• 제목/요약/키워드: RNA degradation

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활성슬러지로부터 분리된 Miniimons sp. S16 세균의 특성 (Characterization of Miniimonas sp. S16 isolated from activated sludge)

  • 고현우;김홍익;박수제
    • 미생물학회지
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    • 제55권3호
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    • pp.242-247
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    • 2019
  • 폐수 처리 설비에서 생물학적 요인은 유기물 분해 또는 제거에 필수적인 역할을 수행한다. 본 연구에서는, 폐수처리장의 미생물 기능적 역할을 이해하기 위해, 활성 슬러지 샘플로부터 박테리아 균주를 분리하고 그들의 특성 분석을 시도했다. S16 균주는 대한민국 대전광역시의 폐수처리장의 활성슬러지로 부터 분리되었다. 세포들은 그람음성, 비운동성, 통성 혐기성 그리고 막대모양이였다. S16 균주는 $15{\sim}40^{\circ}C$ (최적 $30^{\circ}C$), 0~9.0% (w/v) NaCl (최적 1.0~2.0%), pH 5.5~9.0 (최적 pH 7.0~7.5)에서 성장하였다. 분자계통학적 분석결과, S16은 Miniimonas 속의 고유종인 Miniimonas areae NBRC $106267^T$ (99.79%, 16S rRNA 유전자 염기서열 유사성)와 가장 밀접한 것으로 나타났다. 해양 미생물로 여겨지는 표준균주 NBRC $106267^T$의 분리 원은 바다 모래이지만 S16 균주는 육상 환경이다. 이는 서식지 전환에 대한 생태학적 의문을 제기할 수 있다. 따라서 비교 유전체 분석은 잠재적인 대사 특성 및 유전체 간소화를 밝히기 위한 가치있는 연구가 될 것이다.

Effects of enzymolysis and fermentation of Chinese herbal medicines on serum component, egg production, and hormone receptor expression in laying hens

  • Mei Hong Jiang;Tao Zhang;Qing Ming Wang;Jin Shan Ge;Lu Lu Sun;Meng Qi Li;Qi Yuan Miao;Yuan Zhao Zhu
    • Animal Bioscience
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    • 제37권1호
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    • pp.95-104
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    • 2024
  • Objective: In the present study, we aimed to investigate the effects of enzymolysis fermentation of Chinese herbal medicines (CHMs) on egg production performance, egg quality, lipid metabolism, serum reproductive hormone levels, and the mRNA expression of the ovarian hormone receptor of laying hens in the late-laying stage. Methods: A total of 360 Hy-Line Brown laying hens (age, 390 days) were randomly categorized into four groups. Hens in the control (C) group were fed a basic diet devoid of CHMs, the crushed CHM (CT), fermented CHM (FC), and enzymatically fermented CHM (EFT) groups received diets containing 2% crushed CHM, 2% fermented CHM, and 2% enzymatically fermented CHM, respectively. Results: Compared with crushed CHM, the acid detergent fiber, total flavonoids, and total saponins contents of fermented CHM showed improvement (p<0.05); furthermore, the neutral and acid detergent fiber, total flavonoids, and total saponins contents of enzymatically fermented CHM improved (p<0.05). At 5 to 8 weeks, hens in the FC and EFT groups showed increased laying rates, haugh unit, albumin height, yolk color, shell thickness, and shell strength compared with those in the C group (p<0.05). Compared with the FC group, the laying rate, albumin height, and Shell thickness in the EFT group was increased (p<0.05). Compared with the C, CT, and FC groups, the EFT group showed reduced serum total cholesterol and increased serum luteinizing hormone levels and mRNA expressions of follicle stimulating hormone receptor and luteinizing hormone receptor (p<0.05). Conclusion: These results indicated that the ETF group improved the laying rate and egg quality and regulated the lipid metabolism in aged hens. The mechanism underlying this effect was likely related to cell wall degradation of CHM and increased serum levels of luteinizing hormone and mRNA expression of the ovarian hormone receptor.

