• 제목/요약/키워드: SSC12

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Methylation Status of H19 Gene in Embryos Produced by Nuclear Transfer of Spermatogonial Stem Cells in Pig

  • Lee, Hyun-Seung;Lee, Sung-Ho;Gupta, Mukesh Kumar;Uhm, Sang-Jun;Lee, Hoon-Taek
    • Reproductive and Developmental Biology
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    • 제35권1호
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    • pp.67-75
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    • 2011
  • The faulty regulation of imprinting gene lead to the abnormal development of reconstructed embryo after nuclear transfer. However, the correlation between the imprinting status of donor cell and preimplantation stage of embryo development is not yet clear. In this study, to determine this correlation, we used the porcine spermatogonial stem cell (pSSC) and fetal fibroblast (pFF) as donor cells. As the results, the isolated cells with laminin matrix selection strongly expressed the GFR ${\alpha}$-1 and PLZF genes of SSCs specific markers. The pSSCs were maintained to 12 passages and positive for the pluripotent marker including OCT4, SSEA1 and NANOG. The methylation analysis of H19 DMR of pSSCs revealed that the zinc finger protein binding sites CTCF3 of H19 DMRs displayed an androgenic imprinting pattern (92.7%). Also, to investigate the reprogramming potential of pSSCs as donor cell, we compared the development rate and methylation status of H19 gene between the reconstructed embryos from pFF and pSSC. This result showed no significant differences of the development rate between the pFFs ($11.2{\pm}0.8%$) and SSCs ($13.3{\pm}1.1%$). However, interestingly, while the CTCF3 methylation status of pFF-NT blastocyst was decreased (36.3%), and the CTCF3 methylation status of pSSC-NT blastocyst was maintained. Therefore, this result suggested that the genomic imprinting status of pSSCs is more effective than that of normal somatic cells for the normal development because the maintenance of imprinting pattern is very important in early embryo stage.

Millimeter Wave를 이용하는 OFDM WPAN 시스템에서 PAPR 감소에 관한연구 (A Study on PAPR reduction in OFDM WPAN system using Millimeter Wave)

  • 김완태;유선용;조성준
    • 한국항행학회논문지
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    • 제12권2호
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    • pp.139-145
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    • 2008
  • 최근 60GHz 대역의 millimeter wave 를 이용하는 통신 시스템에 관한 연구가 활발히 진행되고 있으며 새롭게 정의된 57~64GHz의 ISM 대역에 대한 관심이 집중되고 있다. 국내를 비롯한 미국, 일본, 유럽 등에서도 millimeter wave 를 이용하는 근거리 통신에 대한 연구가 진행 중이다. 그 중 IEEE 802.15.3c 표준화는 근거리에서 높은 전송 속도를 지원하기 위해 OFDM (Orthogonal Frequency Division Multiplexing) 방식의 시스템을 제안하고 있다. 하지만 OFDM 방식은 PAPR (Peak-to-Average Power Ratio) 이 발생하는 문제점을 가지고 있으며, PAPR 문제는 신호가 A/DC와 D/AC 그리고 전력 증폭기와 같은 비선형 소자를 통과할 때 심각한 왜곡을 발생시켜 전송 시스템의 성능이 저하된다. 본 논문에서는 PAPR 문제를 해결하기 위하여 Sine Soft Clipping (SSC) 기법을 제안하고, SAW (Surface Acoustic Wave) Filter와 전력 증폭기를 적용하여 IEEE 802.15.3c OFDM WPAN 전송 시스템의 PAPR, CCDF, PSD, BER 성능을 분석하였다.

