누에에서 생체 방어에 관련된 새로운 항 세균성 펩타이드 유전자를 탐색 분리하기 위하여 누에 체강에 비 병원성 세균인 Escherichia coli를 주사하여 면역 반응의 일환으로 발현량이 증가하는 유도 유전자 종류를 조사 하였다. 체강 주사 8시간 후 누에에서 cDNA 유전자 은행을 만들고, 정상 및 유도 누에에서 분리한 각각의 mRNA를 탐침으로 차별화 선별을 하였다. 차별화 선별 결과 정상보다도 유도 누에의 탐침을 사용한 막에서 강도가 높은 클론 32개를 선발하였고, 29개 클론에 대해 전체 또는 부분 염기 서열을 분석하여 DNA 상동성을 조사하였다. DNA 상동성 비교를 통해 생산한 발현 유전자 꼬리표 중에는 비교적 상동 유의성이 인정되어 그 실체를 추정할 수 있는 19개의 클론이 있었다. 특히 곤충의 면역 작용에 직접적으로 관계하는 항세균성 펩타이드 유전자, hemolin 유전자, transferrin 유전자 등 4종의 유전 자원을 확보할 수 있었다.
Tho2/THOC2는 전사 과정을 mRNA 성숙 및 방출과 연결함으로써 mRNP의 생성에 중요한 역할을 담당하는 THO 복합체의 구성인자이다. 분열효모 Schizosaccharomyces pombe의 유전체 데이터에서 Tho2/THOC2의 이종상동체를 찾아 기능을 분석하였다. 4분체 분석 결과 이 유전자는 생장에 필수적이었다. S. pombe tho2 유전자의 발현을 억제하거나 과발현시키면 생장이 저해되는데, 세포의 길이가 길어지고 비정상적인 DNA분포와 $poly(A)^+$ RNA가 핵 안에 축적되는 표현형을 보였다. 또한 정상적인 기능을 가진 GFP-Tho2 단백질은 주로 핵 안에 존재하였다. Yeast two-hybrid 분석에서 Tho2는 THO 복합체의 또 다른 구성인자인 Tex1과 상호작용을 하였다. 이와 같은 결과들은 S. pombe의 Tho2 상동체도 THO 복합체의 구성인자로 mRNA 방출에 관여하고 있음을 시사한다.
노인에게서 두드러지게 나타나고 있는 저근육형 비만은 근육감소를 동반한 체지방의 증가로 신체상의 뚜렷한 체성분의 변화를 야기 시킨다. 이때 골감소증을 동반하여 신체기능의 감소 및 골절장애 그리고 대사성 관련 질환의 위험도가 올라가는 것으로 보고되고 있다. 노화로 인한 체성분의 변화는 단순한 저근육형일 경우와 비만일 때 보다 급격히 증가된 복부내장 지방조직에서 분비되는 염증성 사이토카인, C-반응성 단백질(CRP), 인터루킨(IL)-6, IL-8 및 종양 괴사 인자(TNF-${\alpha}$)들이 단백질 대사를 저해하여 근육량의 감소를 더욱 촉진시키며, 염증관련 대사질환의 유병률에 중요한 요인이다. 본 연구에서는 DNA 메틸화가 당뇨병, 심혈관질환, 암과 같은 만성염증성 질환에 관계하고 있다는 최근 연구 결과를 기초로 하여 항염증 영양소와 생리활성을 갖는 식품인자들의 충분한 섭취가 염증조절에 중요하게 기여할 것으로 생각되며, 또한 염증성 질환의 주요 표식자인 DNA 메틸화와 히스톤 변형을 유발하는 효소의 활성 또는 비 암호화된 RNA의 발현을 조절함으로써 근육량 증가와 체지방 감소에 중요한 역할을 하는 것을 살펴보았다. 따라서 최근 새롭게 인식되는 후생유전학적 연구의 중심에 있는 항염증 영양소의 효과와 체성분 변화와의 긍정적 관계를 중심으로 저근육형 비만의 예방 및 인구고령화에 건강한 노화를 위한 효과적인 방법을 제시하였다.
