• 제목/요약/키워드: RHO

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Discovery of Cellular RhoA Functions by the Integrated Application of Gene Set Enrichment Analysis

  • Chun, Kwang-Hoon
    • Biomolecules & Therapeutics
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    • 제30권1호
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    • pp.98-116
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    • 2022
  • The small GTPase RhoA has been studied extensively for its role in actin dynamics. In this study, multiple bioinformatics tools were applied cooperatively to the microarray dataset GSE64714 to explore previously unidentified functions of RhoA. Comparative gene expression analysis revealed 545 differentially expressed genes in RhoA-null cells versus controls. Gene set enrichment analysis (GSEA) was conducted with three gene set collections: (1) the hallmark, (2) the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway, and (3) the Gene Ontology Biological Process. GSEA results showed that RhoA is related strongly to diverse pathways: cell cycle/growth, DNA repair, metabolism, keratinization, response to fungus, and vesicular transport. These functions were verified by heatmap analysis, KEGG pathway diagramming, and direct acyclic graphing. The use of multiple gene set collections restricted the leakage of information extracted. However, gene sets from individual collections are heterogenous in gene element composition, number, and the contextual meaning embraced in names. Indeed, there was a limit to deriving functions with high accuracy and reliability simply from gene set names. The comparison of multiple gene set collections showed that although the gene sets had similar names, the gene elements were extremely heterogeneous. Thus, the type of collection chosen and the analytical context influence the interpretation of GSEA results. Nonetheless, the analyses of multiple collections made it possible to derive robust and consistent function identifications. This study confirmed several well-described roles of RhoA and revealed less explored functions, suggesting future research directions.

강릉 지역 공간 감마선량률과 강수량, 일조시간, 평균풍속 사이 교차 상관성 분석 (Cross Correlation Analysis of Gamma Exposure Rates and Rainfall, Hours of Saylight, Average Wind Speed in Gangneung Area)

  • 차호환;김재화
    • 한국방사선학회논문지
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    • 제7권5호
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    • pp.347-352
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    • 2013
  • 본 논문은 강릉 지역에서 동일 기간에 기록된 공간 감마선량률과 강수량, 일조시간, 평균풍속 사이의 교차 상관 지수 ${\rho}_{DCCA}$를 DCCA cross-correlation coefficient(DCCA ${\rho}$)방법으로 구하여 교차 상관성을 분석하였다. 우리는 이 연구를 통해 다음의 사실을 알았다. 첫 번째, 공간 감마선량률과 강수량 사이 ${\rho}_{DCCA}$는 일(4~7일), 달(30일), 계절(90일), 년(360일)에서 0.57~0.48, 0.39, 0.34, 0.26, 공간 감마선량률과 일조시간 사이 ${\rho}_{DCCA}$는 일, 달, 계절, 년에서 -0.20~-0.23, -0.22, -0.17, -0.13, 공간 감마선량률과 평균풍속 사이의 ${\rho}_{DCCA}$는 일, 달, 계절, 년에서 -0.10~-0.12, -0.11, -0.05, -0.05이다. 두 번째, ${\rho}_{DCCA}$를 통하여 공간 감마선량률과 강수량은 교차 상관성이 있으며 공간 감마선량률과 일조시간, 평균풍속 사이에는 교차 상관성이 없다는 것을 확인하였다.

판상형 충전제의 함량과 배향에 따른 PP복합체의 열팽창계수 영향 연구 (Empirical Study on Effects of Disk Shape Filler Content and Orientation on Thermal Expansion Coefficient of PP Composites)

