• 대한미생물학회지
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• 제35권4호
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• pp.273-282
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• 2000

dTDP-rhamnose provides L-rhamnose to the bridge-like structure between mycolyl arabinogalactan and peptidoglycan of the mycobacterial cell wall. dTDP-rhamnose is composed of glucose-l-phosphate and dTTP by four enzymes encoded by rmlA-D. To determine the region(s) of RmlC protein essential for its dTDP-4-keto-6-deoxyglucose epimerase activity, we overexpressed both whole (202 amino acids) and three different truncated (N-terminal 106 or 150 or C-terminal 97 amino acids) RmlC proteins of Mycobacterium tuberculosis. The RmlC enzyme activity in the soluble lysates of ${\Delta}rmlC$ E. coli strain $S{\Phi}874$ (DE3 PlysS) expressing the wild type or truncated rmlC genes was initially analyzed by three sequential reactions from dTDP-glucose to dTDP-rhamnose in the presence of purified RmlB and RmlD. All three soluble lysates containing the truncated RmlC proteins showed no enzyme activity, while that containing the wild type RmlC was active. This wild type RmlC was then overexpressed and purified. The incubation of the purified RmlC enzyme so obtained with dTDP-4-keto-6-deoxyglucose resulted in the conversion of dTDP-4-keto-rhamnose. The results show that the truncated regions of the RmlC protein are important for the RmlC enzyme activity in M. tuberculosis.

• 한국컴퓨터정보학회논문지
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• 제25권8호
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• pp.9-21
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• 2020

RDF 지식 그래프의 사용이 늘어나면서 표준화된 RDF 스키마 표현 형식의 부재가 데이터 상호 교환·운용성을 저해한다는 문제가 제기되어 왔다. 이를 위해 W3C는 RDF 그래프에 대한 구조 묘사 및 검증을 지원하는 SHACL 명세를 개발하였다. 관계형 데이터베이스(RDB)는 구조화된 지식 그래프를 얻는 주요 원천 중 하나이다. RDB로부터 RDF 그래프를 생성하는 방법은 통상 W3C에 의해 표준화된 R2RML 명세를 따른다. 그러나 R2RML 방식으로 생성한 RDF 그래프에 대한 스키마를 생성하기 위해서는 전문가에 의한 별도의 수작업이 요구된다. 본 논문에서는 R2RML 매핑에 의해 구축된 RDF 그래프에 대한 SHACL 스키마를 자동 생성하는 방법을 제안한다. 제안하는 방법의 특징은 R2RML 매핑 문서만으로 SHACL 스키마를 생성할 수 있다는 것이다. 본 논문은 제안하는 방법의 구현 사항들을 상세히 기술하며 구현 결과물을 W3C의 R2RML 테스트 케이스에 적용한 결과를 제시한다.

• 한국컴퓨터정보학회논문지
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• 제27권11호
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• pp.67-80
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• 2022

본 논문에서는 RML 매핑 방식으로 생성된 RDF 지식 그래프의 구조를 묘사하고 검증할 용도의 ShEx 스키마를 자동으로 생성하는 시스템을 제안한다. ShEx 스키마는 제약 조건들로 구성된다. 제안된 시스템은 대부분의 제약 조건을 RML 매핑 규칙을 변환하여 생성한다. 매핑 규칙에서 유도된 제약 조건만으로 구성한 스키마는 사용자가 RML 매핑으로 생성한 그래프의 구조를 파악하는 데 도움을 주는 용도로는 부족함이 없지만 정교한 검증 용도로 사용하기에는 충분치 않다. 검증 용도에 부합하는 스키마가 요구될 경우, 제안된 시스템은 RML 매핑의 입력 데이터 소스에서 추출한 메타데이터를 사용해 만든 제약 조건이 추가된 스키마를 생성할 수 있다. 제안된 시스템이 지원하는 입력 데이터 소스 유형은 CSV, XML, JSON, RDBMS다. 297개의 테스트 케이스로 구성된 실험에서 보인 결과는 제안된 시스템이 RML 매핑으로 생성된 RDF 그래프 검증을 위해 범용적으로 사용될 수 있음을 보여준다.