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Cloning and Initial Analysis of Porcine MPDU1 Gene

  • Yang, J.;Yu, M.;Liu, B.;Fan, B.;Zhu, M.;Xiong, T.;Li, Kui
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제18권9호
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    • pp.1237-1241
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    • 2005
  • Mannose-P-dolichol utilization defect 1 (MPDU1) gene is required for utilization of the mannose donor MPD in synthesis of both lipid-linked oligosaccharides (LLOs) and glycosylphosphatidylinositols (GPI) which are important for functions such as protein folding and membrane anchoring. The full length cDNA of the porcine MPDU1 was determined by in silico cloning and rapid amplification of cDNA ends (RACE). The deduced amino acid showed 91% identity to the corresponding human sequence with five predicted transmembrane regions. RT-PCR was performed to detect its expression pattern in five tissues and results showed that it is expressed ubiquitously among the tissues checked. A single nucleotide substitution resulting in the amino acid change (137 Tyr-137 His) was detected within exon 5. Allele frequencies in six pig breeds showed distinctive differences between those Chinese indigenous pigs breeds and European pigs. Using the pig/rodent somatic cell hybrid panel (SCHP), we mapped the porcine MPDU1 gene to SSC12, which is consistent with the comparative mapping result as conservative syntenic groups presented between human chromosome 17 and pig chromosome 12.

기능성 MA 필름으로 포장한 이집트산 토마토의 신선도 (Freshness of Tomatoes Cultivated in Egypt by Packaging Functional MA film)

  • 박형우;김상희;차환수;김윤호;이선아
    • 한국포장학회지
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    • 제12권1호
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    • pp.41-44
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    • 2006
  • 이집트에서 생산되는 토마토의 신선도 유지를 위해 기능성 MA 필름을 사용하여 박스단위(10 kg)로 포장하여 상온에서 7일간 저장하면서 품질변화를 살펴보았다. 저장 7일후 중량 감모율은 MA구가 대조구에 비해서 50% 정도 중량 감소가 적었으며, 적정산도와 가용성 고형분의 함량 역시 저장기간 동안 MA구에서 높게 유지되고 있었다. 비타민 C의 변화는 필름 포장구인 MA구에서 그 변화 정도가 대조구에 비해 적게 나타나 이집트산 토마토의 품질유지를 위해 기능성 MA 포장재 활용이 가능할 것으로 사료된다.

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신고배의 저장성에 미치는 가식성 코팅제의 효과 (Edible Coating Effects on Storage life of ‘Niikata’ Pear)

  • 양용준
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제3권3호
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    • pp.216-220
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    • 2002
  • 신고배의 저장성에 미치는 가식성 코팅제의 효과를 조사하고자 연구하였다. 신고 배의 저온저장 18주 후 무게는 저온상태에서 11% 정도의 감량이 나타난 반면, 코팅 처리구에서 약간 적은 감량을 보였고 경도는 저온상태에서 보다 코팅 처리구에서 높았고 가용성 당 함량(SSC)도 같은 경향이었다. Hunter 'L' 값은 코팅 처리구에서 감소가 비교적 큰 것으로 나타났다. 저온 처리구의 호흡률은 저장 14주 이후 다소 증가하는 경향을 보였고 에틸렌 발생은 함량이 저장초기에 에틸렌 발생이 높았다. 저온 처리와 코팅 처리 시 모두 저장 10주째까지 높은 시장성을 유지하였고 저온 처리구에서 저장 12주째까지 시장성 지수 3 이상을 나타내 코팅 처리에 비하여 품질이 우수하였다. 코팅 처리구는 코팅 두께로 기인된 과육내 고 이산화탄소 장해로 과피 흑변이 나타나 저온저장처리에 비해 시장성이 떨어졌다.

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압밀시험의 수치해석에 의한 MCC 모델과 SSC 모델 비교 (Comparison of MCC and SSC Models Based on Numerical Analysis of Consolidation Test)

  • 권병해;임성훈
    • 한국농공학회논문집
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    • 제66권2호
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    • pp.1-12
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    • 2024
  • In order to integrate two consolidation theories of Terzaghi's consolidation theory and Mesri's secondary compression theory and to identify a model suitable for analyzing stress-strain behavior over time, numerical analysis on consolidation tests were conducted using a modified cam-clay model and a soft soil creep model and the following conclusions were obtained. The results of numerical analysis applying the theory that a linear proportional relationship is established between the void ratio at logarithmic scale and the permeability coefficient at logarithmic scale is better agreement with the result of oedometer test than the results of applying constant hydraulic conductivity. The modified cam-clay model is a model that does not include secondary compression, but the slope of the normal consolidation line corresponding to the compression index of the standard consolidation test includes secondary compression, so the actual settlement curve over time is lower than the predicted value through numerical analysis. It always gets smaller. Other previous studies that applied Terzaghi's consolidation theory to consolidation test analysis showed the same results and were cross-confirmed. The soft soil creep model, which includes secondary compression in the theory, showed good agreement in all sections including secondary compression in the consolidation test results. It was judged appropriate to use a soft soil creep model when performing numerical analysis of soft clay ground.

