• 제목/요약/키워드: RT-PCR analysis

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한방이화주 주박 추출물에 의한 암세포 항성장 및 세포사멸 기전 연구 (Anti-proliferative and Pro-apoptotic Effects by Lees Extracts of Ehwa Makgeolli Containing Oriental Herbs)

  • 권민정;이승훈;정정욱;손호용;신우창;김종식
    • 생명과학회지
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    • 제26권2호
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    • pp.241-246
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    • 2016
  • 본 연구에서는 한국 전통 막걸리 중 하나인 한방 이화주의 주박으로부터 에탄올 추출물과 그것의 순차적인 유기용매 분획물을 획득하고, 이들 시료들이 인간 대장암 세포인 HCT116 세포주의 cell viability와 pro-apoptotic 유전자인 ATF-3와 NAG-1의 발현에 미치는 영향을 연구하였다. 처리된 유기용매 시료 가운데 KSD-E3-2 분획물 (hexane 분획물)과 KSD-E3-3 분획물 (ethyl acetate 분획물)의 처리에 의해 현저하게 세포생존율이 감소하였으며, 두 분획물에 의해 농도의존적으로 세포 생존율이 감소하였다. 또한, 두 분획물의 처리에 의해 pro-apoptotic 유전자인 NAG-1과 ATF-3의 유전자와 단백질의 발현이 증가함을 확인하였다. 특히, KSD-E3-3 분획물 0.1 mg/ml의 처리에 의해 NAG-1 단백질의 발현이 현저하게 증가하였으며, 또한 apoptosis의 지표인 PARP cleavage가 관찰되었다. 이러한 KSD-E3-3 분획물에 의해 유도된 apoptosis는 NAG-1 siRNA transfection에 의해 회복됨을 확인하였다. 따라서, KSD-E3-3 분획물에 의한 NAG-1 단백질의 발현증가와 apoptosis 간의 직접적인 관련성이 있음을 시사한다. 종합적으로 본 연구 결과는 한방이화주 주박에 함유된 생리활성물질의 암세포 항 성장 활성 및 apoptosis기전을 이해하는데 도움을 줄 것으로 생각된다.

3T3-L1 지방전구세포에서 합토글로빈에 의한 염증성 cytokine 발현 조절 (The Effect of Haptoglobin on Expression of Inflammatory Cytokines in 3T3-L1 Preadipocytes.)

  • 조진경;김남훈;오미경;박선주;김인숙
    • 생명과학회지
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    • 제18권4호
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    • pp.537-541
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    • 2008
  • 백색지방조직(white adipose tissue)은 에너지 저장뿐만 아니라 다양한 adipokines을 분비하는 중요한 내분비 기관이다. 급성기반응 단백질로 알려져 있는 합토글로빈(haptoglobin)도 adipokine의 한 종류로서 지방세포에서 합성되고 분비된다. 그러나 adipokine으로서의 기능과 지방조직에서의 역할은 아직까지 규명되지 않았다. 본 연구에서는 3T3-L1 지방전구세포를 합토글로빈 유전자로 transfection 시켜 합토글로빈을 과발현하는 세포를 만들고 세포증식, 염증관련 인자들의 발현조절 및 단구세포의 유인성을 조사하였다. 그 결과, 합토글로빈은 3T3-L1 세포의 성장에는 별 영향을 미치지 않았으나 IL-6와 COX-2 발현을 저해하고 HO-1 합성을 증가하였다. 또한 THP-1 단구세포를 이용한 invasion assay에서는 합토글로빈이 단구세포의 이동을 저해하였다. 이러한 결과들은 합토글로빈이 지방조직에서 항염증 반응에 관여함을 시사한다. 만성적 염증상태(chronic low-grade inflammatory state)로 인식되고 있는 비만은 염증관련 인자들에 의한 인슐린저항성이 유도되는 바, 합토글로빈은 비만 관련 인슐린저항성을 방지하고 인슐린민감성을 향상시키는 데에도 기여할 것으로 생각된다.

