• Experimental and Molecular Medicine
• /
• 제50권12호
• /
• pp.6.1-6.10
• /
• 2018

Bmal1 is one of the key molecules that controls the mammalian molecular clock. In humans, two isoforms of Bmal1 are generated by alternative RNA splicing. Unlike the extensively studied hBmal1b, the canonical form of Bmal1 in most species, the expression and/or function of another human-specific isoform, hBmal1a, are poorly understood. Due to the lack of the N-terminal nuclear localization signal (NLS), hBMAL1a does not enter the nucleus as hBMAL1b does. However, despite the lack of the NLS, hBMAL1a still dimerizes with either hCLOCK or hBMAL1b and thereby promotes cytoplasmic retention or protein degradation, respectively. Consequently, hBMAL1a interferes with hCLOCK:hBMAL1b-induced transcriptional activation and the circadian oscillation of Period2. Moreover, when the expression of endogenous hBmal1a is aborted by CRISPR/Cas9-mediated knockout, the rhythmic expression of hPer2 and hBmal1b is restored in cultured HeLa cells. Together, these results suggest a role for hBMAL1a as a negative regulator of the mammalian molecular clock.

• 한국자원식물학회:학술대회논문집
• /
• 한국자원식물학회 2019년도 춘계학술대회
• /
• pp.92-92
• /
• 2019

In this study, we evaluated the effect of branch (STB) and leave (STL) extracts from Sageretia thea on ${\beta}$-catenin level in human colorecal cancer cells, SW480 and lung cancer cells, A549. STB and STL dose-dependently suppressed the growth of SW480 and A549 cells. STB and STL decreased ${\beta}$-catenin level in both protein and mRNA level. MG132 decreased the downregulation of ${\beta}$-catenin protein level induced by STB and STL. However, the inhibition of $GSK3{\beta}$ by LiCl or ROS scavenging by NAC did not block the reduction of ${\beta}$-catenin protein by STB and STL. Our results suggested that STB and STL may downregulate ${\beta}$-catenin protein level independent on $GSK3{\beta}$ and ROS. Based on these findings, STB and STL may be a potential candidate for the development of chemopreventive or therapeutic agents for human colorectal cancer and lung cancer.

• 한국지하수토양환경학회지:지하수토양환경
• /
• 제26권4호
• /
• pp.20-26
• /
• 2021

In this work, an indigenous microbial consortium was obtained by selectively cultivating microbes using a long-aged petroleum-contaminated soil (Kuwait) containing recalcitrant petroleum hydrocarbons. The obtained microbial consortium was able to grow on and degrade the remaining petroleum hydrocarbons which could not have been utilized by the indigenous microbes in the original Kuwait soil. The following microbial community analysis using 16S rRNA gene sequencing suggested that the enhanced degradation of the remaining recalcitrant petroleum hydrocarbons by the novel microbial consortium may have been attributed to the selected bacterial populations belonging to Bacillus, Burkholderia, Sphingobacterium, Lachnospiraceae, Prevotella, Haemophilus, Pseudomonas, and Neisseria.

• Journal of Applied Biological Chemistry
• /
• 제65권2호
• /
• pp.93-99
• /
• 2022

Lysosome organelle extract (LOE) was derived from egg whites. The lysosome is an intracellular organelle that contains several hydrolysis enzymes. Previous studies have reported that LOE performs important functions, such as melanin de-colorization and anti-melanin production in B16F10 melanoma cells. However, its principal molecular and cellular mechanisms have not been elucidated till date. In non-cytotoxic conditions, LOE significantly inhibited α-MSH induced melanin synthesis of murine B16F10 cells. The anti-melanogenic activity of LOE was mediated by suppressing the mRNA expression of tyrosinase enzyme, tyrosinase related protein-1/2 (TRP-1/2), and microphthalmia-associated transcription factor (MITF) genes. By performing western blot analysis, we found that LOE significantly attenuated melanogenesis. In this case, LOE helped in increasing extracellular receptor kinase (ERK) phosphorylation in α-MSH induced B16F10 cells. Furthermore, MITF is found to be a key regulatory transcription factor in melanin synthesis; it was down-regulated by LOE through ERK phosphorylation. In this experiment, PD98059 (MEK inhibitor) was used to check whether LOE directly regulated the activity of ERK. Although LOE exerted inhibitory effect on melanin synthesis, we could not observe this effect in PD98059-treated α-MSH induced B16F10. These results strongly indicate that LOE is related to ERK activation and MITF degradation in anti-skin pigmentation. Hence, LOE should be utilized as a whitening agent of skin in the near future.

• Biomolecules & Therapeutics
• /
• 제31권3호
• /
• pp.306-311
• /
• 2023

The current study aimed to reveal the potential effect of meclofenamate, a nonsteroidal anti-inflammatory drug, on the gene expression of airway MUC5AC mucin. Human pulmonary mucoepidermoid NCI-H292 cells were pretreated with meclofenamate for 30 min and stimulated with phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA) for 24 h. Thereafter, the effect of meclofenamate on the PMA-induced nuclear factor kappa B (NF-kB) signaling pathway was assessed. Meclofenamate inhibited glycoprotein production and mRNA expression of MUC5AC mucins induced by PMA by inhibiting the degradation of inhibitory kappa Bα (IkBα) and NF-kB p65 nuclear translocation. These results suggest meclofenamate suppresses mucin gene expression by regulating NF-kB signaling pathway in human pulmonary epithelial cells.

