• 제목/요약/키워드: Pattern identification

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PAH를 분해할 수 있는 Pseudomonas rhodesiae KK1의 SOD 유전자의 동정 및 분자학적 특성 분석 (Identification and Molecular Characterization of Superoxide Dismutase Genes in Pseudomonas rhodesiae KK1 Capable of Polycyclic Aromatic Hydrocarbon Degradation)

  • 이동헌;오계헌;김승일;강형일
    • 생명과학회지
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    • 제26권1호
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    • pp.75-82
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    • 2016
  • Pseudomonas rhodesiae KK1은 이미 주요한 환경오염물질인 anthracene, naphthalene, phenanthrene과 같은 다환성 방향족 화합물(PAHs)을 분해할 수 있음을 보고한 바 있다. 흥미롭게도, superoxide dismutase를 비롯한 항산화 유전자는 환경오염물질에 반응하여 다른 수준으로 발현됨이 알려져 있다. 본 연구는 균주 KK1에서 PAHs 분해에 간접적으로 관계될 것으로 여겨지는 superoxide dismutase 유전자의 존재를 동정하고 세 가지 PAHs를 기질로 하여 생장한 세포에서 superoxide dismutase 유전자의 발현 양상을 조사하고자 수행하였다. P. rhodesiae KK1에서 항산화 기작에 관여하는 두 가지지 형의 superoxide dismutase인 Mn-superoxide dismutase (sodA)와 Fe-superoxide dismutase (sodB) 유전자를 동정하고 그 특성을 규명하였다. 균주 KK1에서 발견된 sodA 유전자는 141개의 아미노산 유전자를 기준으로 P. fluorescens Pf-5의 Mn-sod와 95%, sodB 유전자는 135개 아미노산을 기준으로 P. fluorescens Pf-5의 Fe-sod와 99%의 가장 높은 상동성을 나타내었다. sod 유전자 단편을 탐침자로 사용한 Southern 혼성화 반응 결과 적어도 두 개 이상의 superoxide dismutase 유전자가 균주 KK1에 존재함을 규명하였다. RT-PCR 분석을 통해 sodA 및 sodB 유전자들은 anthracene보다 naphthalene과 phenanthrene에 반응하여 더 강하게 발현함을 보여주었다. 포도당과 PAHs를 기질로 사용하여 생장한 세포에서 sodA와 sodB 유전자는 활성 상태로 존재함이 밝혀졌다.

염도의 변화에 따른 미생물 군집의 변화: 경북 형산강 하류 미생물 군집 변화의 DGGE pattern 분석 (Bacterial Community Structure Shift Driven by Salinity: Analysis of DGGE Band Patterns from Freshwater to Seawater of Hyeongsan River, Korea)

  • 백보람;;황철원;도형기
    • 생명과학회지
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    • 제23권3호
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    • pp.406-414
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    • 2013
  • 강의 하류지역에서 미생물의 군집이 점진적인 염도의 증가에 따라 변한다는 것을 실험적으로 보기 위하여, 경북 형산강의 하류에서부터 연안해역으로 유입되는 곳까지 약 2.91 km 간격으로 0.02%, 1.48%, 2.63%, 3.62%의 염분을 포함하는 물 시료를 얻어 denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE)를 수행하였다. 계통분석, 계통수 및 각 시료간의 연관성을 조사한 결과, 미생물 군집의 변화가 염분의 증가에 따라 점진적으로 변화하는 것을 확인하였으며, 이는 염분의 농도가 미생물 군집에 큰 영향을 미치는 요소임을 제시한다. 덧붙여 연안 지역이나 다른 수계환경에 비해 하류지역은 염분의 점진적인 변화로 인해 좁은 면적에 비하여 미생물 다양성이 크고, 이는 곧 특이하고 새로운 종을 찾기에 좋은 장소임을 시사하였다.