  • 이용현;정선경;황효연;이승구;이기윤
    • 폴리머
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    • 제36권3호
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    • pp.281-286
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    • 2012
  • 두 가지의 종횡비(${\rho}_{\alpha}=a_1/a_3$ and ${\rho}_{\beta}=a_1/a_2$)에 의해 특징지어진 3차원 타원체($a_1$ > $a_2$ > $a_3$)를 사용하여 polypropylene 복합체의 판상형 충전제 함량과 방향이 열팽창률에 미치는 영향에 대해 실험적인 연구를 수행하였다. 측정된 실험적인 값은 Lee와 그의 연구자들이 제안한 이론적인 모델에 의한 계산 값과 비교분석되었다. 판상형 충전제로는 운모와 탈크가 사용되었다. 실험 결과로 운모의 경우 종횡비는 ${\rho}_{\alpha}=13.5$, ${\rho}_{\beta}=1.8$이 사용되어, 20 wt% 함량일 때 ${\alpha}_{11}/{\alpha}_m$는 약 0.56으로 감소하였으나, ${\alpha}_{33}/{\alpha}_m$는 오히려 1.018로 증가함을 보였다. 탈크의 경우의 종횡비는 ${\rho}_{\alpha}=3.7$, ${\rho}_{\beta}=1.4$이었고 ${\alpha}_{11}/{\alpha}_m$는 0.63으로 감소하였다. 결국 운모와 탈크 모두 그 함량증가에 따라 종단방향과 횡단방향에서 열팽창률은 감소하였으나 수직방향에서는 초기 낮은 충전제 함량에서는 오히려 증가하는 경향을 보였다.

Frequency Characteristics of Anodic Oxide Films on Tantalum

  • Lee, Dong-Nyung;Yoon, yong-Ku
    • Nuclear Engineering and Technology
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    • 제5권1호
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    • pp.30-37
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    • 1973
  • 양극산화 피막의 임피단스(impedance)에 대한 니시다니식은 p-i-n 모델에 기초를 두고 $\omega$$\varepsilon$$\rho$$_{ο}$<<4$\pi$<<$\omega$$\varepsilon$$\rho$$_{\omega$}$의 가정하에서 유도된 것이다. 여기서 $\omega$는 각 주파수, $\varepsilon$는 유전상수, $\rho$$_{ο}$ and $\rho$$_{\omega}$는 양극산화피막의 계면과 중간영역의 비저항이다. 그러나 이 식의 파라데타를 전부 계산할 수 없기 때문에 이 식으로 양극산화피막의 물리적 모형을 분명히 할 수가 없다. 그러므로 $\omega$$\tau$$_{\omega}$1과 In(1+$\omega$$^2$$\tau$$^2$$_{ο}$)<<1이란 가정을 하여 임피단스에 대한 수정된 식을 유도하였다. 여기서 $\tau$$_{\omega}$=$\varepsilon$$\rho$$_{\omega}$/(4$\pi$) 및 $\tau$$_{ο}$=$\varepsilon$$\rho$$_{ο}$/(4$\pi$)로 정의된다. 양극산화피막을 가열하였을 때의 주파수톡성의 변화를 이 수정된 식으로 설명하였다. 양극산화피막을 가열하였을 매 양극산화피막의 임피단스의 변화는 주로 양극산화피막의 확산층의 증가와 비저항의 감소때문이라고 해석하였다.

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3차원적 타원 형태의 충전제를 함유하는 복합체의 열팽창 계수 연구 (Study on the Coefficient of Thermal Expansion for Composites Containing 3-Dimensional Ellipsoidal Inclusions)

  • 이기윤;김경환;정선경;전형진;주상일
    • 폴리머
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    • 제31권3호
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    • pp.206-214
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    • 2007
  • 3차원적 타원체 형태 ($a_1>a_2>a_3$)를 사용하여, 2가지의 종횡비 (1차 종횡비 $\rho_{\alpha}$와 2차 종횡비 $\rho_{\beta}$)를 갖는 배열된 3차원 형태의 충전제를 포함하는 복합체의 열팽창 변화를 이론적으로 예측하는 모델을 연구하였다. Eshelby의 등가 텐서를 이용하여 배열된 타원형 충전제를 기지재의 이론에 의해 열팽창 계수를 예측할 수 있었다. 종단방향 열팽창 계수 ${\alpha}_{11}$는 두 가지 종횡비 모두 증가하면, 감소하여 충전제의 열팽창에 접근한다. 수직방향 열팽창 계수 ${\alpha}_{33}$는 충전제 함유량에 따라 초기에는 증가하여 최대값을 갖는 경향을 보인다. 1차 종횡비 $\rho_{\alpha}$가 증가하면, 횡단방향 열팽창 계수는 감소하나, 2차 종횡비 $\rho_{\beta}$가 증가하면, 같이 증가한다. 또한, 수직방향 열팽창 계수 ${\alpha}_{33}$$\rho_{\alpha}$가 증가하면 증가하나, $\rho_{\beta}$가 증가하면, ${\alpha}_{33}$는 반대로 감소한다.

