• Journal of Plant Biology
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• 제30권3호
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• pp.201-203
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• 1987

Total RNA was isolated from two months old wheat, rice, tobacco and sweet potato. The procedure used was simple and provided pure RNA preparation. Lysis of plant tissue in a buffer with guanidine thiocyanate and CsCl density gradient centrifugation separated RNA from the rest of the cellular components. Subsequent cholroform/1-butanol extraction and ethanol precipitation were necessary to ensure contaminant-free RNA preparation. Storage of the lysed plant tissue in the buffer with guanidine thiocyanate preserved the sample for two months without noticeable RNA degradation.

• Molecular & Cellular Toxicology
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• 제1권2호
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• pp.92-98
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• 2005

DNA microarray analysis of gene expression in toxicogenomics typically requires relatively large amounts of total RNA. This limits the use of DNA microarray when the sample available is small. To confront this limitation, different methods of linear RNA amplification that generate antisense RNA (aRNA) have been optimized for microarray use. The target preparation strategy using amplified RNA in DNA microarray protocol can be divided into direct-incorporation labeling which resulted in cDNA targets (Cy-dye labeled cDNA from aRNA) and indirect-labeling which resulted in cRNA targets (i.e. Cy-dye labeled aRNA), respectively. However, despite the common use of amplified targets (cDNA or cRNA) from aRNAs, no systemic assessment for the use of amplified targets and bias in terms of hybridization performance has been reported. In this investigation, we have compared the hybridization performance of cRNA targets with cDNA targets from aRNA on a 10 K cDNA microarrays. Under optimized hybridization conditions, we found that 43% of outliers from cDNA technique and 86% from the outlier genes were reproducibly detected by both targets hybridization onto cDNA microarray. This suggests that the cRNA labeling method may have a reduced capacity for detecting the differential gene expression when compared to the cDNA target preparation. However, further validation of this discordant result should be pursued to determine which techniques possesses better accuracy in identifying truly differential genes.

• BMB Reports
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• 제37권3호
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• pp.351-355
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• 2004

Separate protocols are commonly used to prepare plasmid DNA, chromosomal DNA, or total RNA from E. coli cells. Various methods for the rapid preparation of plasmid DNA have been developed previously, but the preparation of the chromosomal DNA and total RNA are usually laborious. We report here a simple, fast, reliable, and cost-effective method to extract total nucleic acids from E. coli by direct lysis of the cells with phenol. Five distinct and sharp bands, which correspond to chromosomal DNA, plasmid DNA, 23S rRNA, 16S rRNA, and a mixture of small RNA, were observed when analyzing the prepared total nucleic acids on a regular 1-2% agarose gel. The simple and high-quality preparation of the total nucleic acids in a singe tube allowed us to rapidly screen the recombinant plasmid, as well as to simultaneously monitor the change of the plasmid copy number and rRNA levels during the growth of E. coli in the liquid medium.

• KSBB Journal
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• 제17권3호
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• pp.311-313
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• 2002

L. crispatus KLB46는 Gram-positive bacteria로써 인간의 건강에 중요한 역할을 한다. 본 연구에서는 glass bead를 이용하여 세포벽을 파괴하고 hot phenol RNA 분리방법을 이용하여 RNA를 성공적으로 분리하였다. 또한 Iysozyme과 proteinase K 처리과정을 배제하여 시간적, 경제적인 면에서 유용한 방법임을 확인할 수 있었다. Gram-positive bacteria에서 glass bead를 이용한 RNA 분리는 특수한 조건에 의해 전사 되거나 반감기가 찬은 mRNA의 연구에 유용한 방법이라 사료된다.

