Background: The STK15 gene located on chromosome 20q13.2 encodes a centrosome-associated kinase critical for regulated chromosome segregation and cytokinesis. Recent studies have demonstrated STK15 to be significantly associated with many tumors, with aberrant expression obseved in many human malignancies. The purpose of this study was to investigate expression of STK15 in esophageal squamous cell carcinomas (ESCCs) in a Mongolian population. Methods: Two non-synonymous single nucleotide polymorphisms in the coding region of STK15, rs2273535 (Phe31Ile) and rs1047972 (Val57Ile) were assessed in 380 ESCC patients and 380 healthy controls. We also detected STK15 mRNA expression in 39 esophageal squamous cell carcinomas and corresponding adjacent tissues by real time PCR. Results: rs2273535 showed a significant association with ESCC in our Mongolian population (rs227353, P allele = 0.0447, OR (95%CI) = 1.259 (1.005~1.578)). Real time PCR analysis of ESCC tissues showed that expression of STK15 mRNA in cancer tissues was higher than in normal tissues (p = 0.013). Conclusions: Our study showed that functional SNPs in the STK15 gene are associated with ESCC in a Mongolian population and up-regulation of STK15 mRNAoccurs in ESCC tumors compared adjacent normal tissues. STK15 may thus have an important role in the prognosis of ESCC and be a potential therapeutic target.
Chong, Eric Tzyy Jiann;Goh, Lucky Poh Wah;See, Edwin Un Hean;Chuah, Jitt Aun;Chua, Kek Heng;Lee, Ping-Chin
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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제17권2호
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pp.647-653
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2016
Background: Breast cancer is the most common type of cancer affecting Malaysian women. Recent statistics revealed that the cumulative probability of breast cancer and related deaths in Malaysia is higher than in most of the countries of Southeast Asia. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in CYP2E1 (rs6413432 and rs3813867), STK15 (rs2273535 and rs1047972) and XRCC1 (rs1799782 and rs25487) have been associated with breast cancer risk in a meta-analysis but any link in Southeast Asia, including Malaysia, remained to be determined. Hence, we investigated the relationship between these SNPs and breast cancer risk among Malaysian women in the present case-control study. Materials and Methods: Genomic DNA was isolated from peripheral blood of 71 breast cancer patients and 260 healthy controls and subjected to polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) analysis. Results: Our study showed that the c1/c2 genotype or subjects with at least one c2 allele in CYP2E1 rs3813867 SNP had significantly increased almost 1.8-fold higher breast cancer risk in Malaysian women overall. In addition, the variant Phe allele in STK15 rs2273535 SNP appeared to protect against breast cancer in Malaysian Chinese. No significance association was found between XRCC1 SNPs and breast cancer risk in the population. Conclusions: This study provides additional knowledge on CYP2E1, STK15 and XRCC1 SNP impact of risk of breast cancer, particularly in the Malaysian population. From our findings, we also recommend Malaysian women to perform breast cancer screening before 50 years of age.
We evaluate the properties of friction welded STK400 steel tube in terms of the relationship between microstructures and mechanical properties. Friction welding is conducted at a rotation speed of 1,600 rpm and upset time of 3-7 sec for different thicknesses of STK 400 tubes. To analyse the grain boundary characteristic distributions(GBCDs) in the welded zone, electron backscattering diffraction(EBSD) method is introduced. The results show that a decrease in welding time (3 sec.) creates a notable increase grain refinement so that the average grain size decreases from $15.1{\mu}m$ in the base material to $4.5{\mu}m$ in the welded zone. These refined grains achieve significantly enhanced microhardness and a slightly higher yield and higher tensile strengths than those of the base material. In particular, all the tensile tested specimens experience a fracture aspect at the base material zone but not at the welded zone, which means a soundly welded state for all conditions.
본 연구에서는 동일한 지층 및 하중조건에서 PHC말뚝을 강관말뚝으로 대체할 경우 말뚝 본수의 변화와 푸팅을 포함한 공사비를 비교하였다. 얕은 풍화암층에 강관말뚝을 지지할 경우 PHC말뚝과 비교하여 12.5%의 본수가 절감되었다. 실 사례로부터 가정된 1.7m 두께의 풍화암층을 통과하여 깊은기초를 연암층에 지지할 경우 일반 및 고강도 강관말뚝은 각각 풍화암층에 설치한 PHC 말뚝 대비 35.7% 및 46.4%, 강관말뚝 대비 26.5% 및 38.8%의 본수가 절감되는 효과가 있는 것으로 나타났다. 푸팅두께가 일정하다고 가정할 경우 풍화암층을 관통하여 연암층에 설치된 일반 및 고강도 강관말뚝은 풍화암층에 설치된 PHC말뚝 대비 각각 12.2% 및 45.4%까지 푸팅의 소요면적을 절감할 수 있는 것으로 나타났다. 이러한 결과를 가지고 말뚝시스템의 전체 공사비를 산정한 결과 풍화암에 지지된 PHC말뚝과 비교할 때 연암층에 설치된 일반 강관말뚝의 비용은 12% 높게 산정된 반면, 이를 고강도 강관말뚝으로 대체하였을 경우는 오히려 16% 절감효과가 있는 것으로 나타났다. 이는 고강도 강관말뚝의 재료비가 상대적으로 높으나 말뚝 본수 및 푸팅면적의 감소로 인한 비용 절감효과가 더 크기 때문이다. 풍화암층 두께를 변화시키며 해석하여 말뚝시스템의 공사비를 비교한 결과 풍화암층 두께가 5m 이하인 조건에서는 PHC말뚝을 풍화암층에 지지하는 것보다 이를 관통하여 연암층에 고강도 강관말뚝을 지지하는 것이 전체 공사비 측면에서 유리한 것으로 나타났다.
