• 제목/요약/키워드: Science & Technology Databases

검색결과 447건 처리시간 0.029초

바이오데이터베이스와 도구를 활용한 바이오인포매틱스의 동향 (Current Status of Bioinformatics on Bio-databases and it Tools)

  • 임달혁;전수경;박완규;이영주
    • Journal of Pharmaceutical Investigation
    • /
    • 제34권1호
    • /
    • pp.73-79
    • /
    • 2004
  • The union of information-technology and biology presents great possibilities to both applications of bio-information and development of science and technology. Also, meaningful analysis of bio-information brings about a new innovation in the field of bio-market with the advent and growth of bioinformatics. Hence, bioinformatics is the most import aspect for establishing a science-technology-oriented society in the $21^{st}$ century. This article provides trends in current state of bioinformatics. Technological development of bioinformatics for the rapid growth of bio-industry means that using bioinformatics, a biologist can process and store enormous amount of data such as current Human Genome Project and future data in the field of biology. We have manly looked at the tends of bio-information, databases and mining tools that are generally used, and strategies and directions for the future.

A System for Describing Cis-Regulatory Machinery Unit

  • Kaminuma, Tsuguchika;Takai-Igarashi, Takako;Yukawa, Masumi;Tanaka, Yoshitomo;Tanaka, Hiroshi
    • 한국생물정보학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국생물정보시스템생물학회 2005년도 BIOINFO 2005
    • /
    • pp.427-430
    • /
    • 2005
  • Studies on cellular pathways and networks are now one of the most actively researched topics in all fields of biomedicine ranging from developmental biology to etiology. Many databases have been developed and quantitative simulation models have been proposed. One of the eventual goals of pathway/network studies is to integrate different types of pathway/network models and databases to simulate overall cellular responses. A bottleneck to this goal is modeling gene expression since the mechanism of this process is not yet fully unveiled. We are developing a small scale computer program called CiRMU (Cis-Regulatory Machinery Unit model) for describing, viewing, analyzing, and modeling the process of gene expression. A prototype system is being designed and implemented for analyzing functions of nuclear receptors.

  • PDF

XML 기반의 생물정보학시스템 (XML-BASED BIOINFORMATIC SYSTEMS)

  • 신종환;정무영
    • 한국경영과학회:학술대회논문집
    • /
    • 대한산업공학회/한국경영과학회 2002년도 춘계공동학술대회
    • /
    • pp.301-305
    • /
    • 2002
  • Bioinformatics can beexplained as the science of developing algorithms, applicatiou tools, and computer databases and so on, for the purpose of supporting and enhancing biological research. Bioinformatic information systems (BIS) typically handle large data sets and the amount of the data goes up exponentially. Another impediment to easy extraction and retrieval of genomic data in BIS is the need to access different sites for similar information. Recently. there has been some attempts to integrate bioinformatics data in the World Wide Web (WWW) among the bioinformatics community by the internet computing technology. However, the work to integrate bioinformatics data on a universal platform has some problems because of the lack of standard, terminologies, semantics, and ontologies about bioinformatics. In this paper, an XML-based BIS architecture is proposed as an integrated BIS framework. The XML and related technologies allow the creation of meaningful information tags to exchange data between various databases as a standard format, and to create more simple interfaces. This integrated BIS framework has bioinformatic architectural components which is used in the Corporate Information Factory (CIF) method.

  • PDF

한국과학기술인용 DB를 반영한 JCR 분석연구 (Analysis of Korea Science Citation Database's effect on JCR)

