• Biomolecules & Therapeutics
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• 제17권1호
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• pp.12-16
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• 2009

One of the WHSC1/MMSET/NSD2 variant RE-IIBP is a histone H3-K27 methyltransferase with transcriptional repression activity. Overexpression of RE-IIBP in various types of leukemia suggests it's role in leukemogenesis. Here we identify two proteins, KRAB zinc finger protein ZNF 350 and enolase-1 as RE-IIBP interacting proteins by yeast two-hybrid screening and confirmed direct interaction in vivo and in vitro. Both proteins have been known for their role in transcriptional repression. Reporter assays using transient transfection demonstrated that both ZNF 350 and enolase-1 proteins synergistically repressed transcription with RE-IIBP, respectively. These results indicate both proteins have roles in RE-IIBP mediated transcriptional repression by involving co-repressor complex.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제6권3호
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• pp.129-133
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• 1978

Trichoderma viride QM 9414의 생육을 저해하여 colony를 형성 시키고 배지에 첨가된 cellulose가 균이 분비한 cellulase에 의해서 분해되어 생긴 clear zone으로서 육안으로 cellulase 역가를 쉽게 측정할 수 있는 방법과 repressor를 첨가하여 constitutive mutant를 선별할 수 있는 방법에 관한 실험을 하였든 바 그 결과를 요약하면 다음과 같다. 1) Colony를 형성시키고 그 size를 제한 하는데는 deoxycholate를 배지에 0.15％ 첨가 하였을 때 가 가장 좋았다. 2) Saponin을 배지에 0.l％ 첨가하면 뚜렷한 clear zone을 형성하였다. 3) Constitutive mutant를 선별하기 위해서는 기질로 pulp를 사용하였을 경우 glucsoe를 1％ 첨가하거나 glycerol이나 cellobiose를 0.5％ 첨가하면 가능하다고 생각되며 기질로 pure cellulose를 사용하였을 경우는 그대로 배지에 spore를 plating하면 가능하다고 생각된다. 4) Cellulase 역가가 높은 균주는 clear zone의 크기로서 쉽게 분리할 수 있다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제32권8호
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• pp.1047-1053
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• 2022

When ptsG, a glucose-specific phosphotransferase system (PTS) component, is deleted in Escherichia coli, growth can be severely poor because of the lack of efficient glucose transport. We discovered a new PTS transport system that could transport glucose through the growth-coupled experimental evolution of ptsG-deficient E. coli C strain under anaerobic conditions. Genome sequencing revealed mutations in agaR, which encodes a repressor of N-acetylgalactosamine (Aga) PTS expression in evolved progeny strains. RT-qPCR analysis showed that the expression of Aga PTS gene increased because of the loss-of-function of agaR. We confirmed the efficient Aga PTS-mediated glucose uptake by genetic complementation and anaerobic fermentation. We discussed the discovery of new glucose transporter in terms of different genetic backgrounds of E. coli strains, and the relationship between the pattern of mixed-acids fermentation and glucose transport rate.

• Molecules and Cells
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• 제26권5호
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• pp.443-453
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• 2008

The Bric-a-brac, Tramtrack, Broad-complex (BTB) domain is a protein-protein interaction domain that is found in many zinc finger transcription factors. BTB containing proteins play important roles in a variety of cellular functions including regulation of transcription, regulation of the cytoskeleton, protein ubiquitination, angiogenesis, and apoptosis. Here, we report the cloning and characterization of a novel human gene, KLHL31, from a human embryonic heart cDNA library. The cDNA of KLHL31 is 5743 bp long, encoding a protein product of 634 amino acids containing a BTB domain. The protein is highly conserved across different species. Western blot analysis indicates that the KLHL31 protein is abundantly expressed in both embryonic skeletal and heart tissue. In COS-7 cells, KLHL31 proteins are localized to both the nucleus and the cytoplasm. In primary cultures of nascent mouse cardiomyocytes, the majority of endogenous KLHL31 proteins are localized to the cytoplasm. KLHL31 acts as a transcription repressor when fused to GAL4 DNA-binding domain and deletion analysis indicates that the BTB domain is the main region responsible for this repression. Overexpression of KLHL31 in COS-7 cells inhibits the transcriptional activities of both the TPA-response element (TRE) and serum response element (SRE). KLHL31 also significantly reduces JNK activation leading to decreased phosphorylation and protein levels of the JNK target c-Jun in both COS-7 and Hela cells. These results suggest that KLHL31 protein may act as a new transcriptional repressor in MAPK/JNK signaling pathway to regulate cellular functions.

