• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
• /
• 제30권11호
• /
• pp.1660-1666
• /
• 2017

Objective: Burial is associated with environmental effects such as the contamination of ground or surface water with biological materials generated during the decomposition process. Therefore, bacterial communities in leachates originating from the decomposing bovine carcasses were investigated. Methods: To understand the process of bovine (Hanwoo) carcass decomposition, we simulated burial using a lab-scale reactor with a volume of $5.15m^3$. Leachate samples from 3 carcasses were collected using a peristaltic pump once a month for a period of 5 months, and bacterial communities in samples were identified by pyrosequencing of the 16S rRNA gene. Results: We obtained a total of 110,442 reads from the triplicate samples of various sampling time points (total of 15 samples), and found that the phylum Firmicutes was dominant at most sampling times. Differences in the bacterial communities at the various time points were observed among the triplicate samples. The bacterial communities sampled at 4 months showed the most different compositions. The genera Pseudomonas and Psychrobacter in the phylum Proteobacteria were dominant in all of the samples obtained after 3 months. Bacillaceae, Clostridium, and Clostridiales were found to be predominant after 4 months in the leachate from one carcass, whereas Planococcaceae was found to be a dominant in samples obtained at the first and second months from the other two carcasses. The results showed that potentially pathogenic microbes such as Clostridium derived from bovine leachate could dominate the soil environment of a burial site. Conclusion: Our results indicated that the composition of bacterial communities in leachates of a decomposing bovine shifted continuously during the experimental period, with significant changes detected after 4 months of burial.

• 식물병연구
• /
• 제30권2호
• /
• pp.148-156
• /
• 2024

Ralstonia pseudosolanacearum은 토양과 물에서 오랫동안 생존하고, 가지과 작물에 심각한 풋마름병을 일으키는 식물병원세균이다. Simga S는 세균의 스트레스 환경에서 반응 또는 정지기 동안 유전자 발현을 조절하는 RNA 중합효소 복합체의 일부인 단백질이다. 본 연구는 스트레스 조건에서 R.pseudosolanacearum의 sigma S의 역할을 조사하기 위해서, R.pseudosolanacearum의 GMI1000 균주의 sigma S를 암호화하는 rpoS 유전자 변이체를 준비하여 야생형 균주와 세균의 특징을 비교하였다. 아울러 rpoS 유전자 역할은 원래 유전자를 변이체에 도입하여 rpoS 유전자 표현형 회복을 확인하였다. 야생형 균주와 rpoS 결여 변이체는 생장 속도, 외피다당류 생산, 식물체에서 병원성, 식물 세포벽 분해 효소 활성에서 차이를 보이지 않았다. 그러나 야생형 균주는 영양분결핍 조건에서 변이체보다 더 민감하게 반응하였고 과산화수소가 첨가된 조건에서 변이체보다 덜 민감하게 반응하였다. 흥미롭게도 영양분결핍 조건에서 rpoS 결여 변이체에서는 장기간 생균수를 유지하지만, 같은 조건에서 야생형 균주 생균수는 빠르게 감소하였다. 그리고 두 균주 배양액 pH를 측정한 결과, 야생형 균주와 변이체 간에 상당한 차이가 나타났다. 야생형 균주는 생장하면서 빠르게 배지의 pH가 감소하여 산성화되었다. 그러므로 야생형 균주의 빠른 사멸은 배지가 산성화되면서 정지기 상태 세균의 산성 pH에 대한 민감도 때문일 것이다. Biolog 분석으로 rpoS 변이체는 acetic acid, D-alanine, D-trehalose, L-histidine을 이용하지 못함을 확인하였다. 본 연구 결과는 R. pseudosolanacearum 세균의 sigma S가 영양분결핍 조건에서 정지기 동안 유기산 생산 또는 이용을 조절하며 정지기 세포사멸도 조절하는 것을 보여준다.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
• /
• 제9권1호
• /
• pp.1-13
• /
• 2006

