• 대한수의학회지
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• 제34권3호
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• pp.517-527
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• 1994

An attempt was made to isolate a causative viral agents from the fecal specimens of the diseased dogs with the gastroenteritis symptoms. Two coronavirus-like agents were isolated by serial dilution end point method and plaque assay. The isolates were characterized in terms of cytopathology, antigenicity, replication, physicochemical and morphological properties. The results obtained through the experiment were as follows; 1. Among 7 fecal specimens collected from the dogs with enteric disease, 2(28.6%)coronavirus-like agents showing typical cytopathic effects of canine coronavirus were isolated, and designated as CCV D1 and CCV D2, respectively. 2. By the cross-neutralization test and indirect immunofluoresence antibody test, the isolates were antigenically indentified as the standard CCV. The viruses were replicated only in the cytoplasm of A-72 cells. 3. The isolates showed no haemagglutinating activity against the erythrocytes from 11 kinds of animals. 4. The electron microscopic observation for the isolates showed spherical and pleomorphic features, covered with club-shaped projections on the surface. The size of particles was ranged from 70 to 150nm. 5. In one-step growth curve for the isolates in A-72 cells, maximum titers of intracellular vius was $10^{4.6}$ $TCID_{50}/0.1ml$ at 46 hrs postinoculation(pi) of CCV Dl and $10^{4.4}$ $TCID_{50}/0.1ml$ at 34 hrs pi of CCV D2. The maximum titers of extracellular virus was $10^{5.5}$ $TCID_{50}/0.1ml$ at 58 hrs pi of CCV D1 and $10^{5.8}$ $TCID_{50}/0.1ml$ at 46 hrs pi of CCV D2. 6. In physicochemical property test, the isolates were very sensitive to choroform and were found to be RNA virus. The viruses was stable at pH 3.0 for 1 hr and at $22{^{\circ}C}$ for 5 hrs. However, infectivity titers reduced remarkably by treatment with $56{^{\circ}C}$ for 10min.

• Pediatric Infection and Vaccine
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• 제17권2호
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• pp.130-136
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• 2010

목적 : 부산에서 급성호흡기 증상으로 외래 방문한 환자를 대상으로 원인 바이러스 및 역학을 연구하고자 하였다. 방법 : 2007년 1월부터 2008년 12월까지 3개 병원 소아청소년과 외래에 급성 호흡기 증상을 주소로 내원한 990명을 대상으로, 비강 세척법으로 검체를 채취하여 역전사중합효소연쇄반응을 시행하였다. 결과 : 총 검체 990건 중 351건(35.5%)이 검출되었으며, 남녀 비는 1.6대 1이었고, 5세 이하가 93.7%였다. hRV가 가장 흔한 원인으로 연중 202건(57.5%), 그 다음으로는 RSV로 10월부터 3월까지 57건(16.2%), ADV는 연중 37건(10.5%), INF는 12월부터 4월까지 21건(6%), hBoV는 1월부터 8월까지 15건(4.3%), PIV는 4월부터 7월까지 9건(2.6%), hCoV는 1월부터 7월까지 7건(2%), EV는 6월부터 9월에 3건(0.9%) 검출되었다. 결론 : 본 연구는 부산의 소아급성호흡기 질환을 예방하고 치료하는데 도움이 되고자 하며, 앞으로도 원인 바이러스에 대한 지속적인 연구가 필요하다.

• 미생물학회지
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• 제39권4호
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• pp.248-252
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• 2003

2000년~2002년 사이 부산지역의 병의원으로부터 의뢰된 바이러스성 뇌수막염 환자로 의심되는 환자의 가검물을 대상으로 바이러스 분리를 시도한 결과 2000년에는 검체 292건 중 2건, 2001년에는 371건 중 4건, 2002년에는 703건 중 83건의 장내바이러스를 분리하였다. 2000년에 분리된 원인 바이러스의 경우 echovirus 11 혈청형과 coxsackievirus B2 혈청형이, 2001년에는 coxsackievirus B5 혈청형만이 분리되었으며, 2002년에는 echovirus 2, 3, 6, 7, 9, 13, 25, 30 혈청형이 70건으로 가장 많았고, coxsackievirus B3과 B4 혈청형이 10건으로 예전에 비해 보다 다양한 경향을 나타내었다. 월별발생 양상은 2000년에는 동절기인 12월과 1월에, 2001년에는 5월에 집중적으로 발생하였으며, 2002년에는 4월부터 11월까지 넓은 발생 분포를 나타내었지만 특히 6월과 7월에 가장 발생율이 높았다. Echovirus와 coxsackievirus는 Vero와 HEp-2 세포주에서 강한 병변 효과를 나타내었다. 전자현미경으로 촬영한 echovirus 및 coxsackievirus의 형태학적 양상은 모두 envelope가 없고 크기가 30~35 nm로 아주 작은 구형의 특징을 나타내었다. 세포병변 효과가 나타난 세포배양액에 대하여 nested PCR을 수행한 결과 echovirus 및 coxsackievirus 모두 436 bp 위치에 단일띠를 나타내었으며, serotype은 국립보건원 소화기계바이러스과에 의뢰하여 확인 동정하였다.