어버이살이 (Parenthood)

  • 조두영
    • 정신신체의학
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    • 제5권1호
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    • pp.3-11
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    • 1997
  • In becoming parents, the marital partners enter into a new developmental phase. The conception of the child is an act of mutual creativity during which the boundaries between the self and another were temporarily obliterated more completely than at any time since infancy. The infant is a physical fusion of the parents, and their personalities unite within the child. for many women, creativity as a mother becomes a central matter that provides meaning and balance to their lives. The husband usually has strong desires for an offspring and can be transformed by it. The child can profoundly affect one or both parents, and the influences are reciprocal-a child's needs or specific difficulties uncover a parent's inadequacy. following the child's development, each transition into a new developmental phase requires an adaptation by the parents, and one or another of these required adaptations may disturb a parent's equilibirium. And the personality changes, emotional difficulties, and regressions of a spouse that occur in response to some phase of parenthood can upset the marriage. Not only do children identify with parents, but parents also identify with their children. The parents take pleasure in child's joy and suffer with the child's pain more than in almost any other relationship. certain respects e parents lives again in the child. Through the process of identification the child can also provide one of the two parents with the opportunity to experience intimately the way in which a person of the opposite gender grows up. Parenthood also provides the opportunity to be loved, admired, and needed simply because one is a parent and, as such, a central and necessary object in the young child's life. The many potentialities for emotional satisfactions from parenthood manage to outweigh the tribulations and sacrifices that are required. The child also exerts an indirect effect through changing the parent's position in the society, for new sets of relationships are established as the parents are drawn to other couples with children of the same age, and for a new impetus toward economic and social mobility often possesses the parents. frequently the couple's relatedness to their own parents improves and grows firmer once again. Parenthood, the satisfactions it provides and the demands it makes, varies as life progresses : and changes with the parent's interests, needs, and age as well as with the children's maturation. There are phases in the child's life that the parents are reluctant to have pass, whereas they tolerate others largely through knowing that they will soon be over. The changing lives of the children provide many satisfactions that offset the tribulations, uncertainties, and regrets. The parents change. The young father, who was just starting on his carrier whom the first child was born, settles into a life pattern. He becomes secure with increasing achievement and interacts differently with the youngest child and provides a different model for him than for the oldest. The mother may have less time for a second or third child than for her first, but she may also be more assured in her handling of them. The birth of a baby when the parents art in their late thirties will find them Less capable of physical exertion with the child and less tolerant of annoyances, but they are less apt to be annoyed. Eventually the children min and leave home, but the couple do not cease to be parents.

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형광분석을 이용한 지문방식의 해수중 유기인의 분석 방법 (Development of Analytical Method of Organophosphates in Sea water by Finger Printing Fluorescence Spectroscopy)

  • 박미옥
    • 한국수산과학회지
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    • 제30권3호
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    • pp.377-387
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    • 1997
  • 해수로 유출되고 있는 유기인제 살충, 살균제의 형광 분석법에 의한 finger print식 분석 방법을 개발하기 위해, 벼 농사에 가장 많이 사용되어지는 Hinosan과 Kitazin을 포함하는 10가지의 표준 용액을 조제하여, 형광 특성을 측정하였다. $220nm\~520nm$ 구간의 흡수 파장을 이용하여, 여기 (excitation)시켜 얻은 형광스펙트럼들을 이차원 평면 위의 형광세기 표시를 등고선 모양으로 표시하였다. 이 contour들은 각 조사된 유기인제에 대해 특징적인 형태로 관찰되었다. 조사된 10가지의 유기인제 농약의 형광 contour들은, 봉우리가 한 개로 된 DDVP를 포함한 8가지의 유기인제와 두 개의 봉우리로 나타난 Ateric을 포함한 두 가지의 유기인제 농약으로 나뉘어진다. 또한 최대 흡수파장의 영역별로 보면, 단일한 봉우리를 보이는 많은 유기인제는 약 280nm에, Ateric을 포함한 두 종류의 유기인제는 260nm에서, 그리고 장파장에서 최대 형광파장을 보여준 Monopho, Thaconyl의 최대 흡수파장은 비교적 장파장쪽으로 치우친 300nm와 340nm인, 다른 유기인제의 최대 형광파장과 서로 겹치지 않는 영역에서 나타났다. 그러나, 280nm에서 최대 흡수파장을 나타내는 유기인제 중에 Kitazin, Locsion, Meta는 약 2nm이하의 근소한 차이를 두고 최대 형광세기를 308nm주변에서 나타내었다. 이러한 그룹의 분별을 위해, HPLC-형광 자료를 이용하면 용리시간 차이에 의한 분리와 identification이 가능했다. 형광 contour가 매우 유사한 Kitazin, Locsion과 Meta를 비교하면, Kitazin은 $16\~20$분 대에 나타나는 peak들이 매우 미약할 뿐 아니라, 용리시간 9.6분에 나타난 현저한 단일 peak가 다른 형광 특성이 비슷한 유기인제인 Locsion이나 Meta와의 구분이 용이하게 해 준다. 그러나, Locsion과 Meta는 chromatogram의 용리시간이나, 세부적인 작은 peak 특징은 다르나, 그 pattern이 유사하여, 분석상 불확실성이 내재될 가능성이 있다.

