• 제목/요약/키워드: RNA degradation

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Molecular analysis on the ODC antizyme from flounder (Parlichthys olivaceus)

  • Seo, Yong-Bae;Lee, Jae-Hyung;Kim, Young-Tae
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
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    • 한국생물공학회 2003년도 생물공학의 동향(XII)
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    • pp.733-735
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    • 2003
  • Ornithine decarboxylase (ODC) is a key enzyme on the regulation of cellular polyamines. ODC antizyme is a protein that represses ODC through accelerating enzymatic degradation by the 26S proteasome. We have isolated two distinct antizyme cDNA clones (AZS and AZL) from a brain cDNA library constructed with flounder (Paralichthys olivaceus). AZS and AZL cDNA clones were encoding 221 and 218 residues long respectively and revealed 57.7% amino acids sequence identity. The presence of two antizymes mRNA were detected in brain, kidney, liver, and embryo.

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Visualization of Candidate Division OP3 Cocci in Limonene-Degrading Methanogenic Cultures

  • Rotaru, Amelia-Elena;Schauer, Regina;Probian, Christina;Mussmann, Marc;Harder, Jens
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제22권4호
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    • pp.457-461
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    • 2012
  • Members of candidate division OP3 were detected in 16S rRNA gene clone libraries from methanogenic enrichment cultures that utilized limonene as a carbon and energy source. We developed probes for the visualization of OP3 cells. In situ hybridization experiments with newly designed OP3-specific probes [OP3-565 and Eub-338(VI)] revealed abundant small OP3 cocci attached to larger cells. Syntrophic Deltaproteobacteria, OP3 cells, and methanogens affiliating with Methanoculleus and Methanosaeta formed the limonene-degrading community.

An FCA-mediated epigenetic route towards thermal adaptation of autotrophic development in plants

  • Lee, Hyo-Jun;Ha, Jun-Ho;Park, Chung-Mo
    • BMB Reports
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    • 제50권7호
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    • pp.343-344
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    • 2017
  • Plants are able to recognize even small changes in surrounding temperatures to optimize their growth and development. At warm temperatures, plants exhibit diverse architectural adjustments, including hypocotyl and petiole elongation, leaf hyponasty, and reduced stomatal density. However, it was previously unknown how such warm temperatures affected the early stages of seedling development. In our recent study, we demonstrated that the RNA-binding protein, FCA, is critical for sustaining chlorophyll biosynthesis during early seedling development, which is a prerequisite for autotrophic transition at warm temperatures. FCA plays a dual role in this thermal response. It inhibits the rapid degradation of protochlorophyllide oxidoreductases (PORs) that mediate chlorophyll biosynthesis. In addition, it induces the expression of POR genes at the chromatin level, which contributes to maintaining functional enzyme levels. Our findings provide molecular basis for the thermal adaptation of chlorophyll biosynthesis during the early stages of seedling development in nature.

Regulation of adductor muscle growth by the IGF-1/AKT pathway in the triploid Pacific oyster, Crassostrea gigas

  • Kim, Eun-Young;Choi, Youn Hee
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제22권9호
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    • pp.19.1-19.10
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    • 2019
  • We investigated the insulin-like growth factor 1 (IGF-1)/AKT signaling pathway involved in muscle formation, growth, and movement in the adductor muscle of triploid Pacific oyster, Crassostrea gigas. Large and small triploid oysters (LTs and STs) cultured under identical conditions were screened, and the signaling pathways of individuals with superior growth were compared and analyzed. mRNA and protein expression levels of actin, troponin, tropomyosin, and myosin, proteins important in muscle formation, were higher in LTs compared with STs. Expression levels of IGF-1, IGF binding protein (IGFBP), and IGFBP complex acid-labile subunit were also higher in LTs compared with STs. Phosphorylation of the IGF receptor as well as that of AKT was high in LTs. In addition, the expression of phosphomammalian target of rapamycin and phospho-glycogen synthase kinase $3{\beta}$ was increased and the expression of Forkhead box O3 was decreased in LTs. Therefore, we suggested that the IGF-1/AKT signaling pathway affects the formation, growth, and movement of the adductor muscle in triploid oysters.

Involvement of IKK/IkBα/NF-kB p65 Signaling into the Regulative Effect of Engeletin on MUC5AC Mucin Gene Expression in Human Airway Epithelial Cells

  • Hossain, Rajib;Kim, Kyung-il;Li, Xin;Lee, Hyun Jae;Lee, Choong Jae
    • Biomolecules & Therapeutics
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    • 제30권5호
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    • pp.473-478
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    • 2022
  • In this study, we examined whether engeletin exerts an effect on the gene expression of MUC5AC mucin, in human pulmonary epithelial NCI-H292 cells. The cells were pretreated with engeletin for 30 min and stimulated with phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA), for the following 24 h. The effect of engeletin on PMA-induced nuclear factor kappa B (NF-kB) signaling pathway was also investigated. Engeletin suppressed the mRNA expression and production of MUC5AC mucin, induced by PMA through the inhibition of degradation of inhibitory kappa Bα (IkBα) and NF-kB p65 nuclear translocation. These results suggest engeletin inhibits the gene expression of mucin through regulation of NF-kB signaling pathway, in human airway epithelial cells.

