• 제목/요약/키워드: Quantitative Screening Method

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Application of digital polymerase chain reaction technology for noninvasive prenatal test

  • Lee, Seung Yong;Hwang, Seung Yong
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제12권2호
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    • pp.72-78
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    • 2015
  • Recently, noninvasive prenatal test (NIPT) has been adopted as a primary screening tool for fetal chromosomal aneuploidy. The principle of NIPT lies in isolating the fetal fraction of cell-free DNA in maternal plasma and analyzing it with bioinformatic tools to measure the amount of gene from the target chromosome, such as chromosomes 21, 18, and 13. NIPT will contribute to decreasing the need for unnecessary invasive procedures, including amniocentesis and chorionic villi sampling, for confirming fetal aneuploidy because of its higher positive predictive value than that of the conventional prenatal screening method. However, its greater cost than that of the current antenatal screening protocol may be an obstacle to the adoption of this innovative technique in clinical practice. Digital polymerase chain reaction (dPCR) is a novel approach for detecting and quantifying nucleic acid. dPCR provides real-time diagnostic advantages with higher sensitivity, accuracy, and absolute quantification than conventional quantitative PCR. Since the groundbreaking discovery that fetal cell-free nucleic acid exists in maternal plasma was reported, dPCR has been used for the quantification of fetal DNA and for screening for fetal aneuploidy. It has been suggested that dPCR will decrease the cost by targeting specific sequences in the target chromosome, and dPCR-based noninvasive testing will facilitate progress toward the implementation of a noninvasive approach for screening for trisomy 21, 18, and 13. In this review, we highlight the principle of dPCR and discuss its future implications in clinical practice.

원자력발전소 안전성 평가를 위한 외부사건 식별 및 선별 방법 연구동향 (Research Trends on External Event Identification and Screening Methods for Safety Assessment of Nuclear Power Plant)

  • 김동창;곽신영;김지태;임승현
    • 한국재난정보학회 논문집
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    • 제18권2호
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    • pp.252-260
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    • 2022
  • 연구목적: 기후변화 등으로 인해 자연재해의 빈도 및 강도가 증가하고 있어, 원자력발전소에 영향을 주는 외부사건이 발생할 수 있다. 원자력발전소는 자연재해, 인공재해 등 외부사건으로부터 안전해야 한다. 따라서 원자력발전소에 발생할 수 있는 외부사건을 식별하여야 하며, 원자력발전소에 큰 영향을 줄 수 있는 외부사건을 선별하여야 한다. 본 연구에서는 외부사건을 식별 및 선별하는 방법의 연구동향을 소개한다. 연구방법: 원자력발전소의 확률론적 안전성 평가를 위한 외부사건의 식별 및 선별에 관한 문헌조사를 실시하였다. 또한 국내외 외부사건의 식별 및 선별에 관한 규정을 조사하였다. 연구결과: 원자력발전소의 외부사건 영향분석의 비용을 최소화하고자 외부사건을 식별 및 선별하는 연구가 이루어지고 있다. 각 연구는 관점에 따라 차이를 보이지만 공통적으로 식별과정에서는 원자력발전소 부지에서 발생할 수 있는 모든 사건을 식별하고자 하며, 선별과정에서는 정성적 기준과 정량적 기준을 바탕으로 외부사건을 선별한다. 결론:기후변화 등으로 인하여 자연재해의 강도가 변화하고 있어, 원자력발전소에 영향을 주는 외부사건을 식별 및 선별하는 과정이 중요해지고 있다. 따라서 본 논문에서는 외부사건을 식별과 선별하는 방법에 대해 조사하여 정리하였다. 국내의 경우 원자력발전소의 확률론적 안전성 평가를 위한 외부사건의 식별과 선별에 관한 연구가 미미한 실정이다. 또한 외부사건 정량적 선별과정에서 수행하는 '경계분석'과 '명백히 보수적인 분석' 방법에 관한 연구가 필요할 것으로 보인다.