본 연구에서는 Sprague-Dawley 종 랫트 수컷을 대조군, EtOH군, Fe군, EtOH + Fe군으로 나누어, 알코올과 철분을 액상 사료로 8주간 공급한 후, 간 조직과 간 세포 mtDNA의 손상 정도를 알아보았다. EtOH + Fe군은 대조군, EtOH군, Fe군의 다른 세 군에 비해 혈청 ALT와 혈청 AST 수치가 가장 유의적으로 높았으며, 간 조직 검사의 결과에서도 다수의 지방구, 염증성 세포 침입 및 조직의 괴사가 관찰되는 등 가장 심한 간 손상이 확인되었다. DNA 손상 여부를 긴 영역 PCR을 사용하여 분석한 결과, 만성적인 알코올과 철분에 의한 노출은 간 세포의 mtDNA 손상을 유발하는 것으로 나타났으며, 핵 DNA에는 영향을 미치지 않았다. 또한 미토콘드리아의 호흡에 관여하는 Cox1과 Nd4 유전자 발현 정도를 real-time PCR으로 분석한 결과, 알코올 또는 철분은 간 세포의 Cox1 mRNA와 Nd4 mRNA 수준을 유의적으로 낮추는 것으로 나타났다. 이상의 결과는 만성 알코올 또는 과잉의 철분에 의한 간 손상에 mtDNA 손상 및 미토콘드리아 기능 저하가 관여함을 제시한다.
본 연구는 배추의 유전자 기능분석을 위한 RNAi 유전자 침묵 기법과 T-DNA 삽입 기법을 비교하기 위해 수행하였다. 두 종류의 형질전환 계통이 이용되었으며 BrSAMS-knockout(KO) 계통은 T-DNA 삽입으로 한 개의 Brassica rapa S-adenosylmethionine synthetase(BrSAMS) 유전자가 기능을 상실한 계통이었으며 BrSAMS-knockdown(KD) 계통은 RNAi 방법을 통해 BrSAMS 유전자들의 발현이 억제된 계통이었다. KO 계통과 KD 계통의 microarray 분석 결과에서는 SAMS 유전자와 관련된 sterol, 자당, homogalacturonan 생합성 및 glutaredoxin-related protein, serine/threonine protein kinase, 그리고 gibberellin-responsive protein 유전자들의 발현 수준이 뚜렷한 차이를 보여 주었다. 그러나 KO 계통의 유전자 발현 양상은 하나의 BrSAMS 유전자가 기능을 상실하였음에도 불구하고 대조 계통과 비교하여 RNAi기법을 적용한 KD 계통에 비해 큰 차이를 보여주지 못했다. 또한 직접적으로 SAMS 유전자와 관련된 폴리아민과 에틸렌 합성 유전자들의 발현 변화도 KD 계통에서 더 잘 나타났다. 본 연구에서 microarray 결과를 이용한 KO 계통의 BrSAMS 기능분석은 배추과식물의 게놈 triplication 발생으로 인하여 다수로 존재하는 SAMS 유전자들 때문에 명확한 결론을 얻을 수 없었다. 결론적으로 배추와 같은 배수체 작물의 유전자 기능 분석은 RNAi silencing에 의한 유전자 knock-down 기법이 T-DNA 삽입에 의한 knock-out 기법보다 더욱 효율적인 것으로 나타났다.
본 연구에서는 개의 Helicobacter 균속 감염을 비침습적 방법으로 진단하기 위해 분변을 시료로한 PCR 검사법을 확립하고 그 효능을 검정하고자 하였다. 분변 PCR 분석은 분변에서 채취된 DNA에서 Helicobacter 균속의 16S RNA의 특이적인 영역에 반응하는 primer를 이용해 수행하였다. 분변 PCR분석법에 의한 결과와 위조직 검사 법 결과를 비교해 본 결과 분변 PCR분석법은 높은 특이도 (100%)와 민감도(96%)를 나타내었다. 도한 확립된 분볍 PCR분석법을 이용해 국내 애완결들의 위내 Helicobacter 균속 감염율을 조사한 결과 감염율이 72.1%로 나타났다. 이상의 결과 본 연구에서 확립한 분변 PCR 분석법은 개의 Helicobacter 균 감염을 진단할 수 있는 새로운 비침습적 진단방법으로 이용될 수 있으리라 사료된다.
Differential screening을 통해 Moriguchi등 (1998)이 분리한 유전자와 상동성을 나타내는 CitMT45 유전자의 cDNA를 분리하였다. 본 실험에서 분리한 cDNA는 Moriguchi등 (1998)이 분리한 cDNA에 비해 긴 3' UTR을 가지고 있었다. 잎과 과피, 과육에서 CitMT45 유전자의 발현분석을 northern blot을 통해 수행한 결과, 발달단계에 따라 증가하는 비슷한 앙상을 관찰할 수 있었으나, 과육, 과피, 잎의 순으로 그 발현 양이 많았다. 이들의 발현조절에 대한 정보를 얻기 위해 게놈 DNA를 분리한 결과, CitMT45 게놈 구조는 3개의 exon과 2개의 intron으로 구성되어 있었고, primer extension 분석을 통해 CitMT45 유전자의 발현은 3개의 부위에서 개시되고 있음을 알 수 있었다. 전사개시부위의 5'upstream 지역에서 TATA box와 CCAAT box뿐만 아니라, 금속이온과 온도변화에 의한 조절에 중요한 부위로 알려진 cis-element를 발견하였다.
