한국생물정보시스템생물학회 2006년도 Principles and Practice of Microarray for Biomedical Researchers
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pp.30-36
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2006
Tissue microarray (TMA) is an array-based technology allowing the examination of hundreds of tissue samples on a single slide. To handle, exchange, and disseminate TMA data, we need standard representations of the methods used, of the data generated, and of the clinical and histopathological information related to TMA data analysis. This study aims to create a comprehensive data model with flexibility that supports diverse experimental designs and with expressivity and extensibility that enables an adequate and comprehensive description of new clinical and histopathological data elements. We designed a Tissue Microarray Object Model (TMA-OM). Both the Array Information and the Experimental Procedure models are created by referring to Microarray Gene Expression Object Model, Minimum Information Specification For In Situ Hybridization and Immunohistochemistry Experiments (MISFISHIE), and the TMA Data Exchange Specifications (TMA DES). The Clinical and Histopathological Information model is created by using CAP Cancer Protocols and National Cancer Institute Common Data Elements (NCI CDEs). MGED Ontology, UMLS and the terms extracted from CAP Cancer Protocols and NCI CDEs are used to create a controlled vocabulary for unambiguous annotation. We implemented a web-based application for TMA-OM, supporting data export in XML format conforming to the TMA DES or the DTD derived from TMA-OM. TMA-OM provides a comprehensive data model for storage, analysis and exchange of TMA data and facilitates model-level integration of other biological models.
The complex documentation involved in power system analysis software require a well-defined and friendly database system. We have developed an object-oriented database management system for power system analysis, and have described load flow analysis and transient stability analysis using object-oriented database(OODB). Database management systems are widely used and achieve high reliability of data management in the engineering fields. However relational database system have shortcomings in application to power system analysis. ill relational database, the data model is too simple for modeling complex data and database languages are very different from programming languages. Object-oriented techniques are sufficiently powerful to support data-modeling requirements of GUI applications. The GUI is implemented using C++ on a MS windows platform. The OODB supports data modeling requirements of GUI applications and the performance is well acceptable for Gill applications.
This paper presents a sensor fusion method to recognize a cylindrical object a CCD camera, a laser slit beam and ultrasonic sensors on a pan/tilt device. For object recognition with a vision sensor, an active light source projects a stripe pattern of light on the object surface. The 2D image data are transformed into 3D data using the geometry between the camera and the laser slit beam. The ultrasonic sensor uses an ultrasonic transducer array mounted in horizontal direction on the pan/tilt device. The time of flight is estimated by finding the maximum correlation between the received ultrasonic pulse and a set of stored templates - also called a matched filter. The distance of flight is calculated by simply multiplying the time of flight by the speed of sound and the maximum amplitude of the filtered signal is used to determine the face angle to the object. To determine the position and the radius of cylindrical objects, we use a statistical sensor fusion. Experimental results show that the fused data increase the reliability for the object recognition.
B2B 전자상거래와 같이 XML.을 이용한 정보교환이 확산되고 있으며 이에 따라 상호 교환되는 정보에 대하여 체계적이며 안정적인 저장관리가 요구되고 있다. 이를 위해 XML 응용과 데이터베이스 연계를 위한 다양한 연구가 관계형 데이터베이스를 중심으로 수행되었다. 그러나 계층구조를 갖는 XML 데이터를 2차원 테이블의 집합인 관계형 정보로 표현하는 관계형 데이터베이스로의 저장에는 본질적인 한계가 있어, 계층구조를 지원하는 객체지향 데이터베이스로의 저장이 요망된다. 이에 따라 계층구조를 갖는 XML 데이터를 객체지향 데이터 베이스로 지장하기 위한 모델링 방안이 요구된다. 본 논문에서는 객체모델을 토대로 DTD를 객체 지향 데이터베이스 스키마로 변환하기 위한 방법을 제안한다. 이를 위하여 먼저 DTD를 객체모델로 변환시키기 위한 객체변환 방안을 제시하고, 변환된 객체모델을 객체지향 데이터베이스 스키마로 변경시키기 위한 스키마 변환 방법을 제안했다.
