The structures of two VBS (viral binding site) RNAs, SL1 and SL2, of Yeast Saccharomyces cerevisiae vims have been studied by 2D and 3D NMR experiments. VBSs play a crucial role in viral particle binding to the plus strand and packaging of the RNA. The secondary structures of the two VBS RNAs share a common feature of the stem-internal loop-stem-hairpin loop structure although the size of the internal loops of SL1 and SL2 differs. 2D experiments were sufficient for fill assignments of SL1. However, isotope labeling of the sample and multidimensional experiments were required for 28-nucleotide-long SL2 due to the spectral overlap. Several 3D HCCH experiments have accomplished full assignment of SL2 RNA.
Choi, Soon-Yong;Park, Hee Yun;Paek, Aron;Kim, Gil Seob;Jeong, Seong Eun
Molecules and Cells
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제28권6호
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pp.575-581
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2009
Ornithine decarboxylase (ODC) is a rate-limiting enzyme in the biosynthesis of polyamines, which are essential for cell growth, differentiation, and proliferation. This report presents the characterization of an ODC-encoding cDNA (SlitODC) isolated from a moth species, the tobacco cutworm, Spodoptera litura (Lepidoptera); its expression in a polyamine-deficient strain of yeast, S. cerevisiae; and the recovery in polyamine levels and proliferation rate with the introduction of the insect enzyme. SlitODC encodes 448 amino acid residues, 4 amino acids longer than B. mori ODC that has 71% identity, and has a longer C-terminus, consistent with B. mori ODC, than the reported dipteran enzymes. The null mutant yeast strain in the ODC gene, SPE1, showed remarkably depleted polyamine levels; in putrescine, spermidine, and spermine, the levels were > 7, > 1, and > 4%, respectively, of the levels in the wild-type strain. This consequently caused a significant arrest in cell proliferation of > 4% of the wild-type strain in polyamine-free media. The transformed strain, with the substituted SlitODC for the deleted endogenous ODC, grew and proliferated rapidly at even a higher rate than the wild-type strain. Furthermore, its polyamine content was significantly higher than even that in the wild-type strain as well as the spe1-null mutant, particularly with a very continuously enhanced putrescine level, reflecting no inhibition mechanism operating in the putrescine synthesis step by any corresponding insect ODC antizymes to SlitODC in this yeast system.
본 연구에서는 동시당화발효공정으로 바이오에탄올을 생산하기 위하여 바이오캡슐 형성을 시도하였다. 다수의 당화곰팡이 균주들과 발효 효모 균주들이 먼저 탐색되었다. Aspergillus sp. BCNU 6200, Penicillium sp. BCNU 6201 및 P. chrysogenum KACC 44363이 ${\alpha}$-amylase와 glucoamylase와 같은 당화 효소를 우수하게 생산하는 균주이었으며, Saccharomyces cerevisiae IFO-M-07이 조사된 균주 중에서 가장 에탄올 생산능이 높았다. 다음으로 pellet 형성 및 바이오 캡슐 형성을 위한 최적 조건을 평가하였다. 모든 조사된 곰팡이 모두 pellet을 형성하였으며, 바이오캡슐의 최적조건은 $28^{\circ}C$, 120 rpm이었다. 최종적으로 형성된 바이오캡슐을 이용하여 동시당화발효를 수행하여, Aspergillus sp. BCNU 6200의 바이오캡슐(Aspergillus sp. BCNU 6200 + S. cerevisiae IFO-M-07)이 10일간 발효시 $30^{\circ}C$, 120 rpm에서 3.9%의 에탄올을 생산함을 확인하였다. 본 실험 결과는 동시 당화발효 공정으로 바이오에탄올을 생산하는데 있어서 바이오캡슐을 활용함에 관한 유용한 정보를 제공하고 있다.
