• Archives of Pharmacal Research
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• 제22권6호
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• pp.542-548
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• 1999

The UL47 gene (b 60390-b 60388) located in the unique long region of the human cytomegalovirus (HCMV) AD169 strain genome was analyzed RNA mapping. Northern blot analysis showed that the UL47 gene was expressed at late times after infection (72 h postinfection). The 9.7-kb transcript was expressed in the infected cells but not in phosphonoformate-treated cells at 72 hpi, indicating that the UL47 gene was only expressed at late times after infection. To map the 5'-end and 3'-end of UL47 transcripts, primer at late times after infection. To map the 5'-end and 3'-end of UL47 transcripts, primer extension and RNase protection analysis were performed. Primer extension analysis revealed that the transcription initiation site of UL47 was located in 27 bp downstream (b 60323) of the TATA box motif. The sizes of UL47 ORF (approximately 2.9-kb) and UL48 ORF (approximately 6.7-kb) deduced from computer sequence analysis suggest that the expressed 9.7-kb transcript of UL47 uses the 3'-end polyadenylation signal of Ul48. The result of RNase protection determined that the 3'-end of UL47 RNA utilized the 3'-end polyadenylation signal of UL48, which is located in HCMV genome b 70082.

• Genomics & Informatics
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• 제3권1호
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• pp.8-14
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• 2005

Although much is known about the molecular biology of platelets, the megakaryocytes' (MKs) molecular biology was not understood so well because of their rareness. By the cloning and characterization of thrombopoietin (TPO), which is the principal regulator of the growth and development of the MKs, researches on the MKs have been growing rapidly. To understand megakaryocytopoiesis, we investigated the gene expression profile of the MKs using oligonucleotide microarray where 10,108 unique genes were spotted. Comparing the fluorescence intensities of which ratio is $\ge$ ${\mid}2{\mid}$, 372 genes were up-regulated and 541 genes were down-regulated in MKs. For confirmatory expression, RNase protection assay (RPA) establishing abundant apoptotic gene expression was carried out. In MKs, many of the known genes, including several platelet related genes, GATA binding protein were highly expressed. Particularly, TGF beta, clusterin (complement lysis inhibitor), and thymosin beta 4 (actin-sequestering molecules) were expressed highly in MKs. As MKs specific expressed genes may regulate normal and pathologic platelet (and/or MK) functions, the transcript profiling using microarray was useful on molecular understanding of MKs,

• KSBB Journal
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• 제17권3호
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• pp.283-289
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• 2002

Insulin-like growth factor-I(IGF-I)은 성장호르몬의 여러 가지 성정촉진 작용을 매개하는 분열 유발성 폴리펩티드이며, 조직의 수선과 재생, 창상치유 및 골대사와 같은 과정들에서 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 있고, 비교적 여러 조직에서 발현되고 있는 IGF-I 유전자의 전사조절에 대한 정확한 분자적 기전과 호르몬 및 대사 상태가 그것을 어떻게 조절하는지 아직 밝혀져 있지 않다. 쥐를 절삭시키므로써 대사 상태를 변조시켰을 때, 간 조직내 IGF-I mRNA의 발현에 미치는 절식의 영향을 살펴보기 위하여 solution hybridizatioon/RNase protection 방법으로 분석 하였다. IGF-I의 exon 1 및 exon 2에 의하여 encode된 tran-scripts 모두가 감소된 결과를 얻었고, 이러한 감소는 전사 수준에서 일어난 것으로 nuclear run-on 분석에 의하여 확인하였다. 또한 절식시킨 쥐에서 IGF-I mRNA의 양을 조절하는 cia-acting elements를 IGF-I 유전자의 5'-flanking 지역과 exon 1과 econ 2에서 밝히고자 절식시킨 쥐의 신선한 간조직에서 핵 추출물을 얻어 IGF-I의 여러 가지 DNA fragments와 반응시켜 DNase I protection 분석을 한 결과, IGF-I 유전자의 주요한 전사 개 시점으로부터 downstream에 있는 sequences가 절식으로 변조시킨 대사상태에서 IGF-I의 발현 조절에 중요하며 이곳에는 전사인자인 C/EBP family의 isoform들을 포함한 간조직에 풍부하게 존재하는 여러 전사인자들이 결합할 것으로 제안하였다.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제2권2호
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• pp.189-196
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• 1998