판상형 충전제의 함량과 배향에 따른 PP복합체의 영률 변화 연구 (Empirical Study on the Effects of the Content and the Orientation of the Disk Shape Fillers on the Modulus of PP Composites)

  • 서상범;이용현;정선경;이승구;이기윤
    • 폴리머
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    • 제36권2호
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    • pp.229-234
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    • 2012
  • 이 논문은 판상형 충전제의 함량과 배향에 따라 폴리프로필렌 복합체의 영률 변화에 미치는 영향을 연구하였다. 이론적인 예측은 Lee와 그의 연구자들에 의해 제안된 두 개의 종횡비, ${\rho}_{\alpha}=a_1/a_3$${\rho}_{\beta}=a_1/a_2$를 이용하여 3차원 타원체의 형상을 계산하였고 실험값과 비교 분석하였다. 판상형 충전제로 운모와 탈크를 사용하였다. 충전제의 형태는 SEM을 이용해 관찰하였고, 종횡비는 고분자의 흐름을 기준으로 좌표축을 설정하여 통계적 방법으로 계산하였다. 충전제가 운모인 경우에 ${\rho}_{\alpha}=13.5$${\rho}_{\beta}=1.8$이었고, 탈크의 경우는 ${\rho}_{\alpha}=3.8$${\rho}_{\beta}=1.4$이었다. 또한 충전제의 2개의 종횡비와 함량이 기계적 물성에 미치는 영향을 실험적으로 연구하였다. 운모의 경우 30 wt% 함량일 때 $E_{11}$이 약 2.7배 향상되었다. 탈크의 경우는 $E_{11}$이 약 2.3배 향상하였다.

ON $\eta$K-CONFORMAL KILLING TENSOR IN COSYMPLECTIC MANIFOLD WITH VANISHING COSYMPLECTIC BOCHNER CURVATURE TENSOR$^*$

  • Jun, Jae-Bok;Kim, Un-Kyu
    • 대한수학회보
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    • 제32권1호
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    • pp.25-34
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    • 1995
  • S. Tachibana [10] has defined a confornal Killing tensor in a n-dimensional Riemannian manifold M by a skew symmetric tensor $u_[ji}$ satisfying the equation $$ \nabla_k u_{ji} + \nabla_j u_{ki} = 2\rho_i g_{kj} - \rho_j g_{ki} - \rho_k g_{ji}, $$ where $g_{ji}$ is the metric tensor of M, $\nabla$ denotes the covariant derivative with respect to $g_{ji}$ and $\rho_i$ is a associated covector field of $u_{ji}$. In here, a covector field means a 1-form.

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COMPARISON OF $\rho-ADIC$ THETA FUNCTIONS

  • Sung Sik Woo
    • 대한수학회보
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    • 제38권3호
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    • pp.427-434
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    • 2001
  • In this paper we investigate how $\rho-adic\;\theta$\theta$-function$ of Neron and Tate are related. As a result, we show that the $\rho-adic$ theta function defined by Neron and that defined by Tate are differ by an analytic function whose values are units.

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HOMOTOPY FIXED POINT SET $FOR \rho-COMPACT$ TORAL GROUP

  • Lee, Hyang-Sook
    • 대한수학회보
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    • 제38권1호
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    • pp.143-148
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    • 2001
  • First, we show the finiteness property of the homotopy fixed point set of p-discrete toral group. Let $G_\infty$ be a p-discrete toral group and X be a finite complex with an action of $G_\infty such that X^K$ is nilpotent for each finit p-subgroup K of $G_\infty$. Assume X is $F_\rho-complete$. Then X(sup)hG$\infty$ is F(sub)p-finite. Using this result, we give the condition so that X$^{hG}$ is $F_\rho-finite for \rho-compact$ toral group G.

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THE VARIATIONAL THEORY OF A CIRCULAR ARCH WITH TORSIONAL SPRINGS AT BOTH EDGES

  • Go, Jae-Gwi
    • 대한수학회지
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    • 제44권3호
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    • pp.707-717
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    • 2007
  • Arches are constrained with rotational resistance at both edges. An energy method is used to derive variational formulation which is used to prove the existence of equilibrium states of elastic circular arches for the torsional spring constants ${\rho}-\;{\geq}\;0,\;{\rho}+\;{\geq}\;0,\;and\;{\rho}-\;+\;{\rho}+\;>\;0$. The boundary conditions are searched using the existence of minimum potential energy.