국내 참치 부산물 내 히스타민 생성 주요 세균의 특성 구명 (Characteristics of Histamine Forming Bacteria from Tuna Fish Waste in Korea)

  • 방민우;정창대;김선호;장문백;이성실;이상석
    • 생명과학회지
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    • 제19권2호
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    • pp.277-283
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    • 2009
  • Biogenic amines은 발효제품과 같이 어류 속의 미생물에서 분비된 decarboxylase의 free amino acid의 decarboxylation에 의해 형성된다. 본 연구는 국내 어분 제조원료로 이용되고 있는 참치 부산물의 항영양인자로 작용하는 biogenic amines (histamine, tyramine, tryptamine, putrescine, cadaverine)의 분해조절을 위해 참치 부산물의 특성 구명을 위한 연구로 실시하였다. 참치 부산물의 pH 및 염도 농도는 6.51과 3.35%이었으며, 참치 어분의 pH 및 염도 농도는 5.58과 5.83% 이었다. 참치 부산물 내 존재하고 있는 균주 및 주요 미생물을 확인한 결과 Total bacteria, aerobic plate count (APC), Total coliform (TC), Lactobacillus spp. 및 Bacillus spp.는 각각 9.20, 9.29, 5.67, 7.82 및 7.58(Log CFU/g)이었다. 참치 부산물 내 히스타민 주요 생성균을 확인하기 위해 TLC 방법을 이용하였으며 히스타민 선택배지에서 추출한 미생물 중 총 7종의 히스타민 생성 균주를 선발하였다. 선발된 균주는 HPLC 분석을 통하여 히스타민 농도를 측정하여 아민 생성 미생물을 재확인하였다. Trypicase soy broth에 1% L-histidine (TSBH)을 첨가한 배지에서 분리한 7종의 히스타민 생성 균주를 16SrRNA 염기서열 분석 방법을 통해 분석한 결과, 참치 부산물내 주요 우점 아민 생성 미생물은 L. lactis subsp. lactis, K.pneummonlae, L. garvieae, V. olivaceus, H. alvei, L. garvieae 및 Morganella morganii가 주요 균주로 분석되었다. 16S rRNA 분석결과로 만들어진 phylogenetic tree는 다른 계통임을 보여주며 이는 biogenic amine을 생성하는 그람 양성 및 음성균으로 분류될 수 있다.

폐암세포주에서 Heme Oxygenase-1의 역할 (The Role of Heme Oxygenase-1 in Lung Cancer Cells)

  • 정종훈;김학렬;김은정;황기은;김소영;박정현;김휘정;양세훈;정은택
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제60권3호
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    • pp.304-313
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    • 2006
  • 연구배경 : Heme oxygenase-1 (HO-1)은 heme의 분해 대사과정에 관여하는 유도성 효소로 heme을 분해하여 biliverdin, free iron, 및 일산화탄소 등을 생성시킨다. HO-1의 발현은 다양한 스트레스성 자극에 반응하여 생체방어 기능을 갖는 것으로 알려져 있는데 세포성장이나 세포사 특히 세포고사를 조절하는 것으로 보고되고 있다. 현재 신장암, 전립선암, 간암, 육종 등의 고형암에서 발현됨이 알려져 있고, 실제 HO-1 억제제를 투여했을 때 암성장이 억제됨이 보고되었다. 저자들은 폐암세포주들에서 HO-1의 발현유무와 그 역할을 규명하고 나아가 HO-1 억제제의 치료제로서의 가능성을 알아보고자 하였다. 방 법 : 비소세포폐암세포주인 A549, H23, NCI-H157, NCI-H460을 이용하였다. 세포독성은 MTT 방법으로 구하였고, HO-1의 발현은 Western blotting으로 확인하였다. HO의 효소활성은 시간당 세포단백질의 mg당 형성된 빌리루빈의 양을 이용하여 측정하였다. 또한 $H_2O_2$의 생성은 horse radish peroxidase(HRP)와 형광물질인 2',7'-dichlorofluorescein(DCF)를 이용한 두 가지 방법을 이용하였다. A549세포에 HO-1 small interfering RNA(siRNA)을 주입하여 유식세포 분석과 caspase-3에 대한 Western blotting을 통하여 세포고사유무를 확인하였다. 결 과 : 비처리 상태에서 다른 세포주에 비해 A549세포의 HO-1 발현이 증가되었으며 HO-1 활성억제제인 ZnPP를 처리하였을 때 생존율의 의미 있는 감소를 보였다. 이러한 소견과 일치하여 ZnPP는 용량의존적으로 HO 의 효소활성 감소와 세포 내 $H_2O_2$ 생성의 증가를 초래하였다. 또한 HO-1 siRNA로 주입된 A549세포는 세포고사를 유도하였다. 결 론 : HO-1은 폐암의 치료에 있어서 새로운 분자생물학적 기전의 가능성을 제시하여 HO-1에 대한 표적치료의 가능성을 보여줄 것으로 기대된다.

