• 제목/요약/키워드: Ralstonia

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Genetic and Pathogenic Characterization of Bacterial Wilt Pathogen, Ralstonia pseudosolanacearum (Ralstonia solanacearum Phylotype I), on Roses in Korea

  • Lee, Ingyeong;Kim, Yeong Son;Kim, Jin-Won;Park, Duck Hwan
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제36권5호
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    • pp.440-449
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    • 2020
  • The purpose of this study was to analyze the genetic and pathogenic characteristics of Ralstonia pseudosolanacearum in roses in Korea, and to examine the similarities and differences between Korean isolates and the first-reported European strains. Between 2017 and 2019, seventeen isolates from rose plants were identified as R. pseudosolanacearum using Ralstonia-specific primers. All 17 isolates were identified as race 1 using race-specific primers, and were confirmed as biovar 3 due to their ability to utilize carbon sources. Multiplex PCR using phylotype discriminating specific primers identified the 17 isolates as phylotype I. Sequevar comparison with reference sequevars using the sequences of the egl, mutS, and fliC genes, and only the egl gene, revealed that the strains evaluated in this study corresponded to sequevar I-33. The pathogenicity in roses differed depending on the rose cultivars. The different methods used for the genetic characterization of R. pseudosolanacearum indicate that the 17 rose bacterial wilt isolates had the same genetic characteristics. The lack of genetic variation in these isolates indicates their recent introduction from other countries (likely European countries). Therefore, appropriate quarantine and control measures should be taken in order to avoid further increases in the pathogenicity and/or secondary host range of R. pseudosolanacearum through genetic mutation.

Ralstonia eutropha JMP134에서 페놀분해에 관여하는 조절유전자의 Subcloning 및 염기서열 분석 (Subcloning and DNA Sequencing of the Phenol Regulatory Genes in Ralstonia eutropha JMP134)

  • 김기황;;김영준
    • 미생물학회지
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    • 제38권4호
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    • pp.260-266
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    • 2002
  • Ralstonia eutropha JMP134로부터 페놀대사의 조절에 관여하는 유전자부위를 cloning하여 염기서열을 파악하였으며 그 특성을 조사하였다. 염기서열 분석 결과 두 개의 open reading frame (ORF1 & ORF2)들을 발견하였다. ORF1은 페놀분해 구조유전자중의 마지막 인자인phlX의 stop codon으로부터 454 bp 아래에서 시작하여 총 501 개의 아미노산으로 구성되었으며 ORF2는 ORF1의 stop codon으로부터 1 bP 위쪽에서 4개의 염기쌍과 중첩된 상태에서 시작하여 총 232개의 아미노산으로 구성되어 있는 것으로 나타났다. 단백질 배열을 분석해본 결과 ORF1은 transcriptional activator로 작용하는 NtrC family에 속하는 것으로 확인되었으며, ORF2는 negative regulator로 알려진 GntR family에 속하는 것으로 나타났다. ORF1과 ORF2를 encoding하는 유전자를 각각 phlR2 와 phlA로 명명하였으며 이들의 가능한 조절기작을 고찰하였다.

우리나라에 분포하는 고추와 토마토 풋마름병균(Ralstonia solanacearum) 계통들의 유전적 다양성 (Genetic Diversity of Ralstonia solanacearum Strains Isolated from Pepper and Tomato Plants in Korea)

  • 서상태;박종한;한경숙;정승룡;이승돈
    • 식물병연구
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    • 제13권1호
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    • pp.24-29
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    • 2007
  • 풋마름병징을 나타내는 고추와 토마토 식물체로부터 35개의 풋마름병균 계통들을 분리하여 생리.생화학 실험, 병원성 실험, 유전학적 실험을 통해 유전적 다양성을 연구하였다. 생리 생화학 실험과 종특이적 polymerase chain reaction(PCR)을 실시한 결과 풋마름병균 계통들은 모두 Ralstonia solanacerum biovar 4로 동정되었다. 분리균은 고추와 토마토 유묘를 이용해 병원성이 확인되었다. Repetitive sequence-based PCR(rep-PCR) 결과를 토대로 계통도 분석을 한 결과 고추와 토마토 분리균은 6개의 group으로 나뉘었으며, 유전적 다양성은 높게 나타났다. 풋마름병균 계통들의 그룹간에는 지역별, 기주별 특이성은 관찰되지 않았다.

