• Title/Summary/Keyword: S34F

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Integrative Profiling of Alternative Splicing Induced by U2AF1 S34F Mutation in Lung Adenocarcinoma Reveals a Mechanistic Link to Mitotic Stress

  • Kim, Suyeon;Park, Charny;Jun, Yukyung;Lee, Sanghyuk;Jung, Yeonjoo;Kim, Jaesang
    • Molecules and Cells
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    • 제41권8호
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    • pp.733-741
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    • 2018
  • Mutations in spliceosome components have been implicated in carcinogenesis of various types of cancer. One of the most frequently found is U2AF1 S34F missense mutation. Functional analyses of this mutation have been largely limited to hematological malignancies although the mutation is also frequently seen in other cancer types including lung adenocarcinoma (LUAD). We examined the impact of knockdown (KD) of wild type (wt) U2AF1 and ectopic expression of two splice variant S34F mutant proteins in terms of alternative splicing (AS) pattern and cell cycle progression in A549 lung cancer cells. We demonstrate that induction of distinct AS events and disruption of mitosis at distinct sub-stages result from KD and ectopic expression of the mutant proteins. Importantly, when compared with the splicing pattern seen in LUAD patients with U2AF1 S34F mutation, ectopic expression of S34F mutants but not KD was shown to result in common AS events in several genes involved in cell cycle progression. Our study thus points to an active role of U2AF1 S34F mutant protein in inducing cell cycle dysregulation and mitotic stress. In addition, alternatively spliced genes which we describe here may represent novel potential markers of lung cancer development.

P34, 7S α' Subunit 및 Lectin 단백질이 없는 녹색자엽을 가진 검정콩 계통 개발 (Improvement of a Black Soybean Line With Green Cotyledon and Triple Null Alleles for P34, 7S α' Subunit, and Lectin Proteins)

  • 리사랏;심상인;김민철;문진영;정종일
    • 생명과학회지
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    • 제34권5호
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    • pp.313-319
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    • 2024
  • 검정종피와 녹색자엽을 가진 콩 품종이나 유전자원은 눈의 피로 등 시신경 보호와 눈 질환 예방에 도움을 줄 수 있는 루테인 성분과 인체 내 활성산소 제거, 콜레스테롤 저하, 항산화 및 항암 작용, 면역증강, 노화 방지 등의 작용을 하는 안토시아닌 성분을 풍부하게 함유하고 있다. 그러나, 성숙 종자에는 알러지 유발 및 품질을 저하시키는 P34, 7S α' subunit 및 렉틴 단백질도 포함되어 있다. 따라서, 본 연구는 P34, 7S α' subunit 및 렉틴의 3가지 단백질이 부재하면서 검정종피와 녹색자엽을 가진 콩 계통을 개발하기 위하여 진행되었다. 갈색종피와 녹색자엽을 가지면서 7S α' subunit 및 렉틴 단백질이 부재한 모본과 검정종피와 녹색자엽을 가지면서 P34 및 렉틴 단백질이 부재한 부본과의 교배로 검정종피와 녹색자엽을 가진 157개의 F2 종자가 선발되었다. P34 및 7S α' subunit 단백질의 존재와 부재는 각각 3:1로 관찰되었고, 두 단백질 간에는 9:3:3:1의 분리비와 일치하여 서로 독립적임을 나타내었다. 두 단백질에 대하여 모두 열성(cgy1cgy1p34p34)을 보인 14개의 F2 종자로부터 형질이 양호하면서 P34, 7S α' subunit 및 렉틴 단백질이 모두 없고 검정종피와 녹색자엽을 가진 한 개의 개체가 선발되었다. 선발 개체의 F3 종자를 이용하여 3가지 단백질의 부재에 대한 유전적 고정이 확인되었다. 온실에서 6월 14일 파종 시 선발 개체의 성숙일은 10월 3일, 경장은 약 68 cm였고 백립중은 26.5 g 정도였다. 선발 개체는 항영양성분이 부재하면서 녹색자엽을 가진 유색콩 품종 육성을 위한 모본으로 이용될 수 있을 것으로 보인다.

