• 제목/요약/키워드: PHY

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Phytochromes A and B: Specificity of photoperception and structure/function analysis of bilin chromophores

  • Shinomura, Tomoko;Hanzawa, Hiroko;Furuya, Masaki
    • Journal of Photoscience
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    • 제9권2호
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    • pp.90-93
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    • 2002
  • Phytochrome A (phyA) and phytochrome B (phyB) perceive light and adapt to fluctuating circumstances by different manners in terms of effective wavelengths, required fluence and photoreversibility. Action spectra for induction of seed germination and inhibition of hypocotyl elongation using phytochrome mutants of Arabidopsis showed major difference. PhyA is the principal photoreceptor for the very low fluence responses and the far-red light-induced high irradiance responses, while phyB controls low fluence response in a red/far-red reversible mode. The structural requirement of their bilin chromophores for photosensory specificity of phyA and phyB was investigated by reconstituting holophytochromes through feeding various synthetic bilins to the following chromophore-deficient mutants: hy1, hyl/phyA and hyl/phyB mutants of Arabidopsis. We found that the vinyl side-chain of the D-ring in phytochromobilin interacts with phyA apoprotein. This interaction plays a direct role in mediating the specific photosensory function of phyA. The ethyl side-chain of the D-ring in phycocyanobilin fails to interact with phyA apoprotein, therefore, phyA specific photosensory function is not observed. In contrast, both phytochromobilin and phycocyanobilin interact with phyB apoprotein and induce phyB specific photosensory functions. Structural requirements of the apoproteins and the chromophores for the specific photoperception of phyA and phyB are discussed.

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Individual or combinational use of phytase, protease, and xylanase for the impacts on total tract digestibility of corn, soybean meal, and distillers dried grains with soluble fed to pigs

  • Adsos Adami Passos;Vitor Hugo Cardoso Moita;Sung Woo Kim
    • Animal Bioscience
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    • 제36권12호
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    • pp.1869-1879
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    • 2023
  • Objective: This study was to evaluate the effects of individual or combinational use of phytase, protease, and xylanase on total tract digestibility of corn, soybean meal, and distillers dried grains with soluble (DDGS) fed to pigs. Methods: Each experiment had four 4×4 Latin squares using 16 barrows. Each period had 5-d adaptation and 3-d collection. All experiments had: CON (no enzyme); Phy (CON+phytase); Xyl (CON+xylanase); Pro (CON+protease); Phy+Xyl; Phy+Pro, Xyl+Pro, Phy+Xyl+Pro. Each Latin square had 'CON, Phy, Xyl, and Phy+Xyl'; 'CON, Phy, Pro, and Phy+Pro'; 'CON, Pro, Xyl, and Xyl+Pro'; and 'Phy+Xyl, Phy+Pro, Xyl+Pro, Phy+Xyl+Pro'. Results: The digestible energy (DE), metabolizable energy (ME), and nitrogen retention (NR) of corn were not affected by enzymes but the apparent total tract digestibility (ATTD) of phosphorus (P) was improved (p<0.01) by Phy. The DE and ATTD dry matter (DM) in soybean meal were increased (p<0.05) by Phy+Pro and the ATTD P was improved (p<0.01) by Phy, Phy+Pro, and Phy+Xyl. The DE, ME, and ATTD DM in DDGS were improved (p<0.05) by Phy+Xyl and the ATTD P was improved (p<0.01) by Phy, Phy+Pro, and Phy+Xyl. Conclusion: Phytase individually or in combination with xylanase and protease improved the Ca and P digestibility of corn, soybean meal, and DDGS, from the hydrolysis of phytic acid. The supplementation of protease was more effective when combined with phytase and xylanase in the soybean meal and DDGS possibly due to a higher protein content in these feedstuffs. Xylanase was more effective in DDGS diets due to the elevated levels of non-starch polysaccharides in these feedstuffs. However, when xylanase was combined with phytase, it demonstrated a higher efficacy improving the nutrient digestibility of pigs. Overall, combinational uses of feed enzymes can be more efficient for nutrient utilization in soybean meal and DDGS than single enzymes.

