Kim, Hyun Hee;Mizuno, Kazuharu;Lee, Ho Sang;Koo, Jae Gyun;Kong, Woo Seok
Journal of Environmental Science International
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v.30
no.1
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pp.29-43
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2021
This study analyzed the status of climate-change indicator plants native to the main islands of the Korean peninsula, while elucidating their distribution characteristics. Information on flora from over 129 island locations, comprising more than 100 species of native plants, was collected, compiled into a database, and utilized as raw data. The distribution of 193 climate-change indicator plants was confirmed. The distribution area of broadleaf evergreen trees and ferns, including Mallotus japonicus and Cyrtomium falcatum, was relatively wide. In contrast, the distribution of common northern plants such as Corydalis turtschaninovii and Malus baccata was limited. If global warming persists, northern plant distribution is expected to decrease rapidly in the Korean Peninsula island region, while the northern limit line of the southern plants is expected to migrate further northward. During this process, it is likely that the plant congregation structure and species diversity within the island region will change dynamically. In this study, comparative analyses between species and regions were conducted by assessing the relative frequency of their occurrence, and six types of botanical geographic distribution patterns were noted.
Bacilysin is a dipeptide antibiotic composed of L-alanine and L-anticapsin produced by certain strains of Bacillus subtilis. Bacilysin is gaining increasing attention in industrial agriculture and pharmaceutical industries due to its potent antagonistic effects on various bacterial, fungal, and algal pathogens. However, its use in industrial applications is hindered by its low production in the native producer. The biosynthesis of bacilysin is mainly based on the bacABCDEF operon. Examination of the sequence surrounding the upstream of the bac operon did not reveal a clear, strong ribosome binding site (RBS). Therefore, in this study, we aimed to investigate the impact of RBS as a potential route to improve bacilysin production. For this, the 5' untranslated region (5'UTR) of the bac operon was edited using the CRISPR/Cas9 approach by introducing a strong ribosome binding sequence carrying the canonical Shine-Dalgarno sequence (TAAGGAGG) with an 8 nt spacing from the AUG start codon. Strong RBS substitution resulted in a 2.87-fold increase in bacilysin production without affecting growth. Strong RBS substitution also improved the mRNA stability of the bac operon. All these data revealed that extensive RBS engineering is a promising key option for enhancing bacilysin production in its native producers.
Ginseng Is renowned for both its medicinal and herbal uses and successful cultivation of Panax ginseng in Asia and Panax quinquefolium in North America has until recently taken place in the native geographical ranges of the plants. As a consequence of the potential high capital return and anticipated increases in consumer consumption, commercial cultivation of American ginseng now occurs well outside the native range of the plant in North America. In fact, the region of greatest expansion of cultivation is in the semi-arid interior region of British Columbia, Canada. Linked with this expansion is the potential domination of the ginseng industry by agricultural corporations. In the interior of British Columbia, the native deciduous forest environment of eastern North America is simulated with elevated polypropylene shade and a surface covering of straw mulch. The architecture of these environments is designed to permit maximum machinery usage and to minimize labor requirements. Further, with only a four- years growth cycle, plant densities in the gardens are high. In this hot, semi-arid environment, producers believe they have a competitive advantage over other regions in North America because of the low precipitation rates. This helps to minimize atmospheric humidity such that the conditions for fungal disease development are reduced. If soil moisture level become limited, supplemental water can be provided by irrigation. The nature of the radiation and energy balance regimes of the shade and many environments promotes high soil moisture levels. Also, the modified environment redlines soil heating. This can result in an aerial environment for the plant that is stressful and a rooting zone environment that is suloptimal. The challenge of further refining the man modified environment for enhanced plant growth and health still remains. Keywords Panax ginseng, Panax quinquefolium, cultivation, ginseng production.