기존의 객체지향 데이터베이스에 학습 객체에 기반을 둔 새로운 클래스를 도입한 확장된 객체 지향 데이터 베이스의 모델을 설계한다. 이를 구현하기 위해 기존의 객체 데이터 베이스에 학습객체클래스를 도입하였으며, 이 클래스들을 연산하기 위한 학습객체 연산 클래스를 설계하였다. 그리고 확장된 객체 지향의 데이터 모델상에서 데이터베이스에 저장된 학습객체의 경험적 분류 모델에 기반을 둔 검색이 가능한 질의어를 설계하였다.
Journal of Information Technology Applications and Management
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제10권2호
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pp.19-31
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2003
We propose an indexing technique and an index selection algorithm for optimal OLAP query processing in object database systems, Although there are many research results on the relational database systems for OLAP Query processing, few researches have been done on the object database systems. Since OLAP queries represent complex business logic on a huge data ware-house, object database systems supporting the OLAP queries should have higher performance. Proposed bitmap index structure is an extension of conventional bitmap indexes for adapting object databases and provides higher performance with lower space overhead. We also propose a linear time solution of the index selection problem that will be used in the OLAP query optimization process.
In this paper, a new approach is proposed for the efficient generation of computer-generated holograms (CGHs) using the spatially redundant data on a 3D object and the novel look-up table (N-LUT) method. First, the pre-calculated N-point principle fringe patterns (PFPs) were calculated using the 1-point PFP of the N-LUT. Second, spatially redundant data on a 3D object were extracted and re-grouped into the N-point redundancy map using the run-length encoding (RLE) method. Then CGH patterns were generated using the spatial redundancy map and the N-LUT method. Finally, the generated hologram patterns were reconstructed. In this approach, the object points that were involved in the calculation of the CGH patterns were dramatically reduced, due to which the computational speed was increased. Some experiments with a test 3D object were carried out and the results were compared with those of conventional methods.
Curved 3D objects represented by range data contain large amounts of information compared with planar objects, but do not have distinct features for matching to those of object models. This makes it difficult to represent and identify a general 3D curved object. This paper introduces a new approach to representing and finding a holdsite of general 3D curved objects using range data. We develop a three-dimensional generalized Hough transformation which can be also applied to general 3D curved object recognition and which reduces both the computation time and storage requirements. Our approach makes use of the relative geometric differences between particular points on the object surface and some model points which are prespecified arbitrarily and task dependently.
Kim, Dae-Suk;Baek, Byung-Joon;Kim, Young-Dong;Javidi, Bahram
Journal of the Optical Society of Korea
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제11권3호
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pp.108-112
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2007
Spectroscopic ellipsometry (SE) has become an important tool in scatterometry based nano-structure 3D profiling. In this paper, we propose a novel 3D nano object recognition method by use of phase sensitive scatterometry. We claims that only phase sensitive scatterometry can provide a reasonable 3D nano-object recognition capability since phase data gives much higher sensitive 3D information than amplitude data. To show the validity of this approach, first we generate various $0^{th}$ order SE spectrum data ($\psi$ and ${\Delta}$) which can be calculated through rigorous coupled-wave analysis (RCWA) algorithm and then we calculate correlation values between a reference spectrum and an object spectrum which is varied for several different object 3D shape.
Accurate acquisition of surface geometries such as machined surfaces, biological surfaces, and deformed parts and processing 3D object have been very important technique in scientific study and engineering, expecially for system design, manufacturing and inspection. Defective human teeth are usually ground to be coped with special alloy coping which is hand-made by dental technician. This make dental technician to be difficult and take a long time Dental CAD/CAM Systems consist of two parts, data acquisition and milling. In this paper, a method is studied to mill object which is acquired 3D geometric data of the small object such as a die in stone model. This paper present a control program and a mechanical system for milling 3D object.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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