• 한국식물병리학회지
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• 제11권4호
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• pp.312-317
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• 1995

The polygalacturonase (PG) production in rotten apples by Botryosphaeria dothidea was purified by using gel filtration and ion exchange column chromatography, and the biochemical characters of PG were investigated. The purified PG appeared as a single band on sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) with approximate molecular weight of 49 kilodalton (kDa). The molecular weight was equal to the native molecular weight estimated by gel filtration. The Km and Vmax values of PG were 0.51 mg/ml and 90.9 $\mu$M/min/ml, respectively. Optimum pH was 4.0~5.0, and the PG activity was stable from pH 5.0~10.0. Optimum temperature of the enzyme activity was 4$0^{\circ}C$. The PG activity was relatively stable at 2$0^{\circ}C$, but it was reduced 45% at 4$0^{\circ}C$ and completely inactivated at 8$0^{\circ}C$. The PG activity was considerably inhibited by Cu2+, Zn2+, SDS and EDTA, whereas it was not effected by Ca2+, K+, Mg2+ or Na+ ions.

• 한국수산과학회지
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• 제28권6호
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• pp.728-735
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• 1995

The peptidyl prolyl cis-trans isomerase(PPlase, EC 5.2.2.8) from Bacillus stearothermophilus SIC1 was extracted from the cells treated with by lysozyme. PPlase was purified from the cell extracts by heat treatment, ammonium sulfate precipitation, ion exchange chromatography and finally gel filtration (FPLC). The purity of purified the enzyme after Superose 12 column chromatography was examined by sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis(SDS-PAGE). The molecular weight of the purified PPlase was estimated as 18,000 by SDS-PAGE. The 39 amino acid residues from the N-terminus were determined by the protein sequencer. The enzyme showed the optimum pH at 8.0 and was stable at the range of pH 7.0 to 8.0. The enzyme was considerably stable after heat treatment at $60^{\circ}C$ for 30 minutes, and the enzyme was quite stable up to $65^{\circ}C$. The presence of the PPlase in the refolding solution accelerated the isomerization rate of the assay peptide.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제11권11호
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• pp.2166-2171
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• 2007

본 논문에서는 P2P 네트워크에서 높은 스트리밍 QoS를 제공하기 위한 Sequential Download System(SDS)을 제안하였다. SDS는 Download Manager를 이용하여 여러 피어로부터 파일을 수신하고, 파일 수신시에 피어의 갑작스런 이탈에 대처할 수 있다. 또한 스트리밍 시 발생하는 버퍼링 시간을 최소화하여 안정된 스트리밍을 제공하며, Memory Map을 이용하여 다운로드 중에도 다른 피어의 요청에 대처할 수 있다.

• BMB Reports
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• 제35권4호
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• pp.364-370
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• 2002

The effect of sodium n-dodecyl sulphate (SDS) on hemoglobin autoxidation was studied in the presence of a 100mM phosphate buffer (pH 7.0) by different methods. These included spectorphotometry, fluorescence technique, cyclic voltametry, differential scanning calorimetry, and densitometry. Spectroscopic studies showed that SDS concentrations up to 1 mM increased deoxy-, decreases oxy-, and had no significant effect on the met- conformation of hemoglobin. Therefore, a SDS concentration up to 1 mM increased the deoxy form of hemoglobin as the folded, compact state and decreases the oxy conformation. The turbidity measurements and differential scanning calorimetry techniques indicated a more stable conformation for hemoglobin in the presence of SDS up to 1mM. Electrochemical studies also confirmed a more difficult oxidation under these conditions. The induction of the deoxy form in the presence of SDS was confirmed by densitometry techniques. The compact structure of deoxyhemoglobin blocks the formation of met-conformation in low SDS concentrations.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제22권1호
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• pp.58-68
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• 2012