Ginseng is renowned for both its medicinal and herbal uses and successful cultivation of Panax ginseng in Asia and Panax Vtiinvtiefolilim in North America has until recently taken place in the native geographical ranges of the plants. As a consequence of the potential high capital return and anticipated increases in consumer consumption, commercial cultivation of American ginseng now occurs well outside the native range of the plant in North America. In fact, the region of greatest expansion of cultivation is in the semi-arid interior region of British Columbia, Canada. Linked with this expansion is the potential domination of the ginseng industry by agricultural corporations. In the interior of British Columbia, the native decidous forest environment of eastern North America is simulated with elevated polypropylene shade and a sllrface covering of straw mulch. The architecture of these environments is designed to permit maximillm machinery useage and to minimize labour requirements. Further, with only a four-year growth cycle, plant densities in the gardens are high. In this hot, semiarid environment, producers believe they have a competitive advantage over other regions in North America because of the low precipitation rates. This helps to minimize atmospheric humidity such that the conditions for fungal disease development are reduced. If soil moisture levels become limited, supplemental water can be provided by irrigation. The nature of the radiation and energy balance regimes of the shade and much environment promotes high soil moistilre levels. Also, the modified environment reduces soil heating. This can result in an aerial environment for the plant that is stressful and a rooting zone environment that is sub-optimal. The challenge of further refining the man modified environment for enhanced plant growth and health still remains.
Kim, Hyun-Hee;Mizuno, Kazuharu;Kim, Da-Bin;Lee, Ho-Sang;Kong, Woo-Seok
Korean Journal of Environmental Biology
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v.38
no.3
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pp.392-403
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2020
This study analyzed the distribution characteristics of invasive alien plants on the islands of the Korean Peninsula. Ten species, Rumex acetosella, Sicyos angulatus, Solanum carolinense, Ambrosia artemisiaefolia var. elatior, Ambrosia trifida, Aster pilosus, Eupatorium rugosum, Hypochaeris radicata, Lactuca scariola, and Paspalum distichum were present on 68 islands. These ecosystem-disturbing invasive alien plants appeared extensively on the islands of Gyeonggi province and Jeollanam province. The proportion of the plants on the inhabited islands (41 places, 2.15 species on average) was higher than that on the uninhabited islands (27 places, 1.07 species on average). This means that the distribution of invasive alien plants was closely related to human activity. The distribution of Ambrosia artemisiaefolia var. elatior(32 islands) and Rumex acetosella (31 islands) was the widest, and there were distinct distribution differences according to species. In the island area, the physical environment is poor compared to the mainland, and the native space is limited. Therefore, when invasive alien species enter and settle on the island, the native island plants can be damaged more than those on the mainland. In this regard, the discussion of the distribution of invasive alien plants in the island region can contribute to the conservation of biodiversity in the region.
The regional distribution and relative frequency of somatostatin-immunoreactive cells in the gastrointestinal tract were studied during the postnatal development(1 day old, 1 month old, 6-month-old and adult) of the Korean native goat by immunohistochemical methods. Somatostatin-immunoreactive cells were found in the entire gastrointestinal tract and were most predominant in the fundic gland region except for the pyloric gland region of the 1 day old. The number of these cells was observed to decrease along the gastrointestinal tract and to decrease according to the increase with age in all postnatal stages. In this study, immunoreactive cells revealed the differences of regional distribution and the relative frequency in the gastrointestinal tract during postnatal development. These results suggest that although the functional significance of fetal endocrine cells remains unknown, this was caused by changing of feeding habits and physiological conditions during different ages.