  • 이종욱;양기덕;김병규;류범종
    • 정보관리연구
    • /
    • 제43권3호
    • /
    • pp.23-41
    • /
    • 2012
  • 전 세계적으로 이용되는 인용색인 서비스인 Web of Science(WoS)는 데이터 수록 범위에 한계가 있음이 인용색인 연구에서 지적되어 왔다. 또한 국내 학술논문이 인용하는 해외 문헌의 비율이 전체의 약 75%를 차지한다는 것이 인용패턴 분석연구에서 밝혀진 바 있다. 본 연구에서는 WoS DB의 데이터 수록 범위를 검증하기 위한 첫 번째 단계로써 WoS DB에 포함되어 있지 않은 국내 연구자의 인용문헌 즉, 한국과학기술인용 DB(Korea Science Citation Database: KSCD)에 수록된 참고문헌 데이터 일부를 JCR 학술지 영향력지수 산출과정에 포함시켜 학술지 영향력 지수(Impact Factor: IF)의 변화 및 그에 따른 학술지 순위변동 여부를 조사하였다. 구체적으로 국내 문헌정보학 분야 학술지에 수록된 참고문헌을 JCR 2009 문헌정보학 분야 학술지 IF 산출과정에 포함하였다. 하지만 학술지 IF의 변화와 그에 따른 순위 차이가 통계적으로 유의하지 않았고, 이에 데이터 범위를 넓혀 컴퓨터 공학 및 전자공학 분야 학술지 45종에 수록된 참고문헌을 추가로 분석하여 JCR 2010 전자공학 분야 학술지 IF 산출과정에 포함하였다. 그 결과, 부분적으로 통계적으로 유의한 학술지 순위 변화가 일어났다. 본 연구는 한정된 데이터를 사용하였음에도 불구하고 미미하지만 통계적으로 유의한 JCR 학술지 순위 변동을 보여줌으로써 WoS DB에 포함되지 않은 인용 데이터의 잠재적 가치를 제시하였다.

Multimedia Document Databases : Representation, Query Processing and Navigation

  • Kalakota, Ravi S.;Whinston, Andrew B.
    • 정보기술과데이타베이스저널
    • /
    • 제1권1호
    • /
    • pp.31-62
    • /
    • 1994
  • Information systems for application areas like office automation, customer service or computer aided manufacturing are usually highly interactive and deal with complex document structures composed of multiple media formats. For the realization of these systems, nonstandard database systems, which we call document databases, need to handle different types of coarse-and fine-grained document objects(like full-text documents, graphics and images), hierarchical and non-hierarchical relationships between objects(like composition-links and cross-references using hypertext structures) and document attributes of different types such as formatting/presentation information and access control. In this paper, we present the underlying data model for document databases based on descriptive markup languages that provide mechanisms for specifying the logical structure(or schema) of individual documents stored in the database. We then describe extensions to the data model for supporting notion of composite structures("join" operators for documents) --composition and hyperlinking mechanisms for representing compound documents and inter-linked documents as unique entites separate from their components. Furthermore, due to the interactive nature of the application domains, the database system in conjunction with clients(or browsers) has to support visual navigation and graphical query mechanisms. We describe the functionality of a new user interface paradigm called HyBrow for meeting the above mentioned requirements. The underlying implementation strategy is also discussed.discussed.

  • PDF

Content-Based Indexing and Retrieval in Large Image Databases

  • Cha, Guang-Ho;Chung, Chin-Wan
    • Journal of Electrical Engineering and information Science
    • /
    • 제1권2호
    • /
    • pp.134-144
    • /
    • 1996
  • In this paper, we propose a new access method, called the HG-tree, to support indexing and retrieval by image content in large image databases. Image content is represented by a point in a multidimensional feature space. The types of queries considered are the range query and the nearest-neighbor query, both in a multidimensional space. Our goals are twofold: increasing the storage utilization and decreasing the area covered by the directory regions of the index tree. The high storage utilization and the small directory area reduce the number of nodes that have to be touched during the query processing. The first goal is achieved by absorbing splitting if possible, and when splitting is necessary, converting two nodes to three. The second goal is achieved by maintaining the area occupied by the directory region minimally on the directory nodes. We note that there is a trade-off between the two design goals, but the HG-tree is so flexible that it can control the trade-off. We present the design of our access method and associated algorithms. In addition, we report the results of a series of tests, comparing the proposed access method with the buddy-tree, which is one of the most successful point access methods for a multidimensional space. The results show the superiority of our method.