목 적: 소아의 급성 위장관염은 매우 흔하고 입원율이 높은 중요한 질환이다. 본 연구에서는 지역 사회에서 소아의 급성 위장관염을 일으키는 대표적인 바이러스 및 세균을 대상으로 1년간 발생 경향에 대한 최근 자료를 제시하고자 하였다. 방 법: 서울대학교 보라매병원 소아과에 3일 이내의 급성 설사를 주소로 내원한 15세 미만의 소아를 대상으로 임상 검사 및 대변 검사를 시행하였다. 입원 소아는 2003년 4월부터 2004년 3월까지 1년간, 외래 소아는 2003년 4월부터 7월까지 단일 외래를 방문한 환아들에 국한하여 연구하였다. 방문 2일 이내에 대변 검체를 얻었으며 바이러스성 원인균 검사로는 로타바이러스, 장 아데노바이러스 항원 검출법을, 세균성 원인균 검사로는 Salmonella, Shigella, Vibrio, Campylobacter 균종 및 Yersinia enterocolitica 대해 배양검사를 시행하였고 병원성 E.coli (ETEC, EHEC, EPEC) 검출을 위해서는 PCR 법을 이용하였다. 입원 환아들은 전해질 검사를 포함한 혈액 검사를 같이 시행받았다. 결 과: 전체 입원 환아는 130명, 외래 환아는 28명이 대상에 포함되었으며, 6세 미만의 환아가 각각 94.6% (123명), 92.8% (26명)로 대부분을 차지하였다. 모두 단일 원인균이 분리되었으며 그 중 로타바이러스가 가장 흔한 원인균으로 입원 환아의 42.3% (55명)에서, 외래 환아의 29.6% (8명)에서 검출되었다. 대변 배양 검사에서는 비장티푸스성 살모넬라균이 입원 환아의 3.9% (4명), 외래 환아의 3.6% (1명)에서 배양되었다. 병원성 대장균은 입원 환아의 2.1% (2명/97명), 외래 환아의 25.0% (3명/12명)에서 분리되었으며 EPEC (4명), ETEC (1명) 순이었고 EHEC는 분리되지 않았다. 이외에 장 아데노바이러스와 Campylobacter, Yersinia, Shigella 균종은 한 예도 없었다. 결 론: 로타바이러스는 국내 지역 사회 병원에서 소아기 위장관염으로 입원하게 되는 가장 흔한 원인균이며 세균성 장염의 원인균으로는 비장티푸스성 살모넬라와 병원성 대장균, 특히 EPEC와 ETEC가 중요하다. Campylobacter 균종은 급성 설사로 입원하게 되는 환아에서는 흔하게 분리되지 않는 것으로 보여지나 외래 환아를 다수 포함한 대단위의 연구가 더 필요하리라 생각된다.

• 농약과학회지
• /
• 제13권3호
• /
• pp.185-189
• /
• 2009

모노터핀의 일종인 벤질리덴아세톤은 곤충병원세균인 Xenorhabdus nematophila의 대사산물이다. 이 물질의 주요 생물활성은 인지질 분해효소인 phospholipase $A_2$를 억제하는 것이다. 이 효소는 아이코사노이드 생합성 반응의 최초 결정단계를 촉매하는 것으로 이 아이코사노이드는 곤충의 면역 반응을 중개하는데 중요하다. 본 연구는 벤질리덴아세톤을 점박이응애(Tetranychus urticae)에 처리하였고, 이 물질의 농도 증가에 따라 응애의 치사율이 높아지는 실내 생물검정 결과를 얻었다. 이에 따라 야외 사과원에 피해를 주는 점박이응애 집단에 처리한 결과 현재 상용화하고 있는 살비제와 비교하여 같은 수준의 살비효과를 나타냈다. 벤질리덴아세톤은 또한 3종의 식물병원세균 배양액에 첨가한 경우 이들 세균의 성장을 억제하였다. 특히 세균성풋마름병을 일으키는 Ralstonia solanacearum에 대해서 현격한 억제효과가 나타났다. 이 세균 균주는 어린 감자묘에 병원성을 나타냈으며, 벤질리덴아세톤은 이 병 발생을 억제시켰다. 이 연구결과는 벤질리덴아세톤이 응애와 식물병 세균을 방제하는 데 새로운 작물보호제로서 개발될 수 있다고 제시한다.