Identification of loci affecting teat number by genome-wide association studies on three pig populations

  • Tang, Jianhong;Zhang, Zhiyan;Yang, Bin;Guo, Yuanmei;Ai, Huashui;Long, Yi;Su, Ying;Cui, Leilei;Zhou, Liyu;Wang, Xiaopeng;Zhang, Hui;Wang, Chengbin;Ren, Jun;Huang, Lusheng;Ding, Nengshui
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제30권1호
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    • pp.1-7
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    • 2017
  • Objective: Three genome-wide association studies (GWAS) and a meta-analysis of GWAS were conducted to explore the genetic mechanisms underlying variation in pig teat number. Methods: We performed three GWAS and a meta-analysis for teat number on three pig populations, including a White Duroc${\times}$Erhualian $F_2$ resource population (n = 1,743), a Chinese Erhualian pig population (n = 320) and a Chinese Sutai pig population (n = 383). Results: We detected 24 single nucleotide polymorphisms (SNPs) that surpassed the genome-wide significant level on Sus Scrofa chromosomes (SSC) 1, 7, and 12 in the $F_2$ resource population, corresponding to four loci for pig teat number. We highlighted vertnin (VRTN) and lysine demethylase 6B (KDM6B) as two interesting candidate genes at the loci on SSC7 and SSC12. No significant associated SNPs were identified in the meta-analysis of GWAS. Conclusion: The results verified the complex genetic architecture of pig teat number. The causative variants for teat number may be different in the three populations

Cloning and Characterization of Bovine Titin-cap (TCAP) Gene

  • Yu, S.L.;Chung, H.J.;Jung, K.C.;Sang, B.C.;Yoon, D.H.;Lee, S.H.;Kata, S.R.;Womack, J.E.;Lee, J.H.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제17권10호
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    • pp.1344-1349
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    • 2004
  • Titin-cap (TCAP), one of the abundant transcripts in skeletal muscles, was nvestigated in this study in cattle because of its role in regulating the proliferation and differentiation of myoblasts by interacting with the myostatin gene. From the 5, and 3, RACE experiments, full-length TCAP coding sequence was identified, comprising 166 amino acids. The amino acid comparison showed high sequence similarities with previously identified human (95.8%) and mouse (95.2%) TCAP genes. The TCAP expression, addressed by northern blot, is limited in muscle tissues as indicated by Valle et al. (1997). The radiation hybrid analysis localized the gene on BTA19, where the comparative human and porcine counterparts are on HSA17 and SSC12. A few muscle-related genetic disorders were mapped on HSA17 and some growth-related QTLs were identified on SSC12. The bovine TCAP gene found in this study opens up new possibilities for the investigation of muscle-related genetic diseases as well as meat yield traits in cattle.

Preliminary research for molecular markers of two invasive toxic weeds, Cenchrus L. (Poaceae) species, based on NGS technique

  • Hyun, JongYoung;Jung, Joonhyung;Do, Hoang Dang Khoa;Kim, Joo-Hwan
    • 한국자원식물학회:학술대회논문집
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    • 한국자원식물학회 2019년도 춘계학술대회
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    • pp.71-71
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    • 2019
  • The genus Cenchrus (Poaceae), containing ca. 23 species, is distributed throughout Australia, Africa, Indian sub-continent, and America. In Korea, Cenchrus longispinus (Hack.) Fernald, especially introduced to Daecheong Island in 1999, is one of the most hazardous invasive plant which causes serious environmental threats, biodiversity damages and physically negative impact on humans and animals. Based on the next-generation sequencing (NGS) technology, we characterized the chloroplast (cp) genome sequences of C. longispinus which contains a large single copy (LSC; 80,223 bp), a small single copy (SSC; 12,449 bp), separated by a pair of inverted repeats (IRs; 22,236 bp). Additionally, we analyzed the cp genome sequences of Cenchrus echinatus L. which contains a large single copy (LSC; 80,220 bp), a small single copy (SSC; 12,439 bp), separated by a pair of inverted repeats (IRs; 22,236 bp). These cp genomes consist of 75 unique genes, 4 rRNA coding genes, 33 tRNA coding genes and 21 duplicated in the IR regions, of which the gene content and organization are similar to the other Poaceae cp genomes. We selected 40 potential regions in cp genomes of two Cenchrus species and one Korean Pennisetum species to develop new single nucleotide polymorphism (SNP) markers for identifying C. longispinus based on amplification-refractory mutation system (ARMS) technique. The markers, inferred from SNP in matK and ndhF genes, show effectiveness to recognize C. longispinus from C. echinatus and Korean native species Pennisetum alopecuroides (L.) Spreng.

