• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제13권4호
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• pp.624-627
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• 2003

Benzo[a]pyrene (B[a]P) is an environmental pollutant that has been implicated in carcinogenesis. Saccharomyces cerevisiae was treated with B[a]P, and the responses of its cytochrome P450 (CYP) enzyme and DNA-damage checkpoint genes were examined through gene expression profiles using a reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). The DNA-damage checkpoint genes tested were the chk1 and pds1 genes, involved in a metaphase arrest, the swi6 gene targeted by G1 arrest, the pol2 gene related to S phase arrest, and the cln2 gene encoding a cyclin protein, all of which are based on rad9 and rad24. Among these genes, no noticeable effect was found when the cells were exposed to various concentrations of B[a]P. However, the transcriptional activity of CYP51 was significantly different when the cells were exposed to B[a]P. Accordingly, the present results indicate that cytochrome P450 plays a more significant role than DNA-damage checkpoint genes in the response of S. cerevisiae to B[a]P.

• 한국생명과학회:학술대회논문집
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• 한국생명과학회 2005년도 제45회 학술심포지움 및 추계학술대회
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• pp.39-39
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• 2005

• 한국동물학회:학술대회논문집
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• 한국동물학회 2003년도 한국생물과학협회 학술발표대회
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• pp.211.4-211
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• 2003

No Abstract, See Full Text

• 한국동물학회:학술대회논문집
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• 한국동물학회 2003년도 한국생물과학협회 학술발표대회
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• pp.195.3-195
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• 2003

No Abstract, See Full Text

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제42권3호
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• pp.154-160
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• 2015

The plant breeding technology was developed with genetic engineering. Many researchers and breeders have turned from traditional breeding to molecular breeding. Genetically modified organisms (GMO) were developed via molecular breeding technology. Currently, molecular breeding technologies facilitate efficient plant breeding without introducing foreign genes, in virtue by of gene editing technology. Gene targeting (GT) via homologous recombination (HR) is one of the best gene editing methods available to modify specific DNA sequences in genomes. GT utilizes DNA repair pathways. Thus, DNA repair systems are controlled to enhance HR processing. Engineered sequence specific endonucleases were applied to improve GT efficiency. Engineered sequence specific endonucleases like the zinc finger nuclease (ZFN), TAL effector nuclease (TALEN), and CRISPR-Cas9 create DNA double-strand breaks (DSB) that can stimulate HR at a target site. RecQl4, Exo1 and Rad51 are effectors that enhance DSB repair via the HR pathway. This review focuses on recent developments in engineered sequence specific endonucleases and ways to improve the efficiency of GT via HR effectors in plants.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제29권4호
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• pp.223-228
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• 2002

본 연구실에서 개발된 particle inflow gun (PIG)은 조작이 간편하고, 사용비용도 저렴하며, 식물 세포 내의 유전자 도입효율이 높은 특징을 갖고 있다. PIG 장비를 이용하여 벼 캘러스 내로의 유전자 도입 조건을 검토하기 위해서 사용된 vector는 pIG121Hm으로서 T-DNA 내부에 intron GUS ($\beta$-glucuronidase)와 hygromycin 및 kanamycin 저항성 유전자를 포함하고 있다. 또한 벼 캘러스 내에 물리적으로 DNA를 도입할 때에 DNA 도입 효율과 관계가 높은 요인들을 GUS의 발현빈도를 통하여 조사하였다. 그 결과 gold particle에 DNA를 부착하는 과정에 사용되는 spermidine과 calcium chloride의 경우 무첨가구에 비해 16 mM의 spermidine과 1.5 M의 calcium chloride 첨가구에서 GUS 발현율이 각각 2배, 3배 증가하였다. 그리고 1회 분사되는 gold particles양이 2 mg의 경우 가장 높은 GUS 발현율을 보여주었으며, 또한 PIG장비의 분사거리와 헬륨의 압력은 벼의 배양세포의 경우 12cm의 분사거리에서 3.5 bar (50 psi)의 헬륨압력으로 분사하였을 때 GUS 발현율이 가장 높았다. 이상의 결과에서 PIG 장비를 이용한 유전자 도입은 본 연구에서 검토한 최적의 조건을 이용하였을 경우 기존에 많이 사용되고 있는 Biolistic Gun (Bio-Rad 사)과 거의 비슷한 유전자 도입효율을 보여 주었다. 특히 PIG 장비의 경우 조작이 매우 간편하고, 분사에 사용되는 일회용 부품이 필요하지 않기 때문에 대량의 반복실험을 필요로 하는 연구에서 손쉽게 사용되리라 기대된다.

• 대한핵의학회지
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• 제34권2호
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• pp.144-153
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• 2000

