Purification and Structural Characterization of P93 Complex from Hyperthermophilic Archaeon Thermococcus profundus

초고온 archaeon인 Thermococcus profundus에서 P93 복합체의 분리 및 구조적 특성

  • Lee, Mi-Hong (Department of Biochemistry, Gyeongsang National University) ;
  • Kim, Suk-Kyoung (Department of Biochemistry, Gyeongsang National University) ;
  • Yun, Young-Gun (Department of Biochemistry, Gyeongsang National University) ;
  • Park, Seong-Cheol (Department of Biochemistry, Gyeongsang National University) ;
  • Bahk, Jeong-Dong (Department of Biochemistry, Gyeongsang National University) ;
  • Cheong, Gang-Won (Department of Biochemistry, Gyeongsang National University)
  • 이미홍 (경상대학교 자연과학대학 생명과학부 생화학과) ;
  • 김숙경 (경상대학교 자연과학대학 생명과학부 생화학과) ;
  • 윤영근 (경상대학교 자연과학대학 생명과학부 생화학과) ;
  • 박성철 (경상대학교 자연과학대학 생명과학부 생화학과) ;
  • 박정동 (경상대학교 자연과학대학 생명과학부 생화학과) ;
  • 정강원 (경상대학교 자연과학대학 생명과학부 생화학과)
  • Published : 2000.06.01

Abstract

An unusually large protein complex was found in the cytosol of the hyperthmophilic archaeon. Thermococcus profundus. The purified protein was shown to be a homomultimer of 93 kDa subunit (P93 complex). The complex is extremely heat stable. During 12 hrs incubation with SDS (final concentration 1%) at $85^{\circ}C$, no changed structure could be observed. Electron image analysis of negatively stained showed that the complex has a single, stable characteristic view and a well-preserved core with threefold rotational symmetry. The periphery of the assembly is composed of a nebulose, possibly flexible, component. Based on the projected structure suggest the P93 complex from T. profundus is composed 24 homomultimer.

초고온 archaeon인 Thermococcus profundus에서 매우 거대한 단백질 복합체를 분리 및 구조를 규명하였다. 거대 복합체는 93kDa단백질(P93 complex)로 구성된 homomultimer이며, 강한 내열성을 보여주고 있다. 순수 분리한 P93 complex를 SDS(최종 농도 1%)와 $85^{\circ}C$에서 12시간 항온시킨 후, SDS-PAGE와 전자현미경에서 구조적 변화를 관찰할 수 없었다. 음착색된 P93 complex의 전자현미경 사진에서 하나의 형태만을 보여주고 있으며, 구조의 규명을 위해 image processing을 하였다. 이의 구조는 3대칭 중심에 core(혹은 hole)이 뚜렷이 존재하며 이를 중심으로 단백질이 모여 있는 형태를 보여 주고 있다. 또한 P93 complex는 가장자리에서 뚜렷한 형태를 보여주지 않은 부분, 즉 flexible부분을 포함하고 있다. Gel filtration과 2차원 구조를 기초로 P93 complex는 24 homomultimer로 되어 있음을 추정하였다.

Keywords