Nested PCR과 DNA Enzyme-Linked Immunosorbent Assays를 이용한 Ralstonia solanacearum의 검출 (Detection of Ralstonia solanacearum with Nested PCR and DNA Enzyme-Linked Immunosorbent Assay)

  • 고영진;조홍범
    • 미생물학회지
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    • 제43권3호
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    • pp.179-185
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    • 2007
  • 본 연구는 polymerase chanin reaction(PCR)기법과 DNA enzyme-linked immunosorbent assay(DNA ELISA) 기법을 이용하여 토양내 식물병원균인 Ralstonia solanacearum를 검출하고자 하였다. 토양 시료로부터 분석에 사용될 R. solanacearum DNA를 추출하기 위하여 몇 가지 방법을 비교 평가한 결과 기존의 DNA 추출 방법에 비하여 Guanidin isothiocyanate와 Chelex-100 resin을 사용하는 방법 이 토양 내에 존재하는 다양한 중류의 반응 저해 물질과 R. solanacearum만의 고유한 PCR반응 저해물질들을 제거하는 데에 효과적이었다. R. solanacearum만을 특이적으로 검출하기 위해 fliC유전자 부위에 특이적인 몇 종의 primer들을 제작하였다. 이들 중 높은 민감도와 특이도를 나타내는 두 set의 primer RsolfliC(forward; 5-GAACGCCAACGGTGCGAACT-3 and reverse; 5-GGCGGCCTTCAGGGAGGTC-3, designed by J. $Sch\ddot{o}nfeld$ et al.)와 RS_247 (forward; 5-GGCGGTCTGTCGGCRG-3 and reverse; 5-CGGTCGCGTTGGCAAC-3, designed by this study)를 선정하여 nested PCR을 수행할 수 있도록 고안하였다. Nested PCR primer에 biotin을 표지하였고 nested PCR산물의 내부 서열과 특이적으로 교잡반응을 할 수 있는 probe를 제작하여 PCR 결과를 DNA-EIA반응으로 확인 분석할 수 있도록 하였다. Primary PCR과 nested PCR의 산물을 전기영동 상에서 확인한 결과, nested PCR이 약 $10^2$정도의 높은 민감도를 나타내었고 DNA-EIA의 경우 $10^2P{\sim}10^3$정도의 민감도를 상승시켜주는 것으로 확인되었다.

가지의 Ralstonia solanacearum에 의한 풋마름병 발생과 생리형의 분화 (Occurrence and Biovar Classification of Bacterial Wilt Caused by Ralstonia solanacearum in Eggplant (Solanum melongena))

  • 임양숙;이문중;정종도;류영현;김병수
    • 식물병연구
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    • 제14권1호
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    • pp.10-14
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    • 2008
  • Ralstonia solanacearum에 의한 풋마름병은 세계적으로 치명적인 병해중의 하나이며 우리나라에서는 가지, 토마토, 감자, 고추 등 가지과 작물에 발병이 보고되어 있다. 2005년${\sim}$2006년 2년 동안 가지 주재배단지의 풋마름병 발생 포장에서 48개의 균주를 수집하여 분리 배양하였으며 R. solanacearum의 특이적인 flipcF/flipcR primer를 이용하여 PCR을 실시한 결과 470-bp의 풋마름병 특이적 밴드가 관찰되어 R. solanacearum으로 동정하였다. 분리 동정된 15균주로 각 기주별 병원성을 검정하였을 때 가지, 토마토에 병원성을 나타내었으나 고추는 저항성을 나타내었다. 가지 풋마름병원균의 biovar분화는 biovar 3, 4로 동정되었으며 특히 biovar 3는 가지 풋마름병 저항성 대목에 다소 강한 병원성을 나타내어 저항성대목의 육종이 필요한 것으로 판단된다.

Ralstonia pseudosolanacearum에 의한 땅콩 풋마름병 발생 보고 (First Report of Bacterial Wilt by Ralstonia pseudosolanacearum on Peanut in Korea)

  • 최수연;김남구;김상민;이봉춘
    • 식물병연구
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    • 제28권1호
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    • pp.54-56
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    • 2022
  • 2021년 7월, 고창 땅콩 재배포장에서 시들음 증상을 보이는 땅콩 지상부를 발견하였다. 병징은 잎이 갈색으로 시들어 말라 죽은 것처럼 보였으며, 채집한 식물체의 지제부를 잘라 표면소독 후 멸균수에 넣었을 때 ooze 현상을 관찰하였다. 땅콩에서 순수분리된 병원균은 16s rRNA 유전자 염기서열과 phylotype 분류, 유연관계 분석을 통해 분리된 균주가 Ralstonia pseudosolanacearum이라는 것을 확인하였다. 현재까지 국내에 보고된 풋마름병은 고추, 토마토, 감자 등을 기주로 발생한다고 알려져 있다. 본 연구는 국내 처음으로 R. pseudosolanacearum에 의해 발생한 땅콩 풋마름병을 보고하고자 한다.

