This paper presents techniques for discovering rules with elastic patterns. Elastic patterns are useful for discovering rules from data sequences with different sampling rates. For fast discovery of rules whose heads and bodies are elastic patterns, we construct a suffix tree from succinct forms of data sequences. The suffix tree is a compact representation of rules, and is also used as an index structure for finding rules matched to a target head sequence. When matched rules cannot be found, the concept of rule relaxation is introduced. Using a cluster hierarchy and a relaxation error, we find the least relaxed rules that provide the most specific information on a target head sequence. Performance evaluation through extensive experiments reseals the effectiveness of the proposed approach.
Investigation of the protein-protein interaction mode at atomic resolution is essential for understanding on the underlying functional mechanisms of proteins as well as for discovering druggable compounds blocking deleteriou interprotein interactions. Solution NMR spectroscopy provides accurate and precise information on intermolecular interactions even for weak and transient interactions, and it is also markedly useful for examining the change in the conformation and dynamics of target proteins upon binding events. In this mini-review, we comprehensively describe three unique and powerful methods of solution NMR spectroscopy, paramagnetic relaxation enhancement (PRE), pseudo-contact shift (PCS), and residual dipolar coupling (RDC), for the study on protein-protein interactions.
Jun, Young Hyun;Lee, Chang Woo;Lee, Kijun;Park, Song Bai
Journal of the Korean Institute of Telematics and Electronics
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v.24
no.2
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pp.347-354
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1987
Timing simulators are widely used nowadays for analyzing large-scale MOS digital circuits, which, however, have several limitations such as nonconvergence and/or in accuracy for circuits containing tightly coupled feedback elements or loops. This paper describes a new timing simulator which aims at solving these problems. The algorithm employed is based on the wave-form relaxation method, but exploits the signal flow along the feedback loops. Each of feedback loops is treated as one circuit block and then local iterations are performed to enhance the timing simulation. With these techniques, out simulator can analyze the MOS digital circuits with up to 5-20 times of the magnitude speed improvemnets as compared to SPICE2, while maintaining the accuracy.
Purpose: This study was conducted to determine effective chest compression methods that could be used when performing cardiopulmonary resuscitation in rocking boats. Methods: Tests were conducted for four minutes using manual and mechanical chest compressions on two mannequins, placed in boats, and moving at a speed of 35km/hours on calm sea surfaces with wave heights of 0.5m and wind speeds of 2-3m/s (testing for two minutes, followed by rest, then a second round of testing for two minutes). To compare the quality of the chest compressions, data were analyzed using mannequins (Resusci Anne Q-CPR, Laerdal, Norway) and then statistically processed. Results: When chest compressions were administered in the moving rescue boat, an accuracy analysis showed that the pressure speed of the hand and mechanical techniques were normal, h owever, the pressure depth accuracies were 49.04% for manual techniques and 0% for mechanical techniques. The relaxation accuracies during compressions were 2.07% for manual techniques and 95.4% for mechanical techniques. Conclusion: When administering chest compressions in rocking rescue boats, mechanical rather than manual techniques should be preferentially considered.
Purpose: Rapid detection of bacteria is very important in agricultural and food industries to prevent many foodborne illnesses. The objective of this study was to develop a portable nuclear magnetic resonance (NMR)-based system to detect foodborne pathogens (E. coli). This study was focused on developing a method to detect low concentrations of magnetic nanoparticles using NMR techniques. Methods: NMR relaxometry was performed to examine the NMR properties of iron nanoparticle mixtures with different concentrations by using a 1 T permanent magnet magnetic resonance imaging system. Exponential curve fitting (ECF) and inverse Laplace transform (ILT) methods were used to estimate the NMR relaxation time constants, $T_1$ and $T_2$, of guar gum solutions with different iron nanoparticle concentrations (0, $10^{-3}$, $10^{-4}$, $10^{-5}$, $10^{-6}$, and $10^{-7}M$). Results: The ECF and ILT methods did not show much difference in these values. Analysis of the NMR relaxation data showed that the ILT method is comparable to the classical ECF method and is more sensitive to the presence of iron nanoparticles. This study also showed that the spin-spin relaxation time constants acquired by a Carr-Purcell-Meiboom-Gill (CPMG) pulse sequence are more useful for determining the concentration of iron nanoparticle solutions comparwith the spin-lattice relaxation time constants acquired by an inversion recovery pulse sequence. Conclusions: We conclude that NMR relaxometry that utilizes CPMG pulse sequence and ILT analysis is more suitable for detecting foodborne pathogens bound to magnetic nanoparticles in agricultural and food products than using inversion recovery pulse sequence and ECF analysis.
Labbafi, S. Fatemeh;Sarafrazi, S. Reza;Gholami, Hossein;Kang, Thomas H.K.
Advances in Computational Design
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v.2
no.3
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pp.123-141
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2017
Solving a system of linear or non-linear equations is required to analyze any kind of structures. There are many ways to solve a system of equations, and they can be classified as implicit and explicit techniques. The explicit methods eliminate round-off errors and use less memory. The dynamic relaxation method (DR) is one of the powerful and simple explicit processes. The important point is that the DR does not require to store the global stiffness matrix, for which it just uses the residual loads vector. In this paper, a new approach to the DR method is expressed. In this approach, the damping, mass and time steps are similar to those of the traditional method of dynamic relaxation. The difference of this proposed method is focused on the method of calculating the damping. The proposed method is expressed such that the time step is constant, damping is equal to zero except in steps with maximum energy and the concentrated damping can be applied to minimize the energy of system in this step. In this condition, the calculation of damping in all steps is not required. Then the volume of computation is reduced. The DR method for form-finding of membrane structures is employed in this paper. The form-finding of the three plans related to the membrane structures with different loading is considered to investigate the efficiency of the proposed method. The numerical results show that the convergence rate based on the proposed method increases in all cases than other methods.