  • PDF

CD-ROM 데이터베이스의 정보검색(情報檢索) 연구 (A Study on Information Retrieval in CD-ROM Database)

  • 이우범
    • 정보관리연구
    • /
    • 제25권4호
    • /
    • pp.1-35
    • /
    • 1994
  • 이 논문은 최근에 급속히 증가하고 있는 CD-ROM 데이터베이스의 수집과 그 효율적인 이용에 대한 방안의 연구로, 주로 각종 CD-ROM 데이터베이스의 제작방향(製作方向) 및 수집방법에 관한 아이디어를 제공하고, CD-ROM 데이터베이스의 검색(檢索) 효율성(效率性)을 높이기 위한 메뉴 화면구성 및 그 구체적인 정보검색 기법을 비교 분석해 본 것이다. 본 논문은 그러한 분석 결과를 통하여 이상적인 메뉴 화면의 제안과 표준(標準) 정보검색(情報檢索) 기술이 무엇인가를 규명하여 하나의 표준(標準)이 될 수 있는 기법을 제시하고자 시도하였다.

  • PDF

상용(商用) 데이터베이스 : 그 요점(要點)과 활용(活用)(1) - 데이터베이스 서비스의 동향(動向) - (Commercial Databases : The Keypoints and Practical Use(1) - Trends of Database Services -)

  • 조재호
    • 정보관리연구
    • /
    • 제24권2호
    • /
    • pp.36-53
    • /
    • 1993
  • 우리는 정보(情報)에 근거를 두고 행동을 취하고 있다. 따라서 효율적인 행동을 하려면 정보의 입수(入手) 루트를 잘 가꾸어야 한다. 여러 경로(經路)의 루트가 있지만, 특히 상용(商用) 데이터베이스는 이점(利點)이 크다. 더구나 대가를 지불하면 누구든 자유롭게 사용할 수 있으므로, 이용 여하에 따라서 정보(情報)의 입수에 상당한 격차(隔差)가 생기게 된다. 한편, 일본(日本)의 상용(商用) 데이터베이스 서비스는 출현된지 20여년이 지나 최근 많이 변화되었다. 예를 들면, 배치에서 온라인으로 그리고 CD-ROM의 등장에 의한 미디어의 다양화(多樣化)는 그 대표적인 예이다. 데이터베이스의 최신 동향을 살펴, 정보화시대(情報化時代)의 틀(도구(道具))로써 활용(活用)하는 것이 매우 중요하다.

  • PDF

Face Sketch Synthesis Based on Local and Nonlocal Similarity Regularization

  • Tang, Songze;Zhou, Xuhuan;Zhou, Nan;Sun, Le;Wang, Jin
    • Journal of Information Processing Systems
    • /
    • 제15권6호
    • /
    • pp.1449-1461
    • /
    • 2019
  • Face sketch synthesis plays an important role in public security and digital entertainment. In this paper, we present a novel face sketch synthesis method via local similarity and nonlocal similarity regularization terms. The local similarity can overcome the technological bottlenecks of the patch representation scheme in traditional learning-based methods. It improves the quality of synthesized sketches by penalizing the dissimilar training patches (thus have very small weights or are discarded). In addition, taking the redundancy of image patches into account, a global nonlocal similarity regularization is employed to restrain the generation of the noise and maintain primitive facial features during the synthesized process. More robust synthesized results can be obtained. Extensive experiments on the public databases validate the generality, effectiveness, and robustness of the proposed algorithm.

국산재 제재목 Database 개발과 종절우선 재단시뮬레이션에 의한 수율 예측 (Development of Databases for Domestic Species and Estimation of Part Yields through Rip-First Cutting Simulation)

  • 이형우;김광남
    • Journal of the Korean Wood Science and Technology
    • /
    • 제29권2호
    • /
    • pp.100-108
    • /
    • 2001
  • 제재목으로부터 얻을 수 있는 부재(部材)(parts)의 수율을 미리 예측할 수 있다면 최고의 수율 보장이 가능한 방법으로 재단할 수 있으므로 목재산업의 생산성을 크게 향상시킬 수 있다. 특히, 옹이와 같은 결점들이 많이 포함되어 있는 국산 중소경재의 경우 수율 예측을 통한 재단최적화는 매우 필요한 공정이 아닐 수 없다. 본 연구에서는 국산 상수리나무와 소나무를 대상으로 제재목 database를 구축하여 다중 종절우선 공정 모형에 적용함으로써 국산재의 가공효율을 탐색하는 동시에 최고의 수율이 보장되는 재단 방법을 제시하고자 하였다.

  • PDF