Regulation of the Gene Expression of Airway MUC5AC Mucin through NF-κB Signaling Pathway by Artesunate, an Antimalarial Agent

  • Kyung-il Kim;Rajib Hossain;Jiho Ryu;Hyun Jae Lee;Choong Jae Lee
    • Biomolecules & Therapeutics
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    • 제31권5호
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    • pp.544-549
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    • 2023
  • In this study, artesunate, an antimalarial agent, was investigated for its potential effect on the gene expression of airway MUC5AC mucin. The human pulmonary epithelial NCI-H292 cells were pretreated with artesunate for 30 min and then stimulated with phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA), for the following 24 h. The effect of artesunate on PMA-induced nuclear factor kappa B (NF-kB) signaling pathway was also examined. Artesunate inhibited the glycoprotein production and mRNA expression of MUC5AC mucins, induced by PMA through the inhibition of degradation of inhibitory kappa Bα (IkBα) and NF-kB p65 nuclear translocation. These results suggest artesunate suppresses the gene expression of mucin through regulation of NF-kB signaling pathway, in human pulmonary epithelial cells.

Trichloroethylene으로 오염된 지하수 제거공정의 미생물 다양성 및 분리균주 Pseudomonas sp. DHC8의 특성 (Microbial Diversity of the Trichloroethylene Contaminated Groundwater Treatment System and Characterization of Pseudomonas sp. DHC8)

  • 남지현;신지혜;권기욱;배우근;이동훈
    • 미생물학회지
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    • 제49권4호
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    • pp.336-342
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    • 2013
  • 산업에서 널리 사용되고 있는 Trichloroethylene (TCE)은 토양 및 지하수의 오염을 일으키며, 암 유발물질로 환경에서 반드시 제거해야 하는 물질이다. 본 연구에서는 미생물 고정화 담체를 이용한 TCE로 오염된 지하수 처리 시스템의 세균 군집구조를 조사하고, 우점종을 분리 및 동정하고 TCE 제거특성을 확인하였다. TCE로 오염된 지하수 처리공정의 세균군집을 16S rRNA 유전자 라이브러리의 염기서열 분석방법을 이용하여 조사한 결과, 주요 개체군은 BTEX 분해세균으로 알려진 Pseudomonas 속이었으며 Pseudomonas putida 그룹이 가장 우점하였다. Pseudomonas putida 그룹의 우점은 높은 toluene과 TCE의 농도에서 기인한 것으로 생각된다. TCE로 오염을 제거하기 위한 미생물 반응기에서 toluene과 TCE 분해 세균을 분리 배양하였으며 Pseudomonas sp. DHC8로 명명하였다. 형태학적 특징, 생리 생화학적 특징, 16S rRNA 유전자 염기서열분석 결과 DHC8 균주는 P. putida 그룹에 속하는 것으로 확인되었다. Pseudomonas sp. DHC8을 이용하여 TCE (0.83 mg/L)와 toluene (60.61 mg/L)에 대해 분해실험을 실시하였을 때 12.5시간 동안 TCE는 72.3%, toluene은 100.0% 제거되었다. 또한, TCE와 toluene의 제거속도는 각각 0.02 ${\mu}mol/g$-DCW/h와 2.89 ${\mu}mol/g$-DCW/h였다. 본 연구 결과는 TCE의 생물정화를 위한 반응기의 최대 효율을 유지하기 위한 노력에 도움이 될 것이다.

Murine AIDS 감염쥐 splenocytes에서 $NF-{\kappa}B$의 활성화 억제를 통한 pycnogenol의 Th2 cytokines의 mRNA 발현 조절 효과 (Pycnogenol, a Standardized Extract of French Maritime Pine Bark, Inhibited the Transcriptional Expression of Th2 Cytokines by Suppressing $NF-{\kappa}B$ Activation in Primary Splenocytes of C57BL/6 Mice with Murine AIDS)

