• The Plant Pathology Journal
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• 제22권2호
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• pp.168-173
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• 2006

To develop the diagnostic method for the viral infection in apple, the partial genes corresponding to the N-terminal region of RNA polymerase of Apple stem grooving virus (ASGV) and coat protein of Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV) were characterized from the infected apple cultivars in Korea. Based on the nucleotide sequences of the characterized partial genes, the virus gene-specific primers were designed for the detection of ASGV and ACLSV infected in species of Malus. The RT-PCR using the primers for the genes of ASGV and ACLSV successfully gave rise to 404 and 566 bp DNA fragments, respectively. Using those viral gene-specific primers, the multiplex RT-PCR assays were also established to diagnose the mixed infection by ASGV and ACLSV simultaneously. Furthermore, the control primers, which have to be included for the RT-PCR as an internal control, were designed using the nucleotide sequence of the gene encoding elongation factor $1{\alpha}(EF1{\alpha})$. This multiplex RT-PCR including the control primers provides more reliable, rapid and sensitive assay for the detection of ASGV and ACLSV infected in Korean apple cultivars.

• 한국식물병리학회지
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• 제13권2호
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• pp.73-78
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• 1997

A virus was purified from Korean cactus (Chamaeaereus silverstrii f. Variegata Hort) showing necrotic spots and its biophysicochemical properties were examined. The typical necrotic spots were observed on healthy looking cactus inoculated with the purified virus and the various symptoms from necrotic spots to systemic were observed on 17 species of test plats used, which suggests that the purified virus has the normal infectivity and wide host range. Ultraviolet absorption scanning analysis revealed that the viral preparation had the typical curve with shoulder at 290 nm and its ratio of absorbances at 260 nm to 280 nm and extinction coefficient was 1.156 and 2.86, respectively. The virus represented one distinct and homogeneous band and molecular weight of viral coat protein was determined to 17, 000 Dalton by SDS-PAGE. The virus revealed rod-shaped virion (325$\times$20 nm) by electron microscopy. Based on these results, it has been thought that the virus purified in this study is the pathogenic agents causing necrotic spot symptom on Korean cacuts and one of the member of tobamovirus family.

• 한국잡초학회지
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• 제11권3호
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• pp.195-204
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• 1991

