• 제목/요약/키워드: Profiling analysis

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벼 microarray를 이용한 유전자발현 profiling 연구동향 (Current status on expression profiling using rice microarray)

  • 윤웅한;김연기;김창국;한장호;이태호;김동헌;이강섭;박수철;남백희
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제37권2호
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    • pp.144-152
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    • 2010
  • As the International Rice Genome Sequencing Project (IRGSP) was completed in 2005 and opened to the public, many countries are making a lot of investments in researches on the utilization of sequence information along with system development. Also, the necessity of the functional genomics researches using microarray is increased currently to secure unique genes related with major agricultural traits and analyze metabolic pathways. Microrarray enables efficient analysis of large scale gene expression and related transcription regulation. This review aims to introduce available microarrays made based on rice genome information and current status of gene expression analysis using these microarrays integrated with the databases available to the public. Also, we introduce the researches on the large scale functional analysis of genes related with useful traits and genetic networks. Understanding of the mechanism related with mutual interaction between proteins with co-expression among rice genes can be utilized in the researches for improving major agricultural traits. The direct and indirect interactions of various genes would provide new functionality of rice. The recent results of the various expression profiling analysis in rice will promote functional genomic researches in plants including rice and provide the scientists involved in applications researches with wide variety of expression informations.

빅데이터 분석 기술(Hadoop/Hive) 기반 네트워크 정상행위 규정 방법 (A Normal Network Behavior Profiling Method Based on Big Data Analysis Techniques (Hadoop/Hive))

  • 김성진;김강석
    • 정보보호학회논문지
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    • 제27권5호
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    • pp.1117-1127
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    • 2017
  • 사물인터넷 시대의 도래로 인터넷에 연결된 다양한 기기들의 사용은 급성장 하였으나 사물인터넷 보안은 아직 취약한 상태이다. 사물인터넷은 목적에 따라 다양한 기기들이 사용되고 또한 저 전력 환경에서 동작할 수 있도록 각기 다른 프로토콜들을 사용하고 있으며, 많은 양의 트래픽을 발생시켜 기존 보안 기술들을 접목시키기 어렵다. 그러므로 본 논문에서는 이러한 문제점을 해결하기 위한 방안중의 하나로 Hadoop/Hive를 이용한 빅데이터 분석 기술 및 통계 분석 도구인 R을 활용하여 네트워크 정상행위 규정 방법을 제시하며 시뮬레이션을 통해 제안한 방법의 유효성을 검증한다.

데이터마이닝을 이용한 표준정책 수요 중소기업의 프로파일링 연구: R&D 동기와 사업화 지원 정책을 중심으로 (An Empirical Study of Profiling Model for the SMEs with High Demand for Standards Using Data Mining)

  • 전승표;정재웅;최산
    • 기술혁신학회지
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    • 제19권3호
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    • pp.511-544
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    • 2016
  • 표준은 호환성 증진, 품질확보 및 안정성 증진, 정보제공 등의 긍정적인 기능과 함께 기술혁신을 유발하는 것으로 알려져 있다. 표준의 순기능이 어떤 특정 기업 집단의 기술혁신 활동이나 사업화에 영향을 주는지 밝히는 것은 표준관련 정책을 수요 집단에 맞춰 적절하게 기획하고 집행하는 것을 가능하게 한다. 따라서 본 연구는 표준 정책 수립과 집행에서 증거기반 정책이라는 측면에서 기여하고자 중소기업 중에서 연구개발 동기가 표준 대응인 기업과 기술사업화를 위해서 표준제도 도입이 필요한 기업을 프로파일링하여, 이런 특정 기업을 판별할 수 있는 예측모형을 개발하고자 한다. 이를 위해, 본 연구는 의사결정나무 분석을 통해 표준 대응을 위해 연구개발을 하는 중소기업과 기술사업화를 위해 표준 규격이나 기술인증 정책을 필요로 하는 중소기업의 특징을 데이터마이닝을 통해 프로파일링 했다. 또한 판별분석을 활용하여 프로파일링된 두 가지 조건의 기업군을 몇 가지 변수로 판별할 수 있는 예측모형을 제시하였으며 판별식의 활용 가능성도 통계적으로 확인했다. 연구결과에 따르면 표준 및 규제 대응을 위해 연구개발을 수행하는 기업은 R&D기획 소요기간, 표준산업분류, 종업원 수, 기술의 신규성 등의 변수에서 차이가 있는 것으로 나타났다. 기술사업화를 위한 표준정책지원 수요기업의 프로파일링 결과에 따르면 표준산업분류, 주거래처, 연구개발 소요기간, 시험검사 능력 등의 변수에서 차이가 있었다. 본 연구에서 프로파일링 결과와 판별분석을 통해 제시한 모형은 향후 표준관련 정책을 기획하거나 집행할 때 표준지원을 필요로 하는 기업에 대한 객관적인 정보를 제공하여 표준관련 사업 성공률을 제고하는데 기여할 것으로 기대된다.