Bacterial programmed cell death is regulated by the toxin-antitoxin (TA) system. YhaV (toxin) and Pr1F (antitoxin) have been recently identified as a type II TA system in Escherichia coli. YhaV homologs have conserved active residues within the C-terminus, and to characterize the function of this region, we purified native YhaV protein (without denaturing) and constructed YhaV proteins of varying lengths. Here, we report a new low-temperature method of purifying native YhaV, which is notable given the existing challenges of purifying this highly toxic protein. The secondary structures and thermostability of the purified native protein were characterized and no significant structural destruction was observed, suggesting that the observed inhibition of cell growth in vivo was not the result of structural protein damage. However, it has been reported that excessive levels of protein expression may result in protein misfolding and changes in cell growth and mRNA stability. To exclude this possibility, we used an [$^{35}S$]-methionine prokaryotic cell-free protein synthesis system in vitro in the presence of purified YhaV, and two C-terminal truncated forms of this protein (YhaV-L and YhaV-S). Our results suggest that the YhaV C-terminal region is essential for mRNA interferase activity, and the W143 or H154 residues may play an analogous role to Y87 of RelE.
Journal of the Korean Society of Environmental Restoration Technology
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v.1
no.1
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pp.45-53
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1998
This study was conducted to investigate the ornamental, ecological, and using characteristic of Korean indigenous perennials of 100 species through observation in native region and in farm. The results were as follows : All of the species were divided into seven groups according to landscape use. Among Korean native perennials, Dicentra spectabilis, Dianthus superious var. longicalycinus, Aster koraiensis, Caryopteris incana, Ixeris stolonifera, Lilium, Chrysanthemum, Sedum, Potentilla, Hosta, Hemerocallis, and Liliope have high and long ornamental values regardless of flower. And they can be planted in any place of Korea.
Kim, Jae-Hwan;Cho, Chang-Yeon;Choi, Seong-Bok;Cho, Young-Moo;Yeon, Seung-Hum;Yang, Boh-Suk
Journal of Life Science
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v.21
no.9
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pp.1329-1335
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2011
Korean native goats, which are characterized by black coat color, have existed on the Korean peninsula for a long time. Until now, there has been no comprehensive investigation concerning their genetic diversity, phylogenetic analysis or origin. In this study, we investigated the genetic diversity and verified phylogenetic status of the Korean native goat using the 453-bp fragment of the hypervariable fragment I (HVI) of mitochondrial DNA (mtDNA) D-loop region from 60 individuals among 5 populations. The Korean native goat showed less haplotype diversity when compared with goats from other countries. In addition, 6 haplotypes that had not been previously reported were verified in this study. In phylogenetic analyses with other country's goats, 10 haplotypes from Korean native goats were classified into mtDNA lineage A. Moreover, in a phylogenetic tree for goats which contained mtDNA lineage A, 8 of 10 haplotypes could be included in a subgroup with goats from Vietnam and an area of China. However, none of the remaining haplotypes belonged to a major group of Korean native goats and were located on different independent positions. These results suggest that almost Korean native goats aligned more closely to China and Vietnam breeds in mtDNA lineage A and there was no gene flow from other mtDNA lineages. Our results will contribute to conservation strategies and genetic breeding of Korean native goats.
Coxiella burnetii is the causative agent of Q fever which is a zoonosis occuring in both humans and animals worldwide. The purpose of this study was to investigate the seroprevalence of C. burnetii in Korean native goat in Gyeongnam province, Korea. A total of 1,365 goat blood samples from 273 farms in Gyeongnam province were collected between 2018 and 2019. Among them, 177 (13.0%) samples out of 71 (26.0%) farms were seropositive for C. burnetii by ELISA. Seroprevalence were 15.4% and 10.9% in 2018 and 2019, respectively. According to the region, seroprevalence in western, central, eastern, northern and southern areas of Gyeongnam province were 16.6%, 17.8%, 8.0%, 11.6% and 10.8%, respectively. Seroprevalence was increased with breeding scale (Head<10:7.0%, 10≤Head<50:8.7%, 50≤Head<100:13.6%, 100≤Head:28.8%). Seroprevalence according to the season showed highest in summer (18.9%) and lowest in winter (9.4%). These results indicated that C. burnetii infection is widespread among Korean native goats of Gyeongnam province in Korea and further study needs to prevent the circulation of other livestock with Korean native goat.
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