An investigation was conducted on the enhancement of production and purification of an oxidant and SDS-stable alkaline protease (BHAP) secreted by an alkalophilic Bacillus horikoshii, which was screened from the body fluid of a unique Korean polychaeta (Periserrula leucophryna) living in the tidal mud flats of Kwangwha Island in the Korean West Sea. A prominent effect on BHAP production was obtained by adding 2% maltose, 1% sodium citrate, 0.8% NaCl, and 0.6% sodium carbonate to the culturing medium. The optimal medium for BHAP production contained (g/l) SBM, 15; casein, 10; $K_2HPO_4$, 2; $KH_2PO_4$, 2; maltose, 20; sodium citrate, 10; $MgSO_4$, 0.06; NaCl, 8; and $Na_2CO_3$, 6. A protease yield of approximately 56,000 U/ml was achieved using the optimized medium, which is an increase of approximately 5.5-fold compared with the previous optimization (10,050 U/ml). The BHAP was homogenously purified 34-fold with an overall recovery of 34% and a specific activity of 223,090 U/mg protein using adsorption with Diaion HPA75, hydrophobic interaction chromatography (HIC) on Phenyl-Sepharose, and ion-exchange chromatography on a DEAE- and CM-Sepharose column. The purified BHAP was determined a homogeneous by SDS-PAGE, with an apparent molecular mass of 28 kDa, and it showed extreme stability towards organic solvents, SDS, and oxidizing agents. The $K_m$ and $k_{cat}$ values were 78.7 ${\mu}M$ and $217.4s^{-1}$ for N-succinyl-Ala-Ala-Pro-Phe-pNA at $37^{\circ}C$ and pH 9, respectively. The inhibition profile exhibited by PMSF suggested that the protease from B. horikoshii belongs to the family of serine proteases. The BHAP, which showed high stability against SDS and $H_2O_2$, has significance for industrial application, such as additives in detergent and feed industries.

• Food Science and Biotechnology
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• 제15권2호
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• pp.177-182
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• 2006

Polyphenol oxidase (PPO) was isolated from the flesh of Fuji apples by DEAE-Cellulose, ammonium sulfate precipitation, phenyl-Sepharose CL-4B, and Sephdex G-100 chromatography. The molecular mass of the purified PPO was estimated to be 40 kDa by SDS polyacrylamide gel electrophoresis. With regard to substrate specificity, maximum activity was achieved with chlorogenic acid as substrate, followed by catechin and catechol whereas, there was no detectable activity with hydroquinic acid, resorcinol, or tyrosine as substrate. The optimum pH and temperature with catechol as substrate were 6.5 and $35^{\circ}C$, respectively. The enzyme was most stable at pH 6.0 and unstable at acidic pH. The enzyme was stable when it was heated to $45^{\circ}C$ but heating at $50^{\circ}C$ for more than 30 min caused 50% loss of activity. Reduced $ZnSO_4$, L-cystein, epigallocatechin-3-o-gallate (EGCG), and gallocatechin gallate (GCG) also inhibited activity.

• Applied Microscopy
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• 제30권2호
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• pp.185-191
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• 2000

초고온 archaeon인 Thermococcus profundus에서 매우 거대한 단백질 복합체를 분리 및 구조를 규명하였다. 거대 복합체는 93kDa단백질(P93 complex)로 구성된 homomultimer이며, 강한 내열성을 보여주고 있다. 순수 분리한 P93 complex를 SDS(최종 농도 1%)와 $85^{\circ}C$에서 12시간 항온시킨 후, SDS-PAGE와 전자현미경에서 구조적 변화를 관찰할 수 없었다. 음착색된 P93 complex의 전자현미경 사진에서 하나의 형태만을 보여주고 있으며, 구조의 규명을 위해 image processing을 하였다. 이의 구조는 3대칭 중심에 core(혹은 hole)이 뚜렷이 존재하며 이를 중심으로 단백질이 모여 있는 형태를 보여 주고 있다. 또한 P93 complex는 가장자리에서 뚜렷한 형태를 보여주지 않은 부분, 즉 flexible부분을 포함하고 있다. Gel filtration과 2차원 구조를 기초로 P93 complex는 24 homomultimer로 되어 있음을 추정하였다.