SOME RELATIONS BETWEEN FUNCTION SPACES ON R$^n$

  • Shin, Seung-Hyun
    • 한국수학교육학회지시리즈B:순수및응용수학
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    • 제2권1호
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    • pp.31-34
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    • 1995
  • Let R$^n$be n-th Euclidean space. Let be the n-th spere embeded as a subspace in R$\^$n+1/ centered at the origin. In this paper, we are going to consider the function space F = {f│f : S$^n$\longrightarrow S$^n$} metrized by as follow D(f,g)=d(f($\chi$), g($\chi$)) where f, g $\in$ F and d is the metric in S$^n$. Finally we want to find certain relation these spaces.(omitted)

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일부 농촌 지역 노인 만성질환자 가족의 부담감에 관한 연구 (A Study of the Family Caregiver's Burden for the Elderly with Chronic disease in a Rural Area)

  • 장인순
    • 가정∙방문간호학회지
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    • 제2권
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    • pp.19-34
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    • 1995
  • The purpose of this study was to analysis level on family caregiver's burden for the elderly with chronic disease in a rural area and to choose priority care group, thereby facilitating the development of interventions to reduce the caregiver's burden. For this purpose, data were collected by questionaire from June 10 to October 8, 1994. The instruments for data collection were Caregiver Burden Inventory by Novak(1989) and Zarit et al(1982), severity of dementia by Hughes Scales(1982), ADL by Lawton(1971), patients' family caregiving activity by pre-survey and reference review(Lee, 1993 ; Jang, 1990 ; Yoo, 1982). The subjects were 213 family caregiver of elderly with chronic disease in a rural area. The data was analysed by the use of t-test, ANOVA, correlation and multiple regression. The results were as follows ; 1. Total burden was evaluated below average, the mean of family burden was 46.98. By the diagnostic classification, Hypertension was 27.37, DM 32.46, CVA 62.96, Dementia 61.24. 2. Significant variables which were correlated to the family caregiver's burden were the patient's disease diagnosis (F=33.82, p<0.001), severity of dementia(F=30.52, p<0.001), the status of disease management(F=11.53, p<0.001), ADL(F=10.54, p<0.001), PADL(F=7.50, p<0.001), income(F=7.17, p<0.001), caregiver's health status(F=24.53, p<0.001), a view of patient's prognosis (F=22.17, p<0.001), relationship with the patient(F=33.82, p<0.001), the number of hours per day spent on caregiving(F=77.52, p<0.001), level of intimacy of caregiver and patients(F=8.75, p<0.001), level of helping(F=4.90, p<0.01), the frequency of caregiving activity(F=3.80, p<0.01), the number of admission(F=5.54, p<0.01), the length of caregiving(F=4.43, p<0.01), other chronic patient in family(t=2.81, p<0.01), caregiver's job(F=3.11, p<0.01), the duration of illness(F=2.98, p<0.05), caregiver's religion(F=2.93, p<0.05), medical security(F=3.89, p<0.05), caregiving's helper(t=2.42, p<0.05). 3. PADL was the most important predictor to family caregiver burden(R2=0.6611). In addition to this, IADL, caregiver's health status, the length of caregiving. level of intimacy of caregiver and patients, patient's age, the patient's disease diagnosis and patient's job accounted for 76% of family caregiver burden. 4. The criteria of priority care group were as follows ; the mean of family caregiver burden was above 58, above of moderate ADL, the number of hours per day spent on caregiving above of 8 hours, above of moderate dementia. By the diagnostic classification, number of priority care group, Hypertension was 4 (8.0%), DM 4(8.0%), CVA 34(64.1%), Dementia 45(75.0%).

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재조합 lysozyme-HJP34 단백질의 다양한 병원성 세균에 대한 항균 효능 및 자돈 사료첨가제의 가능성 평가 (Antibacterial evaluation of recombinant lysozyme-HJP24 proteins against various bacterial pathogens, and of its possibility test as a feed additive in piglets)