생리활성을 가진 고부가가치의 전통발효식품을 개발하고자 전통발효식품과 이들의 부원료로부터 분리한 곰팡이와 효모와 세균을 이용하여 각각 누룩과 막걸리와 청국장등을 제조한 후 이들의 생리기능성을 측정하였다. Aspergillus oryzae을 이용하여 제조한 N152-1 누룩이 가장 높은 57.2%의 항고혈압성 안지오텐신전환효소 저해활성을 보였고 전통누룩에서는 분리한 Saccharomyces cerevisiae Y111-5를 이용하여 제조한 막걸리가 42.0%의 항비만성 ${\alpha}$-Glucosidase 저해활성을 나타내었다. 또한 Brevibacterium iodinum NCDO 613(T)로 제조한 No 463 청국장이 혈전용해활성과 ${\alpha}$-Glucosidase 저해활성이 우수하였다. 위와같이 전통발효식품에서 분리한 진균류와 세균을 이용하여 제조한 Aspergillus oryzae N152-1 누룩과 Saccharomyces cerevisiae Y111-5 막걸리 및 Brevibacterium iodinum NCDO 613(T) No 463 청국장들은 생리기능성이 우수한 고부가가치의 전통발효 식품들로서 추가적인 이들의 안전성과 기호성 실험을 통하여 산업화가 가능할것으로 사료된다.
본 연구에서 와인발효의 최적 균주를 조사하였으며 최종 선발된 Saccharomyces sp. BCNU 6006의 발효 특성과 항산화 활성을 측정하였다. 먼저 효모는 막걸리, 과일 그리고 발효 식품에서 분리하였으며, 분리된 균주는 β-glucosidase, glycosidase와 protease 효소 활성과 에탄올 및 SO2 내성에 의해 선별하였고, 추가로 황화수소와 바이오제닉 아민을 생성하는 균주를 제외하여 총 9균주가 선별되었다, 한편 선별균주들은 계통적으로 K. sevazzii와 S. cerevisiae의 subcluster에 속하는 균주로 확인되었다. 최종 선발된 Saccharomyces sp. BCNU 6006균주의 흑마늘 와인 최적 발효조건은 26 brix, 28℃, 10일로 확인되었다. 발효가 완료된 흑마늘 와인의 성분은 에탄올 15.03%, 12 brix, pH 4.01로 측정되었고, 총 polyphenol, 총 flavonoid함량, tannin 그리고 5-HMF의 함량은 각각 3.85 mg/ml, 0.51 mg/ml, 5.90 mg/ml, 0.07 mg/ml으로 확인되었다. DPPH 라디칼 소거능, ABTS 라디칼 소거능 및 환원력은 각각 90.77%, 95.20% 그리고 1.261로 측정되었으며, 흑마늘 진액보다 낮았으나, Superoxide anion 라디칼 소거능은 94.42%로 흑마늘 진액보다 높았다. 효소활성, 발효특성 그리고 항산화 효능을 기초로 판단하면 Saccharomyces sp. BCNU 6006에 의해 제조된 흑마늘 와인은 산업적으로 잠재성이 높음이 확인되었다.
A repeated batch fermentation system was used to produce ethanol using $Saccharomyces$$cerevisiae$ strain (NCIM 3640) immobilized on sugarcane ($Saccharum$$officinarum$ L.) pieces. For comparison free cells were also used to produce ethanol by repeated batch fermentation. Scanning electron microscopy evidently showed that cell immobilization resulted in firm adsorption of the yeast cells within subsurface cavities, capillary flow through the vessels of the vascular bundle structure, and attachment of the yeast to the surface of the sugarcane pieces. Repeated batch fermentations using sugarcane supported biocatalyst were successfully carried out for at least ten times without any significant loss in ethanol production from sugarcane juice and molasses. The number of cells attached to the support increased during the fermentation process, and fewer yeast cells leaked into fermentation broth. Ethanol concentrations (about 72.65-76.28 g/L in an average value) and ethanol productivities (about 2.27-2.36 g/L/hr in an average value) were high and stable, and residual sugar concentrations were low in all fermentations (0.9-3.25 g/L) with conversions ranging from 98.03-99.43%, showing efficiency 91.57-95.43 and operational stability of biocatalyst for ethanol fermentation. The results of the work pertaining to the use of sugarcane as immobilized yeast support could be promising for industrial fermentations.
찹쌀식혜에 Saccharomyces cerevisiae를 가해 28$^{\circ}C$에서 10일간 발효시켜서 식혜주를 제조하였다. TLC 및 HPLC 분석 결과 발효에 따라 말토오스가 가장 급격히 감소하였다. 말토트리오스의 감소 속도는 낮다. 분자량이 큰 말토올리고당과 한계덱스트린은 전혀 발효되지 않았다. 에탄올은 3.6%를 나타냈다. 찹쌀식혜주의 아미노산 함량은 0.35$\mu$mol/ml, 단백질 함량은 100$\mu\textrm{g}$/ml를 나타냈다. pH는 3.23, 산도는 3.2ml를 나타냈다. 한계덱스트린은 1H-NMR로 분석 결과 식혜에 존재하는 것과 구조상 변화가 없었다. $\alpha$-1, 4- 결합에 대한 $\alpha$-1,6- 결합의 비율은 5.6:1을 나타냈다. 관능검사 결과, 전체적인 맛은 와인과 비슷하였다.