순천만 갈대근권 토양으로부터 얻은 PAH 분해세균의 특성 분석 (Characterization of PAH-Degrading Bacteria from Soils of Reed Rhizosphere in Sunchon Bay Using PAH Consortia)

  • 김성현;강성미;오계현;김승일;윤병준;강형일
    • 미생물학회지
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    • 제41권3호
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    • pp.208-215
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    • 2005
  • 본 연구는 농업과 어업, 그리고 생태체험과 같은 인간들의 활동으로 인하여 상당히 영향을 받는 갯벌환경 중의 하나인 순천만을 모델장소로 갈대의 환경정화 기능에 있어 근권에 분포하는 미생물의 역할에 대한 기초 자료를 얻고자 수행하였다. 우선, 순천만의 갈대근권 토양을 시료로하고 anthracene, naphthalene, phenanthrene, pyrene 등이 첨가된 다환성 방향족 화합물(polycyclic aromatic hydrocarbons; PAH)을 탄소원 및 에너지원으로 하는 농화 배양을 통하여 두 개의 consortium을 획득하였다. 두 consortium으로부터 순수 분리된 우수한 PAH분해능을 갖는 4개의 균주(SCB1, SCB2, SCB6,그리고 SCB7)를 형태 및 생리학적 특성과 16S rRNA유전자서열을 기초로 분석한 결과 각 균주는 $99{\%}$ 이상의 신뢰도로 Burkholderia sp., Aicaligenes sp., Achromobacter sp., and Pseudomonas sp.로 동정되었다. 주목할 만한 점은 Burkholderia sp. SCB1과 Alcaligenes sp. SCB2는 naphthalene이나 phenanthrene보다 훨씬 안정되어 있는 구조의 anthracene이나 pyrene에서 더 빠른 성장률과 기질 분해율을 나타내는 것으로 밝혀졌다. 반면,Achromobacter sp. SCB6와 Pseudomonas sp. SCB7은 pyrene을 제외한 다른 시험기질에 대하여 유사한 성장 및 분해패턴을 나타내었다. 이러한 결과는 주요한 염습지 식물중의 하나인 갈대의 근권에서 살아가는 이들 PAH 분해 균주들이 PAH와 같은 물질로 오염된 근권 환경의 정화작용에 중요한 역할을 할 수 있음을 제시해 주었다.

젓갈에서 분리한 락토바실러스 파라카제이 GLU70 균주의 생화학적 특성 및 글루텐 분해능 (Biochemical properties and gluten degradation of Lactobacillus paracasei strain GLU70 isolated from salted seafood)