  • 유정희;유영주;김선민;허진
    • 한국동물위생학회지
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    • 제44권4호
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    • pp.247-256
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    • 2021
  • The recombinant lysozyme-HJL34 proteins were expressed and purified using commercial Escherichia (E.) coli expression system. Stx2e+ F18+ E. coli, Actinobacillus pleuropneumoniae (APP), Streptococcus (S.) suis, and Clostridium (C.) perfringens strains were isolated from pigs. The minimum inhibitory concentrations (MICs) of the recombinant lysozyme-HJP34 proteins were examined by means of the microtiter plate method, according to the NCCLS recommendations. The possibility of its as the alternatives to antibiotics was tested in piglets. The MICs were determined as 75 ㎍/mL, 300 ㎍/mL, 75 ㎍/mL, 35.5 ㎍/m against Stx2e+ F18+ E. coli, APP, S. suis, C. perfringens, respectively. A total of 25 piglets were divied 5 groups. The piglets in group A~C were fed with commercial feed and those in groups D, E were fed with commercial feedstuff. All piglets in groups B~E were challenged with virulent Stx2e+ F18+ E. coli, APP, S. suis strains. Groups C and D were treated with antimicrobial from 24 h after challenge. All piglets in group B died within 3 days after challenge. Among 5 piglets in groups C and D piglets, 80% survived after challenge. Among group E piglets, 60% were alive until the end of this study. Therefore, this study indicates that recombinant lysozyme-HJP34 proteins is a suitable possibility as a feed additive for reduction of diseases by bacterial pathogens in piglet feed.

율무 이삭마름 증상에서 분리한 Fusarium속 균의 다양성 및 병원성 (Diversity and Pathogenicity of Fusarium Species Associated with Head Blight of Job's Tears)

  • 최효원;홍성기;김완규;이영기
    • 한국균학회지
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    • 제39권3호
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    • pp.217-222
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    • 2011
  • 율무(Coix lacryma-jobi)는 동아시아에 자생하는 작물로, 종실은 주로 건강식품이나 의약용으로 사용되고 있다. 2006년부터 2008년까지 국내 율무 재배 지역에서 이삭마름 증상이 관찰되었다. 병징은 겉껍질이 변색되고, 내부의 속씨는 마르고 쭉정이가 되는 것이다. 159개의 Fusarium균을 분리하였고, 분리 빈도별로 F. graminearum(34%), F. proliferatum(14.5%), F. verticillioides(10.1%), F. equiseti(6.9%), F. fujikuroi(6.3%) 순으로 분리되었고, 그 밖에 F. subglutinans, F. semitectum, F. poae, F. sporodochioides가 분리되었다. 분리균주의 elongation factor 1 alpha 유전자의 염기서열 분석을 통한 계통분석을 수행한 결과, NCBI GenBank에 등록된 균주와 동일한 것을 확인하였다. 분리균주의 병원성 검정을 수행한 결과, F. graminearum, F. proliferatum, F. verticillioides가 병원성이 강하였다. 이 연구는 Fusarium균에 의해 발생한 율무 이삭마름 증상에 대한 첫 번째 보고이다.

Anti-melanogenesis Effects of Schizophragma hydrangeoides Leaf Ethanol Extracts via Downregulation of Tyrosinase Activity

  • Hyun, Ho Bong;Hyeon, Hye Jin;Kim, Sung Chun;Go, Boram;Yoon, Seon-A;Jung, Yong-Hwan;Ham, Young-Min
    • 한국자원식물학회지
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    • 제34권6호
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    • pp.510-516
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    • 2021
  • Whitening agents derived from natural sources which do not have side effects are sought after. Schizophragma hydrangeoides is an edible plant that grows wild on Jeju Island. We aimed to determine whether S. hydrangeoides extracts show anti-melanogenic activity. Here, we found that 70% ethanol extracts of S. hydrangeoides leaf suppressed α-melanocyte-stimulating hormone-induced melanogenesis in B16F10 mouse melanoma cells. This activity of anti-melanogenesis in B16F10 cells were investigated by determining melanin content and tyrosinase activity, and by performing western blotting. The 70% ethanol extract downregulated tyrosinase and tyrosinase-related protein 1. In addition, the n-hexane fraction of S. hydrangeoides leaf (HFSH) exhibited significant anti-melanogenic activity among the various solvent fractions tested without reducing the viability of B16F10 cells. Taken together, these results indicate that extracts from S. hydrangeoides leaf can influence cellular processes via modulation of tyrosinase activity. Hence, S. hydrangeoides can be used as a whitening agent in the cosmetic industry and as a therapeutic agent for treating hyperpigmentation disorders in the clinic.

On $\delta$ -semiclassical orthogonal polynomials

  • K. H. Kwon;Lee, D. W.;Park, S. B.
    • 대한수학회보
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    • 제34권1호
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    • pp.63-79
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    • 1997
  • Consider an oparator equation of the form : $$ (1.1) H[y](x) = \alpha(x)\delta^2 y(x) + \beta(x)\delta y(x) = \lambda_n y(x), $$ where $\alphs(x)$ and $\beta(x)$ are polynomials of degree at most two and one respectively, $\lambda_n$ is the eigenvalue parameter, and $\delta$ is Hahn's operator $$ (1.2) \delta f(x) = \frac{(q - 1)x + \omega}{f(qx + \omega) - f(x)}, $$ for real constants $q(\neq \pm 1)$ and $\omega$.