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RAPD기법을 이용한 갈파래목 해조류의 유전 변이 분석 (RAPD Identification of Genetic Variation in Ulvales Seaweed)

  • 조용철;박지원;진형주;남보혜;손철현;홍용기
    • 한국수산과학회지
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    • 제30권3호
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    • pp.388-392
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    • 1997
  • 해조류중 우리나라 전연안에 가장 흔히 분포하는 갈파래목 녹조류인 참홑파래와 구멍갈파래, 참갈파래, 잎파래, 실파래, 가시파래등을 대상으로 RAPD방법을 이용한 각 지역 개체간의 유전적 유사도를 조사하였다. Total DNA는 엽체로부터 LiCl를 사용한 DNA추출방법으로 분리하였으며, 추출된 DNA는 $3ng/{\mu}\ell$되게 희석한후 in vitro에서 arbitrary primer와 함께 45회 PCR amplification시켰다. 그 결과 34종류 primer들로부터 240bp에서 1.5kb의 다양한 크기로 증폭된 1227개의 전기영동상의 band를 볼 수 있었으며, Jaccard공식에 따라 그 유사도를 구하였다. 파래목의 유전적 유사도는 $7\%$에서 $36\%$범위의 유사도를 보였다. 그중 참흩파래가 다른 갈파래과들로부터 가장 낮은 유사도값을 보여주었으며, 또한 primer OPB-01 (CATCCCCCTG)을 사용하였을때 갈파래과에서 공통적인 630bp크기의 생성물을 생산하지않는 특징을 나타내었다.

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Arthrobacter luteus로부터 유래한 염기성 AL-Protease의 효소학적 성질 및 활성 아미노산 잔기의 검색 (Enzymological Properties of the Alkaline AL-Protease from Arthrobacter luteus and Detection of Its Active Amino Acid Residue)

  • 오홍록;상원태생;반진승
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제13권2호
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    • pp.193-204
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    • 1984
  • Zymolyase 조효소로부터 분리, 정제되었고, 효모세포벽 용해 촉진물질로 밝혀진 바 있는 Arthrobacter luteus로부터 유래한 염기성 protease(AL-protease)의 효소학적 성질 및 활성 아미노산 잔기를 검색한 결과는 다음과 같다. 1. AL-pretense는 저해제 DFP 및 PMSF에 의해서 그 Protease 활성 및 용해 촉진활성이 동시에 완전히 소멸 되었으며, 그 저해 반응속도는 chymotrypsin에 대한 것에 비하여 대단히 완만하였다. 1.반응에서 AL-protease와 DFP의 결합 mole비는 1:1로 추정 되었다. 2. 정제된 AL-protease의 동결건조품 중에는 종래효모세포벽 용해반응에 관여하는 것으로 알려진 yeast phosphomannase를 비롯한 다당류 가수분해효소들의 활성은 그 어느 것도 인정되지 않았다. 3. AL-protease의 casein에 대한 최적 pH 및 최적 온도는 pH 10.5와 $65^{\circ}C$이었고, 그 활성은 pH 5${\sim}$11 사이와 $65^{\circ}C$이하에서 안정하였다. 또한, AL-Protease의 활성에 미치는 여러가지 금속이온의 영향은 인정되지 않았다. 4. [$^{32}P$]-DFP에 의하여 화학수식된 [$^{32}P$]-DIP-AL-protease에 대한 활성부위의 아미노산 잔기를 검색, 동정하기 위하여 조제용 PAG-전기영동, SDS-PAG-전기영동, Dowex 이온교환 크로마토그래피 및 고압 여지 전기영동을 실시하였고, 그 결과, AL-protease는 활성 부위에 1분자당 1 mole의 serine 잔기를 가지는 염기성 protease로 밝혀졌다.

