• 제목/요약/키워드: Resistant length

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벼 RIL집단의 유전 분석과 농업형질 분석을 통한 도열병 저항성 QTL 탐색 및 유망계통 선발 (Genetic and Agronomic Analysis of a Recombinant Inbred Line Population to Map Quantitative Trait Loci for Blast Resistance and Select Promising Lines in Rice)

  • 하수경;정지웅;정종민;김진희;모영준
    • 한국작물학회지
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    • 제65권3호
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    • pp.172-181
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    • 2020
  • 고시히카리는 도열병과 쓰러짐에 약하지만 밥맛 좋은 쌀로 유명하고, 육성된 지 60년이 넘은 지금까지도 일본에서 가장 많이 재배되는 품종이다. 고시히카리에 도열병에 강하면서 생육이 빠른 백일미를 교배한 RIL집단(KBRIL)에서 도열병 저항성에 대한 유전분석을 수행하여 저항성 유전자의 염색체 상 위치를 규명하고, 고시히카리의 우수한 미질을 보유하면서 도열병에도 강한 계통을 선발하기 위해 본 연구를 수행하였다. 주요 결과는 다음과 같다. 1. 고시히카리×백일미 RIL 394계통과 모·부본의 도열병 저항성(전주, 남원) 및 주요 농업형질을 조사하고, 유전 분석을 위해 사용된 142계통으로 총 130개 SNP 마커, 1,272.7cM의 유전자지도를 작성하였다. 도열병 저항성 QTL 분석 결과 전주에서는 1번 염색체의 qBL1.1이, 남원에서는 전주와 동일한 qBL1.1과 추가로 2번 염색체의 qBL2.1이 탐지되었다. 2. RIL 394계통의 qBL1.1과 qBL2.1 유전자형을 도출하고 각 QTL의 백일미 대립인자 집적에 의한 도열병 저항성 강화 효과를 관찰하였다. 전주에서는 qBL1.1의 경우에만 백일미 대립인자 집적에 의하여 도열병 저항성이 강화되었다. 반면 남원에서는 qBL1.1, qBL2.1 모두 백일미 대립인자가 집적될 때 도열병 저항성이 강화되었다. qBL1.1, qBL2.1은 출수기, 간장, 수장, 수수를 포함한 주요 농업형질에는 영향을 미치지 않았다. 3. 고시히카리×백일미 RIL 394계통 중에서 출수기와 간장을 기준으로 고시히카리와 유사하면서 도열병에 약/강한(KS/KR) 계통과 백일미와 유사하면서 도열병에 강한(BR) 계통을 각 15계통씩 선발하였다. KR 그룹은 완전 미율이 가장 우수하여 밥맛 검정, 수량성 등 추가조사를 통해 고시히카리의 우수한 밥맛을 지니면서 도열병 저항성을 보유한 고품질 밥쌀용 품종개발에 활용할 계획이다. 또한 BR그룹은 미질이 우수하면서 출수가 빠른 고품질 품종 개발에 유용할 것으로 기대된다.

배 검은별무늬병(Venturia nashicola) 고도 저항성 '93-3-98' 유래 PR-10 유전자의 특성 (Characterization of PR-10 gene derived from highly resistant '93-3-98' pear inoculated with scab (Venturia nashicola))