• BMB Reports
• /
• 제56권8호
• /
• pp.451-456
• /
• 2023

Deubiquitinases (DUBs) are an essential component of the ubiquitin-proteasome system (UPS). They trim ubiquitin from substrate proteins, thereby preventing them from degradation, and modulate different cellular processes. Ubiquitin-specific protease 14 (USP14) is a DUB that has mainly been studied for its role in tumorigenesis in several cancers. In the present study, we found that the protein levels of USP14 were remarkably higher in gastric cancer tissues than in the adjacent normal tissues. We also demonstrated that the inhibition of USP14 activity using IU1 (an USP14 inhibitor) or the inhibition of USP14 expression using USP14-specific siRNA markedly reduced the viability of gastric cancer cells and suppressed their migratory and invasive abilities. The reduction in gastric cancer cell proliferation due to the inhibition of USP14 activity was a result of the increase in the degree of apoptosis, as evidenced by the increased expression levels of cleaved caspase-3 and cleaved PARP. Furthermore, an experiment using the USP14 inhibitor IU1 revealed that the inhibition of USP14 activity suppressed 5-fluorouracil (5-FU) resistance in GC cells. Collectively, these findings indicate that USP14 plays critical roles in gastric cancer progression and suggest its potential to serve as a novel therapeutic target for gastric cancer treatment.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제34권6호
• /
• pp.1260-1269
• /
• 2024

The gastrointestinal (GI) tract of shrimp, which is comprised of the stomach, hepatopancreas, and intestine, houses microbial communities that play crucial roles in immune defense, nutrient absorption, and overall health. While the intestine's microbiome has been well-studied, there has been limited research investigating the stomach and hepatopancreas. The present study addresses this gap by profiling the bacterial community in these interconnected GI segments of Pacific whiteleg shrimp. To this end, shrimp samples were collected from a local aquaculture farm in South Korea, and 16S rRNA gene amplicon sequencing was performed. The results revealed significant variations in bacterial diversity and composition among GI segments. The stomach and hepatopancreas exhibited higher Proteobacteria abundance, while the intestine showed a more diverse microbiome, including Cyanobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes, Chloroflexi, and Verrucomicrobia. Genera such as Oceaniovalibus, Streptococcus, Actibacter, Ilumatobacter, and Litorilinea dominated the intestine, while Salinarimonas, Sphingomonas, and Oceaniovalibus prevailed in the stomach and hepatopancreas. It is particularly notable that Salinarimonas, which is associated with nitrate reduction and pollutant degradation, was prominent in the hepatopancreas. Overall, this study provides insights into the microbial ecology of the Pacific whiteleg shrimp's GI tract, thus enhancing our understanding of shrimp health with the aim of supporting sustainable aquaculture practices.

• 생명과학회지
• /
• 제20권12호
• /
• pp.1772-1776
• /
• 2010

내재면역반응의 중요한 조절자인 Nrf2와 NF-${\kappa}B$는 염증시에 교차 작용을 통하여 서로의 전사활성을 조절할 수 있다고 보고된 바 있으나 상반된 결과도 제시되고 있어서 아직까지 확실하게 규명되어 있지 않다. 저자들은 선행연구에서 NF-${\kappa}B$ 저해제인 금(I)-화합물 오라노핀이 인간 관절활막세포와 단핵구성 세포에서 Nrf2를 활성화시킴을 확인한 바 있기 때문에, 본 연구에서는 Nrf2를 knockdown 시킨 류마티스성 활막세포를 사용하여 오라노핀에 의해 저해되는 NF-${\kappa}B$ 신호전달 과정에 Nrf2가 관여하는지를 조사하였다. 세포를 Nrf2 siRNA로 transfection시켰을 때 Nrf2 발현은 대부분 차단됨을 확인하였다. 하지만 Nrf2 knockdown은 TNF-$\alpha$에 의해 유도되는 $I{\kappa}B-{\alpha}$ 분해를 막는 오라노핀의 작용에는 영향을 주지 않았다. Nrf2 target 단백질로서 항염 작용에 관여하는 HO-1을 knockdown 시켰을 경우에도 $I{\kappa}B-{\alpha}$ 분해를 저해하는 오라노핀의 작용에 영향을 미치지 않았다. 또한, Nrf2 knockdown은 오라노핀에 의해 저해된 ICAM-1 발현을 다시 복원시키지 못했다. 이러한 결과들은 염증성 싸이토킨에 의해 유도되는 NF-${\kappa}B$ 활성화를 오라노핀이 저해하는 기전에 Nrf2 및 HO-1이 관련되어 있지 않음을 시사한다. 따라서 류마티스성 관절활막세포에서 오라노핀의 항염작용 기전으로 알려진 Nrf2/HO-1 활성유도와 NF-${\kappa}B$ 활성저해는 교차작용 없이 각각 독립적인 기전을 통해 나타나는 것으로 생각된다.

