• 제목/요약/키워드: Pseudomonas glumae

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세균성 벼알마름병의 발병요인과 방제대책 (Occurrence of Pseudomonas glumae and its control)

  • 차광홍
    • 식물병과 농업
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    • 제1권1호
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    • pp.14-18
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    • 1995
  • This study was carried out to investigate effect of transplanting method, environmental factor, and fertilizing level on occurrence of Pseudomonas glumae in south-west coastal area of Chonnam province. Occurrence in filed began after heading and increased gradually during 3-4 weeks. Occurrence of this disease was great at daily minimum temperature of 23-$25^{\circ}C$ and series of rainfall during early and mid. August Degree of infection by fertilization of nitrogen and by transplanting fertilizing level of 50% than standard fertilization of nitrogen and by transplanting method was greater machine-transplanting than hand-transplanting. Rate of degradation was 6.5% in case of 10% of infected panicle, 14.5% in 30%, 22% in 50% and 35.9% in 70%. We can reduce occurrence of this disease by sawing non -infected seed and balanced fertilizing in cultural practice and applying oryza 4kg/a in early transplanting or Kasugamin EC and Allta in heading stage.

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Identification and Characterization of Bdellovibrio bacteriovorus, a Predator of Burkholderia glumae

  • Song, Wan-Yeob
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제14권1호
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    • pp.48-55
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    • 2004
  • Six strains of an obligate predatory bdellovibrio isolate that preys on Burkholderia glumae in rice paddy field water and rhizosphere soil, were identified and characterized. The numbers of Bdellovibrio cells varied from $3.2{\times}10^3$ to $9.2{\times}10^3$ plaque-forming unit/g after enrichment in cells of B. glumae. Prey range tests with six Bdellovibrio strains and 17 prey strains of rice-pathogenic, antibiosis-related, or nitrogen-fixing bacteria resulted in unique predation patterns in related prey cells. Strain BG282 had the widest prey range on 7 plant pathogenic bacteria among the 17 prey strains tested. However, no predation occurred with strains of Azospirillum brasilense, Paenibacillus polymyxa, Pseudomonas fluorescens, P. putida, and Serratia marcescens that are associated with antibiosis or nitrogen fixation in the rice ecosystem. Identification was confirmed by the presence of typical bdelloplast in the prey cells of B. glumae and by a PCR assay using B. bacteriovorus-specific primers. Furthermore, 16S rDNA sequencing of the six bdellovibrio strains showed a homology range of 97.2% to 99.2% to the type strain of B. bacteriovorus.

PCR로 증폭된 16S와 23S rDNA 사이 Spacer 부위의 다형성에 의한 주요 벼종자전염성 세균의 구별 (Differentiation of Major Rice-Seedborne Bacteria by PCR-Amplified Polymorphism of Spacer Region Between 16S and 23S Ribosomal DNA)

  • 김형무;송완엽
    • 한국식물병리학회지
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    • 제12권1호
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    • pp.11-20
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    • 1996
  • 한 쌍의 R16-1과 R23-2R primer를 이용한 PCR에 의해 증폭된 16S와 23S rDNA 사이의 rDNA spacer 부위의 다형성들이 Pseudomonas avenae, P. glumae, P. fuscovaginae, P. syringae pv. syrngae, Xanthomonas oryzae pv. oryzae, X. oryzae, Xanthomonas herbicola 등 벼 종자전염성 51개 균주의 구분을 위하여 적용되었다. 증폭산물은 820∼950bp의 크기였으며, 각각의 종에 특이적이었고 구분이 가능하였다. Pseudomonas species의 증폭산물은 P. avenae는 950bp, P. glumae는 850bp, P. fuscovaginae는 770pb 및 P. syringae pv. syringae는 1,240, 1,100 및 820bp로 특이적이었다. P. avenae와 P. glumae의 국내균주들은 다형성에 있어 종내 변이는 없었다. X. oryzae pv. oryzae의 860bp와 X. oryzae pv. oryzicola의 890, 440 및 370bp의 이차산물에서 Xanthomonas species의 종내에서 균주에 관련없이 단일화된 다형성을 보였다. CXO 211을 제외한 모든 국내 균주는 a형에 속한 반면 하나의 국내 균주를 포함하여 4개 균주는 b형이었다. E. herbicola의 spacer 부위 증폭은 여러 개의 band를 보였으며, 증폭상은 각각 동일하였고, strain간의 종내 변이는 없었다. 본 실험 결과에 의하여 16S와 23S rDNAdp R16-1과 R23-2R primer를 이용하여 PCR 증폭된 spacer 다형성의 구별은 종자전염성 세균의 신속한 구별에 이용될 수 있을것이다.