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HTTP 응용들의 식별을 위한 패턴 기반의 시그니쳐 생성 (Pattern-based Signature Generation for Identification of HTTP Applications)

  • 진창규;최미정
    • 정보화연구
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    • 제10권1호
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    • pp.101-111
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    • 2013
  • 오늘날 인터넷의 발달과 더불어 다양한 스마트 기기들의 증가로 인하여 많은 양의 트래픽이 발생하고 있다. 특히 기존의 데스크탑 이외의 다양한 모바일 기기와 스마트 디바이스에서는 HTTP 기반의 응용 트래픽이 많이 증가하고 있다. 이렇게 증가하는 모바일 트래픽은 인터넷에 망 과부하, 웹보안과 같은 다양한 문제들을 발생시키고 있다. 인터넷 망의 과부하 및 보안 문제를 해결하기 위해서는 우선적으로 응용의 정확한 탐지가 필요하다. 이를 위하여 전통적으로는 잘 알려진 포트 기반의 분석 방법이 사용되었다. 그러나 과도한 트래픽을 발생시켜 방화벽이나 IDS 장비에서 포트를 제한한 P2P 응용 프로그램들이 포트를 변경하여 사용하기 때문에 포트 기반의 분석은 정확성이 떨어진다. 이를 보안하기 위하여 제안된 시그니쳐 기반의 분석 방법의 경우 잘 알려진 포트 기반 분석 방법에 비해 비교적 높은 분석률과 정확성을 가지지만 분석에 필요한 시그니쳐를 생성해야 하는 오버헤드를 가지고 있다. 또한 기존의 시그니쳐에 생성에 관한 연구는 각각의 응용에 대해 분류하고 분석하지만 HTTP를 이용하는 트래픽에 대해서는 프로토콜 레벨의 분석만 가능할 뿐 HTTP를 전송 프로토콜로 사용하는 응용 프로그램의 분류와 같은 깊이 있는 분석이 이루어지지 않고 있다. 본 논문에서는 HTTP 헤더의 반정형적인 특성을 바탕으로 HTTP 기반 응용을 정확히 탐지하기 위한 시그니쳐 생성 방법에 대하여 제시하고 있다. 이를 학내망 트래픽에 실제 적용함으로써 본 논문의 타당성을 보인다.

Identification of marbling-related candidate genes in M. longissimus dorsi of high- and low marbled Hanwoo (Korean Native Cattle) steers

  • Lee, Seung-Hwan;Cho, Yong-Min;Lee, Sang-Hong;Kim, Bum-Soo;Kim, Nam-Kuk;Choy, Yeon-Ho;Kim, Kyoung-Hoon;Yoon, Du-Hak;Im, Seok-Ki;Oh, Sung-Jong;Park, Eung-Woo
    • BMB Reports
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    • 제41권12호
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    • pp.846-851
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    • 2008
  • This study was conducted to identify marbling-related candidate genes in M. longissimus dorsi of high- and low-marbled Hanwoo. The longissimus dorsi muscles were selected for gene expression from eight Hanwoo steer carcasses based on crude fat content. In the analysis of variance, gene expression of five candidate genes, FABP4, SCD, $PPAR\gamma$, Titin and Nebulin was determined to be significantly different between high- and low-marbled Hanwoo steers (P < 0.0001). The Pik-4 and CaMK II genes were also shown to have a significant effect on crude fat content (P < 0.01). In the analysis of the differential expression between high- and low marbled groups, FABP4 gene expression was approximately 2 times higher in the high marbled group relative to the low marbled group. However, the $PPAR\gamma$ and SCD gene were highly expressed in the low marbled group. In addition, Titin and Nebulin were highly expressed in the low marbled group when placed under relatively high shear force. Finally, the Pik-4 and CaM K II gene also displayed a high expression pattern in the low marbled group.