동물의 성장정도에 따라 식이섭취양식이 성장및 각 기관의 DNA와 RNA함량에 미치는 영향을 경토하기 위하여 , 성장기와 성장완료기의 흰쥐에게 ad-lib. feeding과 1일 3회 급여 그리고 1일 1회 급여등 3가지 섭취 양식으로 정제 식이를 급여하여 비교하였으며, 그 결과는다음과 같다. 1 ) 모든 실험동물에서 3희 식이군은 ad-lib. 군과 비슷한 증체량을 나타냈으나, 1회 식이군은 다른 군보다 낮은 증체량을 나타냈으며, 식이섭취량도 더 적었다. 2) 성장기 쥐의 경우. 1회 식이군은 ad-lib.군에 비해 간, 신장, 비장 등 내장기관의 DNA, RNA, 단백질 함량이 강소되었으나, DNAmg당 각 조성은 다른군과 차이가 없었다. 한편, 성인쥐의 경우는 1회 식이군에서, 간의 크기가 현저히 증가되었으며 DNAmg당 각 조성은 증가하였으나, 간의 DNA함량은 유의적 차이가 없었다. 신장과 비장은 식이섭취양식에 의한 유의적 차이를 보이지 않았다. 3) 성장기 쥐와 성인쥐의 위와 소장은 meal-feeding에 의해 크기가 증대된 경향을 나타냈으며, 혈청콜레스테롤은 유의적 차이가 없었다. 본 결과는 식이섭취양식이 성장기 동물에서는 내장기관의 세포수에 크게 영향을 미치며, 성장완료기 동물에서는 내장기관중 특히 간의 세포크기에 영향을 미침을 시사한다.
발아효모 Saccharomyces cerevisiae의 핵공단백질인 Nic96 단백질과 유사성을 보이는 분열효모 Schizosaccharomyces pombe의 Nup97의 기능과 세포 내 위치를 조사하였다. nup97을 과 발현시켰을 때는 생장과 $poly(A)^{+}$ RNA의 분포에 별다른 이상을 보이지 않았다. 하지만, $kan^{r}$ 유전자를 이용하여 제작한 ${\Delta}nup97$ 결실돌연변이는 nup97의 발현이 억제되면, $poly(A)^{+}$ RNA가 핵 안에 축적되었고 비정상적인 DNA 분포를 보였으며 결국 생장하지 못했다. 한편, Nup97p의 N말단 또는 C말단에 GFP를 붙인 Nup97-GFP 융합단배질의 세포 내 위치를 확인하고자 하였다. 이러한 융합단백질들이 ${\Delta}nup97$ 결실돌연변이의 생장결함을 정상적으로 상보하는 것을 확인하고, nup97-GFP 유전자를 염색체의 nup97 유전자 위치에 삽입한 균주를 제작하였다. 자신의 프로모터에서 발현된 Nup97-GFP 융합단백질은 정상적인 기능을 보였으며, 핵막 주위에 점점 이 위치하였다. 이와 같은 결과들은 Nup97 단백질 역시 핵공단배질로 mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 중요하다는 것을 시사한다.
Objective: Heat shock protein 70-2 (Hsp70-2) gene knockout mice are found to have premeiotic arrest at the primary spermatocyte stage with a complete absence of spermatids and spermatozoa. This observation led to the hypothesis that hspA2 may be disrupted in human testes with abnormal spermatogenesis. To test this hypothesis, we studied the mRNA expression of hspA2 in infertile men with azoospermia. Design: The mRNA expression were analyzed by competitive RT-PCR among testes with normal spermatogenesis, pachytene spermatocyte arrest, and sertoli-cell only syndrome. Materials and methods: Testicular biopsy was performed in men with azoospermia (n=15). Specimens were subdivided into three groups: (group 1) normal spermatogenesis (n=5), (group 2) spermatocyte arrest (n=5), (group 3) Sertoli-cell only syndrome (n=5). Total RNA was extracted by Trizol reagent. Total extracted RNA was reverse transcribed into cDNA and amplified by PCR using specific primers for hspA2 target cDNAs. A competitive cDNA fragment was constructed by deleting a defined fragment from the target cDNA sequence, and then coamplified with the target cDNA for competitive PCR. Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) gene was used as an internal control. Results: On Competitive RT-PCR analyses for hspA2 mRNA, significant amount of hspA2 expression was observed in group 1, whereas a constitutively low level of hspA2 was expressed in groups 2 and 3. Conclusion(s): The study demonstrates that the hspA2 gene expression is down-regulated in human testes with abnormal spermatogenesis, which in turn suggests that hspA2 gene may play a specific role during meiosis in human testes.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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