• 한국축산식품학회지
• /
• 제26권3호
• /
• pp.402-409
• /
• 2006

Although microorganisms are, in fact, the most diverse and abundant type of organism on Earth, the ecological functions of microbial populations remains poorly understood. A variety of bacteria including marine Vibrios encounter numerous ecological challenges, such as UV light, predation, competition, and seasonal variations in seawater including pH, salinity, nutrient levels, temperature and so forth. In order to survive and proliferate under variable conditions, they have to develop elaborate means of communication to meet the challenges to which they are exposed. In bacteria, a range of biological functions have recently been found to be regulated by a population density-dependent cell-cell signaling mechanism known as quorum-sensing (QS). In other words, bacterial cells sense population density by monitoring the presence of self-produced extracellular autoinducers (AI). N-acylhomoserine lactone (AHL)-dependent quorum-sensing was first discovered in two luminescent marine bacteria, Vibrio fischeri and Vibrio harveyi. The LuxI/R system of V. fischeriis the paradigm of Gram-negative quorum-sensing systems. At high population density, the accumulated signalstrigger the expression of target genes and thereby initiate a new set of biological activities. Several QS systems have been identified so far. Among them, an AHL-dependent QS system has been found to control biofilm formation in several bacterial species, including Pseudomonas aeruginosa, Aeromonas hydrophila, Burkholderia cepacia, and Serratia liquefaciens. Bacterial biofilm is a structured community of bacterial cells enclosed in a self-produced polymeric matrix that adheres to an inert or living surface. Extracellular signal molecules have been implicated in biofilm formation. Agrobacterium tumefaciens strain NT1(traR, tra::lacZ749) and Chromobacterium violaceum strain CV026 are used as biosensors to detect AHL signals. Quorum sensing in lactic acid bacteria involves peptides that are directly sensed by membrane-located histidine kinases, after which the signal is transmitted to an intracellular regulator. In the nisin autoregulation process in Lactococcus lactis, the NisK protein acts as the sensor for nisin, and NisR protein as the response regulator activatingthe transcription of target genes. For control over growth and survival in bacterial communities, various strategies need to be developed by which receptors of the signal molecules are interfered with or the synthesis and release of the molecules is controlled. However, much is still unknown about the metabolic processes involved in such signal transduction and whether or not various foods and food ingredients may affect communication between spoilage or pathogenic bacteria. In five to ten years, we will be able to discover new signal molecules, some of which may have applications in food preservation to inhibit the growth of pathogens on foods.

• 한국미생물·생명공학회지
• /
• 제43권3호
• /
• pp.187-194
• /
• 2015

인간의 위장관은 매우 복잡한 장내균총으로 이루어져 있으며, 장내균총은 인간의 생리 기능에 있어 매우 중요한 역할을 담당하고 있다. 특히 유아기의 장내균총의 불균형은 면역연관 질병을 일으키는 요인이며 치료 목적으로 probiotics가 유용하게 활용되고 있다. Probiotics의 대표 균종은 L. plantarum으로서 영유아기에 병원균보다 가장 먼저 정착해야 면역 질환을 예방할 수 있다. 그러나 아직 Lactobacillus가 장의 우점종으로 정착하기 위한 환경적 요인과 항생물질분비 조절에 대한 이해는 부족한 실정이다.

• The Plant Pathology Journal
• /
• 제16권4호
• /
• pp.236-241
• /
• 2000

A selective agar medium was developed and tested for the isolation of Acidovorax avenae subsp. avenae, the causal bacterial pathogen of bacterial brown stripe, from rice seeds. The new selective agar medium, designated sorbitol pyroglutamic acid agar (SPA) medium, contained 0.5 g of $K_2$HPO$_4$, 3.0 g of Na$_2$HPO$_4$, 2.0 g of D-sorbitol, 0.2 g of L-pyroglutamic acid, 10.0 $m\ell$ of tween 80, 40.0 mg of victoria blue B, 15.0 g of agar, 150.0 mg of ampicillin and 25.0 mg of vancomycin per litter. Colonies of A. avenae subsp. avenae on SPA medium were smooth, round, convex, shiny, blue and 1.5-2.0 mm in diameter 4 days after incubation at 28$^{\circ}C$. Blue colored colony having dark blue zone was typical type of A. avenae subsp. avenae colonies on the medium. Mean recovery of 8 isolates of A. avenae subsp. avenae on the selective SPA medium was 95.8% in comparison to that on KB medium. The saprophytic bacteria were reduced to 97.9% on SPA medium compared to those on KB medium. Most of other rice seedborne bacteria as well as reported pathogenic bacteria were failed to grow on SPA medium. This medium was highly selective for recovering A. avenae subsp. avenae from rice seed samples, and it could be used to enhance the recovery of this bacterium from rice seed samples, which may be contaminated with large numbers of competing microorganisms.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제24권6호
• /
• pp.803-811
• /
• 2014