Identification of Three Types of Voltage Dependent $Ca^{2+}$-Channels in Mouse Follicular Oocytes

  • Bae, In-Ha;Yoon, Sook-Young;Yoon, Yong-Dal;Kim, Moon-Kyoo;Kim, Hae-Kwon
    • Animal cells and systems
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    • 제3권1호
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    • pp.53-58
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    • 1999
  • The immunocytochemical method was used to identify the existence of voltage-dependent $Ca^{2+}$-channels in mouse follicular oocytes. Three types of voltage-dependent $Ca^{2+}$-channels were shown to exist in the follicular oocytes for the first time, the P/Q-type $Ca^{2+}$-channel, the N-type $Ca^{2+}$-channel, and the L-type $Ca^{2+}$-channel. Among proven $Ca^{2+}$-channels distributions of the P/Q-type $Ca^{2+}$-channel and L-type $Ca^{2+}$-channel showed localized staining (clustered pattern) on the oolemma. The distribution of the P/Q-type $Ca^{2+}$-channel showed all localized staining, and the range of localized staining was from 1 to 8 in staining intensity. As the staining intensity increased from 1 to 8, the number of localized staining decreased. The L-type $Ca^{2+}$-channel are homogeneously stained (29.4%-54.2%), while some of them (around 28.7%-44.1%) showed localized staining on the oolemma. However, the rest of them showed no staining at all (17.1%- 26.5%). On the contrary, the N-type $Ca^{2+}$-channel showed mostly homogeneous staining, while nonstaining oocytes were around 33.8%. The rest showed localized staining (10%). However, staining intensity was much weaker than those of the P/Q-type and L-type $Ca^{2+}$-channel. In fact, the N-type $Ca^{2+}$-channel has been known to exist only in neurons (from ectoderm origin), but it is unknown how the N-type $Ca^{2+}$-channel exists in the follicular oocytes (from mesoderm origin). Further studies are needed to examine the expression of $Ca^{2+}$-channels during the developmental stages of the oocytes.

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성인 음주자의 영양소 섭취실태: 2011 국민건강영양조사 자료 분석 (Nutrient Intake Status of Korean Drinkers: Analysis of Data from Korea National Health and Nutrition Examination Survey (KNHANES), 2011)

  • 김형태;천성수;정선희;윤미은
    • 대한영양사협회학술지
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    • 제19권4호
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    • pp.343-355
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    • 2013
  • This study analyzed the dietary habits and nutrient intake status of adult drinkers in Korea. Alcohol drinking patterns were obtained from the Korea National Health and Nutrition Examination Survey (KNHANES). Among 4,968 persons, 91.5% were drinkers. Classification of their drinking patterns by the Alcohol Use Disorders Identification Test (AUDIT) score showed 64.5% of the drinkers were normal drinkers, 22.4% problem drinkers and 13.2% alcohol-dependent drinkers. Overall, 47% of the drinkers were considered alcohol-dependent in the Rapid Alcohol Problems Screen (RAPS4). Significant differences were found between those who abstained from alcohol (86.8%) and alcohol-dependent drinkers (68.9%); when asked about breakfast habits 73.4% of non-drinkers often had family meals, while only 55.4% of the alcohol-dependent drinkers had family meals. Dietary energy, alcohol energy, and total energy intake significantly increased for the alcohol-dependents (P<0.001). In addition, the intake of eight nutrients (protein, vitamin A, vitamin $B_1$, vitamin $B_2$, niacin, calcium, phosphorous and iron), significantly increased in the following order (least to highest): abstainers, normal drinkers, drinkers with a moderate addiction to alcohol and alcohol-dependent drinkers (P <0.05). Nutrient Adequacy Ratios (NAR) of all nutrients, except vitamin C, and the Mean nutrient Adequacy Ratio (MAR) significantly increased in the following order (least to highest): abstainers, normal drinkers, drinkers with a moderate addiction to alcohol and alcohol-dependent drinkers (P<0.05). The intake of vitamin $B_1$, vitamin $B_2$, and niacin per 1,000 kcal, according to drinking pattern, decreased in the order of abstainers, normal drinkers, drinkers with a moderate addiction to alcohol, and alcohol-dependent drinkers (P<0.001). The above results show that the nutrient intake of normal drinkers, drinkers with a moderate addiction to alcohol, and alcohol-dependent drinkers are higher than abstainers. However, overall intake of vitamin $B_1$, vitamin $B_2$, and niacin per 1,000 kcal was low. Therefore it is necessary to increase vitamin $B_1$, vitamin $B_2$, and niacin intake for drinkers.