• Applied Biological Chemistry
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• 제38권1호
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• pp.55-62
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• 1995

한국 마늘 바이러스의 유전자 구조와 병 발생 메카니즘을 연구하기 위하여, 바이러스가 감염된 마늘잎으로부터 바이러스 입자를 분리하고 RNA를 추출하였다. 그 virus RNA를 이용하여 마늘 바이러스 cDNA 유전자 은행을 만들어 일부 clone의 염기 서열을 결정하였다. 여기에서 얻은 cDNA clones 중에서 poly(A) tail을 갖는 clone S81를 분리하고 873 bp의 전체 염기서열을 결정하였다. Clone S81의 염기서열을 다른 식물 바이러스와 비교한 결과 potexvirus의 껍질단백질 부분의 염기서열과 $30{\sim}40%$의 유사성을 보여주었다. Clone S81은 바이러스 RNA의 3' 말단 부위에 해당하고, 껍질단백질의 N-terminal 3개 아미노산이 빠진 open reading frame (ORF) 및 3'-noncoding region을 포함하고 있다. 3' 말단 부분에는 바이러스 복제과정에서 cis-acting element로 작용한다고 여겨지는 hexamer motif와 polyadenylation signal이 존재한다. 이 clone을 probe로 하여 Northern blot을 실시한 결과 genome의 크기는 7.5 knt라는 것을 알 수 있었고 clone S81은 potexvirus의 cDNA clone이라는 결론을 얻었다. 한국 마늘에서 이 바이러스의 분포 양상을 알아보기 위해 껍질단백질에 대한 항체를 만들었다. 먼저 발현벡터를 이용하여 대장균에서 대량으로 발현시키고 affinity chromatography로 껍질단백질을 정제하였다. 그 단백질을 토끼에 주사하여 껍질단백질에 대한 항체를 얻었다. 이 항체를 사용하여 다양한 지역에서 재배되는 마늘잎의 추출액에 대해 immunoblot을 실시하였다. 그 결과 분자량 29,000과 27,000 위치에서 signal을 보였다. 분자량 27,000 단백질이 29,000이 분해되어 생긴 산물인지 알아보기 위하여 그 추출액을 $37^{\circ}C$에서 시간을 달리하여 incubation한 후 immunoblotting하였다. 그 결과도 마찬가지로 같은 위치에서 signal을 보여줬다. 따라서 한국 마늘에는 재배되는 지역에 따라 다소 다르기는 하지만 대체로 두 종류의 potexvirus로 감염되어 있다고 추정된다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제20권11호
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• pp.1651-1654
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• 2007

The mouse myxovirus resistance protein 1 (Mx1) is known to be sufficient to confer resistance to influenza viruses, and the gene encoding Mx1 is, therefore, an interesting candidate gene for disease resistance in farm animals. The porcine Mx1 gene has already been identified and characterized based on its homology with mouse Mx1; the full-length coding region of the pig Mx1 gene spans 2,545 bp (M65087) and is organized into 17 exons compared with the human ortholog mRNA. In this study, the exons 9, 10 and 11 and introns 6 and 9 of the porcine Mx1 gene were cloned and sequenced. Two SNPs were identified in exons 9, 10 and 11 but none of the SNPs led to an amino acid exchange, and the other eleven variants were detected in introns 6 and 9, respectively. Differences in allele frequency between Meishan and other pig breeds were observed within intron 6, of which an $A{\rightarrow}G$ substitution at position 371 was detected as an SnaBI PCR-RFLP. The association analysis using the Large White${\times}$Meishan $F_2$ offspring suggested that the Mx1 genotype was associated with variation in several immunity traits that are of interest in pig breeding. However, further investigations in more populations are needed to confirm the above result.

• Food Science and Biotechnology
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• 제17권5호
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• pp.925-930
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• 2008

Norovirus has become the most common cause of human gastroenteritis in developed countries. Detection procedures of foodborne viruses from foods require several steps. The concentration step using polyethylene glycol (PEG) is time-consuming and the detection efficiency of reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) is affected by inhibitors from food components. In this study, a rapid detection method based on buoyant density centrifugation was developed to replace the time-consuming chloroform-polyethylene glycol-Tris Tween method. Feline calicivirus that belongs to the family Caliciviridae was used as a surrogate model for norovirus. After artificial inoculation of feline calcivirus (FCV) to oyster and lettuce, 830 ${\mu}L$ of homogenized sample suspension was layered on the top of 670 ${\mu}L$ 20% percoll and centrifuged. Then RNA extraction step was proceeded with the supernatant. By varying several physical conditions, the detection limits were lowered to $2.4{\times}10^2$ PFU per 1 g in oyster and $2.4{\times}10^0$ PFU per 1 g in lettuce. The protocol obtained in this study could be used to develop new detection method for norovirus in foods.