원자력연구소 핫셀의 구조와 오염특성이 조사되었다. SEM 측정결과 핫셀 내부에 부착된 고방사능 분진의 크기는 $0.2{\sim}10{\mu}m$이었다. 사이클론의 최적 Vortex finder의 길이는 49 mm이고, 모의입자 유입속도는 15m/sec가 적합했다. 이때 $3{\mu}m$의 포집효율은 약 85%였다. 모의 입자 유입속도가 15m/sec보다 빠를 때, 포집효율의 증가율은 크지 않았다. 유입가스의 온도가 증가할 때, 포집효율은 약간 감소했다. Vortex finder의 길이가 증가할수록 사이클론내의 압력강하는 커졌다. Cut size diameter는 Reynolds number의 증가와 함께 감소했다. 측정된 Reynolds number에 근거하면, 사이클론 내부는 난류이고 이 난류는 사이클론 내의 압력강하에 원인이 된다고 사료된다. $Stk^{1/2}_{50}$는 Re 값의 증가와 함께 감소하고, Re의 값이 커질 때에서 일정한 값에 수렴했다. 즉, 6000-8000의 Re에서 $Stk^{1/2}_{50}$는 약 0.045를 나타냈다.
2010년 5월에 발사 예정인 KOMPSAT-5(KOrea Multi-Purpose SATellite-5)는 KOMPSAT-1, 2호에 탑재된 광학센서와는 달리 기상상태와 태양고도에 제약을 받지 않고 자료 획득이 가능한 SAR 시스템이 탑재된다. 본 연구에서는 KOMPSAT-5의 SAR 시스템으로부터 radargrammetry 기법을 적용하기 위해 위성의 궤도와 영상 모드를 분석하였다. Radargrammetry 적용을 위한 SAR 영상 pair의 parallax의 height sensitivity를 이론상으로 계산하였다. 그리고 STK 소프트웨어를 사용하여 대전과 남극 세종기지에서의 최적 조건을 각각 예시하였다. 입사각이 20$^{\cric}$-45$^{\cric}$가 되는 nominal mode의 descending pass만을 사용하여 height sensitivity가 0.5-0.75 사이의 영상 조합을 찾았다. 그 결과 Pass Number 쌍으로서, 대전은 5-4, 7-5, 8-5의 영상 조합을 하였을 때 radargrammetry 적용이 용이하고, 남극 세종기지는 8-6, 9-7, 10-7, 11-8, 12-8, 13-9, 14-9, 15-9, 15-10, 15-11의 영상 조합을 하였을 때 radargrammetry 적용이 가능한 것으로 예측되었다.
2010년 발사 예정인 다목적실용위성 5호 (KOMPSAT-5, KOrea Multi-Purpose SATellite-5)는 기상상태와 태양고도에 제약을 받지 않고 영상 획득이 가능한 SAR(Synthetic Aperture Radar) 시스템이 탑재된다. 본 연구에서는 SAR를 이용한 레이더 측량기법 (radargrarnrnetry)을 적용하기 위하여 KOMFSAT-5의 예상 궤도와 영상 모드를 분석하여 최적의 영상 조합을 제시하였다. 임의의 지상점에서 가장 가까운 위치에 있는 궤도로부터 패스번호를 부여하였고, 충분한 고도해상도를 얻기 위해 시차(parallax)에 따른 도민감도는 0.5이상을 선택하였으며, 레이더 영상의 기하왜곡을 고려하여 고도민감도가 0.8이하가 되는 영상 조합을 최적 조건으로 제시하였다. 예를 들어, 인접한 패스간의 거리가 약 95 km인 적도에서는 기하학적 모델을 이용하여 패스번호 3-9와 5-3의 두 쌍이 최적의 영상조합으로 제시되었다. 또한 임의로 선택한 대전과 남극 세종기지 지점에서는 STK 소프트웨어를 통해 궤도를 계산하였다. 대전에서는 5-4, 7-5, 8-5의 세 영상 조합을, 남극 세종기지에서는 8-6, 9-7, 10-7, 11-8, 12-8, 13-9, 14-9, 15-9, 15-10, 15-11의 열 쌍의 영상 조합이 레이더 측량기 법에 최적임을 제시하였다.