• 한국컴퓨터정보학회논문지
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• 제27권9호
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• pp.77-89
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• 2022

본 논문에서는 RML 매핑 방식으로 구축한 RDF 지식 그래프의 구조를 묘사하고 검증할 용도의 SHACL 스키마를 자동으로 생성하는 시스템을 제안한다. 제안하는 시스템은 기존 연구와는 달리 RML 매핑 규칙 뿐만 아니라 RML 매핑의 입력인 CSV, JSON, XML, 데이터베이스와 같은 다양한 포맷의 데이터에서 추출한 메타데이터도 함께 사용하여 스키마를 생성한다. 따라서 기존 연구 기반의 스키마에서는 부재했던 데이터 타입, 문자열 길이, 값의 범위, 차수 관련 제약 조건이 스키마에 포함된다. 그리고 기존 연구에서 간과한 소위 반복된 속성 문제를 제안하는 시스템은 해결한다. 297개의 케이스로 구성된 적합성 테스트를 통해 제안된 시스템이 그래프에 대한 올바른 제약 조건을 생성함을 보여준다. 제안된 시스템은 오류가 발생하기 쉬운 기존 수동 검증 프로세스를 자동화하는 데 기여할 수 있다.

• 정보관리학회지
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• 제32권2호
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• pp.131-152
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• 2015

본 연구에서는 R2RML 방식과 Non-R2RML 방식을 각각 적용하여 RDB를 RDF 온톨로지로 변환한 결과를 비교하였다. RDB 기반의 구조적학술용어사전 데이터베이스인 STNet의 데이터를 대상으로, 변환이 완료된 데이터의 규모, 튜플당 변환에 걸리는 시간, 그리고 질의 응답 속도를 측정하였다. 변환 규모의 평가 결과 Non-R2RML 방식이 더 많은 수의 변환을 하였으며, 표현의 풍부성과 추론 가능성 정도를 높이는 변환을 수행한 것으로 나타났다. 튜플당 변환 시간의 경우 Non-R2RML 방식이 미세하지만 더 빠른 것으로 나타났으며, 질의 응답 속도는 두 방식 모두 300회 이상의 질의 횟수부터는 안정적인 성능을 보이면서 유사한 형태의 속도를 보였다. 측정에 대한 종합적 검토 결과 데이터의 변형이 빈번하고 새로운 데이터의 추가나 데이터들 간의 연결관계가 지속적으로 변화하는 STNet과 같은 동적인 RDB에는 Non-R2RML 방식이 적절한 것으로 평가되었다.

• 한국컴퓨터정보학회논문지
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• 제23권10호
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• pp.45-55
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• 2018

R2RML is a W3C standard language that defines how to expose the relational data as RDF triples. The output from an R2RML mapping is only an RDF dataset. By definition, the dataset has no schema. The lack of schema makes the dataset in linked data portal impractical for integrating and analyzing data. To address this issue, we propose an approach for generating automatically schemas for RDF graphs populated by R2RML mappings. More precisely, we represent the schema using ShEx, which is a language for validating and describing RDF. Our approach allows to generate ShEx schemas as well as RDF datasets from R2RML mappings. Our ShEx schema can provide benefits for both data providers and ordinary users. Data providers can verify and guarantee the structural integrity of the dataset against the schema. Users can write SPARQL queries efficiently by referring to the schema. In this paper, we describe data structures and algorithms of the system to derive ShEx documents from R2RML documents and presents a brief demonstration regarding its proper use.