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세균성 벼알마름병의 연구동향 (Current Status of Bacterial Grain Rot of Rice in Korea)

  • 송완엽;김형무
    • 식물병과 농업
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    • 제5권1호
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    • pp.1-7
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    • 1999
  • The grain rot of caused by Bukholderia glumae was fist reported in japan in 1955 and then reported in other countries as well as in Korea in 1986. The pathogen causes both seedling and grain rot of rice but it cannot attack any other parts of adult rice plant. Bacterial colonies grow slowly, and are circular and greyish white. The causal bacterium is Gram-negative and rod shape with 1-3 polar flagella, and produce a diffusible yellow-greenish nonfluorescent pigment on King's medium B. Biochemical characteristics such as negative in arginine dehydrolase, oxidase reaction and nitrate reduction and positive in lecithinase, and the utilization of L-arginine and inositol are useful in differentiation of this from other nonfluorescent bacteria pathogenic to rice. This pathogenic bacterium had belonged to the genus of Pseudomonas but recently was transferred to the new genus Burkholderia on the basis of physiological characteristics and DNA-DNA hybridization data. However, other characteristics such as colony heterogenicity or colonial variation after subcultures, phytotoxin, secreting antibiotics, and relationship between yellow greenish pigment production and pathogenicity need to be clarified more. To develop an effective control strategy for this disease, understanding of detailed life cycle of the disease and critical environmental factors affecting disease development is prerequisite. Although 5,435 ha of rice paddy in Korea was infested during 1998, there is no exact estimation of yield losses and distribution of the pathogen. The review will focus on recent progress on the understanding of the bacteriological and ecological characteristics of the causal bacterium and control means of the disease.

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Environmental Factors Affecting on Shrimp Cultivation and Bacterial Examination in Shrimp Aquaculture

  • Chun, Jae-Woo;Ma, Chae-Woo;Oh, Kye-Heon
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
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    • 한국생물공학회 2003년도 생물공학의 동향(XIII)
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    • pp.775-779
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    • 2003
  • 충남 태안소재 순천향대학교 해양연구소의 해양수산연구소에서 probiotics 개발을 궁극적인 목표로 하여 대하양식장에서 대하의 효율적 생산을 위한 생육환경을 조사하였다. 대하의 생장에 영향을 미치는 용존산소, 수체온도, pH, 염도, $NH_4-N$, $NO_2-N$, $NO_3-N$, 클로로필 a를 포함하는 몇가지 환경요인들을 조사하였다. 수 표본에 용존되어 있는 $NH_4-N$, $NO_2-N$, 그리고 $NO_3-N$의 농도는 각각 0.024-0.034 mg/L, 0.03-0.02, 0.004-0.009 mg/L였다. 클로로필 a는 0.002-0.018 $ug/m^3$ 범위에 있었다. 양식장에서 채취한 수 표본에서 다른 세균들의 분포를 알아보기 위하여 marine agar plates에서 분리 계수하였다. 총세균수는 대략 $6.5\;{\times}\;10^4$까지 증가하였다. BIOLOG 시험들 통하여 13가지의 분리 세균들은 Corynebacterium nirilophilus, Clavibacter agropyri, Sphingomonas adhaesiva, Brevundimonas vesicularis, Vibrio parahaemolyticus, Pseudomonas bathycetes, Vibrio tubiashii, Sphingomonas macrogoltabidus, Rhodococcus, rhodochrous, Burkholderia glumae, Corynebacterium urealyticus, Rhodococcus fascians, Psychrobacter immobilis로 각각 동정되었다. 향후 연구는 대하의 효율적인 생산을 위한 정보를 제공하기 위한 병독성이나 환경과 probiotics의 연관성을 규명에 집중 될 것이다.

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식물근권에서 분리한 세균의 어류질병세균에 대한 항균활성 효과 (Antibacterial Effect of Bacteria Isolated from the Plant Rhizosphere against Pathogenic Bacteria of Fish)

  • 정지운;박소현;김동휘;전용철;허문수
    • 생명과학회지
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    • 제24권7호
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    • pp.757-761
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    • 2014
  • 천연 항균물질의 연구는 대부분 식품소재, 특히 약용식물을 대상으로 하여 많은 연구가 진행되어 왔다. 그러나 식품소재의 경우 대량의 추출물 등을 제조하기 위해 많은 양의 재료가 필요하며, 이로 인한 비용 문제가 발생하게 된다. 미생물은 적절한 환경 하에서 대량 배양이 용이하기 때문에 천연항생제로 이용하기 위해 지속적인 연구가 이루어지고 있다. 본 연구에서는 식물병 억제에 효과가 있는 식물근권미생물을 이용하여 어류질병세균 4종을 대상으로 항균활성을 확인하였다. 이 중 항균활성을 나타낸 균 3종을 선발하여 배양액, 상층액, 균체 현탁액으로 나누어 어느 부위에서 항균효과를 나타내는지 탐색하고, 16S rDNA 염기서열 분석을 통해 균을 동정하였다. 12종의 식물근권세균 중 BRH433-2, THJ609-3, TRH415-2 3종에서 항균활성이 나타나는 것을 확인하였다. 세 균주의 배양액, 상층액, 균체 현탁액 중에서는 균체 현탁액이 가장 강한 항균활성을 나타내는 것을 알 수 있었다. 세 균주의 16S rDNA 염기서열 분석 결과, BRH433-2는 Burkholderia gladioli와 99.5%, B. plantarii 98.9%, B. ubonensis 98.5%, B. pyrrocinia 98.3%, B. glumae 98%로 나타났다. THJ609-3은 Pseudomonas baetica와 97.7%, P. moorei와 P. plecoglossicida에 대해서는 각각 97.6%, 97.5%의 상동성이, TRH415-2는 P. koreensis, P. baetica와 98.4%, P. moraviensis 98.3%의 염기서열 유사도를 나타났다. 따라서 3종의 식물근권세균은 충분한 안정성 및 안전성 실험을 실행한 후, 양식산업에 적용하여 항생제 대체 물질로서의 이용가치가 있다고 생각된다.