Molecular Cloning and Expression of a Cu/Zn-Containing Superoxide Dismutase from Thellungiella halophila

  • Xu, Xiaojing;Zhou, Yijun;Wei, Shanjun;Ren, Dongtao;Yang, Min;Bu, Huahu;Kang, Mingming;Wang, Junli;Feng, Jinchao
    • Molecules and Cells
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    • 제27권4호
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    • pp.423-428
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    • 2009
  • Superoxide dismutases (SODs) constitute the first line of cellular defense against oxidative stress in plants. SODs generally occur in three different forms with Cu/Zn, Fe, or Mn as prosthetic metals. We cloned the full-length cDNA of the Thellungiella halophila Cu/Zn-SOD gene ThCSD using degenerate RT-PCR and rapid amplification of cDNA ends (RACE). Sequence analysis indicated that the ThCSD gene (GenBank accession number EF405867) had an open reading frame of 456 bp. The deduced 152-amino acid polypeptide had a predicted molecular weight of 15.1 kDa, an estimated pI of 5.4, and a putative Cu/Zn-binding site. Recombinant ThCSD protein was expressed in Escherichia coli and assayed for SOD enzymatic activity in a native polyacrylamide gel. The SOD activity of ThCSD was inactivated by potassium cyanide and hydrogen peroxide but not by sodium azide, confirming that ThCSD is a Cu/Zn-SOD. Northern blotting demonstrated that ThCSD is expressed in roots, stems, and leaves. ThCSD mRNA levels increased by about 30-fold when plants were treated with sodium chloride (NaCl), abscisic acid (ABA), and indole-acetic acid (IAA) and by about 50-fold when treated with UVB light. These results indicate that ThCSD is involved in physiological pathways activated by a variety of environmental conditions.

잣기름 성분분석 및 비만 예방효과 연구 (Analysis of Pine Nut Oil Composition and Its Effects on Obesity)

  • 김경곤;강윤환;김대중;김태우;최면
    • 한국식품과학회지
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    • 제46권5호
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    • pp.630-635
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    • 2014
  • 본 연구에서는 성분분석을 통해 품질이 확인된 PNO의 항비만효과를 세포수준에서 확인하고 기능성소재로서의 연구 가능성을 제시하고자 수행하였다. 그 결과 PNO는 기존에 알려진 바와 같이 linoleic acid, oleic acid, pinolenic acid, 및 palmitic acid가 분석되었으며 정량을 위한 표준물질인 undecanoic acid의 함량을 기준으로 확인한 결과 linoleic acid 43.4%, oleic acid 25.7%, pinolenic acid로 예측되는 11번 unknown peak 12.8%, palmitic acid 5.2% 및 다수의 미량 성분을 함유하고 있었다. 세포독성 실험을 통해 0.2 mg/mL 농도 까지 독성이 관찰되지 않음을 확인하였으며 그 이상의 농도에서도 PNO보다는 용매 DMSO에 의한 독성이 관찰되었다. PNO를 이용하여 항비만 효과에 대한 잠재적 기능 및 기전을 연구하기 위해 Oil Red O staining, $PPAR{\gamma}$ 및 aP2 mRNA 발현 확인 그리고 leptin의 분비량 측정을 진행하였다. 그 결과 PNO는 MDI solution 처리를 통해 분화가 유도된 mature adipocyte에서 지방적(lipid droplet) 형성을 유의하게 억제하는 것을 확인할 수 있었으며 이는 PNO가 항비만 활성에 잠재적으로 기능을 할 수 있음을 의미한다. 또한 $PPAR{\gamma}$와 aP2 mRNA 발현을 확인한 결과, 두 유전자가 유의한 수준으로 MDI control 대비 감소하는 반면 SREBP-1c, $C/EBP{\alpha}$, glucokinase, phosphoenolpyruvate carboxykinase 및 perilipin에는 영향이 없는 것을 확인할 수 있었다(data not shown). RT-PCR 결과는 PNO의 처리가 지방대사 및 축적을 단백질 및 유전자 발현조절 기전에 의해 억제할 수 있음을 제시하여 주며, 추가적인 연구가 필요함을 시사한다. 마지막으로 확인한 PNO의 leptin 방출유도 실험을 통해 leptin이 PNO의 처리에 의해 농도 의존적으로 방출량이 증가됨을 확인할 수 있었다. Leptin은 식욕억제 효과가 있는 호르몬으로 잘 알려져 있다. 이는 PNO가 기존에 알려진 cholecystokinin과 glucagon like peptide-1 (GLP-1)의 분비증가를 통해 식욕을 억제할 뿐만 아니라 leptin의 방출을 유도하여 추가적인 식욕억제작용을 유도할 수 있음을 의미한다. 위의 연구결과를 종합하면 PNO는 불포화지방산이 다량 함유된 우수한 식물성유지이며 기능적으로 항비만 효능을 잠재적으로 가지는 우수한 소재임을 확인할 수 있었다. 따라서 본 연구결과를 기초자료로 하여 효과적인 기능성 식품 및 소재의 개발을 위해 체계적이고 과학적인 연구가 필요할 것으로 판단된다.