  • 천재안;김세희;조강희;김대현;최인명;신일섭
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제42권1호
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    • pp.25-33
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    • 2015
  • 배 검은별무늬병 고도저항성 '93-3-98'과 고도감수성 '스위트스킨'간의 suppression subtractive hybridization 분석을 통해 '93-3-98'에서 특이적으로 발현되는 pathogenesis-related 10 (PR-10) 유전자를 분리하여 PyrcpPR-10으로 명명하고 기관 및 품종별 발현양상을 분석하였다. 단편염기서열의 rapid amplification of cDNA ends PCR을 통해 PyrcpPR-10 유전자는 전체길이가 743bp이고, 480bp의 ORF와 159개의 아미노산을 가지는 것으로 확인되었다. PyrcpPR-10 유전자의 염기서열은 '황실리'(저항성), '감천배'(중도저항성), '원황'(중도감수성), '신고', '스위트스킨'(고도감수성)은 동일하였으나 'Bartlett'(고도저항성)은 일부 염기서열의 차이를 보였다. BLAST X를 통한 다른 식물 종의 PR-10 아미노산과 비교에서 64 ~ 98%의 상동성을 보였고 공통적으로 GXGGXG motif를 가지고 있었다. 기관 및 조직별 PyrcpPR-10 유전자의 발현량은 꽃잎이 가장 높았으며 다음으로 잎, 꽃대, 눈, 수피 순이었다. 저항성과 감수성 품종에 따른 PyrcpPR-10 유전자의 발현양상은 모든 품종에서 접종 24시간 후 급격히 증가였으며, 특히 'Bartlett', '93-3-98', '황실리'에서 높게 발현되었고 '감천배', '원황'의 경우 저항성 품종에 비해 상대적으로 낮았으며, 고도 감수성 '신고', '스위트스킨'은 발현이 가장 낮았다. 배에서 분리한 PyrcpPR-10 유전자는 검은별무늬병 저항성에 직접 연관되는 것으로 추정된다.

문턱전류이상에서 구조 및 재료 변수들이 $\lambda$/4위상천이 DFB 레이저의 단일모드 이득차에 미치는 영향 (The Effect of Laser Geometry and Material Parameters on the Single Mode Gain Difference in Quarter Wavelength Shifted DFB Laser above Threshold Current)

  • 이홍석;김홍국;김부균;이병호
    • 전자공학회논문지D
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    • 제36D권3호
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    • pp.75-84
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    • 1999
  • 주입전류가 문턱전류 이상일 때 선폭증가계수, 구속계수, 내부손실과 레이저의 길이가 λ/4 위상천이 DFB레이저의 단일모드 이득차와 발진주파수의 변화에 미치는 영향에 대하여 체계적으로 연구하였다. 구속계수나 선폭증가계수와 구속계수의 곱으로 주어지는 변수보다 선폭증가계수가 단일모드 이득차 및 발진주파수에 미치는 영향이 크다. 내부손실이나 레이저 길이 각각의 값보다 내부손실과 레이저 길이의 곱으로 정의되는 정규화된 내부손실이 DFB 레이저의 단일모드 이득차 및 발진주파수의 변화에 미치는 영향이 크다. 정규화된 내부손실이 같은 경우에는 내부손실계수보다 레이저의 길이가 동작특성에 미치는 영향이 큼을 알 수 있었다. 또한 양자우물 레이저가 builk 레이저에 비하여 선폭증가계수가 작기 때문에 구속계수와 정규화된 내부손실 값의 변화에 따른 단일모드 이득차의 감소와 발진주파수의 변화가 작음을 보았다.

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Hepatitis C Virus Nonstructural 5A Protein Interacts with Telomere Length Regulation Protein: Implications for Telomere Shortening in Patients Infected with HCV

  • Lim, Yun-Sook;Nguyen, Men T.N.;Pham, Thuy X.;Huynh, Trang T.X.;Park, Eun-Mee;Choi, Dong Hwa;Kang, Sang Min;Tark, Dongseob;Hwang, Soon B.
    • Molecules and Cells
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    • 제45권3호
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    • pp.148-157
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    • 2022
  • Hepatitis C virus (HCV) is a major cause of chronic liver disease and is highly dependent on cellular proteins for viral propagation. Using protein microarray analysis, we identified 90 cellular proteins as HCV nonstructural 5A (NS5A) interacting partners, and selected telomere length regulation protein (TEN1) for further study. TEN1 forms a heterotrimeric complex with CTC and STN1, which is essential for telomere protection and maintenance. Telomere length decreases in patients with active HCV, chronic liver disease, and hepatocellular carcinoma. However, the molecular mechanism of telomere length shortening in HCV-associated disease is largely unknown. In the present study, protein interactions between NS5A and TEN1 were confirmed by immunoprecipitation assays. Silencing of TEN1 reduced both viral RNA and protein expression levels of HCV, while ectopic expression of the siRNA-resistant TEN1 recovered the viral protein level, suggesting that TEN1 was specifically required for HCV propagation. Importantly, we found that TEN1 is re-localized from the nucleus to the cytoplasm in HCV-infected cells. These data suggest that HCV exploits TEN1 to promote viral propagation and that telomere protection is compromised in HCV-infected cells. Overall, our findings provide mechanistic insight into the telomere shortening in HCV-infected cells.