  • 박혜인;윤슬기;장준호;변지영;윤복근
    • 한국식품과학회지
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    • 제54권2호
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    • pp.203-208
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    • 2022
  • 본 연구에서는 글루텐 분해능을 가지는 유산균을 선별하기 위해 전통식품인 젓갈을 이용하였다. 선별된 균주는 API, 16S rRNA sequencing과 현미경을 통해 간균의 형태를 갖는 Lactobacillus paracasei로 동정되었고 이를 GLU70으로 명명하기로 하였다. MRS 배지에서 GLU70의 생육특성을 조사한 결과, 6시간부터 12시간까지 대수기이며 12시간 이후부터 정지기임을 확인하였다. 이렇게 동정된 GLU70을 글루텐이 함유된 MRS배지에서 시간별로 배양하였을 때 대수기인 12시간 이후부터 24시간 이전까지 글루텐 분해가 가속화되었고, 48시간에서 최대 45% 정도의 분해율을 나타내었다. 또한 GLU70이 유산균으로서 적합하기 위해서 가져야하는 내산성, 내담즙성, 내열성에 대한 분석을 실시하였다. 많은 연구에서 Lactobacillus 종이 pH 2.5 이상에서는 균의 생존율이 높았지만, 그 이하에서는 거의 생존하지 않는다고 보고하고 있다 (Shin 등, 1999). 이에 따라 분리한 GLU70에서도 유사하게 pH 2.0에서는 균이 사멸하였고 pH 3.0부터 약 84%의 생존율을 보였고 많은 연구들과 유사한 결과를 가지는 것을 통해 우수한 내산성을 가지는 것을 확인하였다. 내담즙성의 경우 oxgall이 0.3% 함유된 배지에서 성장할 수 있을 정도의 내성을 가져야 한다는 연구결과와 비교하였을 때 GLU70은 담즙에 대하여 매우 강한 내성을 가지고 있다고 보기는 어렵다. 또한 내열성에 대한 연구결과에서는 50℃ 이상의 온도에서는 사멸하였으나 30℃에서는 높은 생존율을 나타냈다. 또한 분리된 GLU70이 실제 밀가루 반죽에서 감소하는 글루텐 함량을 분석하였을 때 12 h 배양한 배양상등액을 넣어 25℃에서 24 h 동안 발효한 밀가루 반죽에서 가장 높은 분해력을 확인하였다. 또한 밀가루 반죽의 발효 온도에 따른 글루텐 분해율을 타 균주와 비교하여 GLU70의 우수성을 판단하고자 하였다. GRAS 인정 유산균 11종과 GLU70을 각각 밀가루 반죽에 넣은 후 25℃와 35℃에서 발효하였다. 그 결과 GLU70이 타 균주들과 비교하였을 때 모든 온도에서 반죽이 흘러내리는 등의 이상현상 없이 50% 이상의 매우 높은 글루텐 분해율을 보였다. 이를 통해 GLU70이 향후 식품 산업에 다양한 활용 가능성을 지니며 글루텐 저감화 밀가루 제조 등에 적용하기에 적합하다고 제시된다.

Monosodium iodoacetate 유도 골관절염 동물모델에서 보스웰리아 검레진 추출물의 항골관절염 효과 연구 (Anti-osteoarthritis effect of Boswellia serrata gum resin extract in monosodium iodoacetate-induced osteoarthritic Sprague-Dawley rats)

  • 정재인;김룡;김은지
    • Journal of Nutrition and Health
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    • 제56권3호
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    • pp.231-246
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    • 2023
  • 본 연구에서는 MIA로 골관절염을 유도한 SD 흰쥐에서 인도산 보스웰리아 검레진을 주정 추출 후, 헥산으로 지방 제거 공정을 추가하여 제조한 보스웰리아 검레진 추출물인 FJH-UBS의 항골관절염 효능을 평가하기 위해 실시하였다. FJH-UBS는 40 또는 80 mg/kg BW/day 용량으로 5주간 경구투여하였고, FJH-UBS를 2주간 투여 후 MIA (3 mg/50 µL/rat)를 무릎 관절강 내에 주사하여 골관절염을 유도하였다. MIA 유도 골관절염 동물모델에서 FJH-UBS는 무릎 관절의 부종을 감소시키고 연골의 분해를 억제하였으며, 연골 내 type II collagen과 aggrecan 발현을 증가시켰다. FJH-UBS (80 mg/kg BW/day)는 혈청 내 PGE2, LTB4, IL-1β, 및 IL-6 함량을 감소시켰고, MMP-13 함량을 감소시켰다. FJH-UBS (80 mg/kg BW/day)는 연골 활막 내 iNOS, COX-2, 5-LOX, IL-1β, IL-6 및 TNF-α 발현을 감소시켰고, MMP-2, MMP-9 및 MMP-13 발현을 감소시켰다. 이 결과는 FJH-UBS가 염증매개물질과 염증성 cytokine의 발현감소를 통해 염증 반응을 억제하고, MMPs의 발현을 억제하여 연골 기질의 분해를 억제함으로서 항골관절염 효능을 나타냄을 의미하며 이는 관절 및 연골 건강 개선 기능성 원료로 FJH-UBS의 활용 가능성을 제시한다.