애기장대의 하배축에서 피토크롬이 생장과 굴중성 반응에 미치는 영향 (Phytochromes are Involved in the Regulation of Growth and the Gravitropic Response via Ethylene Production in Hypocotyl of Arabidopsis)

  • 이상승;김순영
    • 생명과학회지
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    • 제28권1호
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    • pp.9-16
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    • 2018
  • 피토크롬은 빛을 인지하여 식물의 생장과 발달에 영향을 미치고, 식물호르몬인 에틸렌은 식물의 줄기 뿌리의 생장을 조절한다. 본 연구는 phyA, phyB and phyAB와 같은 애기장대의 피토크롬 돌연변이체를 이용하여 다양한 빛 조건(암소, white light, red light, far red light)에서 하배축의 생장과 굴중성 반응을 측정하였다. 모든 빛 조건에서 돌연변이체 phyAB는 다른 돌연변이체와 wild type (WT)보다 생장과 굴중성 반응이 가장 촉진되었다. Red light (R)에서 phyB가 phyA보다 굴중성 반응이 촉진되었으나 far red light (FR)에서는 phyB가 phyA보다 굴중성 반응이 억제되었다. 하배축의 생장도 굴중성 반응과 같은 양상으로 조절되었다. 피토크롬의 작용을 설명하기 위하여 에틸렌 생성과 in vitro ACS, ACO 활성을 측정하였다. White light에서 돌연변이체보다 WT에서 에틸렌 생성이 촉진되었다. 그러나 R에서 키운 phyA와 FR에서 키운 phyB에서 에틸렌 생성이 촉진되어 WT와 비슷한 생성량을 보였다. ACS 활성도 에틸렌 생성량의 양상과 일치하였다. 이 결과는 R에서는 phyB의 Pr 형태가, 그리고 FR에서는 phyA의 Pfr 형태가 에틸렌 생성을 조절하여 하배축의 생장과 굴중성 반응을 조절한다는 가능성을 제시한다.

포플러의 Phytochrome B 유전자 분리 및 특성구명 (Isolation and characterization of Phytochrome B gene in Poplar)

  • 강호덕;이금영;강상구;배한홍
    • 한국산림과학회지
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    • 제94권4호통권161호
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    • pp.236-242
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    • 2005
  • 다양한 광조건에서 식물의 생장조절에 관여하는 광수용체인 phytochrome B(PhyB) 유전자를 교잡종 포플러 수항1호에서 분리하였다. 염기서열분석 결과, PhyB cDNA는 길이가 3,456bp 이었으며 1,156개의 아미노산으로 구성된 단백질을 암호화하고 있는 것으로 나타났다. PhyB 단백질은 아미노산 수준에서 Populus balsamfera PhyB1과 98%의 높은 상동성을 나타내었다. Northern blot 분석 결과, PhyB 유전자는 광조건에서는 높은 수준으로 발현되지만, 암조건에서는 발현되지 않는 것으로 나타났다. 본 연구의 결과들을 종합하여 볼 때 PhyB는 빛에 의하여 발현이 유도되며 광수용체 역할을 하는 것으로 여겨진다.

큰가리비 Patinopecten yessoensis 치패의 성장 및 생존율 향상을 위한 대체 먹이원 개발 (Development of replacement diets for improved growth and survival rate of scallop juvenile Patinopecten yessoensis)

  • 남명모;박진철;박미선;이주
    • 한국패류학회지
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    • 제28권2호
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    • pp.137-143
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    • 2012
  • 큰가리비 치패의 대체 먹이원을 개발하기 위해 각기 다른 먹이원을 공급하여 성장, 생존율 및 체내 조성을 조사하였다. 생존율은 PTE + PHY 실험구에서 90.0%로 가장 높게 나타났다. 각장과 각고는 PHY에서 가장 높게 나타났으나 PTE +PHY 실험구와의 유의적인 차이는 없었다. 반면, PTE와 OTE 단독구는 유의적으로 가장 낮게 나타났다. 한편, 각폭 및 전중량도 동일한 경향을 보여 PHY 단독 실험구와 PTE+PHY 혼합 실험구에서 유의적으로 가장 높게 나타난 반면 PTE와 OTE 단독구는 가장 낮은 값을 보였다. 한편, 체내 지방산 분석에서 DHA 함량은 기존 먹이인 미세조류 단독 실험구 (PHY) 와 경제적인 먹이원인 INS 실험구에 비해 지질강화원인 PTE와 OTE가 혼합된 실험구에서 더욱 높은 것으로 나타났으며, 이러한 높은 값에 기인하여 n-3 PUFA도 높았다. 또한, 총 단백질 함량은 주요 단백질원인 PHY와 INS가 들어간 실험구가 55.5-65.2%의 함량을 보인반면 지질영양강화원만 들어간 PTE, OTE 단독 실험구는 각각 44.8%, 47.0%로 가장 낮은 함량을 나타내었다. 필수아미노산 함량도 동일한 경향을 보여 단순 지질강화원 실험구에서는 낮았다. 한편, 체내 핵산 분석에서 RNA 값은 PHY 단독 실험구와 PTE+PHY 혼합구에서 0.76으로 가장 높게 나타났으나 PTE, OTE 단독구는 각각 0.35, 0.32로 가장 낮게 나타났다. DNA 값도 PHY 단독 실험구와 PTE + PHY 혼합구에서 3.95으로 가장 높게 나타난 반면 PTE, OTE 단독구는 유의적으로 가장 낮았다. 이러한 경향에 의해 RNA/DNA ratio 값도 PHY와 INS가 들어간 단독구와 몇몇 혼합구가 PTE와 OTE 단독구 보다 높았다. 이상의 결과를 통해서 미세조류 단독 공급구인 PHY에 PTE를 혼합해 준 PTE+PHY 혼합 공급구는 큰가리비 치패의 성장, 생존율 및 체내 조성을 향상시켜 주는 것으로 나타났다. 본 실험을 통해 새롭게 대체 개발된 PTE+PHY 혼합구는 이매패류 양식에서 차지하는 미세조류 생산비용의 절감 효과를 기대해 볼 수 있는 것으로 경제적인 측면에서 매우 유용한 결과라 할 수 있다.