Streptococcus gordonii, Fusobacterium nucleatum 및 Porphyromonas gingivalis의 상호작용이 성장에 미치는 영향 (The Interactive Effect of These Bacterial Substrates on the Growth of Streptococcus gordonii, Fusobacterium nucleatum and Porphyromonas gingivalis)

  • 김아름;정문진;안용순;김미나;김성임;임도선
    • 치위생과학회지
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    • 제15권2호
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    • pp.209-219
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    • 2015
  • 치주질환과 관련된 세균인 S. gordonii, F. nucleatum 및 P. gingivalis의 상호작용이 군집 형성에 미치는 영향을 알아보고자 trypticase soy hemin menadione broth에 단독 및 열처리한 사균과 혼합 분주하여 혐기성 균배양조를 통해 $37^{\circ}C$ $CO_2$ 배양기에서 anearobic gas pack 하에 7일간 배양하였다. 군집 형성 정도를 확인하기 위해 흡광도를 측정하였으며, 군집 구조 및 형태를 확인하기 위해 주사전자현미경으로 관찰하였다. P. gingivalis의 병원성에 미치는 영향을 확인하기 위해 real-time RT-PCR를 통해 gingipain인 HRgpA를 생성하는 rgpA 유전자에 대한 발현 분석을 시행하여 다음과 같은 결론을 얻었다. S. gordonii와 P. gingivalis의 군집 형성은 다른 사균들에 의해 증가하였다. F. nucleatum의 경우 P. gingivalis 사균에 의해 증가하는 양상을 보였으나 S. gordonii 사균에 의해서는 군집 형성이 감소되었다. 따라서 본 실험에 사용된 균주는 군집 형성 시 상호작용 인자뿐 아니라 세균 입자 그 자체 등을 통해서도 서로 영향을 주는 것으로 생각된다.

A plasma circulating miRNAs profile predicts type 2 diabetes mellitus and prediabetes: from the CORDIOPREV study

  • Jimenez-Lucena, Rosa;Camargo, Antonio;Alcala-Diaz, Juan Francisco;Romero-Baldonado, Cristina;Luque, Raul Miguel;van Ommen, Ben;Delgado-Lista, Javier;Ordovas, Jose Maria;Perez-Martinez, Pablo;Rangel-Zuniga, Oriol Alberto;Lopez-Miranda, Jose
    • Experimental and Molecular Medicine
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    • 제50권12호
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    • pp.13.1-13.12
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    • 2018
  • We aimed to explore whether changes in circulating levels of miRNAs according to type 2 diabetes mellitus (T2DM) or prediabetes status could be used as biomarkers to evaluate the risk of developing the disease. The study included 462 patients without T2DM at baseline from the CORDIOPREV trial. After a median follow-up of 60 months, 107 of the subjects developed T2DM, 30 developed prediabetes, 223 maintained prediabetes and 78 remained disease-free. Plasma levels of four miRNAs related to insulin signaling and beta-cell function were measured by RT-PCR. We analyzed the relationship between miRNAs levels and insulin signaling and release indexes at baseline and after the follow-up period. The risk of developing disease based on tertiles (T1-T2-T3) of baseline miRNAs levels was evaluated by COX analysis. Thus, we observed higher miR-150 and miR-30a-5p and lower miR-15a and miR-375 baseline levels in subjects with T2DM than in disease-free subjects. Patients with high miR-150 and miR-30a-5p baseline levels had lower disposition index (p = 0.047 and p = 0.007, respectively). The higher risk of disease was associated with high levels (T3) of miR-150 and miR-30a-5p ($HR_{T3-T1}=4.218$ and $HR_{T3-T1}=2.527$, respectively) and low levels (T1) of miR-15a and miR-375 ($HR_{T1-T3}=3.269$ and $HR_{T1-T3}=1.604$, respectively). In conclusion, our study showed that deregulated plasma levels of miR-150, miR-30a-5p, miR-15a, and miR-375 were observed years before the onset of T2DM and pre-DM and could be used to evaluate the risk of developing the disease, which may improve prediction and prevention among individuals at high risk for T2DM.

가래나무 수액의 당성분 분석 및 생리활성 연구 (Studies on the Sugar Analysis and Biological Activity of Sap from Juglans mandshurica Maxim.)