  • 이정민
    • 한국식품과학회지
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    • 제38권6호
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    • pp.829-834
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    • 2006
  • HIV 감염 후 AIDS로의 진행과정에서 cytokines의 변화는 필수적인 결과로서 나타나게 된다. 본 연구에서는 AIDS 동물모델을 사용하여 Pyc Cytokines발현에 미치는 영향과 조절 매개체로서 $NF-{\kappa}B$의 관련성 및 작용 기작 확인에 초점을 두었다. LP-BM5 retrovirus에 감염된 C57BL/6 생쥐를 이용하여12주간에 걸친 실험에서Pyc 투여는 Th1과 Th2 cytokines의 혈중농도를 조절하여 murine AIDS로의 진행을 억제하는 데 역할을 하는 것으로 사료된다. 특히 Th2 cytokines의 mRNA 발현을 억제함에 따라 Th1 cytokines의 혈중농도는 상대적으로 증가한 것으로 사료된다. 이러한 결과는 Pyc가 Th2 cytokines을 선택적으로 transcription level에서 조절하고 있음을 의미하고 있다. 또한 Th2 cytokines mRNA 발현 조절은 $NF-{\kappa}B$의 활성화에 의한 것으로 추정된다. 본 연구는 AIDS 동물모델에서 $NF-{\kappa}B$의 조절을 통한 cytokines의 발현 조절의 가능성을 제시함과 동시에 Pyc의 역할에 대해 자료를 제시하고 있다. 또한 향후 murine AIDS 진행 억제제로서의 Pyc의 기작에 대한 일면을 보인 것에 의의를 두고자 한다.

까마귀쪽나무 열매 추출물의 골관절염 억제 효과 (Anti-osteoarthritis Effects on Fruit Extract of Litsea japonica)

  • 윤원종;송상목;함영민;오대주;고창식;윤선아;이용범;박대원;정용준;권정은;조영미;조주현;김창숙;강세찬
    • 한국자원식물학회지
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    • 제28권5호
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    • pp.591-599
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    • 2015
  • 본 연구는 까마귀쪽나무 열매 70% 주정에탄올 추출물을 가지고 제작된 인체적용시험시료(LJTM)의 항염증 및 골관절염 biomarker의 변화를 통한 관절건강 기능성식품을 개발하기 위하여 인체적용시험시료를 제작한 후 이에 대한 유효성분의 함량을 평가하고, 인체적용시험전에 그 효력이 유지됨을 확인하기 위하여 수행되었다. 본 연구에 사용된 시료 LJTM은 NO생성이 억제되는 농도에서 세포독성이 관찰되지 않았으며, TNF-α와 IL-6 생성이 농도 의존적으로 억제되고 PGE2를 억제하였다. 또한 동물시험에서 골관절염의 biomarker인 MMP-2, 3, 7, 9와 TIMP-1, 2에 대한 mRNA 발현이 농도 의존적으로 억제되었으며, 중추신경계 및 말초신경계에 의한 통증을 억제하는 것으로 평가되었다. 따라서 까마귀쪽나무 열매 70% 추출물이 함유된 인체적용시험시료(LJTM)는 골관절염과 진통억제에 우수한 효과가 있는 것으로 확인되었다.

옻 추출물의 세포독성 및 자궁 경부암 바이러스 암 유발인자 E6 와 E7의 작용에 미치는 효과 (The Effects of Rhus Extracts on The Cytotoxicity on Cancer Cells and E6 and E7 Oncogenes of Human Papillomavirus Type 16)

  • 조영식;정옥;조정원;이경애;심정현;김광수;이홍수;성기승;윤도영
    • 한국식품과학회지
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    • 제32권6호
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    • pp.1389-1395
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    • 2000
  • 자궁 경부암은 매년 약 50만명 정도씩 사망하는 여성의 치명적인 사망원인의 하나이다. 인두유종 바이러스(HPV) 16형 및 18형과 자궁 경부암과의 긴밀한 관련성은 잘 알려져 있다. 옻 추출물 Rhus가 HPV 16형의 E6, E7 발암 유전자를 억제하는지 여부를 측정하였다. 이 Rhus는 자궁 경부암 세포주(C-33A, SiHa, Caski)와 HaCaT keratinocytes의 분열은 농도 의존적으로 억제하였다. In vitro binding assay와 효소면역측정법에 의하면 Rhus가 암 억제인자인 p53과 결합하여 분해 시키는데 필수적인 E6와 E6AP와의 결합을 억제할 뿐더러 암 억제인자 Rb와 E7과의 결합을 억제하였다. RT-PCR에 의하면 Rhus에 의해 E6 mRNA의 level이 감소하였으나 E7 mRNA는 변하지 않았음을 보여주었다. 이들 결과에 의하면 Rhus가 HPV 16형의 E6와 E7의 발암성을 억제함을 보여 주므로 HPV에 의해 유도된 자궁 경부암의 치료에 유효할 것으로 사료되어 좀 더 자세한 in vitro실험 등이 요구된다.

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