• The Plant Pathology Journal
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• 제33권5호
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• pp.508-513
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• 2017

The complete genome sequence of a Slovak SL-1 isolate of Tomato mosaic virus (ToMV) was determined from the next generation sequencing (NGS) data, further confirming a limited sequence divergence in this tobamovirus species. Tomato genotypes Monalbo, Mobaci and Moperou, respectively carrying the susceptible tm-2 allele or the Tm-1 and Tm-2 resistant alleles, were tested for their susceptibility to ToMV SL-1. Although the three tomato genotypes accumulated ToMV SL-1 to similar amounts as judged by semiquantitative DAS-ELISA, they showed variations in the rate of infection and symptomatology. Possible differences in the intra-isolate variability and polymorphism between viral populations propagating in these tomato genotypes were evaluated by analysis of the capsid protein (CP) encoding region. Irrespective of genotype infected, the intra-isolate haplotype structure showed the presence of the same highly dominant CP sequence and the low level of population diversity (0.08-0.19%). Our results suggest that ToMV CP encoding sequence is relatively stable in the viral population during its replication in vivo and provides further demonstration that RNA viruses may show high sequence stability, probably as a result of purifying selection.

• Biomolecules & Therapeutics
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• 제26권6호
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• pp.576-583
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• 2018

Human rhinoviruses (HRV) are one of the major causes of common cold in humans and are also associated with acute asthma and bronchial illness. Heat-shock protein 90 (Hsp90), a molecular chaperone, is an important host factor for the replication of single-strand RNA viruses. In the current study, we examined the effect of the Hsp90 inhibitor pochonin D, in vitro and in vivo, using a murine model of human rhinovirus type 1B (HRV1B) infection. Our data suggested that Hsp90 inhibition significantly reduced the inflammatory cytokine production and lung damage caused by HRV1B infection. The viral titer was significantly lowered in HRV1B-infected lungs and in Hela cells upon treatment with pochonin D. Infiltration of innate immune cells including granulocytes and monocytes was also reduced in the bronchoalveolar lavage (BAL) by pochonin D treatment after HRV1B infection. Histological analysis of the lung and respiratory tract showed that pochonin D protected the mice from HRV1B infection. Collectively, our results suggest that the Hsp90 inhibitor, pochonin D, could be an attractive antiviral therapeutic for treating HRV infection.

• 미생물학회지
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• 제27권3호
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• pp.225-230
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• 1989

1983년 우리나라에서 처음으로 전염성췌장괴저 바이러스가 분리되기 시작한 이래 여러가지 종류의 내수며 양식 물고고기로부터 이 바이러스가 검출되어 왔다. 세계적으로 안정되고 있는 세가지 표준혈청형 즉 VR-299, Sp 그리고 Ab형 에 대한 중화항체 실험으로, 우리나라에서 발견되는 전염성췌장괴저 바이러스는 주로 VR-299형임이 확인되어 왔으나 대청댐에서 양식된 송어로부터 발견된 한 주의 바이러스는 독특한 혈청형을 보이고 있어 그 특성을 조사하였다. 이 바이러스로부터 단백질과 핵산을 분리하여 세가지 표준 혈청형 바이러스의 그것과 비교하여 본 결과, 크기에 있어 분명한 차이가 보였고 중화항체를 이용한 감염저지 실험으로 Sp 형과 비교적 가까운 연관관계를 가지는 거승로 밝혀졌으나, 세가지 표준 혈청과는 뚜렷이 구분되는 새로운 혈청형으로 판정되었다.

• Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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• 제6권4호
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• pp.205-212
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• 2001

One of the important characteristics of biological systems os their ability to change im-portant properties in response to small environmental signals. The molecular mechanisms that biological molecules utilize to sense and respond provide interesting models for the development of "smart" polymeric biomaterials with biomimetic properties. An important example of this is the protein coat of viruses, which contains peptide units that facilitate the trafficking of the virus into the cell via endocytosis, then out of the endosome into the cytoplasm, and from there into the nucleus, We have designed a family of synthetic polymers whose compositions have been de-signed to mimic specific peptides on viral coats that facilitate endosomal escape. Our biomimetic polymers are responsive to the lowered pH whinin endosomes, leading to distruption of the en-dosomal membrane and release of important biomolecular druges such as DNA, RNA, peptides and proteins to the cytoplasm before they are trafficked to lysosomes and degraded by lysosomal en-zymes. In this article, we review our work on the design, synthesis and action of such smart, pH-sensitive polymers.