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인삼 뿌리썩음병(根 病) 관련 Fusarium species와 그 병원성 (Fusarium species Associated with Ginseng (Panax ginseng) and Their Role in the Root-Rot of Ginseng Plant)

  • 이순구
    • 식물병연구
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    • 제10권4호
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    • pp.248-259
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    • 2004
  • 1982년부터 1885년 동안, 인삼뿌리썩음병 및 근권 토양에서 분리한 Fusarium균(115균주)을 Snyder-Hansen 방식(주로 F. solani 및 F. oxysporum의 동정에 적용) 및 Gerlach-Nirenberg 방식(주로 F. moniliforme[Liseola section]의 균주 동정 및 F. roseum[Snyder-Hansen 분류개념에 의한]에 속하는 균주 동정에 적용), 그리고 Cylindrocarpon균은 Booth 방식으로 분류 동정한 결과, 11개의 종으로 나눌 수 있었다. 가장 많이 분리된 균은 Fusarium solani(55균주), F. oxysporum(35균주), 그리고 F. moniliforme(10균주) 등이었다. Snyder와 Hansen(1945) 분류방식에 의해 F. roseum으로 불리우는 나머지 균주들(15균주)은 매우 드물게 분리되었으며, 8개의 종으로 다시 분류할 수 있었다. 이들은 F. equiseti, F. avenaceum, F. graminum, F. arthrosporioides, F. sambucinum, F. reticulatum, F. semitectum and F. poa 등이었다. 1985년 6월 이들 Fusarium 균주들과 Cylindrocarpon destructans 균주들 및 주요 인삼의 토양전염성 병원균 균주들을 증평인삼시험장 3년생 격리포장에서 균총 절편으로 뿌리 상부에 접종시켜 그 병원성을 검정한 결과, Phytophthora cactorum과 Pythium ultimum은 접종 12일 만에 지상부 위조 및 뿌리의 물렁썩음을 일으키는 높은 병원성을 나타내었다. 접종 후 77일경에 뿌리를 채굴하여 뿌리의 마른 썩음을 조사한 결과, Fusarium solani 균은 34 균주 중 1개 균주만이 병원성을 보였으나, Cylindrocarpon destructans는 12개 접종 균주 모두 인삼의 뿌리썩음에 높은 병원성을 나타내었다 . Fusarium solani 및 Cylindrocarpon destructans는 전형적인 기주-위주의 인삼 토양병원균으로 추정할 수 있었다.

DNA marker를 이용한 벼의 조직배양 효율개선 (Improvement of cultural efficiency using DNA markers in anther and seed culture of rice)

  • 김홍집;김태헌;손재근
    • Current Research on Agriculture and Life Sciences
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    • 제27권
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    • pp.21-28
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    • 2009
  • 벼의 약 및 현미 배양효율과 관련된 DNA marker를 이용하여 인디카형 벼 품종인 'IR 36'의 조직배양 효율을 개선하기 위하여 실험한 결과를 요약하면 다음과 같다. 벼품종 간에 약 및 현미배양 효율을 비교한 결과 자포니카 > 통일형 > 인디카 형의 순으로 나타났다. 그러나 MGRI집단의 약배양에서 식물체분화율이 높은 계통으로 선발된 'MGRI 079'와 'MGRI 036'의 약배양 효율은 각각 19.8%, 19.9%로 가장 높게 나타났다. 'MGRI 079'에 'IR 36'이 여교배되어 양성된 $BC_2F_4$ 90 계통에 대한 marker검정을 실시하여 positive band를 나타내는 34계통을 선발할 수 있었다. 선발된 34계통 중 10 계통의 약배양에서 캘러스 형성률은 'IR 36' 보다 현저히 높았다. 선발된 10 계통의 현미배양에서도 캘러스형성 능력과 식물체재분화율이 'IR 36' 보다 높게 나타났다. $BC_2F_4$ 계통 중에서 식물체분화능력이 높은 계통으로 선발된 $BC_2F_4$-28은 간장이 'IR 36'보다 큰 편이었으나 출수기와 미립특성은 'IR 36'과 비슷하였다.

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