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'만풍배'의 생육기별 해부학적 구조와 과실품질 (The Characteristics of Anatomical Structure and Fruit Quality According to Fruit Developmental Stage of Pyrus pyrifolia Nakai cv. Manpungbae)

  • 박지은;권용희;이별하나;박요섭;정명희;최진호;박희승
    • 원예과학기술지
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    • 제31권4호
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    • pp.407-414
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    • 2013
  • 본 연구는 '만풍배'의 생육단계 및 괘대 유무에 따른 과실의 해부학적 차이를 알아보고, 수확기 과실의 품질 및 착색특성 관찰을 통하여 '만풍배'의 생리적 특징을 이해하기 위하여 수행되었다. 만개기의 과실구조는 바깥쪽으로부터 외표피층, 아표피층, 유조직층, 내표피층으로 구성되어 있으며 아표피층을 이루는 세포 층수는 만개기부터 만개 후 77일까지 9-13층까지 최대로 증가하여 '만풍배'의 세포 분열 기간은 만개 후 77일까지로 조사되었다. 이 기간 동안 아표피층에서 유관속조직까지의 두께는 $73.1{\mu}m$부터 $195{\mu}m$까지 증가하였다. 석세포는 만개 후 7일부터 관찰되어 만개 후 49일에는 석세포군이 형성되어 있었다. 코르크층은 만개 후 49-77일 사이에 형성되었다. 성숙기인 만개 후 161일 '만풍배' 과실의 과피는 바깥쪽부터 코르크층은 4.5층, 아표피층은 7개의 세포층으로 구성되어 있었고 아표피층에는 탄닌이 분포해 있었다. '만풍배'의 괘대 유무에 따른 과실비대 및 조직발달을 비교한 결과, 괘대 초기에는 코르크층이 유대재배구에서 더 빨리 생겨나는 것으로 관찰되었으나 성숙기에는 3층 정도 무대재배구에서 더 두꺼워지는 것을 관찰할 수 있었다. 석세포군의 크기는 두 실험구 모두 불균일하게 분포되어 있었으며 과중은 무대재배구에서 더 높았으나 수확기의 당도는 괘대 유무에 따른 차이를 보이지 않았다. '만풍배'의 수확기 과중 등급은 301g부터 900g 이상까지 분포하였고, 그 중 551-800g의 과실이 총 수확량의 71.6%로 가장 많았으며 이 범위의 평균 과중은 677.2g이었다. 과실품질은 가용성 고형물 함량 $10.1-12.1^{\circ}Brix$, 산도 0.10-1.24%, 당산비 9.76-14.31로 분포하였으며 과중과 가용성 고형물 함량은 매우 높은 정의 상관관계를 나타내어 과실 크기가 클수록 가용성 고형물 함량도 높았다. 반면에 경도는 과중 및 가용성 고형물 함량과 높은 부의 상관관계를 나타내어 과실크기가 클수록 낮은 경향을 나타냈다. 과피의 황갈색 부분과 녹색 부분을 구분하여 코르크층 수와 함께 엽록소 함량을 조사한 결과, 코르크층은 황갈색 부분은 3.8층, 녹색부분은 3.5층으로 거의 차이를 보이지 않았으나 엽록소 함량은 녹색부분이 많은 것으로 조사되었다.