Concerns over drug-resistant bacteria have stimulated interest in developing alternative methods to control bacterial infections. Endolysin, a phage-encoded enzyme that breaks down bacterial peptidoglycan at the terminal stage of the phage reproduction cycle, is reported to be effective for the control of bacterial pathogenic bacteria. Bioinformatic analysis of the SPN9CC bacteriophage genome revealed a gene that encodes an endolysin with a domain structure similar to those of the endolysins produced by the P1 and P22 coliphages. The SPN9CC endolysin was purified with a C-terminal oligo-histidine tag. The endolysin was relatively stable and active over a broad temperature range (from $24^{\circ}C$ to $65^{\circ}C$). It showed maximal activity at $50^{\circ}C$, and its optimum pH range was from pH 7.5 to 8.5. The SPN9CC endolysin showed antimicrobial activity against only gram-negative bacteria and functioned by cutting the glycosidic bond of peptidoglycan. Interestingly, the SPN9CC endolysin could lyse intact gram-negative bacteria in the absence of EDTA as an outer membrane permeabilizer. The exogenous lytic activity of the SPN9CC endolysin makes it a potential therapeutic agent against gram-negative bacteria.

• 한국콘텐츠학회:학술대회논문집
• /
• 한국콘텐츠학회 2009년도 춘계 종합학술대회 논문집
• /
• pp.1150-1158
• /
• 2009

현재 영상의학과에서 사용되는 촬영장비는 질환을 가지고 있는 환자와의 접촉이 불가피 하기 때문에 병원균이 존재 할 수밖에 없다. 따라서 영상의학과 촬영실에서의 세균 오염도를 측정하고, 검출된 세균들을 소독(물, Tissue Cleaner, 70% 알코올)하여 소독 전 후 세균의 감소율을 비교함으로써 병원감염예방에 있어 소독제 사용의 중요성과 병원감염관리의 인식을 높이고자 한다. 영상의학과 촬영실에서의 세균 오염도를 측정 하였을 때 여러 가지 세균들이 검출되었다. 영상의학과 촬영실내를 소독할 때 물이나 Tissue Cleaner, 환기 보다는 70% Alcohol을 사용하여 소독을 실시하는 것이 세균 사멸 및 병원감염 예방부분에 있어 효과적임을 알 수 있었다. 따라서 세균을 사멸시키기 위해 보다 좋은 소독제를 개발하여야 하며, 병원 내 각종 의료 장비는 언제나 오염될 가능성이 있으므로 기구에 대한 소독 및 멸균을 실시하여 병원감염으로 인해 환자에게 2차 감염을 유발되지 않도록 노력해야 할 것이다.

• Parasites, Hosts and Diseases
• /
• 제49권4호
• /
• pp.349-356
• /
• 2011

The existence of symbiotic relationships between Acanthamoeba and a variety of bacteria is well-documented. However, the ability of Acanthamoeba interacting with host bacterial pathogens has gained particular attention. Here, to understand the interactions of Escherichia coli K1 and E. coli K5 strains with Acanthamoeba castellanii trophozoites and cysts, association assay, invasion assay, survival assay, and the measurement of bacterial numbers from cysts were performed, and nonpathogenic E. coli K12 was also applied. The association ratio of E. coli K1 with A. castellanii was 4.3 cfu per amoeba for 1 hr but E. coli K5 with A. castellanii was 1 cfu per amoeba for 1 hr. By invasion and survival assays, E. coli K5 was recovered less than E. coli K1 but still alive inside A. castellanii. E. coli K1 and K5 survived and multiplied intracellularly in A. castellanii. The survival assay was performed under a favourable condition for 22 hr and 43 hr with the encystment of A. castellanii. Under the favourable condition for the transformation of trophozoites into cysts, E. coli K5 multiplied significantly. Moreover, the pathogenic potential of E. coli K1 from A. castellanii cysts exhibited no changes as compared with E. coli K1 from A. castellanii trophozoites. E. coli K5 was multiplied in A. castellanii trophozoites and survived in A. castellanii cysts. Therefore, this study suggests that E. coli K5 can use A. castellanii as a reservoir host or a vector for the bacterial transmission.