• 생명과학회지
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• 제34권2호
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• pp.86-93
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• 2024

플라스미드의 복제는 엄격하게 조절되어야 하기 때문에 일반적으로 rolling circle 복제를 수행하는 플라스미드들은 복제 개시인자인 RepB는 전사 및 번역 수준에서 엄격하게 조절되어 일정한 copy number를 유지한다. 플라스미드 pJB01에는 단일 오페론으로 구성된 세 개의 orfs (copA, repB, repC 또는 repABC)가 포함되어 있다. 아미노산 서열 분석에서 pJB01 CopA는 다른 플라스미드의 복제 수 조절 단백질로서 Cops와 상동성을 보였다. pMV158의 CopG와 비교할 때, CopA는 플라스미드의 일반화된 억제자의 모티브로 알려진 RHH (ribbon-helix-helix)를 형성하는 것으로 추정된다. gel mobility shift assay 결과 정제된 융합 단백질이 repABC 오페론의 operator 영역에 결합하는 것으로 나타났다. 전사 수준에 대한 CopA의 기능적 역할을 조사하기 위해 CopA R16M, K26R 및 E50V와 같은 세 개의 포인트 돌연변이가 CopA의 코딩 프레임에서 구성되었다. CopA R16M, K26R 및 E50V 돌연변이의 repABC mRNA 수준은 CopA wt보다 각각 1.84, 1.78 및 2.86배 증가했다. 또한 세 개의 CopA 유전자의 돌연변이로 인한 복제 수도 CopA wt보다 각각 1.86, 1.68 및 2.89배 증가했다. 이러한 결과는 CopA가 전사 억제자이며 복제 개시자로서 repABC mRNA 및 RepB 단백질 수를 감소시킴으로써 pJB01의 복제 수를 감소시키는 것으로 제의된다.

• BMB Reports
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• 제40권4호
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• pp.517-524
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• 2007

There were many different families of zinc finger proteins that contained multiple cysteine and/or histidine residues and used zinc to stabilize their folds. The classical C2H2 zinc finger proteins were the founding members of this superfamily and were among the most abundant proteins in eukaryotic genomes. C2H2 proteins typically contained several C2H2 fingers that made tandem contacts along the DNA. Here we reported a novel C2H2 type zinc finger gene, ZNF438, which encoded 828 amino acids that formed five zinc finger domains. Bioinformatics analysis revealed that the ZNF438 was mapped to human chromosome 10p11.2 and shared 62% identity with rat and mouse homologues. RT-PCR analysis indicated that it was ubiquitously expressed in 18 human adult tissues. With immunofluorescence assay, it was shown that the exogenous Flag-tagged ZNF438 was located in nucleus of COS-7 cells. To further explore the function of ZNF438, we examined the transcriptional activity of ZNF438 protein by transfecting recombinant pM-ZNF438 into mammalian cells. The subsequent analysis based on the duel luciferase assay system showed that ZNF438 was a transcriptional repressor.

• 대한화장품학회지
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• 제40권4호
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• pp.403-412
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• 2014

효능이 우수한 신규 미백 소재 개발을 위하여, 민간 및 전통 미백 처방에 사용되어 온 오이(Cucumis sativus L.)에서 활성 물질 분획 추적 연구를 통하여 cucurbitacin B를 분리 정제하고, cucurbitacin B의 멜라닌 합성에 미치는 효과를 B16F1 멜라노마 세포를 이용해 확인하였다. Cucurbitacin B는 세포 독성을 보이지 않는 농도에서 실험한 결과, 멜라닌 생합성을 농도 의존적으로 감소시켰다. Cucurbitacin B는 mushroom tyrosinase의 활성은 직접적으로 저해하지 않았지만, 세포에 처리했을 때 세포 내의 tyrosinase의 활성을 감소시킴을 확인하였다. 또한, cucurbitacin B의 이러한 멜라닌 합성 저해의 기전 연구를 위하여, 멜라닌 합성에 중요한 단백질인 tyrosinase와 microphthalmia-associated transcription factor (MITF)의 단백질 발현을 조사한 결과, cucurbitacin B가 tyrosinase와 MITF의 단백질의 발현을 농도 의존적으로 감소시키는 결과를 확인하였다. 또한, cucurbitacin B는 자외선에 의한 피부암 발생 억제인자(tumor repressor) 및 $Wnt/{\beta}$-catenin 신호전달 과정에 대한 억제 기능이 밝혀진 WW domain-containing oxidoreductase (WWOX)의 단백질 발현을 증가시킴을 추가적으로 확인하였다. 따라서, 이상의 연구 결과를 통해, 오이에서 분리 정제된 cucurbitacin B는 멜라닌 세포(melanocytes)에서 멜라닌 합성을 저해하는 효능이 있음을 확인하였으며, 향후 피부 미백 소재로 활용될 수 있을 것으로 판단된다.

