• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제7권3호
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• pp.200-203
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• 1997

Bacteria isolated from ultrapure water made by a high-purity water manufacturing system in a semiconductor manufacturing plant were classified into two groups which either grew in diluted nutrient broth medium (oligotrophic bacteria) or could not grow (copiotrophic bacteria). The nutritional flexibility of oligotrophic and copiotrophic bacteria was investigated. The oligotrophic bacteria were shown to be able to utilize a significantly broader range of organic substrates than the copiotrophic bateria. This finding substantiates the hypothesis that nutritional flexibility is adaptive for oligotrophic bacteria.

• 미생물학회지
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• 제37권2호
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• pp.114-119
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• 2001

산림토양의 각 토양층으로부터 분리된 세균 중에는 통상 농도의 NB배지에서는 중식이 현저히 저해되고 희석한 DNB 배지에서만 중식이 가능한 세균이 다수 포 되어 있었으며, 이들 세균은 NB배지를 $10^{-1}$~$10^{-4}$배로 희석한 배지에서의 증식양상에 따라 4가지형으로 구분되었다. 본 연구에서는 저영양세균의 기준에 따라 $10^{-4}$NB(1 mg C/liter)배지에서 양호하게 증식하는 Type II와 IV세균을 저영양세균으로 분류하였고, 60개의 Type IV(편성저영양세균; obligate oligotrophic bacteria)균주를 순수분리 하였다. 이들 저영양성 세균중 질소고정능을 갖는 11균주에 대하여 화학분류 및 계통분류학적 특성을 검토한 결과 모든 균주는 주요 균체지방산으로 $C_{18:1}$)을, 퀴논종은 Q-10을 함유하였으며, G+C함량은 61-64 mol%범위를 나타내었다. 16S rDNA염기서열을 결정한 결과 각 균주는 Proteobacteria $\alpha$-subdivision의 BANA domain (Bradyrhizobium, Agromonas, Nitrobacter 및 Afipia)에 속하였고 Bradyrhizobium japonicum 및 Bradyrhizobium elkanii와 98% 이상의 높은 상동성을 나타내었다. 나타내었다.

• 미생물학회지
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• 제38권4호
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• pp.293-298
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• 2002

다양한 농도의 영양배지(nutrient broth, NB; diluted nutrient broth, DNB)를 이용하여 음용 지하수중의 세균수를 계수한 결과, 통상농도의 NB배지에 비해 저영양배지인 DNB배지에서 2～50배 이상 높은 계수치를 나타내었다. 이와 같은 결과로부터 지하수중에는 NB배지에서는 중식이 현저히 저해되고 DNB배지에서만 중식이 가능한 저영양세균(oligotrophic bacteria)이 다수 분포하고 있음이라 판단되어 DNB배지로부터 184균주의 저영양세균을 분리하였다. 본 연구에서는 시판 음용수(CW, CJ )와 광천수(DPG, CJG1)에서 분리된 저영양세균 102 균주의 165 rDNA 염기서열을 결정하여 계통분류학적 특성을 검토한 결과 세 개의 주요한 계통군: Proteobacteria $\alpha$-subdivision (49 균주), $\beta$-subdivision (50 균주), $\gamma$-subdivision (3 균주)으로 분류되었다. Proteobacteria $\alpha$-subdivision에는 Afipia, Blastobacter, Bradyrhizobium, Caulobacter, Phenylobacterium, Rhizobioum, Sphingomonas가 포함되었으며, $\beta$-subdivision에는 Acidovorax, Azonexus, Ferribacterium, Janthinobacterium, Leptothrix, Polaromonas, Variovorax가 포함되었고, $\gamma$-subdivision에는 Rhodanobacter 등 다양한 계통군이 확인되었다.

• 한국미생물생명공학회:학술대회논문집
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• 한국미생물생명공학회 2000년도 Proceedings of 2000 KSAM International Symposium and Spring Meeting
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• pp.150-156
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• 2000