• Ultrasonography
• /
• 제32권1호
• /
• pp.59-65
• /
• 2013

목적: 본 연구는 초음파 조영제를 직접 합성하고 그 크기 및 소멸 시간 등의 특성을 분석하며, 기존의 초음파 조영제와의 영상을 비교하여 앞으로 초음파 조영제를 매개로 한 영상 유도 하 약물 및 유전자 치료제의 전달 시스템 구축의 기본을 갖추고자 한다. 대상 및 방법: 초음파 조영제는 21마이크로 몰의 DPPC(1, 2-Dihexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine, $C_{40}H_{80}NO_8P$), 9 마이크로 몰의 콜레스테롤, 1.9 마이크로 몰의 DCP(Dihexadecylphosphate, $[CH_3(CH_2)_{15}O]_2P(O)OH$) 및 클로로포름 및 SF6 기체를 이용하여 합성하였다. 약 12-24시간의 동결건조 후에 초음파 조영제는 SF6 기체와 초음파 처리(sonication) 법을 이용하여 합성하였고 그 초음파 조영제의 크기는 압출기를 이용하여 일정한 크기로 조정하였다. 합성된 초음파 조영제는 동적 광산란 측정법(dynamic light scattering measurement)을 이용하여 그 크기를 분석하였다. 한편 합성한 초음파 조영제의 소멸 양상을 평가하기 위하여 광학 현미경을 이용하여 그 숫자를 합성 직후, 12시간, 24시간, 36시간, 48시간, 60시간, 72시간 및 84시간 후에 평가하였다. 초음파 조영제로서의 효과를 평가하기 위하여 모형을 만들어 현재 임상적으로 사용되고 있는 초음파 조영제와 그 에코를 비교 분석하였다. 결과: 초음파 조영제는 동결건조-초음파 처리 방법을 통하여 성공적으로 합성 할 수 있었다. 합성된 초음파 조영제는 154.2 nm의 정점 (peak)에서 가장 많이 분포하였으며 합성 후 24시간부터는 입자의 숫자들이 감소하는 양상을 보였다. 소노뷰와 합성된 초음파 조영제의 에코밝기는 유의한 차이를 보이지 않았으나 소노뷰와 생리식염수 및 합성된 초음파 조영제와 생리식염수의 에코 밝기는 통계적으로 유의한 차이를 보였다 (p < 0.01). 결론: 본 연구를 통하여 초음파 조영제를 직접 합성할 수 있는 방법을 습득할 수 있었고 그 크기 및 특성을 분석할 수 있었다.

• Applied Biological Chemistry
• /
• 제38권1호
• /
• pp.55-62
• /
• 1995

한국 마늘 바이러스의 유전자 구조와 병 발생 메카니즘을 연구하기 위하여, 바이러스가 감염된 마늘잎으로부터 바이러스 입자를 분리하고 RNA를 추출하였다. 그 virus RNA를 이용하여 마늘 바이러스 cDNA 유전자 은행을 만들어 일부 clone의 염기 서열을 결정하였다. 여기에서 얻은 cDNA clones 중에서 poly(A) tail을 갖는 clone S81를 분리하고 873 bp의 전체 염기서열을 결정하였다. Clone S81의 염기서열을 다른 식물 바이러스와 비교한 결과 potexvirus의 껍질단백질 부분의 염기서열과 $30{\sim}40%$의 유사성을 보여주었다. Clone S81은 바이러스 RNA의 3' 말단 부위에 해당하고, 껍질단백질의 N-terminal 3개 아미노산이 빠진 open reading frame (ORF) 및 3'-noncoding region을 포함하고 있다. 3' 말단 부분에는 바이러스 복제과정에서 cis-acting element로 작용한다고 여겨지는 hexamer motif와 polyadenylation signal이 존재한다. 이 clone을 probe로 하여 Northern blot을 실시한 결과 genome의 크기는 7.5 knt라는 것을 알 수 있었고 clone S81은 potexvirus의 cDNA clone이라는 결론을 얻었다. 한국 마늘에서 이 바이러스의 분포 양상을 알아보기 위해 껍질단백질에 대한 항체를 만들었다. 먼저 발현벡터를 이용하여 대장균에서 대량으로 발현시키고 affinity chromatography로 껍질단백질을 정제하였다. 그 단백질을 토끼에 주사하여 껍질단백질에 대한 항체를 얻었다. 이 항체를 사용하여 다양한 지역에서 재배되는 마늘잎의 추출액에 대해 immunoblot을 실시하였다. 그 결과 분자량 29,000과 27,000 위치에서 signal을 보였다. 분자량 27,000 단백질이 29,000이 분해되어 생긴 산물인지 알아보기 위하여 그 추출액을 $37^{\circ}C$에서 시간을 달리하여 incubation한 후 immunoblotting하였다. 그 결과도 마찬가지로 같은 위치에서 signal을 보여줬다. 따라서 한국 마늘에는 재배되는 지역에 따라 다소 다르기는 하지만 대체로 두 종류의 potexvirus로 감염되어 있다고 추정된다.