유도결합 플라스마 질량분석기를 이용한 담배 제품의 무기물 반정량 분석 (Semiquantitative Analysis of metal for Cigarette Product by Inductively Coupled Plasma Mass Spectrometry)

  • 조성일;김효근;황건중
    • 한국연초학회지
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    • 제31권2호
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    • pp.95-106
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    • 2009
  • Semiquantitative analysis by ICP-MS has proven to be a powerful tool for fast screening, in addition, it does not require the element of interest to be present in the calibration standard, making it especially useful for the analysis of unknown samples. In this study, seven cigarette samples were analyzed by the rapid semi-quantitative analysis method based on the ICP-MS. For each cigarette sample, cut tobacco, cigarette paper, filter (before and after smoking), and smoke condensate were analyzed. The accuracy of the analysis technique was evaluated by comparing results obtained from Calibration Check Standard(CCS) and calibration method. Relative Percentage Error(RPE) value of all elements measured for three CCS showed a stable result of less than ${\pm}20%$. Compared to full quantitative analysis by calibration method, the results for cigarette samples showed average error within ${\pm}15%$.

비용 효과도 최적화 기반 양산 무기체계 환경 부하 선별 시험 설계 방법 (The Mass Production Weapon System Environmental Stress-Screening Test Design Method based on Cost-effective-Optimization)

  • 김장은
    • 한국신뢰성학회지:신뢰성응용연구
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    • 제18권3호
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    • pp.229-239
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    • 2018
  • Purpose: There is a difficulty in Environmental Stress Screening (ESS) test design for weapon system's electrical/electronic components/products in small and medium-sized enterprises. To overcome this difficulty, I propose an easy ESS test design approach algorithm that is optimized with only one environment tolerance design information parameter (${\Delta}T$). Methods: To propose the mass production weapon system ESS test design for cost-effective optimization, I define an optimum cost-effective mathematical model ESS test algorithm model based on modified MIL-HDBK-344, MIL-HDBK-2164 and DTIC Technical Report 2477. Results: I clearly confirmed and obtained the quantitative data of ESS effectiveness and cost optimization along our ESS test design algorithm through the practical case. I will expect that proposed ESS test method is used for ESS process improvement activity and cost cutting of mass production weapon system manufacturing cost in small and medium-sized enterprises. Conclusion: In order to compare the effectiveness of the proposed algorithm, I compared the effectiveness of the existing ESS test and the proposed algorithm ESS test based on the existing weapon system circuit card assembly for signal processing. As a result of the comparison, it was confirmed that the test time was reduced from 573.0 minutes to 517.2minutes (9.74% less than existing test time).

비선형 혼합효과모형에서의 로버스트 능형회귀 방법과 정량적 고속 대량 스크리닝 자료에의 응용 (Robust ridge regression for nonlinear mixed effects models with applications to quantitative high throughput screening assay data)

  • 유지선;임창원
    • 응용통계연구
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    • 제31권1호
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    • pp.123-137
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    • 2018
  • 비선형 혼합효과 모형은 다양한 분야에서 반복 측정 자료를 분석할 때 주로 사용된다. 비선형 혼합효과 모형은 개체 내 변동(intra-individual variation)에 대해 고려하는 제 1단계 개별수준모델(individual-level model)과 개체간 변동(inter-individual variation)에 대해 고려하는 제 2단계 개체군모델(population model)의 두 단계로 구성되어 있다. 비선형 혼합효과 모형의 첫 번째 단계인 개별수준모델은 비선형 회귀모형의 모수를 추정하는 것으로 일반적인 비선형 회귀모형과 같고, 주로 보통최소제곱추정 방법을 사용하여 모수를 추정한다. 그러나 최소제곱추정방법은 가정된 비선형 함수가 자료에 의해 명시적으로 드러나지 않는 경우 모수의 추정값과 그 표준오차가 극단적으로 커지는 문제가 발생할 수 있다. 본 논문에서는 최근에 비선형 회귀모형에서 제안된 능형회귀(ridge regression) 방법을 비선형 혼합효과 모형의 제 1단계 개별수준모델에 도입함으로써 이러한 문제를 해결할 수 있는 새로운 추정방법을 제안하였다. 제안된 추정량은 모의실험 연구를 통하여 기존의 표준적인 추정량과 그 성능을 비교하였다. 또한 미국의 National Toxicology Program으로부터 얻어진 정량적 대량고속 스크리닝(quantitative high throughput screening) 실제 자료를 사용하여 추정 방법들을 비교하였다.