  • 김대욱;최미나;이민성;정회석;변준기;김영수
    • 한국키틴키토산학회지
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    • 제23권4호
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    • pp.262-266
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    • 2018
  • 우리나라토종호두나무인가래나무(Juglans mandshurica Maxim.)의 수액의 유리당 함량은 약 3%로 다른 나무 수액에 비해 높게 나타났으며 미량 원소 중에는 Ca이 30 mg/kg의 농도로 포함되어 있는 것으로 확인되었다. 가래나무 수액 $200{\mu}g/ml$에서 elastase 저해 활성이 약 30% 정도를 보이고 있고 HaCaT 세포를 이용한 피부보습 효과에서는 자외선을 조사한 HaCaT세포의 aquaporin 3 유전자와 hyaluronan synthase 2 유전자 발현을 촉진시켜 hyaluronic acid의 생합성을 증가시킨 것으로 확인되었다. 본 연구를 통해 가래나무 수액의 피부 노화 방지 효능을 최초로 규명하였고 이는 가래나무 수액의 활용도를 높일 수 있는 가능성을 제시한 결과라 사료된다. 다만 물질 분석과 in-vivo 시험, 임상 연구 등 심도 있는 추가 연구가 필요할 것으로 판단된다.

폐쇄성과 비폐쇄성 무 정자증 환자의 고환 내 세포 자연사 관련 인자들의 발현 변화와 SELDI-TOF Mass Spectrometry를 이용한 단백질 발현 분석 (Differential Expressions of Apoptosis Regulators and Protein Profiling by SELDI-TOF Mass Spectrometry in Human Testis with Obstructive and Non-obstructive Azoospermia)

  • 김슬기;김호승;이호준;박용석;서주태;윤용달
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제32권2호
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    • pp.121-132
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    • 2005
  • 연구목적: 본 연구에서는 비폐쇄성 무정자증 환자에서 나타나는 정자형성과정의 이상과 고환세포의 세포자연사와의 연관관계 여부를 확인하였다. 또한 SELDI-TOF MS 분석을 통하여 고환 내 단백질 발현 양상을 확인하고, 질환에 따른 효과적인 biomarker 개발 가능성 여부를 확인하였다. 재료 및 방법: RT-PCR 및 면역조직화학법을 사용하여 고환에서의 Fas, FasL, Bcl-2, Bax와 Caspase-3의 발현 양상을 확인하고, in situ DNA 3'-end-labelling 방법으로 고환세포의 세포자연사 양상을 확인하였다. SELDI-TOF MS 분석법에 의한 고환의 병리학적 소견에 따른 단백질 발현 변화는 소수성 칩 ($H_4$)을 사용하여 분자량 10~100 kDa 범위 내에서 분석하였다. 결 과: 정상적인 정자형성과정을 보이는 폐쇄성 무정자증 환자의 고환에 비해 지주세포 증후군 (Sertoli cell only syndrome)과 성숙정지 (maturation arrest)를 보이는 고환 내 생식세포와 지주세포에서 세포자연사가 현저하게 증가한 것을 확인할 수 있었다. 세포자연사 관련인자들의 발현 양상을 확인한 결과, 지주세포 증후군과 성숙정지 환자군에서 Fas와 FasL mRNA의 발현이 증가하였으나, bcl-2, bax와 caspase-3 mRNA 발현의 경우에는 두 질환 모두에서 유의한 차이를 확인할 수 없었다. FasL 단백질 발현의 경우, 세포자연사의 증가가 관찰되었던 지주세포 증후군과 성숙정지를 보이는 환자의 간질세포와 지주세포에서 증가하는 양상을 나타내었다. SELDI-TOF MS 분석 결과에서 폐쇄성 무정자증 환자군에 비해 전체적인 단백질 발현양이 지주세포 증후군과 성숙정지 환자의 고환에서 감소하는 양상을 보였으며, 특히, 16.730 kDa 단백질의 현저한 감소를 확인할 수 있었다. 결 론: 본 연구결과를 통해 비폐쇄성 무정자증 환자에서 나타나는 정자형성과정의 장애는 생식세포의 비정상적인 세포자연사와 연관되어 있으며, 고환 내 Fas와 FasL의 비정상적인 발현이 주된 원인인 것을 확인할 수 있었다. 또한, SELDI-TOF MS 분석법을 통한 단백질 발현 양상의 연구는 무정자증 환자에서의 다양한 병리학적 소견을 쉽게 파악할 수 있는 biomarker 발굴뿐만 아니라 질환의 원인규명을 위한 연구에도 유용하게 이용될 수 있을 것으로 사료된다.