Oligotrophic bacteria isolated from forest soil showed a specific community consisting of various taxonomic groups compared with those in other soil or aquatic habitats. Based on the cell shape, the isolates were divided into four groups: regular rod, curved/spiral rod, irregular rod, and prosthecate bacteria. The cellular fatty acids 60 oligotrophic isolates were analyzed. The 30 fatty acids which were identified or characterized are classified. At the dendrogram based on cellular fatty acid composition, four clusters(I-IV) were separated at a euclidian distance of about 50. Cluster 3 and 4-a strains were containing Q-8, these strains are accommodated in the Proteobacteria gamma and beta subdivision. The chemotaxonomic profiles of the cluster 4-a strains showed good agreement with those of the genus Burkholderia. Cluster 3 was characterized by the presence of branched-chain fatty acids, iso-C15:0, iso-C17:1, and iso-C17:0 as the major components. These chemotaxonomy suggested the close relationship of the isolates with Xathomonas/Sterotrophomonas group. Based on the 16S rDNA sequence analysis, the two representative strains(MH256 and MA828) of cluster 3 showed the close relation to genera, Xathomonas/Sterotrophomonas, but were not included in these genera. These strains were even further away from core Xanthomonas, and clearly were seen to branch outside the cluster formed by the Sterotrophomonas maltophilia. MH256 and MA828 16S rDNA sequence was different enough to put new genus on a separate branch. The isolates with Q-10 were also studied. They are corresponded to the two large groups in Proteobacteria alpha subdivision. One was incorporated in the genus Bradyrhizobium cluster, which also includes Agromonas, a genus for oligotrophic bacteria. The strains of the other group showed high similarity to the genus Agrobacterium.

• 미생물학회지
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• 제38권3호
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• pp.180-185
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• 2002

직접생균수측정법(direct viable count; DVC)과 평판법(p1ate count; PC)을 이용하여 시판되고 있는 먹는샘물, 약수, 도시 인근 지역과 축산농가 밀집지역의 음용 지하수로부터 채수된 시료에 대하여 정략적 평가를 실시하였다. DVC법에 의한 생균수는 전균수(total direct count: TDC)의 약 30~80%, 평판법에 의한 생균수는 DVC의 약1~30%로 나타났다. 이와 같은 결과는 지하수내에 배양 불가능한(viable but non-culturable: VBNC)세균이 높은 비율로 존재함이라고 판단된다. 한편, 통상농도의 영양배지(nutrient broth; NB)와 이를 $10^-2 -2/배로 희석한 영양배지(diluted nutrient broth; DNB)및 R2A배지를 이용하여 계수한 결과, 통상농도의 NB배지에 비해 저영양배지인 DNB와 R2A에서 2~50배 이상 높은 계수치를 나타내었다. 이와 같은 결과로부터 지하수와 같이 빈영양한 환경 내에는 통상농도의 NB배지에서는 중식이 현저히 저해되고 저영양배지에서 중식 가능한 저영양세균이 다수 분포해 있음이라 판단되었다.

• 한국미생물학회:학술대회논문집
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• 한국미생물학회 2002년도 추계학술대회
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• pp.81-85
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• 2002

Oligotrophic bacteria isolated from forest soil showed a specific community consisting of various taxonomic groups compared with those in other soil or aquatic habitats. Based on the cell shape, the isolates were divided into four groups: regular rod, curved/spiral rod, irregular rod, and prosthecate bacteria. The cellular fatty acids 60 oligotrophic isolates were analyzed. At the dendrogram based on cellular fatty acid composition, four clusters(I-IV) were separated at a euclidian distance of about 50. Based on the 16S rDNA sequence analysis, the two representative strains(MH256 and MA828) of cluster 3 showed the close relation to genera, Xathomonas/Stenotrophomonas, but were not included in these genera. The isolates with Q-10 were also studied. They are corresponded to the two large groups in Proteobacteria alpha subdivision. One was incorporated in the genus Bradyrhizobium cluster, which also includes Agromonas, a genus for oligotrophic bacteria. The strains of the other group showed high similarity to the genus Agrobacterium. We attempted to screening of bioactive compounds from oligotrophs which was isolated from forest soil. The active compounds were analyzed by mass and NMR spectrum, one of them identified as crisamicin A. Another one designated as SAPH is a new compound. The results indicate that there were possibilities for finding new compounds from the rare microorganisms such as oligotrophs.

• 미생물학회지
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• 제40권3호
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• pp.248-253
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• 2004