First Report of Bacterial Wilt Caused by Ralstonia solanacearum Biovar 2 Race 1 on Tomato in Egypt

  • Seleim, Mohamed A.A.;Abo-Elyousr, Kamal A.M.;Abd-El-Moneem, Kenawy M.;Saead, Farag A.
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제30권3호
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    • pp.299-303
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    • 2014
  • This study aims to isolate and identify the causal pathogen of tomato bacterial wilt in Egypt. In 2008, tomato plants showing typical symptoms of bacterial wilt disease with no foliar yellowing were observed in Minia, Assiut and Sohag governorates, Egypt. When cut stems of symptomatic plants were submerged in water, whitish ooze was evident and longitudinal sections showed a brown discoloration in the vascular tissues. Bacteria were isolated on triphenyl tetrazolium chloride medium and fifteen isolates shown typical morphological and cultural characteristics were confirmed as Ralstonia solanacearum biovar 2 race 1. Pathogenicity tests showed that all isolates proved to be pathogenic to tomato plants, varied from 52 to 97% wilting. This is the first report of R. solanacearum biovar 2 race 1 causing bacterial wilt in tomato crop in Egypt.

Improvement of Biological Control against Bacterial Wilt by the Combination of Biocontrol Agents with Different Mechanisms of Action

  • Kim, Ji-Tae;Kim, Shin-Duk
    • Journal of Applied Biological Chemistry
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    • 제50권3호
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    • pp.136-143
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    • 2007
  • Despite the increased interests in biological control of soilborne diesease for environmental protection, biological control of bacterial wilt caused by Ralstonia solanacearum have not provided consistent or satisfying results. To enhance the control efficacy and reducing the inconsistency and variability, combinations of specific strains of microorganisms, each having a specific mechanism of control, were applied in this study. More than 30 microorganisms able to reduce the activity of pathogen by specific mechanism of action were identified and tested for their disease suppressive effects. After in vitro compatibility examinations, 21 individual strains and 15 combinations were tested in the greenhouse. Results indicated three-way combinations of different mode of control, TS3-7+A253-16+SKU78 and TS1-5+A100-1+SKU78, enhanced disease suppression by 70%, as compared to 30-50% reduction for their individual treatments. This work suggests that combining multiple traits antagonizing the pathogen improve efficacy of the biocontrol agents against Ralstonia solanacearum.

Characterization of an Antibiotic Produced by Bacillus subtilis JW-1 that Suppresses Ralstonia solanacearum

  • Kwon, Jae Won;Kim, Shin Duk
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제24권1호
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    • pp.13-18
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    • 2014
  • Bacillus subtilis JW-1 was isolated from rhizosphere soil as a potential biocontrol agent of bacterial wilt caused by Ralstonia solanacearum. Seed treatment followed by a soil drench application with this strain resulted in >80% reduction in bacterial wilt disease compared with that in the untreated control under greenhouse conditions. The antibacterial compound produced by strain JW-1 was purified by bioactivity-guided fractionation. Based on mass spectroscopy and nuclear magnetic resonance spectral data ($^1H$, $^{13}C$, $^1H-^1H$ correlation spectroscopies, rotating frame nuclear Overhauser effect spectroscopy, and heteronuclear multiple-bond correlation spectroscopy), the structure of this compound was elucidated as a cyclic lipopeptide composed of a heptapeptide (Gln-Leu-Leu-Val-Asp-Leu-Leu) bonded to a ${\beta}$-hydroxy-iso-hexadecanoic acid arranged in a lactone ring system.

산성배양에 공급에 의한 토마토 풋마름병 방제 (Control Strategy of Acidified Nutrient Solution on Bacterial Wilt of Tomato Plants)

  • 이영근;설균찬
    • 한국식물병리학회지
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    • 제14권6호
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    • pp.744-746
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    • 1998
  • Control effect of acidified nutrient solution on bacterial wilt of tomato plants was tested by examining the degree of bacterial growth inhibition and plant damage due to the acidity. Ralstonia solanacearum, the causal bacterium of bacterial wilt of tomato plants, showed 105 times population reduction when the bacterium was cultured in the acidified nutrient solution (pH 3.5∼4.0). However, fruit yields were decreased only fifteen to twenty percents. These results suggest that control of the bacterial wilt of tomato plants may be possible with supplying acidified nutrient solution.

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