IRDS 시스템에 의한 디자인 컨셉트의 평가방법 연구 (A Study on the Evaluation Methods of IRDS for Screening the Industrial Design Proposals)

  • 우흥룡
    • 디자인학연구
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    • 제20권
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    • pp.51-58
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    • 1997
  • 다차원적이며 다속 성을 지니는 디자인 대상에 대하여 통합적으로 자료처리가 진행되고, 가시적인 운용이 더해짐으로서 디자인 과정은 보다 효율적이며, 효과적으로 처리되어 궁긍 적으로 시장경쟁을 가지게 되는 것이다. 본 연구에서는 디자인 제의(컨셉트)의 각 단계와 세부 디자인 완료 후 최종 디자인 결과의 평가를 C/S의 컴퓨팅 환경 아래, 효율적으로 접근시키는데 있으며, 특히 선행연구인 디자인 평가의 방법별 비교연구 결과를 바탕으로 컴퓨터 어플리케이션을 연구/개발하여 실제적인 디자인 평가의 실행기반을 조성하는데 연구의 기본 목적을 둔다. 평가 법 특성 정도에서 평가 법(Ⅹ)는 신속성, 평가 법(Y)는 신뢰성, 평가 법(Z)는 중요성을 두드러지게 보이고 있는 점 또한 이에 대한 주관적인 조사와도 대체로 일치되고 있다. 평가방법 별 상관관계 분석에서는 1차 연구에서 보다 강한 상관계수를 보여 영가 설(nullhypothesis)이 부정되고 연구가설(research hypothesis)이 채택되어 평가 법 간의 정적인 상관관계(positive relation)가 있다고 보여 진다.

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Screening for MiRNAs Related to Laryngeal Squamous Carcinoma Stem Cell Radiation

  • Huang, Chang-Xin;Zhu, Ying;Duan, Guang-Liang;Yao, Ji-Fen;Li, Zhao-Yang;Li, Da;Wang, Qing-Qing
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제14권8호
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    • pp.4533-4537
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    • 2013
  • Objective: To use microarray chip technology for screening of stem cell radiation related miRNAs in laryngeal squamous cell carcinoma; study and explore the relationship of miRNAs with radiosensitivity of laryngeal squamous cells. Method: After conventional culture and amplification of the laryngeal squamous carcinoma cell line Hep-2, CD 133+ cells were screened out with combination of isolated culture of stem cell microspheres and FACS for preparation of laryngeal cancer stem cells. After radiation treatment, miRNAs of laryngeal squamous carcinoma stem cells before and after radiation were enriched and purified. After microarray hybridization with mammalian miRNA and scanning of fluorescence signal, the miRNAs of laryngeal squamous carcinoma stem cells before and after radiation was subject to differential screening and clustering analysis. Real-time quantitative RT-PCR was used to verify part of the differentially expressed miRNAs. Results: 70 miRNAs related to laryngeal cancer stem cell radiation with 2-fold difference in expression were screened out, in which 62 were down-regulated and 8 were up-regulated. Fluorescent quantitative RT-PCR results were consistent with miRNAs chip results. Conclusion: Some miRNAs may be involved in self-regulation with laryngeal squamous carcinoma stem cell radiation.

Quantitative Screening of Insect Cell Transformants Stably Expressing $GFP_{uv}-{\beta}1$, 3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 Fusion Protein

  • Deo Vipin Kumar;Kato Tatsuya;Asari Naoko;Park Enoch Y.
    • Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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    • 제10권3호
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    • pp.275-279
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    • 2005
  • Insect cell transformants, stably expressing human $GFP_{uv}-{\beta}1$, 3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 $({\beta}3GnT2)$ as the green fluorescent protein $(GFP_{uv})-fused$ protein, were efficiently isolated on Western blot by the quantification of the densitometric intensity of the fusion protein. From almost 150 transformants containing the fusion gene linked to three different types of signal sequence, two transformants, Tn-pXme4a and -pX28a, were successfully selected, showing 8.3 and 8.6 mU/mL ${\beta}3GnT$ activity, respectively. This method requires a screening time almost one-half that required in the isolation of stably transformed cells with high expression levels, and at the same time allows the handling a large number of transformants.