무궁화위성 $1{cdot}2$호와 앞으로 발사될 무궁화위성 3호의 원지점 궤도천이는 기본적으로 궤도평면을 바꾸는 타원궤도천이인데, 무궁화위성 $1{cdot}2$호의 경우는 고체추진제를 이용하여 천이궤도의 원지점에서 단 한번 분사함으로써 목표 표류궤도로 진입하는 AKM(Apoges Kick Motor)단계를 거치는 반면, 무궁화위성 3호는 액체추진제를 이용하영 원지점에서 여러번 분사를 통해 천이궤도를 바꾸어 나가면서 최종 표류궤도로 진입하는 LAE(Liquid Apogee Engine) 단계를 거치도록 계획되어 있다. 본 연구에서는 액체추진제를 사용한 정지궤도 진입방법과 추진제 제어방법을 연구하여 액체추진제를 사용한 정지궤도 진입 시뮬레이션 툴을 개발하였다. 정밀한 시뮬레이션을 위해 연세대학교 위성궤도공학연구실의 COWELL5 정밀궤도예측 프로그램을 토대로 기본설계를 했으며, 결과는 $STK/VO^{TM}$의 지상궤적 및 3차원 그래픽환경으로 실시간 구현이 가능하도록 했다.
The rs2273535 polymorphism in the AURKA gene had proven to be associated with breast carcinoma susceptibility. Nevertheless, the results of different studies remain contradictory. A meta-analysis covering 28, 789 subjects from eleven different studies was here carried out in order to investigate the association in detail. The random effects model was used to analyze the pooled odds ratios (ORs) and their corresponding 95% confidence intervals (95% CIs). A significant relationship between the rs2273535 polymorphism and breast tumors was found in an allelic genetic model (OR: 1.076, 95% CI: 1.004-1.153, p=0.040, $P_{heterogeneity}$=0.002). No significant association was detected in a homozygote model (OR: 1.186, 95% CI: 0.990-1.423, P=0.065, $P_{heterogeneity}$=0.002), a heterozygote model (OR: 1.016, 95% CI: 0.959-1.076, p=0.064, $P_{heterogeneity}$=0.000), a dominant genetic model (OR: 1.147, 95% CI: 0.992-1.325, p=0.217, $P_{heterogeneity}$=0.294) and a recessive genetic model (OR: 1.093, 95% CI: 0.878-1.361, p=0.425, $P_{heterogeneity}$=0.707). A significant relationship between the rs2273535 polymorphism in the AURKA gene and breast tumor in Asian group was found in an allelic genetic model (OR: 1.124, 95% CI: 1.003-1.29, p=0.044, $P_{heterogeneity}$=0.034), a homozygote model (OR: 1.229, 95% CI: 1.038-1.455, p=0.016, $P_{heterogeneity}$=0.266) and a recessive genetic model (OR: 1.227, 95% CI: 1.001-1.504, p=0.049, $P_{heterogeneity}$=0.006). A significant association was thus observed between the rs2273535 polymorphism in the AURKA gene and breast cancer risk. Individuals with the rs2273535 polymorphism in the AURKA gene have a higher risk of breast cancer in Asian populations, but not in Caucasians.
Milk-related traits (milk yield, fat and protein) have been crucial to selection of Holstein. It is essential to find the current selection trends of Holstein. Despite this, uncovering the current trends of selection have been ignored in previous studies. We suggest a new formula to detect the current selection trends based on single nucleotide polymorphisms (SNP). This suggestion is based on the best linear unbiased prediction (BLUP) and the Fisher's fundamental theorem of natural selection both of which are trait-dependent. Fisher's theorem links the additive genetic variance to the selection coefficient. For Holstein milk production traits, we estimated the additive genetic variance using SNP effect from BLUP and selection coefficients based on genetic variance to search highly selective SNPs. Through these processes, we identified significantly selective SNPs. The number of genes containing highly selective SNPs with p-value <0.01 (nearly top 1% SNPs) in all traits and p-value <0.001 (nearly top 0.1%) in any traits was 14. They are phosphodiesterase 4B (PDE4B), serine/threonine kinase 40 (STK40), collagen, type XI, alpha 1 (COL11A1), ephrin-A1 (EFNA1), netrin 4 (NTN4), neuron specific gene family member 1 (NSG1), estrogen receptor 1 (ESR1), neurexin 3 (NRXN3), spectrin, beta, non-erythrocytic 1 (SPTBN1), ADP-ribosylation factor interacting protein 1 (ARFIP1), mutL homolog 1 (MLH1), transmembrane channel-like 7 (TMC7), carboxypeptidase X, member 2 (CPXM2) and ADAM metallopeptidase domain 12 (ADAM12). These genes may be important for future artificial selection trends. Also, we found that the SNP effect predicted from BLUP was the key factor to determine the expected current selection coefficient of SNP. Under Hardy-Weinberg equilibrium of SNP markers in current generation, the selection coefficient is equivalent to $2^*SNP$ effect.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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