Growth Hormone Releasing Hormone (GHRH)은 척추동물의 시상하부로부터 합성, 분비되어 시상하부-뇌하수체간의 문맥계를 통해 뇌하수체 전엽에 작용하여 Growth Hormone (GH)의 분비를 촉진한다. 시상하부에서 발현되는 일부 Releasing Hormone 들이 여러 시상하부외 조직에서도 검출되고 조직특이적인 기능을 수행한다는 사실이 여러 연구자들에 의해 밝혀졌다. 이러한 사실들을 배경으로 본 연구자는 GHRH가 흰쥐의 뇌하수체 전엽과 뇌하수체로부터 유래된 종양세포주들에서 발현될 가능성을 조사하였다. GHRH 펩타이드와 mRNA의 존재와 구조를 규명하기 위하여 뇌하수체와 배양 세포를 사용하여 GHRH immunocytochemistry, 방사면역측정법, GHRH PCR과 RNase protection assay를 시행하였다. Immunocytochemistry의 결과 gonadotrope (대형)와 somat-olactotrope (중간형)로 추정되는 세포들에서 GHRH 염색이 나타났고, Somatolactotrope성 종양세포인 GH3 cell 추출물에서 immunoreactive GHRH가 방사면역측정법으로 검출되었다. 3'rapid amplification of cDNA end (3'-RACE)를 시행한 결과, 흰쥐 뇌하수체에 GHRH transcript가 존재하고, 그 3'end 부분이 다른 조직내의 GHRH와 동일함을 확인하였다. GHRH RT-PCR에서도 뇌하수체와 종양세포주들인 $\alpha$T3 cell (gonadotrope성)과 GH3 cell에서 예상 산물들이 증폭되었다. RNase protection assay를 시행한 결과 난소절제에 의해 뇌하수체내 GHRH 유전자 발현이 증가됨을 확인하였다. 이상의 결과는 GHRH가 뇌하수체 전엽의 gonadotrope와 somatotrope에서 발현되고, paracrine 또는 autocrine조절물질로 작용하여 GH 분비 외에도 뇌하수체 전엽 세포들의 분화와 분열등에 관여함을 시사한다.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제5권5호
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• pp.433-441
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• 2001

The ATP-sensitive potassium $(K_{ATP})$) channel is a member of inward rectifier potassium channel (Kir) that is inhibited by intracellular ATP and functions in close relation to sulfonylurea receptors (SUR). Although the molecular mechanism and physiological function of $K_{ATP}$ channels are well understood, the expression pattern during development or treatment with the channel modulators such as glybenclamide is little known. In this work, we determined mRNA levels of a $K_{ATP}$ channel (Kir6.2) and a sulfonylurea receptor (SUR2) in rat tissues by RNase protection assay. Levels of Kir6.2 and SUR2 mRNA in the rat brain and skeletal muscle were higher in adult $(90{\sim}120\;days)$ than in neonate $(2{\sim}8\;days),$ whereas those in the heart were not much different between neonate $(2{\sim}8\;days)$ and adult $(90{\sim}120\;days).$ In addition, none of $K_{ATP}$ channel modulators (opener, pinacidil and nicorandil; blocker, glybenclamide) affected the Kir6.2 mRNA levels in the heart, brain and skeletal muscle. The results indicate that the expression of Kir and SUR genes can vary age-dependently, but the expression of Kir is not dependent on the long-term treatment of channel modulators. The effect of the channel modulators on mRNA level of SUR is remained to be studied further.