Metastasis prognostic factors and cancer stem cell-related transcription factors associated with metastasis induction in canine metastatic mammary gland tumors

  • Kim, Saetbyul;Bok, Eunyeong;Lee, Sangyeob;Lee, Hyeon-Jeong;Choe, Yongho;Kim, Na-Hyun;Lee, Won-Jae;Rho, Gyu-Jin;Lee, Sung-Lim
    • Journal of Veterinary Science
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    • 제22권5호
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    • pp.62.1-62.13
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    • 2021
  • Background: Canine mammary gland tumor (MGT) is the most common cancer in aged female dogs. Although it's important to identify reliable metastasis or prognostic factors by evaluating related to cell division, adhesion, and cancer stem cell-related transcription factor (TF) in metastasis-induced canine MGT, but there are limited studies. Objectives: We aimed to identify metastasis prognostic factors and cancer stem cell-TFs in canine MGTs. Methods: Age-matched female dogs diagnosed with MGT only were classified into metastatic and non-metastatic groups by histopathological staining of MGT tissues. The mRNA levels of cancer prognostic metastasis molecular factors (E-cadherin, ICAM-1, PRR14, VEGF, HPRT1, RPL4 and hnRNP H) and cancer stem cell-related TFs (Oct4, Sox2, and Nanog) were compared between metastatic and non-metastatic canine MGT tissues using qRT-PCR analysis. Results: The mRNA levels of ICAM-1, PRR14, VEGF, hnRNP H, Oct4, Sox2, and Nanog in metastatic MGT group were significantly higher than those in non-metastatic MGT group. However, mRNA level of RPL4 was significantly lower in metastatic MGT group. Loss of E-cadherin and HPRT1 was observed in the metastatic MGT group but it was not significant. Conclusions: Consistent expression patterns of all metastasis-related factors showing elevation in ICAM-1, PRR14, VEGF, hnRNP H, Oct4, Sox2, and Nanog, but decreases in RPL4 levels occurred in canine MGT tissues, which was associated with metastasis. Thus, these cancer prognostic metastasis factors and TFs of cancer stem cells, except for E-cadherin and HPRT1, can be used as reliable metastasis factors for canine MGT and therapeutic strategy.

Exosomal miR-181b-5p Downregulation in Ascites Serves as a Potential Diagnostic Biomarker for Gastric Cancer-associated Malignant Ascites

  • Yun, Jieun;Han, Sang-Bae;Kim, Hong Jun;Go, Se-il;Lee, Won Sup;Bae, Woo Kyun;Cho, Sang-Hee;Song, Eun-Kee;Lee, Ok-Jun;Kim, Hee Kyung;Yang, Yaewon;Kwon, Jihyun;Chae, Hee Bok;Lee, Ki Hyeong;Han, Hye Sook
    • Journal of Gastric Cancer
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    • 제19권3호
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    • pp.301-314
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    • 2019
  • Purpose: Peritoneal carcinomatosis in gastric cancer (GC) patients results in extremely poor prognosis. Malignant ascites samples are the most appropriate biological material to use to evaluate biomarkers for peritoneal carcinomatosis. This study identified exosomal MicroRNAs (miRNAs) differently expressed between benign liver cirrhosis-associated ascites (LC-ascites) and malignant gastric cancer-associated ascites (GC-ascites), and validated their role as diagnostic biomarkers for GC-ascites. Materials and Methods: Total RNA was extracted from exosomes isolated from 165 ascites samples (73 LC-ascites and 92 GC-ascites). Initially, microarrays were used to screen the expression levels of 2,006 miRNAs in the discovery cohort (n=22). Subsequently, quantitative reverse transcriptase-polymerase chain reaction (qRT-PCR) analyses were performed to validate the expression levels of selected exosomal miRNAs in the training (n=70) and validation (n=73) cohorts. Furthermore, carcinoembryonic antigen (CEA) levels were determined in ascites samples. Results: The miR-574-3p, miR-181b-5p, miR-4481, and miR-181d were significantly downregulated in the GC-ascites samples compared to the LC-ascites samples, and miR-181b-5p showed the best diagnostic performance for GC-ascites (area under the curve [AUC]=0.798 and 0.846 for the training and validation cohorts, respectively). The diagnostic performance of CEA for GC-ascites was improved by the combined analysis of miR-181b-5p and CEA (AUC=0.981 and 0.946 for the training and validation cohorts, respectively). Conclusions: We identified exosomal miRNAs capable of distinguishing between non-malignant and GC-ascites, showing that the combined use of miR-181b-5p and CEA could improve diagnosis.