This study was conducted to determine the effect of Saccharomyces cerevisiae (SC) as a dietary probiotic and evaluated the most suitable feeding interval for this probiotic on growth performance, carcass yield, and meat quality parameters in broiler chickens. In total, 1,050 one-day-old Cobb 500 chicks were randomly assigned to one of seven dietary treatment groups, in a $2{\times}3$ factorial arrangement with 3 SC dosages (0.6%, 1%, and 1.4%) and two feeding intervals [long term (LT) for 35 days and short term (ST) for 28 days after hatching], with a negative control diet (NC; 0% SC). Triplicate experiments were performed with 50 birds per cage. Broilers fed a diet including SC showed increased (p<0.01) daily gain and feed efficiency compared to the control. Further, broilers fed the 1.4% SC supplemented diet showed a significantly increased (p<0.01) average daily gain (ADG) and feed conversion ratio (FCR) compared to broilers fed the 0.6% and 1% SC incorporated diets. Similarly, broilers fed an LT SC diet showed a greater (p<0.01) increase in ADG and FCR compared to broilers fed an ST SC diet. Moreover, broilers fed an LT SC diet displayed a reduced (p<0.05) meat pH, gizzard weight, and increased (p<0.05) meat water-holding capacity compared to broilers fed an ST SC diet. Broilers fed the 1.4% SC supplemented diet showed increased (p<0.05) thigh muscle weight compared to broilers fed the 0.6% and 1% SC supplemented diets. In conclusion, broilers fed LT SC diets showed improved growth performance and carcass quality parameters compared to broilers fed ST SC diets, and the NC diet, from hatching to day 35.
본 연구에서는 감가공 과정에서 매년 막대한 양으로 발생하는 감껍질을 이용하여 에탄올을 생산하기 위하여 묽은 황산으로 감껍질을 전처리하는 조건을 중심합성계획법과 반응표면분석법을 통하여 최적화하였다. 감껍질의 최적 전처리 조건은 황산농도 1.77%와 열처리 시간 26.4분이었으며 RSM 모델에서 예측한 수준과 비슷한 수율로 환원당을 생성하였다. 감껍질 전처리물을 이용한 효모발효에서 혐기적 배양조건에서 15.52 g/l의 에탄올이 생산되는 것을 확인하였다. 본 연구를 통하여 매년 막대한 양으로 발생하는 감껍질을 활용하는 방안 중의 하나로써 효모를 이용한 에탄올 생산의 가능성을 제시하였다.
대수증식(代數增殖) 중기(中期)의 S. cerevisiae에 $2{\times}10^{-3}M$의 paraquat를 처리(處理)하여 균체(菌體) 증식(增殖), 균체(菌體)의 일반적(一般的)형태 및 미세구조(微細構造)에 미치는 영향을 검토하였다. 균체(菌體)의 증식(增殖)은 Paraquat 처리(處理) 후(後) 조해(阻害)되기 시작하여 처리(處理) 6시간(時間) 이후(以後) 완전(完全)히 조해(阻害)되었다. 이 기간동안 탁도(濁度)는 0. 1에서 3.6으로, 건물(乾物) 중량(中量) 1ml당 2.75mg으로부터 3.35mg으로, 총균수(總菌數)는 ml당2 $1.14{\times}10^8cell$로부터 $2.15{\times}10^8cell$로 증가(增加)되었으나 6시간(時間) 이상(以上) 처리시간(處理時間)이 길어짐에 따라 역(逆)으로 감소되었고 사균율(死菌率)은 초기의 0.28%로부터 6시간(時間)째에는 5%, 12시간(時間)째에는 72%로 계속 증가(增加)되었다. Paraquat 처리(處理)에 의하여 균체(菌體)의 크기가 균일(均一)치 못하게 되었으며 세포벽(細胞壁)의 두께가 $0.15{\mu}m$(대조구(對照區) $0.20{\mu}m$)로 얇아지는 반면에 외측(外側)의 전자(電子)밀도가 높아졌으며 12시간(時間) 이상(以上)의 처리(處理)에 의하여 원형질막(原形質膜) 및 mitochondria와 같은 내막구조(內膜構造)가 와해되었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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