차세대 모바일 단말 플랫폼을 위한 MIPI CSI-2 & D-PHY 카메라 컨트롤러 구현 (MIPI CSI-2 & D-PHY Camera Controller Design for Future Mobile Platform)

  • 현유진;권순;정우영
    • 정보처리학회논문지A
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    • 제14A권7호
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    • pp.391-398
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    • 2007
  • 본 논문에서는 차세대 모바일 단말 카메라 표준 인터페이스인 MIPI CSI-2 및 D-PHY를 설계하였다. 제안된 CSI-2는 레인별로 존재하는 버퍼를 하나로 통합하여 송수신단이 지원하는 레인의 개수가 다른 경우에도 유연하게 관리 될 수 있는 멀티레인관리계층을 가진다. 설계된 CSI-2 및 D-PHY는 테스트 벤치를 통해 RTL 검증되었다. 또한 FPGA로 합성된 후 테스트 베드를 통해 기능 검증이 이루어 졌으며, 실제 단말기에 적용하여 동작 여부를 확인 하였다. 설계된 CSI-2 및 D-PHY 모듈은 브리지 형태로 제공되어 기존의 카메라 센서와 호스트 프로세서와 오프 칩 형태로 사용할 수 있을 뿐 아니라, 차세대 모바일 카메라 컨트롤러와 온 칩 화 가능한 IP 형태로도 사용 가능하다.

Arabidopsis phytochrome mutant에서 빛이 뿌리 생장과 굴중성 반응에 미치는 영향 (Effect of Light on Root Growth and Gravitropic Response of Phytochrome Mutants of Arabidopsis)

  • 박지혜;이상승;우순화;김순영
    • 생명과학회지
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    • 제22권5호
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    • pp.681-686
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    • 2012
  • 빛이 굴중성과 뿌리 생장에 미치는 영향을 알아보기 위해 Arabidopsis phytochrome mutant를 이용하여 뿌리 생장과 굴중성 반응을 측정하였다. $PhyA$의 뿌리 생장은 white light를 제외한 모든 빛 조건에서 WT와 비교하여 촉진되었다. 특히 red light에서 키웠을 때 다른 mutant와는 달리 뿌리 생장이 촉진되었다. 반면에 phyB는 모든 빛 조건에서 키웠을 때 뿌리 생장이 억제되었으며, 특히 double mutant인 $phyAB$는 white light와 red light에서 키웠을 때 뿌리 생장이 가장 많이 억제되었다. $PhyA$의 굴중성 반응은 far-red light에서 키웠을 때를 제외하고 모든 빛 조건에서 키웠을 때 WT와 비교하여 촉진되었다. 한편 $phyAB$는 모든 조건에서 모두 굴중성 반응이 억제되었다. Ethylene 생합성을 조절하는 효소인 ACS transcript 수준은 white light와 red light에서 키웠을 때 $phyA$가 높게 나타났으며, far-red light에서 키웠을 때는 $phyA$의 transcript 수준이 억제되었다. 결론적으로 뿌리 생장과 굴중성 반응은 $phyB$$P_{fr}$에 의해 조절된다.