• Archives of Plastic Surgery
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• 제44권5호
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• pp.472-473
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• 2017

• 대한본초학회지
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• 제37권3호
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• pp.29-39
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• 2022

Objective : This study is aimed to evaluate the protective effects of Rehmanniae Radix, Mori Folium, and Liriopie Tuber mixture (RML) on lung injury of Particulate matter less than 10 um in diameter and diesel exhaust particles (PM10D) mice model. Methods : To investigate the anti-inflammatory activity of RML, PM10D was diluted in aluminum hydroxide (Alum) in 7-week-old male mice and induced by Intra-Nazal-Tracheal (INT) injection method. Animal experiments were divided into 5 groups. Nor (normal mice), CTL (PM10D-induced mice with the administration of distilled water), DEXA (PM10D-induced mice with the administration of 3 mg/kg Dexamethasone), RML 100 (PM10D-induced mice treated with RML 100 mg/kg weight), and RML 200 (PM10D-induced mice treated with RML 200 mg/kg body weight). After 11 days administration, mice were sacrificed and inflammation-related immune cells in broncho-alveolar lavage fluid (BALF) were analyzed. Inflammation-related biomarkers were also analyzed in blood and lungs. Lung tissue was observed through histological examination. Results : In the PM10D induced model, the PML showed decreases in CXCL-1 and IL-17A in BALF. Expression of inflammatory cytokines and cough-related mRNA genes was significantly decreased in serum and lung tissue. The mixture treatment of RML significantly improved the immune related cells in the serum. In addition, histological observations showed a tendency to decrease the severity of lung injury. Conclusions : Overall, these results confirmed the respiratory protective effect of the RML mixture in a model of lung injury induced by air pollution (PM10+DEP), suggesting that it is a potential treatment for respiratory damage.

• 한국식품영양과학회지
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• 제29권6호
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• pp.1009-1015
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• 2000

본 연구에서는 적갓김치의 발효과정에 따른 발효특성과 항산화성을 규명하기 위해 갓김치와 가열 쇠고기를 이용한 model system을 만들어 쇠고기 지방질에 대한 항산화성을 살펴보았고 용매별로 추출한 김치성분의 항산화성을 살펴보았다. 적 갓김치는 15$^{\circ}C$에서 발효가 진행되면서 6일째 김치의 pH가 4.5에 도달하였다. 발효진행에 따라서 산도는 증가하였고 환원당은 서서히 감소하였으며 이때 젖산균수 역시 최대치에 도달하였다. 또한 a-scorbic acid 함량은 발효가 진행되면서 감소하였다가 발효 6일째에 다시 다소 증가하였다. 총 페놀함량은 생 시료에서보다는 갓김치에서 높게 나타났으며 발효가 진행됨에 따라 총 페놀함량은 증가하였다. 적 갓김치를 가열쇠고기와의 model system을 조제하여 TBA가를 통해 항산화성을 살펴본 결과 첨가한 김치의 양이 많을수록 항산화성이 높게 나타났으며 생시료일 때보다는 김치의 항산화성이 우수하였으며 발효가 진행된 숙성상태일 때 더 항산화성이 우수하였다. 동결건조시킨 적 갓김치를 물, 메탄올, 핵산 세가지 용매로 추출하여 항산화성을 살펴보았을 때 메탄을 추출물의 항산화성이 가장 높게 나타났다. 또한 담금직후보다는 숙성된 상태의 갓김치가 항산화성이 높았다.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제56권4호
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• pp.186-190
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• 2013

Lung torsion is a very rare event that has been reported in only 9 cases in the pediatric literature but has not yet been reported in Korean infants. We present a case of lung torsion after tracheoesophageal fistula repair in an infant. Bloody secretion from the endotracheal tube and chest radiographs and computed tomographic scan results indicated lung torsion. Emergency exploration indicated $180^{\circ}$ torsion of the right upper lobe (RUL) and right middle lobe (RML). After detorsion of both lobes, some improvement in the RUL color was observed, but the color change in the RML could not be determined. Although viability of the RML could not be proven, pexy was performed for both the lobes. Despite reoperation, clinical signs and symptoms did not improve. The bronchoscopy revealed a patent airway in the RUL but not in the RML. Finally, the RML was surgically removed. The patient was discharged on the 42nd day after birth.