• Animal cells and systems
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• 제1권4호
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• pp.589-594
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• 1997

The neuronal voltage-sensitive calcium channels (VSCCs) are multisubunit complexes consisting of $\alpha_1,\;\alpha_2-\delta$ and $\beta$ subunits. Heterologous expression and biochemical studies have shown that the activity of VSCCs is regulated by their $\beta$ subunits in a $\beta$ subunit isoform-specific manner. To elucidate the $\beta$ subunit identity of the P/Q-type calcium channel encoded by an $\alpha_{1A}$ subunit, which is exclusively expressed in the Purkinje and granule cell of the cerebellum, we have examined the spatial and temporal expression patterns of $\beta$ subunits and compared them with those of $\alpha_{1A}$ subunit in the developing rat cerebellum. Reverse transcriptase- polymerase chain reaction (RT-PCR) and Northern blot analysis have shown that $\beta_4$ subunit mRNA was prominently expressed in the cerebellum and much more abundant than any other distinct $\beta$ subunits. RNase protection assay has further demonstrated that the expression of $\alpha_{1A}$ and $\beta_4$ subunits increased during cerebellar development, while the amount of $\beta_2$ and $\beta_3$ mRNAs did not significantly change. In addition, a $\beta_4$ transcript was present in cultured cerebellar granule cells, but not in astrocyte cells, and the level of $\beta_4$ mRNA expression increased gradually in vitro seen as in vivo. Based on the spatial and temporal expression patterns of $\beta_4$ subunit, we conclude that $\beta_4$ may predominantly associate, but probably not exclusively, with the $\alpha_{1A}$ subunit in rat cerebellar granule cells.

• Restorative Dentistry and Endodontics
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• 제36권1호
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• pp.26-36
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• 2011

연구목적: 본 연구는 in vitro 상에서 치수, 치은, 치주인대 세포를 neuropeptide (substance P, Calcitonin gene related peptides (CGRP))및 inflammatory cytokine (TNF-$\alpha$)으로 자극 시 matrix metalloproteinase (MMPs)의 생성 및 발현을 관찰한 것으로 치아와 치아 주변 조직에 염증이 존재할 경우 neuropeptide 및 inflammatory cytokine과 치아 경조직 혹은 치조골의 remodeling에 중요한 역할을 하는 matrix metalloproteinase (MMPs)와의 관계를 규명하고자 하였다. 연구 재료 및 방법: 시편으로는 우식이 없는 건전한 제3대구치(n = 10)를 사용하였으며, 발거 후 즉시 Phosphate buffered saline (PBS)에 보관하고 치아에서 치은과 치주인대 조직을 채취하였다. 치아를 종축으로 절단하고 치수 조직을 채취하여 조각으로 분리한 후 시편을 PBS에서 세 번 세척하였다. Plate에 치수, 치은, 치주인대 시편 조각을 위치시켜 Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM)을 첨가하여 세포를 배양하였다. 치수, 치은, 치주인대 세포를 culture dish에서 confluence에 도달할 때 까지 배양하여 Fetal Bovine Serum (FBS)가 포함되지 않은 배지로 교환하여, $37^{\circ}C$에서 24시간 동안 배양한 후 Phosphate buffered saline (PBS)로 1회 세척하고 Substance P ($10^{-8}\;M$, $10^{-5}\;M$)가 포함된 배양액과 Mock (배양액만 포함됨)으로 4시간, 24시간동안 자극하였다. CGRP ($10^{-6}\;M$)을 함유한 배양액 및 TNF-$\alpha$(2 ng/mL)를 포함한 배양액으로 각각 24시간동안 세포를 자극하였다. 각각 다른 농도의 TNF-$\alpha$(2 ng/mL, 10 ng/mL, 100 ng/mL)를 포함한 배양액으로 24시간 동안 세포를 자극 한 후 RNase protection assay 및 Enzyme linked immunosorbent assay를 시행하였다. 결과: SP와 CGRP는 치수, 치은, 치주인대 세포의 MMPs발현에 관여 하지 않았다. TNF-$\alpha$로 24시간 자극 시 치수, 치은, 치주인대 세포에서 MMP-1,-12, -13의 발현을 증가시켰다. 반면, TNF-$\alpha$는 치수, 치은, 치주인대 세포들에서 TIMP-3의 발현을 감소시켰다. 서로 다른 농도의 TNF-$\alpha$(2 ng/mL, 10 ng/mL, 100 ng/mL)로 24시간 자극 시 MMP-1과 MMP-13의 발현이 증가하였다. 결론: 치아와 치아 주변 조직에 염증이 존재 시 TNF-$\alpha$가 증가함에 따라 치수, 치은, 치주인대로부터의 치아의 경조직 혹은 치조골의 remodeling에 관여하는 matrix metalloproteinase (MMPs)가 중요한 역할을 하는 것으로 사료된다.