다제 내성 폐결핵환자의 폐절제술에 관한 연구 (Pulmonary Resection in the Treatment of Multidrug-Resistant Tuberculosis)

  • 권은수;하현철;황수희;이흥렬;박승규;송선대
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제45권6호
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    • pp.1143-1153
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    • 1998
  • 연구배경 : 다제내성 폐결핵 환자에서 폐절제술이 다제내성 폐결핵의 치료에 미치는 영향에 관심을 두어 폐절제술과 화학요법 즉 병합요법의 치료 효과를 화학치료 효과와 비교 분석하여 그 결과를 지표로 다제내성 폐결핵의 치료효과를 증가시키는 데 지표를 삼고자 본 연구를 시행하였다. 방 법 : 국립마산결핵병원에서 1993년 1월부터 1997년 12월까지 폐결핵 환자 중 폐절제술을 시행 받은 79예 중 INH와 RFP을 포함하는 2제 이상의 항결핵제에 내성을 가지는 다제내성폐결핵 41예를 대상으로 진료기록을 중심으로 후향적으로 조사하였다. 전체 41예의 환자는 흉부 X선 소견상 한쪽 폐야에 국한된 병변을 절제한 국소병변군과 주병변의 절제후 잔류병 변에 공동이 남은 잔류공동군과 침윤성 소견이 남은 잔류침윤군으로 나누어 각 군의 술후 균음전율, 전체치료반응율을 측정하여 Goble 등에 의한 다제내성폐결핵에 대한 화화치료의 균음전율, 전체치료반응율과 비교하였다. 균음전율의 비교는 단일분율의 분석 (analysis of single proportion)중에 이항분포(Binomial distribution)를 이용한 직접산출법(exact model)을 이용하였고, 전체치료반응율은 단일비율의 분석(analysis of single rate)중에 포아송 분포(poisson distribution)를 이용한 직접산출법(exact model)을 이용하여 p 값을 구하였고, 통계화적 의의는 p 값이 0.05 이하일 때 그 유의성을 인정하였다. 결 과 : 전체 대상 환자는 41예로 남자가 31예, 여자가 10예이었고 16세에서 60세의 연령 분포를 보였으며 중앙치가 31 세였다. 평균 2.3회의 화학치료 과거력을 가지고 있으며 술전에 평균 4.9제의 약제를 사용하였고 술전 평균 내성 약제수는 4.8제이었다. 수술은 전폐절제술이 14예, 폐엽절제술이 24예, 구역절제술이 1예, 폐업절제술과 구역절제술을 병합한 경우가 2예이었다. 단순 흉부 X-선 사진상 국소병변군이 26예, 잔류공동군이 7예, 잔류침윤군이 8예였다. 전체환자군에서 균음전율은 90.9%로 통계적으로 유의하게 높았으며 치료실패 5예와 치료종결후 추적관찰이 가능했던 21예 중 재발 2예가 나타나 전체치료반응율은 73.1%로 통계적으로 유의하게 높았다. 국소병변군의 술후 균음전율은 100%로 통계적 유의성이 있었고, 전체 치료반응율은 93.3%로 통계적으로 유의한 차이를 나타내었으며 술후 투약기간은 평균 12.2개월이었다. 국소병변군증 술후에 일차약으로 투약한 군의 전체치료반응율은 75%로 통계적으로 유의하게 좋은 결과를 보였고 술후 투약기간은 평균 7.5개월이었다. 잔류공동군의 수술에 악한 균음전율은 75%로 통계적으로 차이가 없었으며, 전체치료반응율은 14.19%로 통계적으로 유의하게 낮은 결과를 보였고 술후 투약기간은 평균 16.7개월이었다. 잔류침윤군의 술후 균음전율은 83.3%로 통계적으로 차이가 없었고, 전체치료반응율은 100%로 통계적으로 유의하게 높았고 술후 투약기간은 평균 11.8개월이었다. 결 론 : 다제내성 폐결핵의 화학치료 과정 중 적절한 시기에 수술을 시행하는 것은 그 치료결과를 상승시키는 효과가 있다. 그러나, 술후에 공동이 남을 환자들은 가능한 광범위 절제를 시행하여야 하며 모든 공동의 절제가 불가능한 경우는 수술하지 않는 것이 타당할 것으로 판단된다. 국소병변군과 잔류병변군증의 잔류침윤군의 술후 투약기간은 평균 12개월 정도로 굳이 18개월 이상의 투약이 아니라 하더라도 그 결과는 양호하며 국소병변군에서 술후 일차약제의 사용도 치료효과를 상승시키는 데 장애가 되지 않는다고 조심스럽게 말할 수 있겠다.