• 대한토목학회논문집
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• 제31권4B호
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• pp.377-382
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• 2011

본 연구에서는 modified fenton 반응에서 과산화수소를 안정화하여 오염토양 정화의 효과를 증대시키고자 하였다. 오염토양을 모사하기 위하여 PAHs 계열의 대표적인 오염물질인 phenanthrene을 사용하였다. 과수안정제로는 음이온 계면활성제인 SDS(Sodium dodecyl Sulfate)를 사용하였다. Modified Fenton 반응에서 phenanthrene의 제거율을 확인하기 위하여 Fe(II) 4 mM, SDS 5~50 mM 및 $H_2O_2$ 102.897 mM를 phenanthrene 125 mg/kg으로 오염된 토양에 주입하였다. 과수안정제인 SDS가 30 mM이 사용된 경우 phenanthrene의 제거 효율이 95%로 가장 높게 나타났으며 30 mM이싱에서는 시스템에서 SDS가 scavenger로 작용하여 오염물질의 제거효율이 SDS 30 mM 일 때 보다 낮게 나타났다. 과수안정제를 사용한 뒤 과산화수소의 농도변화를 분석한 결과 Fe(II) 2 mM에서 48시간 이후 14.6995 mM 이상 남아있어서 가장 안정적이었지만, Fe(III)을 주입한 경우에는 과산화수소가 안정화되지 않았다. Modified Fenton 반응에서 철과 SDS 농도 사이의 최적의 비율을 찾기 위하여 SDS의 농도는 30 mM로 고정하고 철의 농도를 2~8 mM로 변화시켜 실험한 결과 Fe(II) 4 mM 및 SDS 30 mM에서 약 95%의 가장 높은 제거율을 보였다.

• 한국식품과학회지
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• 제32권4호
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• pp.822-827
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• 2000

새우 알러지를 감소시키기 위한 방법으로써 감마선 조사기술의 이용 가능성을 평가하였다. 새우로부터 분리한 열안정성 단백질(HSP)과 병원에서 임상진단용으로 사용하는 새우 단백질 추출액을 1, 3, 5, 7, 10 kGy의 선량으로 감마선을 조사하였다. 단백질 추출액 및 HSP의 알러지성과 항원성의 변화를 mAb와 환자의 IgE를 사용한 ELISA법과 immunoblotting법으로 측정하였고, 단백질의 구조변화는 gel permeation chromatography와 SDS-PAGE로 관찰하였다. 환자의 IgE는 감마선 조사된 단백질 추출액과 HSP용액 모두에서 감마선 조사선량이 증가함에 따라 감소하였다. GPC-HPLC와 sandwich ELISA법으로 HSP를 정량하였을 때도 역시 감마선 조사선량이 증가함에 따라 감소하였다. SDS-PAGE pattern 변화에서 HSP는 감마선 조사에 의해 변화되어 더 큰 분자량으로 전환되었다. 이러한 결과는 감마선 조사가 새우 알러지 억제에 적용 할 수 있다는 가능성을 시사하였다.

• 공업화학
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• 제5권5호
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• pp.779-785
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• 1994

양이온 색소인 thionin(Th)과 음이온 계면활성제인 sodium dodecyl sulfate(SDS) 사이의 상호작용을 흡수 spectra로 고찰하였다. 임계미셀농도(critical micelle concentration, CMC)보다 훨씬 낮은 premicellar 영역(S/D=10, 80 및 160)에서 온도가 증가함에 따라 몰 흡광계수비가 증가하거나 감소함을 볼 수 있으며, S/D=160에서 Th-SDS계의 다분자 회합체가 생성하는 가장 안정한 온도 범위는 $60^{\circ}C$ 이하임을 알 수 있었다. 한편 Th-SDS계에 첨가한 무기염 및 유기용매의 농도가 증가함에 따라 ${\gamma}$-band와 J-band는 감소하나 ${\alpha}$-band는 오히려 증가하는 경향이 나타났다. 이들의 ${\alpha}$-band의 증가 순서는 무기염의 경우 $Cl^-$>$ClO{_4}{^-}$>$SO{_4}{^{2-}}$>$NO{_3}{^-}$로 나타나며, 유기용매인 경우는 2-propanol>ethanol>methanol>ethylene glycol로 나타남을 알 수 있다.