• 한국안광학회지
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• 제13권4호
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• pp.43-49
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• 2008

목적: 본 연구에서는 UV-A 차단 콘택트렌즈의 UV-A 차단효과를 일반 콘택트렌즈의 효과와 비교하여 보고자 하였다. 방법: RNase A, catalase 및 superoxide dismutase(SOD)를 일반 콘택트렌즈(UV-A 차단율 20%) 및 자외선 차단 콘택트렌즈(UV-A 차단율 85%)로 차단하였을 때의 UV-A에 의한 변성을 아크릴아미드 겔 전기영동법으로 확인하였다. 효소의 용액은 각각 1, 3, 6, 24 및 96시간 동안 365 nm의 UV-A에 노출시켰으며, 콘택트렌즈에 의한 UVA차단 범위는 전안구를 덮는 RGP 렌즈, 소프트 콘택트렌즈, 안경의 크기를 계산하여 각각 50%, 70% 및 100%로 변화를 주었다. 결과: RNase A, catalase 및 SOD의 변성은 UV-A에 노출된 시간이 길어질수록 심하여졌다. 자외선차단 콘택트렌즈의 자외선 차단 효과는 일반 콘택트렌즈와 비교하여 보았을 때 모든 효소에서 차단 효과가 있음을 확인하였다. 콘택트렌즈로 차단된 범위가 줄어들수록 또한 UV-A에 노출된 시간이 길어질수록 자외선 차단 콘택트렌즈의 차단 효과는 감소됨을 알 수 있었다. 결론: 이상의 결과로 미루어 UV-A에 장시간 노출되었을 경우 자외선 차단 콘택트렌즈는 안구 내의 존재하는 효소를 보호하는 효과가 미흡할 것으로 생각되며, 따라서 햇볕 아래에서의 장시간 콘택트렌즈 착용은 충분한 고려를 하여야 할 것으로 제안할 수 있다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제25권4호
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• pp.369-375
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• 2009

The potential antiviral effects of the culture filtrates (CF) from Serratia marcescens strain Gsm01 against yellow strain of Cucumber mosaic virus (CMV-Y) were investigated. The culture filtrate of S. marcescens strain Gsm01 applied on Chenopodium amaranticolor showed high inhibitory activity, likewise no necrosis appeared when applied on the tobacco plants 2 days before CMV-Y inoculation. When plants were challenge inoculated with CMV-Y for eighteen days, the disease incidence in plants with culture filtrate of S. marcescens Gsm01 did not exceed 59%, whereas 100% of control plants were severely infected. The results of double antibody sandwich-enzyme linked immunosorbent assay (DAS-ELISA), reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR), dot blotting, and western blotting showed that culture filtrate treatment highly affected the accumulation of CMV-Y or its CP protein gene in the treated plant leaves. It was also observed that the culture filtrate had no RNase activity on genomic RNAs of CMV-Y, suggesting that culture filtrate may not contain ribosome inactivating proteins (RIPs) or proteins with RNase activity. These data shows that culture filtrate of S. marcescens strain Gsm01 seems to be a promising source of antiviral substance for the practical use.

• BMB Reports
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• 제41권10호
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• pp.739-744
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• 2008

Turnip yellow mosaic virus (TYMV) is a positive strand RNA virus that infects mainly Cruciferae plants. In this study, the TYMV genome was modified by inserting an extra subgenomic RNA promoter and a multiple cloning site. This modified TYMV was introduced into Nicotiana benthamiana using a Agrobacterium-mediated T-DNA transfer system (agroinfiltration). When a gene encoding $\beta$-glucuronidase or green fluorescent protein was expressed using this modified TYMV as a vector, replication of the recombinant viruses, especially the virus containing $\beta$-glucuronidase gene, was severely inhibited. The suppression of replication was reduced by co-expression of viral silencing suppressor genes, such as tombusviral p19, closteroviral p21 or potyviral HC-Pro. As expected, two subgenomic RNAs were produced from the recombinant TYMV, where the larger one contained the foreign gene. An RNase protection assay revealed that the recombinant subgenomic RNA was encapsidated as efficiently as the genuine subgenomic RNA.