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ABA Increases Susceptibility of Pepper Fruits to Infection of Anthracnose by Collectotrichum acutatum

  • Hwang, Soo-Kyeong;Kim, Joo-Hyung;Kim, Young-Ho;Kim, Heung-Tae
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제24권4호
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    • pp.400-406
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    • 2008
  • To examine the relationship between plant hormones and the development of pepper anthracnose, we investigated the effects of several plant hormones on the progression of disease symptoms. Of the five plant hormones examined, abscisic acid (ABA) increased the lesion length and disease incidence on detached fruits of Capsicum annuum cv. Nokkwang. The simultaneous application of ABA with inoculation of Colletotrichum acutatum JC24 resulted in increased lesion length, depending the concentration of ABA applied. Additionally, application of ABA caused the development of pepper anthracnose in fruits of Capsicum baccatum cvs. PBC80 and PBC81, which were previously resistant to the disease. Furthermore, ABA administration rendered increased pathogenicity of other isolates of C. acutatum BAC02063, PECH10, and TCBNU3 obtained from the Chinese matrimony vine, peach, and tea tree, respectively. Our data suggest that exogenous ABA may result in the suppression of defense mechanisms of pepper fruits against anthracnose, which leads to a change in the susceptibility of pepper fruits and the development of pepper anthracnose.

Isolation of a novel dehydrin gene from Codonopsis lanceolata and analysis of its response to abiotic stresses

  • Pulla, Rama Krishna;Kim, Yu-Jin;Kim, Myung-Kyum;Senthil, Kalai Selvi;In, Jun-Gyo;Yang, Deok-Chun
    • BMB Reports
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    • 제41권4호
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    • pp.338-343
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    • 2008
  • Dehydrins (DHNs) compose a family of intrinsically unstructured proteins that have high water solubility and accumulate during late seed development at low temperature or in water-deficit conditions. They are believed to play a protective role in freezing and drought-tolerance in plants. A full-length cDNA encoding DHN (designated as ClDhn) was isolated from an oriental medicinal plant Codonopsis lanceolata, which has been used widely in Asia for its anticancer and anti-inflammatory properties. The full-length cDNA of ClDhn was 813 bp and contained a 477 bp open reading frame (ORF) encoding a polypeptide of 159 amino acids. Deduced ClDhn protein had high similarities with other plant DHNs. RT-PCR analysis showed that different abiotic stresses such as salt, wounding, chilling and light, triggered a significant induction of ClDhn at different time points within 4-48 hrs post-treatment. This study revealed that ClDhn assisted C. lanceolata in becoming resistant to dehydration.