Glufosinate-ammonium에 대(對)한 수도(水稻) 품종간(品種間)의 반응차이(反應差異)를 구명(究明)하고자 glufosinate-ammonium에 대한 감수성(感受性) 반응(反應), 총(總) 수용성(水溶性) 단백질(蛋白質) 함량(含量), 단백질(蛋白質) 패턴의 변화(變化), glutamine synthetase의 활성(活性), 축적(蓄積)된 암모니아 함량(含量), 유리(遊離) 아마노산 조성변화(組成變化)를 조사(調査)를 실시(實施)한 바 결과(結果)를 요약(要約)하면 다음과 같다. 1. Glufosinate-ammonium 10ppm 에 대한 수도(水稻) 품종간(品種間) 반응(反應)을 보면 Fukei 126과 탐진벼의 신초(新鞘)의 길이가 무처리구(無處理區)에 비(比)해 각각(各各) 96%, 100%로 내성품종(耐性品種)으로, 영덕벼, 팔공벼, 남영벼는 신초(新鞘)의 길이가 무처리(無處理)에 비(比)해 각각(各各) 40%, 39%, 37%로 감수성품종(感受性品種)으로 분류(分類)하였다. 2. 총(總) 단백질(蛋白質) 함량(含量)은 내성품종(耐性品種)으로 선발(選拔)된 Fukei 126과 탐진벼는 무처리(無處理)에서 240.0, 207.2 ${\mu}g$/100${\mu}l$이던 것이 처리(處理)에서 234.0, 184.0 ${\mu}g$/100${\mu}l$으로 무처리(無處理)에 대(對)한 비(比)가 97.5%, 88.8% 이었고, 감수성(感受性) 품종(品種)_으로 선발(選拔)된 영덕벼, 팔공벼, 남영벼는 무처리(無處理)에서 255.4, 204.4, 236.3${\mu}g$/100${\mu}l$이던 것이 처리에서 181.1, 160.7, 191.0 ${\mu}g$/100${\mu}l$으로 각각(各各) 무처리(無處理)에 비(比)해 70.1%, 78.6%, 80.8%로 내성품종(耐性品種)에 비(比)해 크게 감소(減少)되었다. 3. 단백질(蛋白質)패턴의 변화(變化)는 내성품종(耐性品種)인 탐진벼에서는 glufosinate-ammonium 10ppm 처리시(處理時)에도 band의 density의 변화(變化)가 없었으나, 감수성(感受性) 품종(品種)으로 선발(選拔)된 남영벼에서는 66kD 상위(上位)에서 band density가 감소(減少)하거나 사라지는 경향(傾向)을 보였다. 2D-PAGE에서도 마찬가지로 내성(耐性)인 탐진벼의 경우(境遇)는 spot의 변화(變化)가 거의 없었던 데 비(比)해 감수성(感受性)인 남영벼에서의 경우(境遇)는 45kD와 66kD사이, 20kD 부근에서 spot의 density가 감소(減少)하거나 사라지는 경향(傾向)을 보였다. 4. Glutamine synthetase의 활성(活性)은 내성(耐性)의 탐진벼는 처리(處理)와 무처리(無處理)에서 각각(各各) 44, 86${\mu}mol$ GHA/mg protein/min로 무처리(無處理)에 대(對)한 처리(處理)의 효소활성(酵素活性)의 비(比)가 51.2%이었고, 감수성(感受性)의 남영벼는 처리(處理)와 무처리(無處理)에서 23, 68${\mu}mol$ GHA/mg protein/min로 무처리(無處理)에 대(對)한 비(比)가 33.8%로 나타나 내성(耐性)의 탐진벼에 비(比)해 다소(多少) 약(弱)한 반응(反應)을 보였다. 5. 암모니아의 체내축적량(體內蓄積量)은 내성(耐性)의 탐진벼는 처리(處理)와 무처리(無處理)에서 각각(各各) 1.46, 0.44mmol/g FW로 무처리(無處理)에 대(對)한 암모니아 함량(含量)의 비(比)가 331.8%이었고, 감수성(感受性)의 남영벼는 3.08, 0.35mmol/g FW로 무처리(無處理)에 대(對)한 비(比)가 905.9%로 나타나 내성(耐性)의 탐진벼에서보다 약 3배 더 많은 것으로 나타났다. 6. 유리(遊離) 아미노산의 조성(組成)은 glutamine synthetase 기질(基質)인 glutamic acid가, 내성(耐性)의 탐진벼는 처리(處理)와 무처리(無處理)에서 4.879, 16.599로 무처리(無處理)에 대(對)한 비(比)가 29.4%로 줄어든 반면(反面), 감수성(感受性)인 남영벼는 처리(處理)와 무처리(無處理)가 13.221, 3.021로 무처리(無處理)에 대(對)한 비(比)가 오히려 약 430%로 증가(增加)되어 glutamine synthetase 기질(基質)로 이용(利用)되지 못하고 남아있었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제15권4호
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• pp.831-837
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• 2005

Low-temperature adaptation and cryoprotection were studied in Leuconostoc mesenteroides SYl, a strain isolated from Kimchi. L. mesenteroides SY1 cells grown in exponential growth phase at $30^{\circ}C$ were exposed to $15^{\circ}C,\;10^{\circ}C$, and $5^{\circ}C$ for 2, 4, and 6 h, respectively, and then frozen at $- 70^{\circ}C$ for 24 h. Survival ratio was measured after the cells were thawed. The freezing-thawing cycles were repeated four times. Preadapted cells survived better than non-adapted control cells, and the highest survival ratio ($96\%$) was observed for cells preadapted for 2 h at $5^{\circ}C$, whereas control cells showed only $22\%$. The 2D gel showed that two proteins (spots A and B) were induced in cells preadapted at lower temperatures. Spots A and B have the same molecular weight (7 kDa), but the pI was 4.6 for spot A and 4.3 for spot B. The first 29 and 15 amino acid sequences from spots A and B were determined, and they were identical, except for one amino acid. A csp gene was cloned, and nucleotide sequencing confirmed that the gene encoded spot A cold shock protein.