Effects of Plant Growth Regulators and Sugars on the $\alpha-Amylase$ Activity in Cotyledons of Germinating Vigna angularis Seeds

  • Hong, Jung-Hee
    • Environmental Sciences Bulletin of The Korean Environmental Sciences Society
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    • 제2권2호
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    • pp.159-168
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    • 1998
  • Effect of plant growth regulators and end-product on the enzyme activities in cotyledons of Vigna angularis during germination was investigated by measuring the changes of $\alpha-amylase$ activities in attached and detached cotyledons applied growth regulators and sugars. The higher levels of $\alpha-amylase$ in detached cotyledons than those in cotyledons attached to the embryonic axis were due to both faster synthesis and slower degradation of the enzyme in the detached cotyledons than in the attached cotyledons. Levels of $\alpha-amylase$ activity were reduced by high concentrations of glucose and sucrose, and it is suggested that this effect was caused mostly by osmotic stress and partly by end-product repression. In detached cotyledons exogenously supplied $GA_3,$ IAA, kinetin, or their combinations has a small promotive effect on the developmental patterns of $\alpha-amylase$ activity ABA and uniconazole both prevented the synthesis of $\alpha-amylase$. Glucose inhibition of enzyme activity was partly reversed by the application of $GA_3,$ and CAMP. $GA_3,$ and cAMP seemed to act through a similar mechanism. The addition of inhibitors of protein and RNA synthesis largely prevented the increase of enzyme activity in the presence or absence of exogenous $GA_3,$. The pretreatment experiments with canavanine indicated that the earlier the time of addition was, the lower the amylase activity was.

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Effects of a β-Adrenergic Agonist on Growth Performance and Protein Metabolism in Broilers Treated with or without an Antithyroid Substance

  • Hamano, Y.;Yamazaki, S.;Miyahara, M.;Hamada, Y.;Kobayashi, S.;Terashima, Y.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제12권5호
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    • pp.788-793
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    • 1999
  • To determine the interrelationship between thyroid status and the reparitioning action of clenbuterol (CLE) in broilers, two-week-old female chickens were fed diets containing an antithyroid substance, propylthiouracil (PTU, 0 or 0.3%), CLE (0 to 1 mg/kg), or both for 18 days in a $2{\times}2$ factorial design experiment. Muscle weights (breast muscle, gastrocnemius and peroneus longus) increased only in the normal chickens fed CLE. As absolute mass, protein of leg muscle quantitatively increased in the CLE-fed normal birds. In contrast, inhibition of the CLE-induced protein accretion, especially of peroneus longus, occurred in the PTU group. A quantitative increase in DNA was observed in leg muscles of the normal chickens, but no DNA response to CLE was shown in the PTU-treated chickens. The decreased RNA in leg muscles of the PTU group was more reduced by CLE feeding. Although not statistically significant, the reduced degradation rate of whole muscle protein in normal chickens fed CLE was not confirmed in the PTU-fed group. The present study, therefore, concluded that metabolic action of thyroid hormones was a prerequisite for the hypertrophic effect of ${\beta}$-agonist in broilers.

Degradation of Phytate Pentamagnesium Salt by Bacillus sp. T4 Phytase as a Potential Eco-friendly Feed Additive

  • Park, In-Kyung;Lee, Jae-Koo;Cho, Jaie-Soon
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제25권10호
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    • pp.1466-1472
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    • 2012
  • A bacterial isolate derived from soil samples near a cattle farm was found to display extracellular phytase activity. Based on 16S rRNA sequence analysis, the strain was named Bacillus sp. T4. The optimum temperature for the phytase activity toward magnesium phytate (Mg-$InsP_6$) was $40^{\circ}C$ without 5 mM $Ca^{2+}$ and $50^{\circ}C$ with 5 mM $Ca^{2+}$. T4 phytase had a characteristic bi-hump two pH optima of 6.0 to 6.5 and 7.4 for Mg-$InsP_6$. The enzyme showed higher specificity for Mg-$InsP_6$ than sodium phytate (Na-$InsP_6$). Its activity was fairly inhibited by EDTA, $Cu^{2+}$, $Mn^{2+}$, $Co^{2+}$, $Ba^{2+}$ and $Zn^{2+}$. T4 phytase may have great potential for use as an eco-friendly feed additive to enhance the nutritive quality of phytate and reduce phosphorus pollution.