Organic Acid Profiling Analysis in Culture Media of Lactic Acid Bacteria by Gas Chromatography-Mass Spectrometry

  • Lee, Jae-Yeon;Nguyen, Duc-Toan;Park, Young-Shik;Hwang, Kyo-Yeol;Cho, Yong-Seok;Kang, Kyung-Don;Yoon, Jae-Hwan;Yu, Jun-Dong;Yee, Sung-Tae;Ahn, Young-Hwan;Lee, Gwang;Seong, Su-Il;Paik, Man-Jeong
    • Mass Spectrometry Letters
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    • 제3권3호
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    • pp.74-77
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    • 2012
  • Organic acid (OA) profiling analysis was performed in culture media from Lactobacillus pentosus K34 (L. pentosus K34) and Pediococcus lolli PL24 (P. lolli PL24) by gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) following methoxime/tert-butyldimethylsilyl derivatives. 12 OAs were positively identified in culture media. Most of OA levels from L. pentosus K34 of hetero lactic fermentation were found to be higher when compared with those from P. lolli PL24 of homo lactic fermentation, which may explain different OA metabolism in each strain. In addition, the distorted dodecagonal star patterns were readily distinguishable, and the characteristics of each strain were well represented. The present study demonstrates that the OA metabolic profiling method by GC-MS combined with star pattern recognition is useful for the monitoring study of characteristic OA metabolism in various microorganisms.

불법복제물 고속검색 및 Heavy Uploader 프로파일링 분석기술 연구 (High-Speed Search for Pirated Content and Research on Heavy Uploader Profiling Analysis Technology)

  • 황찬웅;김진강;이용수;김형래;이태진
    • 정보보호학회논문지
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    • 제30권6호
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    • pp.1067-1078
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    • 2020
  • 인터넷 기술의 발달함에 따라 많은 콘텐츠가 생산되고 그 수요가 증가하고 있다. 이에 따라 유통되고 있는 콘텐츠 수가 증가하였고, 반면에 저작권을 침해하는 불법복제물을 유포하는 건수도 증가하고 있다. 한국저작권보호원은 문자열 매칭 기반 불법복제물 추적관리시스템을 운영하고 있으며, 이를 우회하기 위해 다수의 노이즈를 삽입하므로 정확한 검색이 어려운 현실이다. 최근, 노이즈를 제거하기 위한 자연어 처리, AI 딥러닝 기술을 이용한 연구와 저작권 보호를 위한 다양한 블록체인 기술이 연구되어 있으나 한계가 있다. 본 논문에서는 온라인에서 수집한 데이터에 노이즈를 제거하고, 키워드 기반 불법복제물을 검색한다. 또한, heavy uploader 대상 프로파일링 분석을 통해 동일 heavy uploader를 추정해 간다. 향후, 불법복제물 검색기술과 heavy uploader 대상 프로파일링 분석 결과를 바탕으로 차단 및 대응기술이 결합하면 저작권 피해를 최소화할 것으로 기대한다.