화재폭발손실지수법을 이용한 BTX 공장의 위험선별 (Risk Screening of a BTX Plant Using FEDI Method)

  • 김용하;김인태;김인원;김구회;윤인섭
    • 한국화재소방학회논문지
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    • 제19권1호
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    • pp.20-28
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    • 2005
  • 미국, 유럽 등의 대형 화학회사들은 효율적인 위험관리를 위해 단계적 위험성평가 전략을 채택하고 있다. HAZOP이나 정량적위험성평가와 같은 상세한 평가를 수행하기 위한 사전단계로서 위험선별(risk screening)기법을 도입하였다. 본 연구에서는 Khan과 Abbasi가 제안한 위험선별방법인 화재폭발손실지수 법(Fire & Explosion Damage Index, FEDI)을 국내의 BTX플랜트에 적용시켜 보았다. 적용결과를 정량적위험성평가의 결과와 비교해 본 결과, 화재폭발손실지수법이 위험잠재성을 파악하는데 효과적으로 사용될 수 있음을 알 수 있었다. 또한 화재폭발손실지수 법에 대한 민감도분석을 수행함으로써 화재 및 폭발에 영향을 미치는 가장 큰 인자는 설비내 물질의 특성과 양(quantity)임을 알 수 있었다. 본 연구의 결과를 바탕으로 하여 HAZOP의 사전단계로서 화재폭발손실지수 법을 적용한다면 보다 효율적인 위험성 평가가 가능할 것이다.

화약물질 현장검출시약 EXPRAY$^{(R)}$를 이용한 토양내 화약물질 스크리닝 및 준정량화 가능성 (Screening and Possibility of Semi-quantitative Analysis of Explosive Compounds in Soil Using EXPRAY$^{(R)}$ Explosives Field Detection Kit)

  • 배범한;조정현
    • 한국지하수토양환경학회지:지하수토양환경
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    • 제14권2호
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    • pp.45-53
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    • 2009
  • 환경 시료 (토양 및 수질)내 화약물질을 신속하고 간편하게 검출할 수 있다면, 현장조사에서 오염도 조사를 위한 스키리닝 단계로 이용하여 불필요한 시료의 갯수와 고가의 실험실 정량분석비용을 줄일 수 있다. 상용 EXPRAY$^{(R)}$ Explosives Field Detection Kit(EXPRAY)를 이용하여 14종의 화약물질을 대상으로 화약물질 표준용액에 대한 최저검출농도를 결정 하고 및 준정량화 가능성을 확인하기 위한 실험을 실시하였다. 실험결과 EXPRAY는 14종의 화약물질 중에서, TNT, RDX, HMX, Tetryl및 TNB등 5종의 화약물질을 검출할 수 있었다. Nitramine계열인 HMX와 RDX에 대한 최저검출농도는 모두 14ng/mm$^2$이었다 EXPRAY는 nitroaromatic계열에는 더욱 민감하게 반응하여, Tetryl, TNB및 TNT에 대한 단위면적당(mm$^2$)최저 검출량이 각각 3ng, 3ng및 0.3ng이었다. 실험이 통제되는 조건에서 화약물질 표준용액에 EXPRAY를 적용하였을 경우에는 발색 강도의 비교를 통해 10배 단위의 준정량화가 가능하였다. 그러나 오염토양으로 실험한 경우에는 화약물질의 존재여부 및 종류만을 확인할 수 있었다. EXPRAY Explosives Detection Kit$^{(R)}$가 화약물질을 검출할 수 있는 경제적이고 민감한 방법이지만, 현장시료의 스크리닝 단계에만 적용할 수 있는 방법이다.