabbage, red pepper powder and garlic, with or without one of both fermented shrimp and anchovy juice, were cured for 75 days at $5^{\circ}C$. The changes in contents of nitrates, nitrites, pH, ascorbic acid, secondary amines, trimethyl-aminoxide (TMAO), trimethylamine (TMA) and NDMA were analyzed periodically during the fermentation. TMAO, TMA. DMA, nitrate, nitrite and ascorbic acid were analyzed by colorimetric methods, and NDMA, NPYR and NDEA were determined by the method of GLC-TEA. Although the total secondary amines markedly increased, no significant changes in the levels of TMAO and TMA were observed during the fermentation Kimchi added with fermented shrimp or anchovy juice. The predominating component of secondary amines was confirmed to be dimethylamine by means of nitrosating technique coupled with gas chromatography. No appreciable increase in the level of nitrites was appeared although nitrate level in the Kimchi apparently decreased. Non detectable or trace level of nitrosamine formation was detected whereas the nitrates fairly decreased during the fermentation of Kimchi. This could be explained by the fact that the lack of nitrites was resulted in the system due to rapid consumption of nitrites formed from nitrates by the reactions with ascorbic acid and amino acids which have been known as inhibitors of nitrosation reaction.
Thermoresponsive polymers were successfully synthesized by a combination of atom transfer radical polymerization (ATRP) and Cu(I)-catalyzed 1,3-dipolar cycloaddition of azide and alkynes (click chemistry). Poly(2-hydroxyethyl methacrylate) (PHEMA) was synthesized by ATRP, followed by introduction of alkyne groups using pentynoic acid, leading to HEMA-alkyne. Homopolymers having secondary amine groups, tertiary amines with hydroxyethyl and hydroxypropyl groups were synthesized by adding 2-azido-N-ethyl-ethanamine, 2-[(2-azidoethyl)amino]ethanol, and 2-[(2-azidoethyl)amino]propanol, respectively, to the PHEMA-alkyne backbone using click chemistry. Molecular weight (MW), molecular weight distribution (MWD), and click reaction efficiency were determined by gel permeation chromatography (GPC) and $^1H$ NMR spectroscopy. The transmission spectra of the 1.0 wt% aqueous solutions of the resulting polymers at 650 nm were measured as a function of temperature. Results showed that the lower critical solution temperature (LCST) could be easily controlled by the length of the hydroxyalkyl groups.
The reactions of [Ni(L)(H₂O)₂]Cl₂ (L = 2,5,9,12-tetramethyl-1,4,8,11-tetraazacyclotetradecane) with terephtalate (tp) and 2,5-pyridinedicarboxylate (pdc) generate one-dimensional nickel(II) complexes, [Ni(L)(H₂O)₂](tp) · ₄H₂O (1) and [Ni(L)(H₂O)₂](pdc)·₄H₂O (2). The structures have been characterized by X-ray crystallography, magnetic susceptibility and spectroscopy. The crystal structures of 1 and 2 show a distorted octahedral coordination geometry around the Ni(II) ion, with secondary amines of the macrocycle and two water molecules at the trans position. Complexes 1 and 2 display the one-dimensional hydrogen-bonded infinite chains. The magnetic behavior of all compounds exhibits weak interchain antiferromagnetic interactions with J values of -1.09(3) for 1 and -1.14(2) cm-1 for 2.
Contents of dimethylamine (DMA) in fresh fish muscle were analyzed by gaschromatography. DMA contents were in Pseudosciaena manchuria $10.367mg\%$, in Theragra chalcogramma $19.133mg\%$, in Sardinops melanosticta $22.833mg\%$, and in Scomber japonicus $26.300mg,\%$ respectively. Individual amines could not be separated with such a low content.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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