CHEMICAL COMPONENTS INFLUENCING LODGING RESISTANCE OF RICE PLANT AND ITS STRAW DIGESTIBILITY IN VITRO

  • Hasan, S.;Shimojo, M.;Goto, I.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제6권1호
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    • pp.41-44
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    • 1993
  • This study was conducted to investigate the chemical components of culm that influencing the resistance to lodging and the in vitro digestibility in indica type rice plants. Indica type rice plants with three levels of lodging resistance were used; resistant type (RT), intermediate type (IT) and susceptible type (ST). For each type there were four varieties. Culm length was shorter in RT and longer in ST (98.1 cm vs. 151.8 cm). Silica content in the culm was highest in RT and lowest in ST (11.0% vs. 7.6%). There was no difference in the level of acid detergent lignin (ADL) between the 3 levels of lodging. For the 12 straw samples, in vitro organic matter digestibility (IVOMD) was negatively correlated with silica content (r = -0.664, p<0.05) but ADL had no significant effect (r = -0.454, p>0.05). Digestibility was more closely correlated with the sum of silica and ADL (r = -0.747, p<0.01) than silica alone. It was concluded that rice plants showed resistance to lodging when the culm was short and its structure was reinforced with larger quantities of silica. However these silicified straws were less digestible.

Wind characteristics of a strong typhoon in marine surface boundary layer

  • Song, Lili;Li, Q.S.;Chen, Wenchao;Qin, Peng;Huang, Haohui;He, Y.C.
    • Wind and Structures
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    • 제15권1호
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    • pp.1-15
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    • 2012
  • High-resolution wind data were acquired from a 100-m high offshore tower during the passage of Typhoon Hagupit in September, 2008. The meteorological tower was equipped with an ultrasonic anemometer and a number of cup anemometers at heights between 10 and 100 m. Wind characteristics of the strong typhoon, such as mean wind speed and wind direction, turbulence intensity, turbulence integral length scale, gust factor and power spectra of wind velocity, vertical profiles of mean wind speed were investigated in detail based on the wind data recorded during the strong typhoon. The measured results revealed that the wind characteristics in different stages during the typhoon varied remarkably. Through comparison with non-typhoon wind measurements, the phenomena of enhanced levels of turbulence intensity, gust factors, turbulence integral length scale and spectral magnitudes in typhoon boundary layer were observed. The monitored data and analysis results are expected to be useful for the wind-resistant design of offshore structures and buildings on seashores in typhoon-prone regions.

Molecular Cloning and Expression of a Novel Protease-resistant GH-36 $\alpha$-Galactosidase from Rhizopus sp. F78 ACCC 30795

  • Yanan, Cao;Wang, Yaru;Luo, Huiying;Shi, Pengjun;Meng, Kun;Zhou, Zhigang;Zhang, Zhifang;Yao, Bin
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제19권11호
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    • pp.1295-1300
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    • 2009
  • A 2,172-bp full-length gene (aga-F78), encoding a protease-resistant $\alpha$-galactosidase, was cloned from Rhizopus sp. F78 and expressed in Escherichia coli. The deduced amino acid sequence shared highest identity (45.0%) with an $\alpha$-galactosidase of glycoside hydrolase family 36 from Absidia corymbifera. After one-step purification with a Ni-NTA chelating column, the recombinant Aga-F78 migrated as a single band of ~82 and ~210 kDa on SDS-PAGE and nondenaturing gradient PAGE, respectively, indicating that the native structure of the recombinant Aga-F78 was a trimer. Exhibiting the similar properties as the authentic protein, purified recombinant Aga-F78 was optimally active at $50^{\circ}C$ and pH 4.8, highly pH stable over the pH range 5.0-10.0, more resistant to some cations and proteases, and had wide substrate specificity (pNPG, melidiose, raffinose, and stachyose). The recombinant enzyme also showed good hydrolytic ability to soybean meal, releasing galactose of $415.58\;{\mu}g/g$ soybean meal. When combined with trypsin, the enzyme retained over 90% degradability to soybean meal. These favorable properties make Aga-F78 a potential candidate for applications in the food and feed industries.