• 한국어병학회지
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• 제13권1호
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• pp.7-13
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• 2000

1993년부터 한국 서해안의 새우 양식장에서는 양식새우의 대량폐사가 일어났다. 외부증상은 두흉갑과 표피에 흰 반점이 나타났고 어류주화세포에는 배양되지 않았다. 열($50^{\circ}C$) 및 강산(pH 3)에는 쉽게 실활되었으나 강알카리(pH 11)에는 내성이 강했다. 바이러스의 입자 형태는 Rod Shaped한 형태를 보였다. 바이러스 단백질의 분석결과는 Hypodermal Hematopoietic Necrosis Baculovirus(HHNBV)와 유사했고 바이러스 핵산분석 결과는 약 114kb로 Penaeid Acute Viremia(PAV)와 유사했다.

• KSBB Journal
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• 제25권5호
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• pp.478-482
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• 2010

죽여 추출물의 미백 효과를 확인하기 위하여 용매와 추출방법을 달리한 6가지의 추출물을 얻어 tyrosinase 활성 억제시험을 하였다. 그 결과 메탄올로 추출한 죽여 추출물에서 tyrosinase 활성 억제 효과가 가장 우수한 것을 확인 하였다. 세포 수준에서 죽여 추출물의 melanin 생성 억제 효과를 알아보기 위해서 B16 melanoma 세포를 이용하여 MTT assay를 실시하였고, 50 ppm의 농도 까지는 세포 독성이 나타나지 않은 것을 확인하였다. 죽여 추출물에 의한 세포 내 melanin 합성 저해 효과를 측정하기 위해 melanin contents assay를 하였고, 10 ppm 추출물을 처리한 extra cellular에서는 control 대비 68%, intra cellular에서는 74% 수준으로 melanin 합성이 저해됨을 확인하였다. 이차원전기영동을 이용하여 B16 melanoma 세포의 proteome을 분석 해 본 결과, 죽여 추출물 을 투여하지 않은 대조군에서는 171개, 추출물을 투여한 것에서는 282개의 spot을 확인하였고, 120개의 spot matching 을 확인하였다. 이 중 미백에 관련된 12개의 단백질 동향분석을 통하여, 죽여 추출물이 melanin 합성 전이나 합성 중에 관련된 메커니즘에 관련하는 것을 알 수 있었다.

• The Korean Journal of Pain
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• 제21권2호
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• pp.112-118
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• 2008

Background: This study was conducted to quantitatively analyze proteins associated with the calcitonin gene-related peptide (CGRP) in cerebrospinal fluid (CSF) that was obtained from a rat model of chronic neuropathic pain following administration of intrathecal $CGRP_{8-37}$. Methods: Male Sprague-Dawley rats (100-150 g, 5-6 wks) were divided into two groups, sham controls and neuropathic pain models. At the time of operation for neuropathic pain model, an intrathecal catheter was threaded through the intrathecal space. At 1 or 2 wks after the operation (maximum pain state), a test dose of 1, 5, 10, or 50 nM of $CGRP_{8-37}$ was injected into the intrathecal catheter and the CSF was then aspirated. Conventional proteomics to evaluate the CSF were then performed using high resolution 2-D, gel electrophoresis followed by computational image analysis and protein identification by mass spectrometry. Results: Treatment with $CGRP_{8-37}$ effectively alleviated mechanical allodynia in a dose dependent manner. The most effective response was obtained when a dose of 50 nM was administered, but significant differences were obtained following administration of only 5 nM $CGRP_{8-37}$. Furthermore, the results of the proteomic analysis were consistent with the experimental results. Specially we detected 30 differentially expressed spots in 7 images when 2-D gel electrophoresis was conducted. The intensity of 6 of these spots (spot number: 20 and 26-30) was found decrease the $CGRP_{8-37}$ dose increased; therefore, these spots were evaluated by mass spectrometry. This analysis identified 2 different proteins, CGRP (spot numbers: 26-30) and neurotensin-related peptide (spot number: 20). Conclusions: The results of this study suggest that CGRP plays a role in chronic central neuropathic pain and is a major target of chronic neuropathic pain management.