비접촉 변위센서를 이용한 초소형렌즈 정밀금형 형상측정 (Precision Surface Profiling of Lens Molds using a Non-contact Displacement Sensor)

  • 강승훈;장대윤;이주형
    • 한국기계가공학회지
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    • 제19권2호
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    • pp.69-74
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    • 2020
  • In this study, we proposed a method for surface profiling aspheric lens molds using a precision displacement sensor with a spatial scanning mechanism. The precision displacement sensor is based on the confocal principle using a broadband light source, providing a 10 nm resolution over a 0.3 mm measurable range. The precision of the sensor, depending on surface slope, was evaluated via Allan deviation analysis. We then developed an automatic surface profiling system by measuring the cross-sectional profile of a lens mold. The precision of the sensor at the flat surface was 10 nm at 10 ms averaging time, while 200 ms averaging time was needed for identical precision at the steepest slope at 25 deg. When we compared the measurement result of the lens mold to a commercial surface profiler, we found that the accuracy of the developed system was less than 90 nm (in terms of 3 sigmas of error) between the two results.

Recent advances in deep learning-based side-channel analysis

  • Jin, Sunghyun;Kim, Suhri;Kim, HeeSeok;Hong, Seokhie
    • ETRI Journal
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    • 제42권2호
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    • pp.292-304
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    • 2020
  • As side-channel analysis and machine learning algorithms share the same objective of classifying data, numerous studies have been proposed for adapting machine learning to side-channel analysis. However, a drawback of machine learning algorithms is that their performance depends on human engineering. Therefore, recent studies in the field focus on exploiting deep learning algorithms, which can extract features automatically from data. In this study, we survey recent advances in deep learning-based side-channel analysis. In particular, we outline how deep learning is applied to side-channel analysis, based on deep learning architectures and application methods. Furthermore, we describe its properties when using different architectures and application methods. Finally, we discuss our perspective on future research directions in this field.

Genomic approaches for the understanding of aging in model organisms

  • Park, Sang-Kyu
    • BMB Reports
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    • 제44권5호
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    • pp.291-297
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    • 2011
  • Aging is one of the most complicated biological processes in all species. A number of different model organisms from yeast to monkeys have been studied to understand the aging process. Until recently, many different age-related genes and age-regulating cellular pathways, such as insulin/IGF-1-like signal, mitochondrial dysfunction, Sir2 pathway, have been identified through classical genetic studies. Parallel to genetic approaches, genome-wide approaches have provided valuable insights for the understanding of molecular mechanisms occurring during aging. Gene expression profiling analysis can measure the transcriptional alteration of multiple genes in a genome simultaneously and is widely used to elucidate the mechanisms of complex biological pathways. Here, current global gene expression profiling studies on normal aging and age-related genetic/environmental interventions in widely-used model organisms are briefly reviewed.

Insights into the signal transduction pathways of mouse lung type II cells revealed by transcription factor profiling in the transcriptome

  • Ramana, Chilakamarti V.
    • Genomics & Informatics
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    • 제17권1호
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    • pp.8.1-8.10
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    • 2019
  • Alveolar type II cells constitute a small fraction of the total lung cell mass. However, they play an important role in many cellular processes including trans-differentiation into type I cells as well as repair of lung injury in response to toxic chemicals and respiratory pathogens. Transcription factors are the regulatory proteins dynamically modulating DNA structure and gene expression. Transcription factor profiling in microarray datasets revealed that several members of AP1, ATF, $NF-{\kappa}B$, and C/EBP families involved in diverse responses were expressed in mouse lung type II cells. A transcriptional factor signature consisting of Cebpa, Srebf1, Stat3, Klf5, and Elf3 was identified in lung type II cells, Sox9+ pluripotent lung stem cells as well as in mouse lung development. Identification of the transcription factor profile in mouse lung type II cells will serve as a useful resource and facilitate the integrated analysis of signal transduction pathways and specific gene targets in a variety of physiological conditions.