• BMB Reports
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• 제51권2호
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• pp.92-97
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• 2018

B cell leukemia/lymphoma 3 (Bcl3) plays a pivotal role in immune homeostasis, cellular proliferation, and cell survival, as a co-activator or co-repressor of transcription of the $NF-{\kappa}B$ family. Recently, it was reported that Bcl3 positively regulates pluripotency genes, including Oct4, in mouse embryonic stem cells (mESCs). However, the role of Bcl3 in the maintenance of pluripotency and self-renewal activity is not fully established. Here, we report the dynamic regulation of the proliferation, pluripotency, and self-renewal of mESCs by Bcl3 via an influence on Nanog transcriptional activity. Bcl3 expression is predominantly observed in immature mESCs, but significantly decreased during cell differentiation by LIF depletion and in mESC-derived EBs. Importantly, the knockdown of Bcl3 resulted in the loss of self-renewal ability and decreased cell proliferation. Similarly, the ectopic expression of Bcl3 also resulted in a significant reduction of proliferation, and the self-renewal of mESCs was demonstrated by alkaline phosphatase staining and clonogenic single cell-derived colony assay. We further examined that Bcl3-mediated regulation of Nanog transcriptional activity in mESCs, which indicated that Bcl3 acts as a transcriptional repressor of Nanog expression in mESCs. In conclusion, we demonstrated that a sufficient concentration of Bcl3 in mESCs plays a critical role in the maintenance of pluripotency and the self-renewal of mESCs via the regulation of Nanog transcriptional activity.

• 한국식품영양학회지
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• 제10권3호
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• pp.407-413
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• 1997

Cinnamaldehyde의 항돌연변이 작용기구를 밝히기 위하여 E. coli B/r 및 K-12 계열의 다양한 DNA 수복 결손주를 이용하여 4-NQO 및 MNNG에 대한 돌연변이 억제 효과 및 생존율 변화에 대하여 조사하였다. SOS response가 항상 발현되는 균주인 GW1107의 $\beta$-Gal 활성과 41$^{\circ}C$에서 $\beta$-Gal을 합성하는 균주인 GW1060 및 GW1103의 $\beta$-Gal 활성에도 cinnamaldehyde는 효과를 나타내지 못하였다. 이와 같은 결과는 cinnamaldeyde가 LexA와 같은 repressor로서 작용하지 못함은 물론 SOS response를 positive하게 조절하는 RecA 기능에 대하여 아무런 변화를 주지 못한다는 사실을 제시한다. 또한 Trp+ 복귀돌연변이주의생육 및 세포생장 속도에도 영향을 미치지 못하였다. 4-NQO 처리된 균주(WP2s, ZA159 및 TK603)에서 cinnamaldehyde의 첨가로 돌연변이율이 감소되었음\ulcorner 불구하고 생존율은 크게 향상되었다. 그러나 절제 수복기능이 결여되지 않은 WP2 및 lexA 유전자 결손주(CM561 및 CM611)에서는 그와 같은 효과가 나타나지 않았으며, 상보적 DNA의 gap을 연결시켜주는 polymerase I이 결여된 균주인 WP67에서도 생존율이 증가되지 않았다. 위와 같은 결과를 종합하여 볼 때 cinnamaldehyde는 오류 없는 재조합 수복계를 향상시킴으로써 항돌연변이 효과를 나타내는 것으로 추정되었다.

• KSBB Journal
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• 제20권1호
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• pp.26-33
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• 2005

유기성 폐기물의 composting에 사용된 토양유래의 복합 발효 미생물 제제로부터 분리, 동정된 다당 생성 균주인 Enterobacter sp.를 이용하여 서로 다른 기질 및 이의 농도에 따른 발효 특성을 조사하였다. 본 균주는 단당 및 단당의 혼합 탄소원인 경우보다는 lactose에서의 균체 생육 및 다당 생산량이 매우 높아 lactose를 효율적으로 이용하는 특징을 보였다. 공급된 lactose는 $20\%$ 정도가 galactose로 발효액에 축적되어 서서히 감소하였고, glucose는 소량이 존재하였으나, 곧 고갈되었다. 한편, lactose 농도를 증가시킨 결과, 효소 활성도의 증가폭은 약 $350\~450$ unit를 나타내었다. 즉, lactose의 분해 효소 활성도는 다당 생성 경향과 잘 일치하여 $\beta-galactosidase$에 의해 lactose가 구성당인 glucose와 galactose로 분해되는 과정에서 다당이 생성되는 것으로 추론되었다. 또 lactose 배지에 첨가한 glucose와 galactose는 각각 효소 생성의 repressor와 inducer로써 작용하는 것으로 판단하였다. 한편, 탄소원 농도를 증가한 결과, 비증식속도 $(0.133\~0.151hr^{-1})$에는 거의 영향을 미치지 않았고, 균체량의 차이를 나타내었으며, 고농도의 탄소원을 사용할 경우는 배지내의 잔존 당량이 높아져 수율이 감소하였으므로, 다당 생산의 최적 lactose 농도는 $30\~70g/L$인 것으로 판단하였다. 반면, 탄소원의 농도를 각각 30 및 70 g/L로 고정시킨 후, 질소원의 농도를 달리하였을 때는 질소원 농도의 증가로 균체량보다는 비증식속도가 $0.059\~0.225 hr^{-1}$ 및 $0.141\~0.237 hr^{-1}$로 크게 증가하므로 질소원이 증식 속도의 제한 기질로 작용하는 것으로 판단하였다.