• The Plant Pathology Journal
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• 제31권4호
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• pp.379-387
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• 2015

Melon necrotic spot virus (MNSV) was recently identified on watermelon (Citrullus vulgaris) in Korea, displaying as large necrotic spots and vein necrosis on the leaves and stems. The average occurrence of MNSV on watermelon was found to be 30-65% in Hapcheon and Andong City, respectively. Four isolates of the virus (MNSV-HW, MNSV-AW, MNSV-YW, and MNSV-SW) obtained from watermelon plants in different areas were non-pathogenic on ten general indicator plants, including Chenopodium quinoa, while they infected systemically six varieties of Cucurbitaceae. The virus particles purified by 10-40% sucrose density gradient centrifugation had a typical ultraviolet spectrum, with a minimum at 245 nm and a maximum at 260 nm. The morphology of the virus was spherical with a diameter of 28-30 nm. Virus particles were observed scattered throughout the cytoplasm of watermelon cells, but no crystals were detected. An ELISA was conducted using antiserum against MNSV-HW; the optimum concentrations of IgG and conjugated IgG for the assay were $1{\mu}l/ml$ and a 1:8,000-1:10,000 dilutions, respectively. Antiserum against MNSV-HW could capture specifically both MNSV-MN from melon and MNSV-HW from watermelon by IC/RT-PCR, and they were effectively detected with the same specific primer to produce product of 1,172 bp. The dsRNA of MNSV-HW had the same profile (4.5, 1.8, and 1.6 kb) as that of MNSV-MN from melon. The nucleotide sequence of the coat protein of MNSV-HW gave a different phylogenetic tree, having 17.2% difference in nucleotide sequence compared with MNSV isolates from melon.

• 한국작물학회지
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• 제60권1호
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• pp.114-122
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• 2015

침종 기간과 침종 후 발아의 유무에 따른 단백질 발현을 이차원전기영동을 이용하여 단백질 발현양상을 확인하고 비교 분석한 결과, 침종 기간과 침종 후 발아의 유무에 따른 단백질 발현 양상은 전반적으로 매우 유사하였으며, 주요 단백질의 발현에는 차이가 없었다. 침종 기간에 따른 품종별 단백질 발현 양상은 침종 기간이 길어짐에 따라 단백질 발현정도가 점차 증가되는 것을 확인할 수 있었다. 공시품종들 중 황금콩, 단엽콩, Peking이 다른 품종들에 비하여 침종 4일후에 단백질 발현정도가 급격히 증가하는 것을 알 수 있었다. 침종 후 발아 유무에 따른 단백질 발현양상은 소수의 단백질 spot들을 제외하고는 전반적으로 모든 공시 품종들에서 발아한 종자에서의 단백질 발현정도는 미발아 종자에서보다 높게 확인되었다.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제59권4호
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• pp.406-412
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• 2005

연구배경 : 최근 말초혈액을 결핵균 특이 항원으로 자극후 분비되는 $IFN-{\gamma}$ 를 측정하는 $QuantiFERON^{(R)}-TB$ Gold (QFT) 와 T $SPOT-TB^{(R)}$(SPOT) 검사가 임상에서 잠복결핵의 진단에 상품화되어 사용되고 있다. 그러나 이전에 시행한 투베르쿨린 검사가 상기 체외 $IFN-{\gamma}$ 검사의 위양성을 유발할 수 있는 가능성에 대해서는 아직 발표된 자료가 없다. 방 법 : 과거 결핵치료력 또는 환자 접촉력이 없는 46명의 15세 남자 고등학생을 대상으로 하였다. 혈액을 채취하여 $IFN-{\gamma}$ 검사를 시행하고, 이단계 TST를 시행하였다. 첫 번째 검사에서 $IFN-{\gamma}$ 검사와 TST가 모두 음성인 학생을 대상으로 하여 2개월 째에 TST, 2개월, 4개월 째에 QFT, 그리고 2개월 째에 SPOT 검사가 반복 시행되었다. 결 과 : TST 경결 크기의 평균값은 $3.1{\pm}5.4mm$ (범위: 0-20)였고, 이단계 TST에서 최종 13/46명(28.3%)이 양성 결과를 나타내었다. SPOT검사는 9명(19.6%)에서 양성이었으며 QFT는 1명(2.2%)에서만 양성이었다. 첫 $IFN-{\gamma}$ 검사와 TST에서 모두 음성인 학생 24명에서 2개월에 시행한 TST 모두 음성이었다. 2개월(23명) 및 4개월(25명)에 시행한 QFT 검사는 모두 음성이었다. 2개월에 SPOT 검사를 시행한 23명 중 1명(4.3%)에서 약양성 결과를 보였다. 결 론 : 두 가지 체외 $IFN-{\gamma}$ 검사의 결과에 일부 차이가 있었으나 2개월 및 4개월 이전에 시행된 TST가 체외 $IFN-{\gamma}$ 검사결과에 영향을 미치지 않음을 알 수 있었다.