2000년 9월부터 2002년 12월 사이에 바이칼호에서 분리된 빈영양성 세균 168균주와 저온성 세균 132균주를 대상으로 BIOLOG Microplate를 이용하여 탄소원의 이용특성을 조사하였다. 본 연구에 사용된 빈영양성 세균 중 oxidase 양성 (GN-NENT 그룹)의 86% (56균주)와 oxidase음성 (GN-ENT그룹)의 89% (92균주), 저온성 세균 중 oxidase 음성 (GN-ENT 그룹)의 82% (85균주)는 다앙한 탄소원 중에서 $\alpha$-D-glucose를 이용할 수 있었으며, 저온성 세균 중 oxidase 양성 (GN-NENT 그룹)의 93% (26 균주)는 bromosuccinic acid를 이용하였다. $\alpha$-D-lactose는 빈영양성 GN-ENT 그룹의 일부만이 이용하였으며 나머지 균주들은 전혀 이용하지 못하였다. BIOLOG Microplate를 이용하여 동정된 균들을 속별로 살펴보면, Pseudomonas속이 49균주로 가장 많았으며, 그 외에도 Salmonella 속, Serratia속, Buttiauxella 속, Pantoea 속, Yersinia 속, Brevundimonas 속, Hydrogenophaga 속, Photorhabdus 속, Sphingomonas 속, Xenorhabdus 속이 동정되었다.

• 미생물학회지
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• 제41권4호
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• pp.293-299
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• 2005

인삼근권토양으로부터 분리된 총640 저영양세균 중 유일한 탄소원으로 colloidal chitin을 첨가한 배지에서 투명환을 나타낸 8균주를 선발하였다. 대부분의 균주가 chitin의 형광성 유사체인 4-methylumbelliferyl D-N,N'-diacetylchitobioside (MUF-diNAG)을 분해하였고, CR-42균주의 경우 4-methylumbelliferyl-D-glucosaminide (MUF-NAG)를 분해하였다. 이들 chitinase 생산균주의 16S rDNA 염기서열을 결정하여 계통학적 위치를 확인한 결과 5개의 주요한 계통군: proteobacteria $\gamma-subdivision$ (3균주), proteobacteria $\beta-subdivision$ (1 균주), Actinobacteriaceae (1 균주), Bacillaceae (1 균주) 그리고 Bacteriodetes (2 균주)로 분류되었다. 이들 분리균주 중 WR164와 CR18 균주는 16S rDNA염기서열의 유사도가 미배양 및 미동정 등록균주와 $97\%$ 미만으로 나타나 신규미생물로 제안할 수 있는 균주로 예상되었다. 한편 CR2와 CR75 chitinase 생산균주는 인삼 탄저 병원균인 Colletotrichum gloeosporioides의 생장을 저해하는 것으로 나타났다.

• 미생물학회지
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• 제39권1호
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• pp.16-20
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• 2003

충남 홍성군 광천 사문암 토양지역의 석면폐광석(KS1)과 인근 토양(KG, KS2)은 pH8.5-9.2를 나타내어 초염기성 토양임이 확인되었다. KSI과 KS2 토양으로부터 통상농도의 alkaline 배지(AL)와 AL 배지를 $10^{-2}$로 희석한 DAL배지를 사용하여 평판법으로 세균수를 측정한 결과 AL 배지에서보다 DAL배지에서 10-100배 이상 높은 계수치를 나타내었다. 초염기성 사문암 토양으로부터 분리된 75균주에대해 통상농도의 AL 배지에서의 중식 유무를 확인한 결과, 통상농도의 AL배지에서 증식 가능한 [AL세균군]과 AL배지에서는 증식이 저해되고 DAL 배지에서만 증식 가능한 [DAL세균군으로 크게 나누었다. DAL세균(42균주)은 $10^{-3}$ AL 배지(약 6mg C/L)에서도 증식 가능한 저영양성세균(oligotrophic bacteria)으로 사문암 토양 중 50% 이상 분포해 있음이 확인되었다. 분리된 75 균주의 16S rDNA 염기서열을 결정하여 계통해석한 결과 proteobacteria $\alpha$-subdivision (3균주), $\beta$-subdivision (7균주), $\gamma$-subdivision (2균주), high G+C gram-positive bacteria (19균주)와 low G+C gram-positive bacteria (14 strains)의 계통군을 나타내었다. 이들 세균중 AL세균군(34균주)은 high G+C gram positive bacteria 에 속하는 streptomyces과 low G+C gram positive bacteria에 속하는 Bacillus로 구성되었다. 한편, DAL세균군(42균주)은 high G+C 및 low G+C gram positive 계통군 이외에도 proteobacteria -subdivision에 속하는 Afipia와 Ralstonia, proteobacteria -subdivision에 속하는 Variovorax, proteobacteria $\beta$-subdivision에 속하는Pseudomonas로 구성되어 계통학적으로 다양한 세균임이 확인되었다.

• 한국동물학회:학술대회논문집
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• 한국동물학회 1998년도 한국생물과학협회 학술발표대회
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• pp.167.1-167
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• 1998

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