목적: 피부세포인 A431세포주에서 방사선 조사에 의한 세포고사가 방사선량과 방사선 조사 후 경과시간에 따라서 어떻게 변하는지를 밝혀보고, 방사선에 의해 유도된 수선유전자의 발현을 방사선량별, 조사 후 경과시간별로 분석하여 세포고사와 어떤 관계가 있는지 알아보고자 하였다. 대상 및 방법: 한국 세포주은행으로부터 분양받은 피부상피암 세포의 일종인 A431을 Cs-137 세포조사기를 이용하여 5 Gy, 25 Gy씩 조사하고 4, 12, 48시간이 지난 다음 세포를 모아 유세포계측법을 이용하여 고사세포를 계수하였다. 또한 이 세포들을 Northern blot analysis, Western blot analysis를 시행하여 방사선량별, 경과시간별로 유전자의 변화를 분석하였다. 각 실험군간의 통계적 유의성은 SPSS 통계프로그램을 사용하여 MANOVA test에 의해 검정하였으며, p값 0.05 미만을 유의한 수준으로 판정하였다. 결과: 유세포 계측기로 측정한 고사세포의 비율은 방사선 조사 후 12시간째에 가장 유의하게 증가하였다 (p<0.01). DNA수선유전자의 발현은 5 Gy 조사 후 p53, p21, hRAD 유전자가 12시간째에 증가하였고, 25 Gy 조사 후에는 hRAD50과 p21이 12시간에 증가하였으며, p53과 GADD45는 12시간까지 별 변화가 없었으나 이후 증가하여 48시간에 가장 높은 발현을 보였다. 결론: 피부상피암세포에서 방사선에 의해 유도되는 세포고사는 방사선 조사 후 12시간에 가장 현저해지는 것을 알 수 있었으며, 이 세포고사에 DNA수선 유전자가 밀접한 관련이 있을 것으로 보이는데, 특히 최근에 발견된 hRAD50 유전자도 세포고사와 밀접한 관련이 있을 것으로 사료되었다.

• Animal cells and systems
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• 제3권4호
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• pp.413-415
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• 1999

Our previous report demonstrated that the rhp51$^＋$, a recA and RAD51 homolog of the fission yeast, encodes three transcripts of 1.9, 1.6 and 1.3 kb which have at least six polyadenylation sites. The 3'-end of the gene alone can direct the formation of multiple, discrete 3'ends of the transcripts. To identify the regulatory element required for the 3'-end formation of -rhp51$^＋$ deletion mapping analysis was performed. Northern blot analysis revealed that the 254-bp DNA fragment including 4 distinct poly (A) sites downstream from the Hindlll site, is crucial for normal 3'-end formation. Deletion of the 3'-terminal AU rich region caused appearance of read-through RNA, leading to enhancement of survival rate of the rhp51 deletion mutant in response to DNA damaging agent, methylmethane sulfonate (MMS). The results imply that the rhp51$^＋$ system may be useful for molecular analysis of the 3'-end formation of RNA in the fission yeast.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제52권4호
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• pp.329-336
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• 2010

본 연구는 소의 부위별 근육에 특이하게 발현하는 유전자 마커를 발굴하여 소고기의 부위를 과학적으로 판명할 수 있는 기술을 개발하고자 실시하였다. 이러한 연구 목표 아래 먼저 사태(Beef shank), 등심(Longissimus dorsi), 양지(Deep pectoral), 홍두깨(Semitendinosus) 부위의 근육조직에서 MSC (myogenic satellite cell, 근육줄기세포)를 순수 분리하고 이를 MFC (myotube-formed cell; 근관이 형성된 세포)로 분화시키거나 ALC (adipocyte-like cell; 지방세포와 유사한 세포)로 이형분화 시킨 후 3가지의 세포로 부터 각각의 RNA를 추출하였다. 이렇게 추출한 RNA는 24,000개의 bovine oligo-nucelotide (70 mer)가 집적된 microarray를 이용해 4개의 조직 중 1개의 조직에서만 MSC의 분화(MFC) 또는 이형분화 과정에서 mRNA의 발현이 증감을 보이는 유전자 135개를 먼저 발굴하였다. 135개의 유전자에 대해 microarray 분석에 사용한 동일한 RNA를 이용하여 real-time PCR 기술로 검증한 결과 총 29개의 유전자가 microarray 분석 결과와 유사함을 보였다. 29개의 유전자를 다시 4개 부위의 생체 조직에서 추출한 RNA를 이용해 real-time PCR 방법으로 분석한 결과 TS (thymi- dlyate synthase), TE (tropoelastin), RAD52(similar RAD52 motifcontaining protein 1), unknown gene), MLC2 (myosin light 2, regulatory cardiac, slow), TXNIP (thioredoxin-interating protein) 6개의 유전자만이 다른 부위에 비해 사태 부위에서 현저한 발현의 차이를 나타냈다. 결론적으로 본 연구를 통해 소 부위별 근육을 구분할 수 있는 과학적 기술의 토대를 확립하였다.

• 환경위생공학
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• 제14권4호
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• pp.99-109
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• 1999

Enteropathogenic Yersina enterocolitica is an important cause of human and animal disease. Phenotypic and genotypic characteristics currently used to identify Yersinia enterocolitica are not necessarily sufficient to differentiate pathogenic from non-pathogenic strains or to analyze the epidemiology of yersiniae at a molecular level. To improve the characterization of Yersinia enterocolitica, A total of 65 isolates of Yersinia enterocolitica were examined with bioserotyping, antibiotic susceptibilities, PFGE, PCR-ribotyping. Genomic DNA pattern generated by PFGE are highly specific for different strains of an organism and have significant value in epidemiologic investigations. The PFGE analysis of Not I-digested chromosomal DNA of Y. enterocolitica were performed with a CHEF Mapper(Bio-Rad, USA). Not I generated 19 restriction endonuclease digestion profiles(REDP). PCR-ribotyping, performed with primers complementry to conserved regions of 16S and 23S rRNA gene, generated 13 ribotypes. PCR-ribotyping can be considered a good technich for subtyping strains of Y.enterocolitica.