Lee, Ho Sung;Lee, Young Joo;Chung, Yoon Hee;Lee, Moo Yeol;Kim, Sung Tae;Ko, Sung Kwon;Momoi, Mariko;Kondoh, Yutaka;Sasaki, Fumio;Jeong, Ji Hoon
Journal of Ginseng Research
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v.40
no.4
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pp.334-343
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2016
Background: Progressed tissue culture techniques have allowed us to easily obtain mass products of tissue-cultured mountain ginseng over 100 yr old (TCMG-100). We investigated the effects of TCMG-100 extract on erectile function using in vitro and in vivo studies. Methods: To examine the relaxation effects and mechanisms of action of TCMG-100 on rabbit cavernosal strips evaluated in an organ bath. To investigate the long-term treatment effect of TCMG-100, 8-wk administration was performed. After administration of TCMG-100, intracavernosal pressure, cyclic guanosine monophosphate and nitric oxide (NO) levels of cavernosal tissue, serum testosterone level, histological observation of collagen fiber, endothelium, smooth muscle cell, and transforming growth factor-${\beta}1$ were investigated. Results: TCMG-100 extract displayed dose-dependent relaxation effects on precontracted rabbit corporal smooth muscle. The TCMG-100-induced relaxation was significantly reduced by removing the endothelium, and treatment with an NO synthase inhibitor or NO scavenger. Eight weeks of TCMG-100 administration increased intracavernosal pressure in a rat model. The levels of cyclic guanosine monophosphate and NO in the corpus callosum and serum testosterone level were also increased by TCMG-100 treatment. Furthermore, histological evaluation of collagen, smooth muscle, and endothelium showed increases in endothelium and smooth muscle, and a decrease in transforming growth factor-${\beta}1$ expression. Conclusion: These relaxation effects on corporal smooth muscle and increased erectile function suggest that TCMG-100 might be used as an alternative herbal medicine to improve erectile function.
Aortic strips were prepared from rabbits, and the tensions were maintained by administration of norepinephrine into the incubation chamber. The application of diol or triol induced relaxation of the aortic strip, as indicated by the decreased aortic tension. Triol, in a concentration of $30\;mg\%\;causes\;approximately\;50\%$ of muscle relaxation, whereas a similar degree of relaxation is induced by $50\;mg\%$ of diol. This indicates that both triol and diol cause relaxation of the aorta, but that triol is about $170\%$ more potent than diol. It is well established that blood-vessel smooth-muscle tone is regulated by the available intracellular $Ca^{++}$ concentration, which in turn is profoundly influenced by interaction of the cellular membrane and sarcoplasmic reticulum in the smooth muscle. Thus, any agent which modifies the smooth-muscle tone is expected to interfere with the $Ca^{++}$ binding or uptake of sarcolemma and sarcoplasmic reticulum. In the following experiments sarcoplasmic reticulum and sarcolemma were prepared from the ventricle of rabbit heart, and the active $Ca^{++}$ uptake by these cellular components was measured employing $Ca^{45}$ in the presence of triol and diol. It was found that the active $Ca^{++}$ uptake in the presence of ATP by sarcoplasmic reticulum was inhibited by both triol and diol. Panaxatriol, in a concentration of $80\;mg\;\%,$ inhibited $Ca^{++}$ uptake by $30\%,$ whereas panaxatriol in the same concentration inhibited uptake by $20\%.$ It is clear that triol is a more potent inhibitor of active $Ca^{++}$ transport in sarcoplasmic reticulum than diol. The $Ca^{++}$ binding of the cellular membrane was also studied employing Ca45 and milipore techniques. It was found that triol in a concentration of $80\;mg\;\%,$ decreased $Ca^{++}$ binding by $29\%.$ Diol in the same concentration decreased the binding by $17\%.$ It is clear that both triol and diol inhibit $Ca^{++}$ binding to the cellular membrane, but triol is approximately $180\%$ more potent than diol.
To examine the solution structure of electrolytes, it is very important to understand ion-ion and ion-solvent interactions. In this review, we introduce the basic principle of dielectric relaxation spectroscopy (DRS) and studies of electrolyte structure. DRS is a type of impedance method, which measures the dielectric properties of electrolytes over a high frequency domain at levels of tens of GHz. Therefore, DRS provides information on the different polar chemical species present in the electrolyte, including the type and concentration of free solvents and ion pairs with dipole moments. The information of DRS is complementary to the information of conventional analytical techniques (Infrared/Raman spectroscopy, nuclear magnetic resonance (NMR), etc.) and thus enables a broad understanding of electrolyte structure.
Proceedings of the Korean Operations and Management Science Society Conference
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1994.04a
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pp.303-312
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1994
The problem of optimally allocating available communication channels in a cellular mobile system with nonuniform traffic distribution is considered. This problem is to minimize the weighted average blocking probability subject to cochannel interference constraints. We use the concept of pattern to deal with the problem more conveniently. Using Lagrangian relaxation and subgradient optimization techniques, we obtain high-quality solutions with information about their deviations from true optimal solutions. Computational experiments show that our method works very well.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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