• 대한화학회지
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• 제50권3호
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• pp.269-271
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• 2006

• 대한의생명과학회지
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• 제2권2호
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• pp.257-265
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• 1996

토끼 바이러스성 출혈증의 원인체를 실험 토끼에 접종하여 증식을 유도하고 간장에서 hematoxylin & eosin 염 색 에서 조직학적 진단과 세포내 viral RNA의 소재를 결정하기 위해 post-unicryl 포매한 block의 절편을 사용하여 단 염색과 전자현미경적 in situ hybridization을 시도하였다. 토끼 출혈증 viral RNA의 보합 결합에 이용하는 probe는 4717에서 4800(84bases)까지 oligonucleotide를 5'말단에 biotin-CE phosphoramidite로 표지하여 사용하였다. 보합결합물의 증명은 신호 표지로서 antibiotin antibody-l0nm gold를 사용하였으며, hybridization이나 증명은 기존 protocol에서 약간의 변법을 사용하였다. 0.02% glutaraldehyde에서 고정하고 unicryl resin 포매한 표본, biotinylated oligonucleotide probe, antibiotin antibody-l0nm gold로 실험한 결과 증강된 신호를 얻을 수 있었다. 특히 전처리를 생략하므로써 실험 과정을 간단하게 하여 신속한 결과를 얻을 수가 있었다. 전자현미경 in situ hybridization을 통하여 토끼 출혈증 바이러스의 주요 표적은 간세포로 감염 세포의 세포질 내 미토콘드리아와 핵 사이에서 immune gold입자가 뚜렷하게 표지 됨으로서 viral RNA를 증명할 수 있었다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제33권11호
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• pp.3861-3863
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• 2012

• 생명과학회지
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• 제16권2호
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• pp.240-244
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• 2006

본 실험에서는 토마토의 종자를 기내 배양하여 얻어진 1g 이하의 무균 잎 조직을 이용하여 미토콘드리아를 분리 정제하여 MitoTracker를 이용하여 세포생물학적으로 확인하였고, 이들의 mt를 이용하여 미토콘드리아 DNA와 RNA를 추출과 검정을 하였다. 또한 고농도의 이온성을 이용하여 미토콘드리아와 mtDNA 및 mtRNA을 추출할 수 있었으며, 식물의 여러 종류에도 사용되어질 수 있을 것이다. mtDNA는 PCR 분석에 의하여 plastid DNA와 혼재되어 있지 않음을 확인하였다. mtRNA는 RT-PCR 분석을 통하여 plastid RNA와 흔재되어 있지 않음을 확인할 수 있었다.

• 한국융합학회논문지
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• 제12권8호
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• pp.179-186
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• 2021

국내 승인된 코로나-19 백신 중, mRNA 플랫폼 기반 백신의 제조공정을 중심으로 살펴보았다. 제조공정은 크게 DNA 주형 제조공정, mRNA 전사공정, 나노에멀젼화 공정, 제형화, 그리고 완제공정으로 이루어져 있다. 이 공정들은 여러 제약사 및 위탁생산회사와 협업으로 진행되고 있다. 이 중 핵심공정인 나노에멀젼화 공정은 mRNA 보호역할을 위해 지질 성분들이 필요하며, 혼합공정에는 microfluidic device를 활용하는 것으로 알려져 있다. 나노에멀젼화 공정 기술은 향후 다양한 의약품 개발에 자극제 역할을 할 것으로 기대된다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제25권5호
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• pp.512-519
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• 1997

RNA accumulating strain of Torulopsis versatilis MT-1 was cultured in molasses medium for higher contents of RNA in cell. Yeast cells were harvested at logarithmic phase on synchronous culture. Yield of cells on dry base to input sugar was 59.5%. Crude protein content was 55.1% in cell. RNA content was 13.9%. Some problems found in the process for the preparation of yeast extracts were improved by the addition of culture broth of Streptomyces faecalis MSF which secrete RNase (5' nuclease and 5' adenylic acid deaminase). When the culture broth of S. faecalis MSF was added in autolysis process 46% of RNA in cell was converted to I and G(5' inosinic acid and 5' guanylic acid) in extract. By addition of 3-7% culture broth of S.faecalis MSF in autolysis or enzymolysis process at the start or early stage, RNA in extract was converted easily to I and G and protein in cells was easily extracted and hydrolyzed to amino acid. Taste of those yeast extracts was delicious. The yeasty smell in yeast extracts was removed. And cell debris was easily removed from extract.