모바일 기기 신호 인터페이스용 MIPI 디지털 D-PHY의 저전력 설계 (Low Power Design of a MIPI Digital D-PHY for the Mobile Signal Interface)

  • 김유진;김두환;김석만;조경록
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제10권12호
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    • pp.10-17
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    • 2010
  • 본 논문에서는 모바일 기기 신호 인터페이스용 MIPI(Mobile industry processor interface)의 D-PHY의 디지털 블록의 저전력 설계를 제안한다. MIPI는 고속 데이터 전송을 위한 HS(high-speed)모드와 주로 제어에 사용되는 LP(low-power)모드의 두 가지 동작 모드를 갖는다. 저전력 소모를 위해 디지털 블록 내부 구성요소를 각 동작에 따라 선택적으로 스위칭 할 수 있는 클럭 게이팅(Clock gating) 기법을 적용했다. 저전력 동작의 설계에 대한 동작을 시뮬레이션을 통해 검증하고 기존의 일반적인 MIPI D-PHY 디지털 블록과 전력소모를 비교했다. HS 모드 데이터 전송동작에 대해서는 저전력 설계를 통하여 전력소모가 송신단(TX: transmitter)과 수신단(RX: receiver) 각각 74%와 31% 감소하여 전체적으로 전력소모가 50%로 줄었고, LP 모드 동작에 대해서도 전력소모가 TX와 RX 각각 79%와 40% 감소하여 전체적으로 51.5% 줄어들었다. 제안된 저전력 MIPI D-PHY 디지털 칩은 $0.13{\mu}m$ CMOS 공정에서 1.2V의 전원을 갖도록 설계 및 제작되었다.

Production performances and antioxidant activities of laying hens fed Aspergillus oryzae and phytase co-fermented wheat bran

  • Huang, Chung Ming;Chuang, Wen Yang;Lin, Wei Chih;Lin, Li Jen;Chang, Sheng Chang;Lee, Tzu Tai
    • Animal Bioscience
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    • 제34권3_spc호
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    • pp.371-384
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    • 2021
  • Objective: Wheat bran (WB) was co-fermented with Aspergillus oryzae and phytase (Phy) to determine whether co-fermentation improve WB phosphorus and fiber utilization in Isa-brown layers. Methods: A total of 112 Isa brown layer were randomly divided into 7 treatments with 8 replicates per a treatment and 2 hens per a replicate. The treatments included basal diet (control), basal diet supplemented with 250 unit/kg Phy (control+Phy), diet with 10% WB (10% WB), diet with 5% WB and 250 unit/kg Phy (5% WB+Phy) diet with 10% WB and 250 unit/kg Phy (10% WB+Phy), diet with 5% fermented WB supplemented with molasses and phy (PCFWH) and 125 unit/kg Phy (5% PCFWH), and diet with 10% PCFWH (10% PCFWH). The intestinal microbial population, intestinal morphology, serum antioxidant enzyme activities, and excreta phosphorus content were assessed. Results: In PCFWH, spore counts, protease activity, xylanase activity, and ferulic acid were 8.50 log/g dry matter (DM), 190 unit/g DM, 120 unit/g DM, and 127 ㎍/g, respectively. Xylobiose and xylotriose were released in PCFWH, while they were not detectable in WB. Antioxidant capacity was also enhanced in PCFWH compared to WB. The 10% WB+Phy and 10% PCFWH groups produced higher egg mass, but hens fed 5% WB+Phy had the lowest amount of feed intake. Eggs from 10% PCFWH had better eggshell weight, eggshell strength, and eggshell thickness. Birds fed with 10% PCFWH also had higher serum superoxide dismutase and catalase activities. Compare to control, 10% PCFWH significantly reduced excreta phosphorus content. Conclusion: Diet inclusion of 10% PCFWH improved egg quality, antioxidant status, and excreta phosphorus content of laying hens.

Improved Thermal Stability of a Novel Acidophilic Phytase

  • Byung Sam Son;So Hyeong Kim;Hye-Young Sagong;Su Rin Lee;Eun Jung Choi
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제34권5호
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    • pp.1119-1125
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    • 2024
  • Phytase increases the availability of phosphate and trace elements by hydrolyzing the phosphomonoester bond in phytate present in animal feed. It is also an important enzyme from an environmental perspective because it not only promotes the growth of livestocks but also prevents phosphorus contamination released into the environment. Here we present a novel phytase derived from Turicimonas muris, TmPhy, which has distinctive structure and properties compared to other previously known phytases. TmPhy gene expressed in the Pichia system was confirmed to be 41 kDa in size and was used in purified form to evaluate optimal conditions for maximum activity. TmPhy has a dual optimum pH at pH3 and pH6.8 and exhibited the highest activity at 70℃. However, the heat tolerance of the wildtype was not satisfactory for feed application. Therefore, random mutation, disulfide bond introduction, and N-terminal mutation were performed to improve the thermostability of the TmPhy. Random mutation resulted in TmPhyM with about 45% improvement in stability at 60℃. Through further improvements, a total of three mutants were screened and their heat tolerance was evaluated. As a result, we obtained TmPhyMD1 with 46.5% residual activity, TmPhyMD2 with 74.1%, and TmPhyMD3 with 66.8% at 80℃ heat treatment without significant loss of or with increased activity.